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Fusion Gene Summary | |
Fusion Gene ORF analysis | |
Fusion Genomic Features | |
Fusion Protein Features | |
Fusion Gene Sequence | |
Fusion Gene PPI analysis | |
Related Drugs | |
Related Diseases |
Fusion gene:GOSR1-ZNF207 (FusionGDB2 ID:33915) |
Fusion Gene Summary for GOSR1-ZNF207 |
Fusion gene summary |
Fusion gene information | Fusion gene name: GOSR1-ZNF207 | Fusion gene ID: 33915 | Hgene | Tgene | Gene symbol | GOSR1 | ZNF207 | Gene ID | 9527 | 7756 |
Gene name | golgi SNAP receptor complex member 1 | zinc finger protein 207 | |
Synonyms | GOLIM2|GOS-28|GOS28|GOS28/P28|GS28|P28 | BuGZ|hBuGZ | |
Cytomap | 17q11.2 | 17q11.2 | |
Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
Description | Golgi SNAP receptor complex member 128 kDa Golgi SNARE protein28 kDa cis-Golgi SNARE p28Golgi SNARE 28 kDacis-golgi SNAREgolgi integral membrane protein 2 | BUB3-interacting and GLEBS motif-containing protein ZNF207 | |
Modification date | 20200313 | 20200313 | |
UniProtAcc | O95249 | . | |
Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000225724, ENST00000451249, ENST00000467337, ENST00000581721, ENST00000579905, | ENST00000394670, ENST00000321233, ENST00000394673, ENST00000341711, ENST00000342555, ENST00000577908, ENST00000584416, | |
Fusion gene scores | * DoF score | 9 X 5 X 8=360 | 13 X 11 X 5=715 |
# samples | 10 | 14 | |
** MAII score | log2(10/360*10)=-1.84799690655495 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | log2(14/715*10)=-2.35251641472079 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | |
Context | PubMed: GOSR1 [Title/Abstract] AND ZNF207 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
Most frequent breakpoint | GOSR1(28811788)-ZNF207(30696314), # samples:3 | ||
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event. |
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
Hgene | GOSR1 | GO:0042147 | retrograde transport, endosome to Golgi | 15215310 |
Tgene | ZNF207 | GO:0090307 | mitotic spindle assembly | 26388440 |
Fusion gene breakpoints across GOSR1 (5'-gene) * Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window. |
Fusion gene breakpoints across ZNF207 (3'-gene) * Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window. |
Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
Source | Disease | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
ChimerDB4 | LAML | TCGA-AB-2820-03A | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
ChimerDB4 | LAML | TCGA-AB-2820_700GJAAXX_2 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
ChimerDB4 | LAML | TCGA-AB-2820_700J3AAXX_2 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
Top |
Fusion Gene ORF analysis for GOSR1-ZNF207 |
Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
In-frame | ENST00000225724 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000225724 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000225724 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000225724 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000225724 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000225724 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
5CDS-intron | ENST00000225724 | ENST00000584416 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000451249 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000451249 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000451249 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000451249 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000451249 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000451249 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
5CDS-intron | ENST00000451249 | ENST00000584416 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000467337 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000467337 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000467337 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000467337 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000467337 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000467337 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
5CDS-intron | ENST00000467337 | ENST00000584416 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000581721 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000581721 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000581721 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000581721 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000581721 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
In-frame | ENST00000581721 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
5CDS-intron | ENST00000581721 | ENST00000584416 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
intron-intron | ENST00000579905 | ENST00000584416 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
ORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. |
Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand | Seq length (transcript) | BP loci (transcript) | Predicted start (transcript) | Predicted stop (transcript) | Seq length (amino acids) |
ENST00000225724 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000394670 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 12868 | 420 | 72 | 740 | 222 |
ENST00000225724 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000321233 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1433 | 420 | 72 | 740 | 222 |
ENST00000225724 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000394673 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1325 | 420 | 72 | 740 | 222 |
ENST00000225724 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000341711 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1430 | 420 | 72 | 740 | 222 |
ENST00000225724 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000342555 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 842 | 420 | 72 | 740 | 222 |
ENST00000225724 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000577908 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 3822 | 420 | 72 | 737 | 221 |
ENST00000451249 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000394670 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 12847 | 399 | 57 | 719 | 220 |
ENST00000451249 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000321233 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1412 | 399 | 57 | 719 | 220 |
ENST00000451249 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000394673 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1304 | 399 | 57 | 719 | 220 |
ENST00000451249 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000341711 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1409 | 399 | 57 | 719 | 220 |
ENST00000451249 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000342555 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 821 | 399 | 57 | 719 | 220 |
ENST00000451249 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000577908 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 3801 | 399 | 57 | 716 | 219 |
ENST00000467337 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000394670 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 12823 | 375 | 87 | 695 | 202 |
ENST00000467337 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000321233 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1388 | 375 | 87 | 695 | 202 |
ENST00000467337 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000394673 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1280 | 375 | 87 | 695 | 202 |
ENST00000467337 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000341711 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1385 | 375 | 87 | 695 | 202 |
ENST00000467337 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000342555 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 797 | 375 | 87 | 695 | 202 |
ENST00000467337 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000577908 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 3777 | 375 | 87 | 692 | 201 |
ENST00000581721 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000394670 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 12803 | 355 | 7 | 675 | 222 |
ENST00000581721 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000321233 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1368 | 355 | 7 | 675 | 222 |
ENST00000581721 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000394673 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1260 | 355 | 7 | 675 | 222 |
ENST00000581721 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000341711 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 1365 | 355 | 7 | 675 | 222 |
ENST00000581721 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000342555 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 777 | 355 | 7 | 675 | 222 |
ENST00000581721 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ENST00000577908 | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 3757 | 355 | 7 | 672 | 221 |
DeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated. |
Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand | No-coding score | Coding score |
ENST00000225724 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.001213935 | 0.99878603 |
ENST00000225724 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.00220253 | 0.9977975 |
ENST00000225724 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.002041193 | 0.9979588 |
ENST00000225724 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.002209904 | 0.9977901 |
ENST00000225724 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.003746643 | 0.9962534 |
ENST00000225724 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.001374584 | 0.9986254 |
ENST00000451249 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.000788198 | 0.9992118 |
ENST00000451249 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.001759408 | 0.9982406 |
ENST00000451249 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.001683562 | 0.9983164 |
ENST00000451249 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.001759539 | 0.9982405 |
ENST00000451249 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.003862844 | 0.9961371 |
ENST00000451249 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.00104347 | 0.99895656 |
ENST00000467337 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.005371684 | 0.99462837 |
ENST00000467337 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.005827378 | 0.99417263 |
ENST00000467337 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.005694913 | 0.9943051 |
ENST00000467337 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.005890103 | 0.99410987 |
ENST00000467337 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.0083393 | 0.9916608 |
ENST00000467337 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.004153318 | 0.9958467 |
ENST00000581721 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.001231602 | 0.9987684 |
ENST00000581721 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.002516725 | 0.9974833 |
ENST00000581721 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.00258562 | 0.99741435 |
ENST00000581721 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.002492796 | 0.9975073 |
ENST00000581721 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.006331609 | 0.9936684 |
ENST00000581721 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + | 0.00141087 | 0.9985891 |
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Fusion Genomic Features for GOSR1-ZNF207 |
FusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints. |
Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand | 1-p | p (fusion gene breakpoint) |
GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696313 | + | 4.96E-07 | 0.9999995 |
GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696313 | + | 4.96E-07 | 0.9999995 |
GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696313 | + | 4.96E-07 | 0.9999995 |
GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696313 | + | 4.96E-07 | 0.9999995 |
Distribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page. |
Distribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page. |
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Fusion Protein Features for GOSR1-ZNF207 |
Go to FGviewer for the breakpoints of chr17:28811788-chr17:30696314 - FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels. |
Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
Hgene | Tgene |
GOSR1 | . |
FUNCTION: Involved in transport from the ER to the Golgi apparatus as well as in intra-Golgi transport. It belongs to a super-family of proteins called t-SNAREs or soluble NSF (N-ethylmaleimide-sensitive factor) attachment protein receptor. May play a protective role against hydrogen peroxide induced cytotoxicity under glutathione depleted conditions in neuronal cells by regulating the intracellular ROS levels via inhibition of p38 MAPK (MAPK11, MAPK12, MAPK13 and MAPK14). Participates in docking and fusion stage of ER to cis-Golgi transport. Plays an important physiological role in VLDL-transport vesicle-Golgi fusion and thus in VLDL delivery to the hepatic cis-Golgi. {ECO:0000269|PubMed:15215310, ECO:0000269|PubMed:21860593}. | FUNCTION: Might normally function as a transcriptional repressor. EWS-fusion-proteins (EFPS) may play a role in the tumorigenic process. They may disturb gene expression by mimicking, or interfering with the normal function of CTD-POLII within the transcription initiation complex. They may also contribute to an aberrant activation of the fusion protein target genes. |
Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000225724 | + | 4 | 9 | 68_95 | 116.0 | 251.0 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000225724 | + | 4 | 9 | 9_30 | 116.0 | 251.0 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000467337 | + | 4 | 9 | 9_30 | 51.0 | 186.0 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000341711 | 8 | 11 | 359_391 | 289.0 | 396.0 | Region | GLEBS | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394673 | 8 | 11 | 359_391 | 357.0 | 464.0 | Region | GLEBS |
- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000467337 | + | 4 | 9 | 68_95 | 51.0 | 186.0 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000225724 | + | 4 | 9 | 2_229 | 116.0 | 251.0 | Topological domain | Cytoplasmic |
Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000467337 | + | 4 | 9 | 2_229 | 51.0 | 186.0 | Topological domain | Cytoplasmic |
Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000225724 | + | 4 | 9 | 230_250 | 116.0 | 251.0 | Transmembrane | Helical%3B Anchor for type IV membrane protein |
Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000467337 | + | 4 | 9 | 230_250 | 51.0 | 186.0 | Transmembrane | Helical%3B Anchor for type IV membrane protein |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000321233 | 8 | 11 | 1_92 | 372.0 | 479.0 | Region | Microtubule-binding region | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000321233 | 8 | 11 | 359_391 | 372.0 | 479.0 | Region | GLEBS | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000341711 | 8 | 11 | 1_92 | 289.0 | 396.0 | Region | Microtubule-binding region | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394670 | 9 | 12 | 1_92 | 388.0 | 495.0 | Region | Microtubule-binding region | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394670 | 9 | 12 | 359_391 | 388.0 | 495.0 | Region | GLEBS | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394673 | 8 | 11 | 1_92 | 357.0 | 464.0 | Region | Microtubule-binding region | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000321233 | 8 | 11 | 11_34 | 372.0 | 479.0 | Zinc finger | Note=C2H2-type 1 | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000321233 | 8 | 11 | 35_58 | 372.0 | 479.0 | Zinc finger | Note=C2H2-type 2 | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000341711 | 8 | 11 | 11_34 | 289.0 | 396.0 | Zinc finger | Note=C2H2-type 1 | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000341711 | 8 | 11 | 35_58 | 289.0 | 396.0 | Zinc finger | Note=C2H2-type 2 | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394670 | 9 | 12 | 11_34 | 388.0 | 495.0 | Zinc finger | Note=C2H2-type 1 | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394670 | 9 | 12 | 35_58 | 388.0 | 495.0 | Zinc finger | Note=C2H2-type 2 | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394673 | 8 | 11 | 11_34 | 357.0 | 464.0 | Zinc finger | Note=C2H2-type 1 | |
Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394673 | 8 | 11 | 35_58 | 357.0 | 464.0 | Zinc finger | Note=C2H2-type 2 |
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Fusion Gene Sequence for GOSR1-ZNF207 |
For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones. |
>In-frame_ENST00000225724_ENST00000394670_TCGA-AB-2820-03A_GOSR1_chr17_28811788_+_ZNF207_chr17_30696314_length(transcript)=12868nt_BP=420nt ACACGCACCATGGTGACTTTCCGGCCTGCATCGCCTCTGCTCCCCTATCCCGGCTGACGTTGGACGACAAAGATGGCGGCAGGGACCAGC AGTTACTGGGAAGATCTCAGGAAACAGGCTCGACAGCTGGAAAATGAACTTGACCTGAAACTAGTTTCCTTCAGCAAACTATGTACAAGT TACAGTCATAGCAGTACCCGAGATGGAAGACGCGACAGGTATAGTTCTGATACAACACCCCTTTTAAATGGATCAAGCCAAGACAGAATG TTTGAGACAATGGCGATTGAGATTGAACAACTTTTGGCAAGGCTTACAGGGGTAAATGATAAAATGGCAGAATATACCAACAGTGCAGGT GTCCCCTCCTTGAATGCAGCCCTGATGCATACATTACAGCGGCATAGAGACATATTGCAGGAAGAGAGAAGGGCACAGTTACCTAAGTAT CAACGTAATCTTCCTCGGCCAGGACAGGCCCCCATCGGTAATCCACCAGTTGGACCAATTGGAGGTATGATGCCACCACAGCCAGGCATC CCACAGCAACAAGGAATGAGACCCCCAATGCCACCTCATGGTCAGTATGGTGGTCATCATCAAGGCATGCCAGGATACCTTCCTGGTGCT ATGCCCCCGTATGGGCAGGGACCGCCAATGGTGCCCCCTTACCAGGGTGGGCCTCCTCGACCTCCGATGGGAATGAGACCTCCTGTAATG TCGCAAGGTGGCCGTTACTGATCTTACTTCATCCAGTCTAATAGGTTTGGAGATTAAACCTTTTCTCAACTTGTGCTGTTTATATAGCCA AGCTTCCGTCAATAAGGCTTCATTGTGACTTTAACAAACATTATCTTCCCACATACCAGGAACTATTGGACATTTATTTTACATGGGAAA AATTATTTGGAATAATAAAGCAGGAACTTTTCCTGAAGTTGCAATTTATACTGTATGGCTTCTTTTTCATGTTTCATCTAGGTTTTTAGA AGTGAAGTATAGTAAATTTGGTTCGTTAAATTGTGAAGGCGCTGGAATTACATGAACATACCACCCTAGTAAAGGCAAGTTCTGTAAGCT TACATTGCTATTTGTAAAGTTTGCCTTCACAGCATTTCAGATGCTGTTGGACTTCATGTCCCCAACCTAGCTTGGTGAGGGCTGTAACTG TTTCCAAGTACTTGTACATTGGAAGTCTGAATGTGTAACAATATTTAATGTATTTAGAGTTCCTCATGTTGCAGGGTTTAAGAAATCTGA CCCACCAAGGTCATGTGACTTTTCTGTACTGTTAAACTTCATTGTAATAAAATGAGAGAAAAATTTATGCCTTTTTATTCATAACCCAGC TGTGGACCACTGCCTGAAAGGTTTGTACAGATGCATGCCACAGTAGATGTCCACATAATAAAATTCATAGTTACCAATGCAGTTTTGATA TATCATTGGATTCTGTCTTTGAGTTGTAGGTTATTTCTTAGCTGCATGTTTTAAACTGAATTTGCATAGAGTTGTATGTTAATGTTTCAG TTAAGAGAAAAACTTAAGATACATGAGTCATTACATAATGGGTATGAAATCTTTATAATCACCCTTCCACCCTCTATGGTGTCAGTACAC ATCACGTGTCATAGATACTTAAAATGTAAATGTTAACACTTTTCCTTCCTGCTGAGATGTTTAGAGCCTAGTGCCAGACCCATTCATTTC CTTTTGATTATTTTTGAGACTCAGTACTGCATGGACCTCAGAAGCTTTTCAGGTGCAAACTTCTAGAAGCTTAGGTGCATGCAGTAATAG CTTCTTGTGCTGTTAATGGGTTATTATATATTATTCTAAGTGTAATGCTGAGAATCTAAATGTGTCTCTGTTGGGATGGTTAACAGATGA ATTGGCAATTTTTATTATGTTCCTGGAAGATTACATTATTCATTTGAGTACCTTCTGTTATTAAGCCTAGGTAGCCTTACTGTGCAACTT TTTATTTATCCTTGGAAATTTTGAATGTTGTGTTCTTACAGAGAGCTTTTCTGTAGAGATGACTGCTATTCAATATTTTGTGTTGCAACC TCTTAAAATAATAGCTCTTGTTGACCTTTTTGGGATCTGTTTTTCTGATCTTTTGCAGGGTAGTTTTATGATTTTTTAGGCATCAAATAA CCTATGCAAAGTATTAATATAATGAACTCAAGTTGAGTTTTTCTCATTATAAAGTTAAGACTTCTAAGAAAATGGTAACATTTCTTTATA ACTTTCCTGTGAAGGTATAGATAAAACACATGAAGTCTGAAGTTGTATGGAAAAAAGGGCTTTAACTTTGAAGGAAAATATATTGAAAAG TGATTTAGCCATCACAAAAGAGTTCGTATTTATGTGACAGATGAAAGTCATACCTTTAAGCAAAACATTGCAAGTATTATAAAGCTGAAT GCTATTTTAACTCACATTGGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCCCTCTGGAAGGCTGAGATGGGAGGATTGCTTGAGTCC AGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTGTACAAAACATTTAAAAATTAGCCAGGCGCGTTAGTGTGTGTCTGTG GTCCCAGCTGCTCAAGAGGCTGAGGAAGGAGGTTCTTCCTCCTTCCGAGGCTGCGGTGAGCTATGTTCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGC GAGACTCTGTCAAAAAATAAATTAAAATATCTGATTATCTGGCTTCAATGATTTTGGCTCCTGTGCTTGTGGTACCATAGTGGTACAAAA ATTTTCATAGTTTGAAAATAAAACAGGTATTTTGCCAGTAATGTATTTCTTTCTGCCAGCAGCCAAGTCCCAAACCACTTTCCCCTCTGA ACCTCTGCTTACCTAAATGGTTTCAAAATTAATACATGCTGCTTTGATTTGGCAGCACACTTAATATACTGCTGAAGGAAAACTTGTGTT GAAAGTCTTTAAGATAAAAATGGTGTGATAGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGCGGGTGGA TCATGAGGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTAGTTGC GGATGCCTGTAGTCCCAACTACTCTGGAGACCGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCATAGCTTGCAGTGAGCGGAGATCACAC CACTGCACTCTAGCCTGGACGACAGATTGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAATGCTGTGATTAAATTTAGAATAATTAAGTAAGGGGTG CTCTCCCAAATTCTCAGGAATTTCATGTATACGGTTATTGACAAACTGCAATAGGGTTAGTAGACCTGTTTCAGAAATTATGTGAAGCTT TATTTGCATTTTATGCAAAGAAGGTTGATACTTTGTAGCAAGGTTTTTTGCTCTCTGTATAGGTCTGATGGGCAAAAATGGAACTTTTAA ATATGGGATAGAATTCTAATTAAAAATTAATTGAAAGTGTTAGGCATTGGCAGATAAAACTTAAGCTCATGAGTTCCTGAGTTTGTAGCT ATAGGCTCAGAGGTGGTGTACCCATTTAATATATTTGAAGTGTAATTTTTGCATGCATCCAAACGTAATTAAGCTTCTAGAAAATACCTT TTTTCTAAATGCTTCTGGGGTCCATAGTGTGGTTGAATTATGAGTGGAGCAAATTATATTCATATAATTAACTCTGACTCAACCTTCCTT AAGTAGTAGATGAAGTTGAGTCAAAGTGGATGCCAACTGCCCTCACAGAAGACAACTTTTGGGACTTGATAATTCAGGCAGGCATTGTGA TTGTCATAATTAAGGAAGCTGTAAGGTTAGTAGGGCTGGCAACTTTGGCTCTACCTTACATCCACCCCTTTTAGAAAAACAAGAAAACAT TTTGTCTGGCACTAGTTTCTGTTGTATAAGTTTTCATACTGTTTAACAAGACCACAGCAGGTAAGGATTAATTTTTGAGTGGCTGCTGGA ATTACTTGATTTGAATACTTAGTATTTTAGTAGTGTCTCACACATTTGCCATTAGGTATGAATAAAATATTCCTACTGTACTCCTATTCC ACTAAGTTACATTTTGAACTTAGACTCACCTTAATTAAACTTAATTAATTGGGGAGGGGGATTCCCCAACAAAAAGAAGTACGGGCTCAG AGTGGAATTGTAGTGGACAATAGTTAAAAACAAAGCTGCTCCTTTTGCTTGCTTGATCATTGGGATTTTTAAAAAAAAAAATTTTAATGC ATGTCTTTTAAATTAATTGGGAACTGTTTTTCTAAAATTAAAATTTTCTTCTTCCTATAGCCCTGCCATAGGACAGGCTGAGGCTGAGTC TCAGTGTTGCCCTGTTCAGTCTGAGGCAAGTGGGATTTATTTTATTCCTTATAGGGGCTTTCACAGCTTTATGGCTGTTGGATATTTATG TCCCCAAACTTGCAGCAAGTTTGGTGAAGGCCCCTAAATTTAATTAAACTTAGGATTTTTATACTCTTTTGGCAGAGAAGGCTCTATATT AATATTCACGTTTGACTGTGGTGTTAATAAACATAAGTATTTCATATGCAATTTTATGTAATTTGCTGTGTGTTACATAATTAACAGCTT CAGTAAAGCTTGTGTTCCTATATTGAACTTCAATAAATTGACAAAATTTGATATTTTTGATTGGAGGCAAGAAATGTTTCATTCAAGTTT TTTACTTTCACTTCTAGGAAAATCTTACTGGTTTTATTTTCTCCATAAACTATTAAATTTAACCTCAAGGATAAGTTTAATCATTGGAAA TGCCACTGGATACTGAAATGTGCCTTCTCTTTTTTGAGACGGAGTTTCACTCTTATCACCCAGGATGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGT TCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGATTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCGCCACCACATCTG GCTATTTTTTCAATATTTTTCAGTAGGGATGGGGTTTTGCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCAT CTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGAGTAGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAAAATCTGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG AGACTGTCTCGCTGTGTCACCCAGGCCAGAGTGCAGTAGCACGATCTCAGCTCACTACAACCTCCACCTCCTGGATTCAAGCGATTCTCC TGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACC GTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTTGCGATCCCCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGGGCCACCGC GCTTGGCCAAAATCTGCATTCTTAATCACAAACTTACGCATTGAATGTTAAGGCTAAAAGGTCATCTGGAAATGCTTAATTTTAAAATAT TTTCAAGCCTCACCACATTAGAGCAAATGTTAATGTAGAGCCCTGTAAAGGTGGGAAGGTGGTGTCTATGTGTGTGCTTGTGTATGTGGG GGTATAGACCATATAGTTGATATAACAACAGAATTTGGGTGTTACAGACCTTTCAGCATGGATGGATTACTAATTTTCAGGTATCGAAAC 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TCTGCGTTATTCCAAATTGAAATTTGTTTGCTCTTCATTGTAACTTTTATGTAAAAGTCCTTTAAAAGGGGATTCAATTATAAGGCTATT TGACTATAGGGCAGATTTTTATAAGTAAACATTCCCCCAATTCCACTTATGCTAACTGTCTCATGACAGTAAAGTTTACTCCTTTTTAGA AACCCTTTCTCAGTATTTTAATTTCTGTCATTGAATCATTTAAATAATAACCTTTTGTTTTTATAGCAAAGAAATCATCTGACTTTTCTG TGTGATGTTTCTTGGCAAAATAAGCACTTGATGTATGGTCATGTACATAATGGATATTCATTAATTTTGTGATTAGTGCTGAGTTTTCTA AACTACTATCTTAAGCTCTTAGGCACCCTATTATGGATCTAATTCAAACCAATATGTAGGAAATGGAGAAAGTAGGACTTCAGTTTGCGC TTCCCAATAACTTTAAATATATCCACCTTTTCCAAGTGTTTAAGCCCTAAAACATCTATCTTTATTTTTTTACCTGGCATTTTTGTTAGA AAATAGATTACGTTTTAAAGTAACATTAAAAAAATTCTTCAGTAAGATAATTGCTTTTAATAAGTATATTTTTCTTGCTCTTGGCTCTAT ACATTTTTGCATAATATTTTAGTCTTGAAAAGCTTTTCATTTTCTTAACTCTGGAAAATAATAGTTTGGAACTAAATTAGTTTGAGAAAT CTGAATCATCTCTCTTTAAATCTGTTCAGTTAGTCTCATGTATTCTCAGGGGAAAATGTCTTTATTTTACTAAGCGGAAGTAGTAGTCAT ATTGAGGCAGAAATTTGTAGCCCAAACAAGGTAGGTCTTCGCTGAAACTAATTTGAACTATTCCTATTTGAAGCAAATTGAACACTATTA TAAATCTAGACTGGCTAATTAGATGGAAACTTTGATGGTTAGGTTCTTTAAGAGGCATACAATCCGTTATGAGAATGTTTATGTTTATGT 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>In-frame_ENST00000581721_ENST00000577908_TCGA-AB-2820-03A_GOSR1_chr17_28811788_+_ZNF207_chr17_30696314_length(amino acids)=221AA_start in transcript=7_stop in transcript=672 MAAGTSSYWEDLRKQARQLENELDLKLVSFSKLCTSYSHSSTRDGRRDRYSSDTTPLLNGSSQDRMFETMAIEIEQLLARLTGVNDKMAE YTNSAGVPSLNAALMHTLQRHRDILQEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMP -------------------------------------------------------------- |
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Fusion Gene PPI Analysis for GOSR1-ZNF207 |
Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in |
Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
- Retained PPIs in in-frame fusion. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
- Lost PPIs in in-frame fusion. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
- Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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Related Drugs for GOSR1-ZNF207 |
Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08) |
Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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Related Diseases for GOSR1-ZNF207 |
Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |