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Fusion gene:ZNF207-LRRC37B (FusionGDB2 ID:100923)

Fusion Gene Summary for ZNF207-LRRC37B

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: ZNF207-LRRC37B
Fusion gene ID: 100923
HgeneTgene
Gene symbol

ZNF207

LRRC37B

Gene ID

7756

114659

Gene namezinc finger protein 207leucine rich repeat containing 37B
SynonymsBuGZ|hBuGZLRRC37
Cytomap

17q11.2

17q11.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
DescriptionBUB3-interacting and GLEBS motif-containing protein ZNF207leucine-rich repeat-containing protein 37BC66 SLIT-like testicular protein
Modification date2020031320200313
UniProtAcc.

Q96QE4

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000394670, ENST00000321233, 
ENST00000394673, ENST00000341711, 
ENST00000342555, ENST00000577908, 
ENST00000584416, 		ENST00000543378, 
ENST00000327564, ENST00000394713, 
ENST00000584368, ENST00000341671, 
ENST00000581786, 
Fusion gene scores* DoF score14 X 15 X 10=210013 X 14 X 8=1456
# samples 1715
** MAII scorelog2(17/2100*10)=-3.62678267641578
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(15/1456*10)=-3.27897594970282
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: ZNF207 [Title/Abstract] AND LRRC37B [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointZNF207(30696801)-LRRC37B(30376121), # samples:2
LRRC37B(30353596)-ZNF207(30698578), # samples:1
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.ZNF207-LRRC37B seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a transcription factor due to the frame-shifted ORF.
ZNF207-LRRC37B seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a essential gene due to the frame-shifted ORF.
ZNF207-LRRC37B seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a essential gene due to the frame-shifted ORF.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneZNF207

GO:0090307

mitotic spindle assembly

26388440


check buttonFusion gene breakpoints across ZNF207 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.

check buttonFusion gene breakpoints across LRRC37B (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4SKCMTCGA-FR-A7U8-06AZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
ChimerDB4SKCMTCGA-FR-A7U8-06AZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
ChimerDB4SKCMTCGA-FR-A7U8-06AZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
ChimerDB4SKCMTCGA-FR-A7U8-06AZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+


Top

Fusion Gene ORF analysis for ZNF207-LRRC37B

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
3UTR-3CDSENST00000394670ENST00000543378ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000394670ENST00000327564ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000394670ENST00000394713ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000394670ENST00000584368ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000394670ENST00000341671ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-intronENST00000394670ENST00000581786ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000321233ENST00000543378ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000321233ENST00000327564ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000321233ENST00000394713ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000321233ENST00000584368ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000321233ENST00000341671ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-intronENST00000321233ENST00000581786ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000394673ENST00000543378ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000394673ENST00000327564ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000394673ENST00000394713ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000394673ENST00000584368ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000394673ENST00000341671ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-intronENST00000394673ENST00000581786ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000341711ENST00000543378ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000341711ENST00000327564ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000341711ENST00000394713ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000341711ENST00000584368ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000341711ENST00000341671ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-intronENST00000341711ENST00000581786ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000342555ENST00000543378ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000342555ENST00000327564ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000342555ENST00000394713ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000342555ENST00000584368ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-3CDSENST00000342555ENST00000341671ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
3UTR-intronENST00000342555ENST00000581786ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000577908ENST00000543378ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000577908ENST00000327564ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000577908ENST00000394713ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000577908ENST00000584368ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000577908ENST00000341671ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-intronENST00000577908ENST00000581786ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000543378ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000327564ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000394713ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000584368ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000341671ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-intronENST00000584416ENST00000581786ZNF207chr17

30696801

+LRRC37Bchr17

30376121

+
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30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
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30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
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30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000394670ENST00000584368ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
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30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
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30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
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30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000321233ENST00000327564ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000321233ENST00000394713ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000321233ENST00000584368ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000321233ENST00000341671ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
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30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
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30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000394673ENST00000327564ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
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30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000394673ENST00000584368ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000394673ENST00000341671ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-intronENST00000394673ENST00000581786ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000341711ENST00000543378ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000341711ENST00000327564ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000341711ENST00000394713ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000341711ENST00000584368ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-3CDSENST00000341711ENST00000341671ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
3UTR-intronENST00000341711ENST00000581786ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000342555ENST00000543378ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000342555ENST00000327564ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000342555ENST00000394713ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000342555ENST00000584368ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000342555ENST00000341671ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-intronENST00000342555ENST00000581786ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000577908ENST00000543378ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000577908ENST00000327564ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000577908ENST00000394713ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000577908ENST00000584368ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000577908ENST00000341671ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-intronENST00000577908ENST00000581786ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000543378ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000327564ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000394713ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000584368ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000341671ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
intron-intronENST00000584416ENST00000581786ZNF207chr17

30697099

+LRRC37Bchr17

30376119

+
In-frameENST00000394670ENST00000543378ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
In-frameENST00000394670ENST00000327564ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
In-frameENST00000394670ENST00000394713ZNF207chr17

30696764

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30376121

+
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30696764

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30376121

+
In-frameENST00000394670ENST00000341671ZNF207chr17

30696764

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30376121

+
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+
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+
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+
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+
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+
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30376121

+
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+
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+
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+
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+
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+
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30376121

+
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+
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+
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+
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30376121

+
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30376121

+
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30376121

+
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+
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30696764

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30376121

+
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+
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30376121

+
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30376121

+
Frame-shiftENST00000342555ENST00000341671ZNF207chr17

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30376121

+
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30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
In-frameENST00000577908ENST00000543378ZNF207chr17

30696764

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30376121

+
In-frameENST00000577908ENST00000327564ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
In-frameENST00000577908ENST00000394713ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
In-frameENST00000577908ENST00000584368ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
In-frameENST00000577908ENST00000341671ZNF207chr17

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30376121

+
5CDS-intronENST00000577908ENST00000581786ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000543378ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000327564ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000394713ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000584368ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-3CDSENST00000584416ENST00000341671ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+
intron-intronENST00000584416ENST00000581786ZNF207chr17

30696764

+LRRC37Bchr17

30376121

+

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000394670ZNF207chr1730696764+ENST00000543378LRRC37Bchr1730376121+14253136341691506445
ENST00000394670ZNF207chr1730696764+ENST00000327564LRRC37Bchr1730376121+14271136341691506445
ENST00000394670ZNF207chr1730696764+ENST00000394713LRRC37Bchr1730376121+14118136341691506445
ENST00000394670ZNF207chr1730696764+ENST00000584368LRRC37Bchr1730376121+14127136341691506445
ENST00000394670ZNF207chr1730696764+ENST00000341671LRRC37Bchr1730376121+14271136341691506445
ENST00000577908ZNF207chr1730696764+ENST00000543378LRRC37Bchr1730376121+219615771062037643
ENST00000577908ZNF207chr1730696764+ENST00000327564LRRC37Bchr1730376121+221415771062037643
ENST00000577908ZNF207chr1730696764+ENST00000394713LRRC37Bchr1730376121+206115771062037643
ENST00000577908ZNF207chr1730696764+ENST00000584368LRRC37Bchr1730376121+207015771062037643
ENST00000577908ZNF207chr1730696764+ENST00000341671LRRC37Bchr1730376121+221415771062037643

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000394670ENST00000543378ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376121+0.0002094240.9997906
ENST00000394670ENST00000327564ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376121+0.0002090830.99979097
ENST00000394670ENST00000394713ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376121+0.0002116140.99978834
ENST00000394670ENST00000584368ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376121+0.0002134610.99978656
ENST00000394670ENST00000341671ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376121+0.0002090830.99979097
ENST00000577908ENST00000543378ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376121+0.002237130.9977629
ENST00000577908ENST00000327564ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376121+0.0020042960.99799573
ENST00000577908ENST00000394713ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376121+0.0039178890.9960821
ENST00000577908ENST00000584368ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376121+0.0039490980.9960509
ENST00000577908ENST00000341671ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376121+0.0020042960.99799573

Top

Fusion Genomic Features for ZNF207-LRRC37B


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)
ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376120+0.0515108970.94848907
ZNF207chr1730696764+LRRC37Bchr1730376120+0.0515108970.94848907

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

Top

Fusion Protein Features for ZNF207-LRRC37B


check button Go to

FGviewer for the breakpoints of chr17:30696764-chr17:30376121

.
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
.LRRC37B

Q96QE4

FUNCTION: Might normally function as a transcriptional repressor. EWS-fusion-proteins (EFPS) may play a role in the tumorigenic process. They may disturb gene expression by mimicking, or interfering with the normal function of CTD-POLII within the transcription initiation complex. They may also contribute to an aberrant activation of the fusion protein target genes.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneLRRC37Bchr17:30696764chr17:30376121ENST00000341671812867_897794.3333333333334948.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255
TgeneLRRC37Bchr17:30696764chr17:30376121ENST00000341671812927_947794.3333333333334948.0Topological domainCytoplasmic
TgeneLRRC37Bchr17:30696764chr17:30376121ENST00000341671812906_926794.3333333333334948.0TransmembraneHelical

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000321233+1111_920479.0RegionMicrotubule-binding region
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000321233+111359_3910479.0RegionGLEBS
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000341711+1111_920396.0RegionMicrotubule-binding region
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000341711+111359_3910396.0RegionGLEBS
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000394670+1121_920495.0RegionMicrotubule-binding region
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000394670+112359_3910495.0RegionGLEBS
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000394673+1111_920464.0RegionMicrotubule-binding region
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000394673+111359_3910464.0RegionGLEBS
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000321233+11111_340479.0Zinc fingerNote=C2H2-type 1
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000321233+11135_580479.0Zinc fingerNote=C2H2-type 2
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000341711+11111_340396.0Zinc fingerNote=C2H2-type 1
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000341711+11135_580396.0Zinc fingerNote=C2H2-type 2
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000394670+11211_340495.0Zinc fingerNote=C2H2-type 1
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000394670+11235_580495.0Zinc fingerNote=C2H2-type 2
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000394673+11111_340464.0Zinc fingerNote=C2H2-type 1
HgeneZNF207chr17:30696764chr17:30376121ENST00000394673+11135_580464.0Zinc fingerNote=C2H2-type 2
TgeneLRRC37Bchr17:30696764chr17:30376121ENST00000341671812556_577794.3333333333334948.0RepeatNote=LRR 1
TgeneLRRC37Bchr17:30696764chr17:30376121ENST00000341671812580_601794.3333333333334948.0RepeatNote=LRR 2
TgeneLRRC37Bchr17:30696764chr17:30376121ENST00000341671812604_625794.3333333333334948.0RepeatNote=LRR 3
TgeneLRRC37Bchr17:30696764chr17:30376121ENST00000341671812628_649794.3333333333334948.0RepeatNote=LRR 4
TgeneLRRC37Bchr17:30696764chr17:30376121ENST00000341671812655_676794.3333333333334948.0RepeatNote=LRR 5
TgeneLRRC37Bchr17:30696764chr17:30376121ENST00000341671812679_699794.3333333333334948.0RepeatNote=LRR 6
TgeneLRRC37Bchr17:30696764chr17:30376121ENST0000034167181228_905794.3333333333334948.0Topological domainExtracellular


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Fusion Gene Sequence for ZNF207-LRRC37B


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>In-frame_ENST00000394670_ENST00000543378_TCGA-FR-A7U8-06A_ZNF207_chr17_30696764_+_LRRC37B_chr17_30376121_length(transcript)=14253nt_BP=13634nt
ACCGCAGTGCTTGACGGGAGGCGGAGCGGGGAACGAGGCCGTCGGCCATTTTGTGTCTGCTTCCTGTGGGACGTGGTGGTAGCCGTTGGG
TTGGGAAAGTGAGGGATTTTTGGCCTCGTTTCTCCTGCTTCTTTTCTCCTCCCTTTTACTTTGCCGGTAGAACACAGTTATGGGTCGCAA
GAAGAAGAAGCAGCTGAAGCCGTGGTGCTGGTATTGTAATAGAGATTTTGATGATGAGAAGATCCTTATTCAGCACCAAAAAGCAAAGCA
TTTTAAATGCCATATATGTCACAAGAAATTGTATACAGGACCTGGCTTAGCTATTCATTGCATGCAGGTACATAAAGAAACAATAGATGC
CGTACCAAATGCAATACCTGGAAGAACAGACATAGAGTTGGAAATATATGGTATGGAAGGTATTCCAGAAAAAGACATGGATGAAAGACG
ACGACTTCTTGAACAGAAAACACAAGAAAGTCAAAAAAAGAAGCAACAAGATGATTCTGATGAATATGATGATGACGACTCTGCAGCCTC
AACTTCATTTCAGCCACAGCCTGTTCAACCTCAGCAAGGTTATATTCCTCCAATGGCACAGCCAGGACTGCCACCAGTACCAGGAGCACC
AGGAATGCCTCCAGGCATACCTCCATTAATGCCAGGTGTTCCTCCTCTGATGCCAGGAATGCCACCAGTTATGCCAGGCATGCCACCTGG
ATTGCATCATCAGAGAAAATACACCCAGTCATTTTGCGGTGAAAACATAATGATGCCAATGGGTGGAATGATGCCACCTGGACCAGGAAT
ACCACCTCTGATGCCTGGAATGCCACCAGGTATGCCCCCACCTGTTCCACGTCCTGGAATTCCTCCAATGACTCAAGCACAGGCTGTTTC
AGCGCCAGGTATTCTTAATAGACCACCTGCACCAACAGCAACTGTACCTGCCCCACAGCCTCCAGTTACTAAGCCTCTTTTCCCCAGTGC
TGGACAGATGGGGACACCTGTCACAAGCTCAAGTACAGCTTCATCCAATTCAGAAAGTCTGTCTGCATCTTCTAAAGCTCTGTTTCCTAG
CACAGCACAAGCTCAGGCAGCTGTCCAAGGACCTGTTGGTACAGATTTCAAACCCTTAAATAGTACCCCTGCAACAACTACAGAACCCCC
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Top

Fusion Gene PPI Analysis for ZNF207-LRRC37B


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


Top

Related Drugs for ZNF207-LRRC37B


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

Top

Related Diseases for ZNF207-LRRC37B


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource