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Fusion gene:GRIK2-RNF217 (FusionGDB2 ID:34664)

Fusion Gene Summary for GRIK2-RNF217

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: GRIK2-RNF217
Fusion gene ID: 34664
HgeneTgene
Gene symbol

GRIK2

RNF217

Gene ID

2901

154214

Gene nameglutamate ionotropic receptor kainate type subunit 5ring finger protein 217
SynonymsEAA2|GRIK2|GluK5|KA2C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1
Cytomap

19q13.2

6q22.31

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionglutamate receptor ionotropic, kainate 5excitatory amino acid receptor 2glutamate receptor KA2probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217IBR domain containing 1opposite STL
Modification date2020031320200313
UniProtAcc

Q13002

.
Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000413795, ENST00000369138, 
ENST00000421544, ENST00000358361, 
ENST00000318991, ENST00000369137, 
ENST00000369134, 		ENST00000521654, 
ENST00000560949, ENST00000454842, 
ENST00000368414, ENST00000359704, 
ENST00000275184, 
Fusion gene scores* DoF score9 X 4 X 6=2165 X 6 X 6=180
# samples 1011
** MAII scorelog2(10/216*10)=-1.11103131238874
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(11/180*10)=-0.710493382805015
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: GRIK2 [Title/Abstract] AND RNF217 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointGRIK2(102376507)-RNF217(125366357), # samples:3
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID

check buttonFusion gene breakpoints across GRIK2 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.

check buttonFusion gene breakpoints across RNF217 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4SARCTCGA-HB-A3YV-01AGRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
ChimerDB4SARCTCGA-HB-A3YVGRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
ChimerDB4SARCTCGA-X9-A971-01AGRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
ChimerDB4SARCTCGA-HB-A3YV-01AGRIK2chr6

102376507

-RNF217chr6

125366357

+


Top

Fusion Gene ORF analysis for GRIK2-RNF217

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000413795ENST00000521654GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000413795ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-3UTRENST00000413795ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000413795ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000413795ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-intronENST00000413795ENST00000275184GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000369138ENST00000521654GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000369138ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-3UTRENST00000369138ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000369138ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000369138ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-intronENST00000369138ENST00000275184GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000421544ENST00000521654GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000421544ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-3UTRENST00000421544ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000421544ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000421544ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-intronENST00000421544ENST00000275184GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
intron-3CDSENST00000358361ENST00000521654GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
intron-3CDSENST00000358361ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
intron-3UTRENST00000358361ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
intron-5UTRENST00000358361ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
intron-5UTRENST00000358361ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
intron-intronENST00000358361ENST00000275184GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000318991ENST00000521654GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000318991ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-3UTRENST00000318991ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000318991ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000318991ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-intronENST00000318991ENST00000275184GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000369137ENST00000521654GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000369137ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-3UTRENST00000369137ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000369137ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000369137ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-intronENST00000369137ENST00000275184GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000369134ENST00000521654GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000369134ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-3UTRENST00000369134ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000369134ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-5UTRENST00000369134ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
5CDS-intronENST00000369134ENST00000275184GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366357

+
In-frameENST00000413795ENST00000521654GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
In-frameENST00000413795ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

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125366356

+
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102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-5UTRENST00000413795ENST00000368414GRIK2chr6

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+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-5UTRENST00000413795ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-intronENST00000413795ENST00000275184GRIK2chr6

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+
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+
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+RNF217chr6

125366356

+
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102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-5UTRENST00000369138ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
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+
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125366356

+
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102376507

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+
In-frameENST00000421544ENST00000560949GRIK2chr6

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125366356

+
5CDS-3UTRENST00000421544ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-5UTRENST00000421544ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-5UTRENST00000421544ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
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102376507

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+
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125366356

+
intron-3CDSENST00000358361ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

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125366356

+
intron-3UTRENST00000358361ENST00000454842GRIK2chr6

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125366356

+
intron-5UTRENST00000358361ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
intron-5UTRENST00000358361ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
intron-intronENST00000358361ENST00000275184GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
In-frameENST00000318991ENST00000521654GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
In-frameENST00000318991ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-3UTRENST00000318991ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-5UTRENST00000318991ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-5UTRENST00000318991ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-intronENST00000318991ENST00000275184GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
In-frameENST00000369137ENST00000521654GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
In-frameENST00000369137ENST00000560949GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-3UTRENST00000369137ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
5CDS-5UTRENST00000369137ENST00000368414GRIK2chr6

102376507

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125366356

+
5CDS-5UTRENST00000369137ENST00000359704GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

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+
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102376507

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125366356

+
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102376507

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125366356

+
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102376507

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125366356

+
5CDS-3UTRENST00000369134ENST00000454842GRIK2chr6

102376507

+RNF217chr6

125366356

+
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102376507

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125366356

+
5CDS-5UTRENST00000369134ENST00000359704GRIK2chr6

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125366356

+
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102376507

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125366356

+

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000413795GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366357+1301825753913321976
ENST00000413795GRIK2chr6102376507+ENST00000560949RNF217chr6125366357+410325753913321976
ENST00000369138GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366357+1301825753913321976
ENST00000369138GRIK2chr6102376507+ENST00000560949RNF217chr6125366357+410325753913321976
ENST00000421544GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366357+1301825753913321976
ENST00000421544GRIK2chr6102376507+ENST00000560949RNF217chr6125366357+410325753913321976
ENST00000318991GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366357+12528208502831943
ENST00000318991GRIK2chr6102376507+ENST00000560949RNF217chr6125366357+3613208502831943
ENST00000369137GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366357+12300185702603867
ENST00000369137GRIK2chr6102376507+ENST00000560949RNF217chr6125366357+3385185702603867
ENST00000369134GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366357+1253120881502834894
ENST00000369134GRIK2chr6102376507+ENST00000560949RNF217chr6125366357+361620881502834894
ENST00000413795GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366356+1301825753913321976
ENST00000413795GRIK2chr6102376507+ENST00000560949RNF217chr6125366356+410325753913321976
ENST00000369138GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366356+1301825753913321976
ENST00000369138GRIK2chr6102376507+ENST00000560949RNF217chr6125366356+410325753913321976
ENST00000421544GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366356+1301825753913321976
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ENST00000318991GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366356+12528208502831943
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ENST00000369134GRIK2chr6102376507+ENST00000521654RNF217chr6125366356+1253120881502834894
ENST00000369134GRIK2chr6102376507+ENST00000560949RNF217chr6125366356+361620881502834894

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000413795ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+3.19E-050.99996805
ENST00000413795ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+0.0001743820.99982566
ENST00000369138ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+3.19E-050.99996805
ENST00000369138ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+0.0001743820.99982566
ENST00000421544ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+3.19E-050.99996805
ENST00000421544ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+0.0001743820.99982566
ENST00000318991ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+2.82E-050.99997175
ENST00000318991ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+0.0001330890.99986684
ENST00000369137ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+4.91E-050.9999509
ENST00000369137ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+0.0002673690.9997327
ENST00000369134ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+0.0002521860.9997478
ENST00000369134ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366357+0.0005632040.9994368
ENST00000413795ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+3.19E-050.99996805
ENST00000413795ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.0001743820.99982566
ENST00000369138ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+3.19E-050.99996805
ENST00000369138ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.0001743820.99982566
ENST00000421544ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+3.19E-050.99996805
ENST00000421544ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.0001743820.99982566
ENST00000318991ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+2.82E-050.99997175
ENST00000318991ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.0001330890.99986684
ENST00000369137ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+4.91E-050.9999509
ENST00000369137ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.0002673690.9997327
ENST00000369134ENST00000521654GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.0002521860.9997478
ENST00000369134ENST00000560949GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.0005632040.9994368

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Fusion Genomic Features for GRIK2-RNF217


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)
GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.004756130.99524385
GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.004756130.99524385
GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.004756130.99524385
GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.004756130.99524385
GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.004756130.99524385
GRIK2chr6102376507+RNF217chr6125366356+0.004756130.99524385

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

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Fusion Protein Features for GRIK2-RNF217


check button Go to

FGviewer for the breakpoints of chr6:102376507-chr6:125366357

.
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
GRIK2

Q13002

.
FUNCTION: Ionotropic glutamate receptor. L-glutamate acts as an excitatory neurotransmitter at many synapses in the central nervous system. Binding of the excitatory neurotransmitter L-glutamate induces a conformation change, leading to the opening of the cation channel, and thereby converts the chemical signal to an electrical impulse. The receptor then desensitizes rapidly and enters a transient inactive state, characterized by the presence of bound agonist (PubMed:28180184). Modulates cell surface expression of NETO2 (By similarity). {ECO:0000250|UniProtKB:P39087, ECO:0000269|PubMed:28180184}.; FUNCTION: Independent of its ionotropic glutamate receptor activity, acts as a thermoreceptor conferring sensitivity to cold temperatures (PubMed:31474366). Functions in dorsal root ganglion neurons (By similarity). {ECO:0000250|UniProtKB:P39087, ECO:0000269|PubMed:31474366}.FUNCTION: Might normally function as a transcriptional repressor. EWS-fusion-proteins (EFPS) may play a role in the tumorigenic process. They may disturb gene expression by mimicking, or interfering with the normal function of CTD-POLII within the transcription initiation complex. They may also contribute to an aberrant activation of the fusion protein target genes.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneGRIK2chr6:102376507chr6:125366356ENST00000318991+1316516_518695.0870.0RegionGlutamate binding
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HgeneGRIK2chr6:102376507chr6:125366356ENST00000369137+1215516_518619.0833.0RegionGlutamate binding
HgeneGRIK2chr6:102376507chr6:125366356ENST00000369138+1317516_518695.01270.3333333333333RegionGlutamate binding
HgeneGRIK2chr6:102376507chr6:125366356ENST00000369138+1317689_690695.01270.3333333333333RegionGlutamate binding
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HgeneGRIK2chr6:102376507chr6:125366357ENST00000369138+1317689_690695.01270.3333333333333RegionGlutamate binding
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- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
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Fusion Gene Sequence for GRIK2-RNF217


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>In-frame_ENST00000413795_ENST00000521654_TCGA-HB-A3YV-01A_GRIK2_chr6_102376507_+_RNF217_chr6_125366357_length(transcript)=13018nt_BP=2575nt
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CTCCTCTGCTTTCACAGGCTCGCGCGGCCGGACATTGTGGGTGTGCGTGCTGGATTTCTCCCGGATGCTCTCCGACTAACATGGATGTCC
CACCATTCCTTGCAGTGGAAGGTTGTTCCTTGGCGCAGTGAGTGAAGAACATGCAGCGATTGCTAATGGGTTTGGGAAGCGGAGACTCCT
TCCTCTCTCTATGACCATGCCGTGATCGTGTCTGCGGTCACCACTCGACGCATCCTCATTTCTACCCGAACCCAGGAGCCGAACGCTAGA
TCGGGGAAGTGGGTGCCGTGCGTGTGGGCACAGAAACACCATGAAGATTATTTTCCCGATTCTAAGTAATCCAGTCTTCAGGCGCACCGT
TAAACTCCTGCTCTGTTTACTGTGGATTGGATATTCTCAAGGAACCACACATGTATTAAGATTTGGTGGTATTTTTGAATATGTGGAATC
TGGCCCAATGGGAGCTGAGGAACTTGCATTCAGATTTGCTGTGAACACAATTAACAGAAACAGAACATTGCTACCCAATACTACCCTTAC
CTATGATACCCAGAAGATAAACCTTTATGATAGTTTTGAAGCATCCAAGAAAGCCTGTGATCAGCTGTCTCTTGGGGTGGCTGCCATCTT
CGGGCCTTCACACAGCTCATCAGCAAACGCAGTGCAGTCCATCTGCAATGCTCTGGGAGTTCCCCACATACAGACCCGCTGGAAGCACCA
GGTGTCAGACAACAAAGATTCCTTCTATGTCAGTCTCTACCCAGACTTCTCTTCACTCAGCCGTGCCATTTTAGACCTGGTGCAGTTTTT
CAAGTGGAAAACCGTCACGGTTGTGTATGATGACAGCACTGGTCTCATTCGTTTGCAAGAGCTCATCAAAGCTCCATCAAGGTATAATCT
TCGACTCAAAATTCGTCAGTTACCTGCTGATACAAAGGATGCAAAACCCTTACTAAAAGAAATGAAAAGAGGCAAGGAGTTTCATGTAAT
CTTTGATTGTAGCCATGAAATGGCAGCAGGCATTTTAAAACAGGCATTAGCTATGGGAATGATGACAGAATACTATCATTATATCTTTAC
CACTCTGGACCTCTTTGCTCTTGATGTTGAGCCCTACCGATACAGTGGTGTTAACATGACAGGGTTCAGAATATTAAATACAGAAAATAC
CCAAGTCTCCTCCATCATTGAAAAGTGGTCGATGGAACGATTGCAGGCACCTCCGAAACCCGATTCAGGTTTGCTGGATGGATTTATGAC
GACTGATGCTGCTCTAATGTATGATGCTGTGCATGTGGTGTCTGTGGCCGTTCAACAGTTTCCCCAGATGACAGTCAGTTCCTTGCAGTG
TAATCGACATAAACCCTGGCGCTTCGGGACCCGCTTTATGAGTCTAATTAAAGAGGCACATTGGGAAGGCCTCACAGGCAGAATAACTTT
CAACAAAACCAATGGCTTGAGAACAGATTTTGATTTGGATGTGATCAGTCTGAAGGAAGAAGGTCTAGAAAAGATTGGAACGTGGGATCC
AGCCAGTGGCCTGAATATGACAGAAAGTCAAAAGGGAAAGCCAGCGAACATCACAGATTCCTTATCCAATCGTTCTTTGATTGTTACCAC
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ATGGAATGGAATGGTTCGTGAACTAATTGATCATAAAGCTGACCTTGCAGTTGCTCCACTGGCTATTACCTATGTTCGAGAGAAGGTCAT
CGACTTTTCCAAGCCCTTTATGACACTTGGAATAAGTATTTTGTACCGCAAGCCCAATGGTACAAACCCAGGCGTCTTCTCCTTCCTGAA
TCCTCTCTCCCCTGATATCTGGATGTATATTCTGCTGGCTTACTTGGGTGTCAGTTGTGTGCTCTTTGTCATAGCCAGGTTTAGTCCTTA
TGAGTGGTATAATCCACACCCTTGCAACCCTGACTCAGACGTGGTGGAAAACAATTTTACCTTGCTAAATAGTTTCTGGTTTGGAGTTGG
AGCTCTCATGCAGCAAGGTTCTGAGCTCATGCCCAAAGCACTGTCCACCAGGATAGTGGGAGGCATTTGGTGGTTTTTCACACTTATCAT
CATTTCTTCGTATACTGCTAACTTAGCCGCCTTTCTGACAGTGGAACGCATGGAATCCCCTATTGACTCTGCTGATGATTTAGCTAAACA
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CAAGGAGTACAAAAAAGGAGACAAATTGTTGCGTCACTGGGCCAGCGAAATTGAGCATGGGCAGAGGAATGCCCAGAAGTGTCCAAAGTG
CAAGATCCACATCCAGCGAACTGAAGGATGTGACCATATGACCTGCTCACAATGTAACACTAATTTTTGTTACCGATGTGGTGAGAGATA
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TGTAATCGGTTTATTTGTATTTCCTATCTATTGCCTTTGTAAAAAACAGAGAAAACGATCACGGACAGGTATGCACTGGTAACATGCAGA
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TTGGGCTCCAGAGTGTAAGAATATTTTATTTTTTGTTTGACATAAAAAGTGAAGTTGACTTGCGTGAATAACAATCCAGCATGCTTTCAT
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CGACTTTTCCAAGCCCTTTATGACACTTGGAATAAGTATTTTGTACCGCAAGCCCAATGGTACAAACCCAGGCGTCTTCTCCTTCCTGAA
TCCTCTCTCCCCTGATATCTGGATGTATATTCTGCTGGCTTACTTGGGTGTCAGTTGTGTGCTCTTTGTCATAGCCAGGTTTAGTCCTTA
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AGCTCTCATGCAGCAAGGTTCTGAGCTCATGCCCAAAGCACTGTCCACCAGGATAGTGGGAGGCATTTGGTGGTTTTTCACACTTATCAT
CATTTCTTCGTATACTGCTAACTTAGCCGCCTTTCTGACAGTGGAACGCATGGAATCCCCTATTGACTCTGCTGATGATTTAGCTAAACA
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TGGCCGTATTGATTCCAGCACCAAGCCATGTCCTCAGTGCAAGCACTTTACAACCTTCAAGAAAAAAGGACATATTCCCACCCCTTCCAG
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CTTTGATTGTAGCCATGAAATGGCAGCAGGCATTTTAAAACAGGCATTAGCTATGGGAATGATGACAGAATACTATCATTATATCTTTAC
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CGACTTTTCCAAGCCCTTTATGACACTTGGAATAAGTATTTTGTACCGCAAGCCCAATGGTACAAACCCAGGCGTCTTCTCCTTCCTGAA
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TGAGTGGTATAATCCACACCCTTGCAACCCTGACTCAGACGTGGTGGAAAACAATTTTACCTTGCTAAATAGTTTCTGGTTTGGAGTTGG
AGCTCTCATGCAGCAAGGTTCTGAGCTCATGCCCAAAGCACTGTCCACCAGGATAGTGGGAGGCATTTGGTGGTTTTTCACACTTATCAT
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AGCTTGGGAAATATTCTTAGTAATCCAATCAAATCCTTAAAAACAGCATTTTTGTGAATGTATTACTTCTTCAATATCCCCATATATTTG
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GTGAACACAATTAACAGAAACAGAACATTGCTACCCAATACTACCCTTACCTATGATACCCAGAAGATAAACCTTTATGATAGTTTTGAA
GCATCCAAGAAAGCCTGTGATCAGCTGTCTCTTGGGGTGGCTGCCATCTTCGGGCCTTCACACAGCTCATCAGCAAACGCAGTGCAGTCC
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CCAGACTTCTCTTCACTCAGCCGTGCCATTTTAGACCTGGTGCAGTTTTTCAAGTGGAAAACCGTCACGGTTGTGTATGATGACAGCACT
GGTCTCATTCGTTTGCAAGAGCTCATCAAAGCTCCATCAAGGTATAATCTTCGACTCAAAATTCGTCAGTTACCTGCTGATACAAAGGAT
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CAGGCATTAGCTATGGGAATGATGACAGAATACTATCATTATATCTTTACCACTCTGGACCTCTTTGCTCTTGATGTTGAGCCCTACCGA
TACAGTGGTGTTAACATGACAGGGTTCAGAATATTAAATACAGAAAATACCCAAGTCTCCTCCATCATTGAAAAGTGGTCGATGGAACGA
TTGCAGGCACCTCCGAAACCCGATTCAGGTTTGCTGGATGGATTTATGACGACTGATGCTGCTCTAATGTATGATGCTGTGCATGTGGTG
TCTGTGGCCGTTCAACAGTTTCCCCAGATGACAGTCAGTTCCTTGCAGTGTAATCGACATAAACCCTGGCGCTTCGGGACCCGCTTTATG
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TCCAGGCCATCTTGTGAGACTTGGTGTTAATAGCTGAAGTCCTATCTGTACCAACAAGCAAGGCCACTTTTCAGAAGATAAGAGTTCACT
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GCACGCCTCTTCTGAGAATTGCTTGGACTGTCTTTGAACTCTGCACCTCCTTCCAGGCCATCTTGTGAGACTTGGTGTTAATAGCTGAAG
TCCTATCTGTACCAACAAGCAAGGCCACTTTTCAGAAGATAAGAGTTCACTGAATGCACCTATTATAATCTGTGGCCCCAGCAGTATAAT
TCTTTTATCTTTCAAATGTTATAATTGCAAAAAATCTCAATGTCCAAAAGGGAATGAGTGAAACTAAATTAATGAGAAGAATATTAAGTT
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ATGCCGCTACACTATTTTTCCACATTTTCATAGACCTATTGAAAGATGATGGCTCCTTTGTGGACATAATTTAGCAATGTATTAAATTAA
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TATATAAAACCATTTACCTTGACAAGGACAATCTGTTACAGATTTTTAATATGAAAATTGACAATTTTGTTGCTTTTAGAAGCAATTAAC
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AGCAATTGGCAAATCCAGAATGTTAAACCCGGTCTAGCTCCAAATAAATGTTATATATAAGGGTAGAGAGTAAAGAAGAATACCACTGTT
CTTCTCCACATACACAGAAGGAATCTAGGTGGTATTTTTGAATATGTGGAATCTGGCCCAATGGGAGCTGAGGAACTTGCATTCAGATTT
GCTGTGAACACAATTAACAGAAACAGAACATTGCTACCCAATACTACCCTTACCTATGATACCCAGAAGATAAACCTTTATGATAGTTTT
GAAGCATCCAAGAAAGCCTGTGATCAGCTGTCTCTTGGGGTGGCTGCCATCTTCGGGCCTTCACACAGCTCATCAGCAAACGCAGTGCAG
TCCATCTGCAATGCTCTGGGAGTTCCCCACATACAGACCCGCTGGAAGCACCAGGTGTCAGACAACAAAGATTCCTTCTATGTCAGTCTC
TACCCAGACTTCTCTTCACTCAGCCGTGCCATTTTAGACCTGGTGCAGTTTTTCAAGTGGAAAACCGTCACGGTTGTGTATGATGACAGC
ACTGGTCTCATTCGTTTGCAAGAGCTCATCAAAGCTCCATCAAGGTATAATCTTCGACTCAAAATTCGTCAGTTACCTGCTGATACAAAG
GATGCAAAACCCTTACTAAAAGAAATGAAAAGAGGCAAGGAGTTTCATGTAATCTTTGATTGTAGCCATGAAATGGCAGCAGGCATTTTA
AAACAGGCATTAGCTATGGGAATGATGACAGAATACTATCATTATATCTTTACCACTCTGGACCTCTTTGCTCTTGATGTTGAGCCCTAC
CGATACAGTGGTGTTAACATGACAGGGTTCAGAATATTAAATACAGAAAATACCCAAGTCTCCTCCATCATTGAAAAGTGGTCGATGGAA
CGATTGCAGGCACCTCCGAAACCCGATTCAGGTTTGCTGGATGGATTTATGACGACTGATGCTGCTCTAATGTATGATGCTGTGCATGTG
GTGTCTGTGGCCGTTCAACAGTTTCCCCAGATGACAGTCAGTTCCTTGCAGTGTAATCGACATAAACCCTGGCGCTTCGGGACCCGCTTT
ATGAGTCTAATTAAAGAGGCACATTGGGAAGGCCTCACAGGCAGAATAACTTTCAACAAAACCAATGGCTTGAGAACAGATTTTGATTTG
GATGTGATCAGTCTGAAGGAAGAAGGTCTAGAAAAGATTGGAACGTGGGATCCAGCCAGTGGCCTGAATATGACAGAAAGTCAAAAGGGA
AAGCCAGCGAACATCACAGATTCCTTATCCAATCGTTCTTTGATTGTTACCACCATTTTGGAAGAGCCTTATGTCCTTTTTAAGAAGTCT
GACAAACCTCTCTATGGTAATGATCGATTTGAAGGCTATTGCATTGATCTCCTCAGAGAGTTATCTACAATCCTTGGCTTTACATATGAA
ATTAGACTTGTGGAAGATGGGAAATATGGAGCCCAGGATGATGCCAATGGACAATGGAATGGAATGGTTCGTGAACTAATTGATCATAAA
GCTGACCTTGCAGTTGCTCCACTGGCTATTACCTATGTTCGAGAGAAGGTCATCGACTTTTCCAAGCCCTTTATGACACTTGGAATAAGT
ATTTTGTACCGCAAGCCCAATGGTACAAACCCAGGCGTCTTCTCCTTCCTGAATCCTCTCTCCCCTGATATCTGGATGTATATTCTGCTG
GCTTACTTGGGTGTCAGTTGTGTGCTCTTTGTCATAGCCAGGTTTAGTCCTTATGAGTGGTATAATCCACACCCTTGCAACCCTGACTCA
GACGTGGTGGAAAACAATTTTACCTTGCTAAATAGTTTCTGGTTTGGAGTTGGAGCTCTCATGCAGCAAGGTTCTGAGCTCATGCCCAAA
GCACTGTCCACCAGGATAGTGGGAGGCATTTGGTGGTTTTTCACACTTATCATCATTTCTTCGTATACTGCTAACTTAGCCGCCTTTCTG
ACAGTGGAACGCATGGAATCCCCTATTGACTCTGCTGATGATTTAGCTAAACAAACCAAGATAGAATATGGAGCAGTAGAGGATGGTGCA
ACCATGACTTTTTTCAAGGTACAACTTGGCCAAGTAGAAATCAAATGCCCCATCACAGAGTGTTTTGAATTCTTGGAAGAAACAACTGTT
GTCTATAACTTAACGCATGAAGACTCCATCAAGTATAAGTACTTCTTGGAACTTGGCCGTATTGATTCCAGCACCAAGCCATGTCCTCAG
TGCAAGCACTTTACAACCTTCAAGAAAAAAGGACATATTCCCACCCCTTCCAGATCAGAAAGCAAATACAAAATCCAGTGCCCTACCTGC
CAATTCGTCTGGTGTTTTAAGTGCCACTCTCCTTGGCATGAAGGTGTTAACTGCAAGGAGTACAAAAAAGGAGACAAATTGTTGCGTCAC
TGGGCCAGCGAAATTGAGCATGGGCAGAGGAATGCCCAGAAGTGTCCAAAGTGCAAGATCCACATCCAGCGAACTGAAGGATGTGACCAT
ATGACCTGCTCACAATGTAACACTAATTTTTGTTACCGATGTGGTGAGAGATACCGCCAGCTCCGATTTTTTGGAGACCACACATCAAAC
CTCAGTATATTTGGATGCAAATATCGCTACCTCCCAGAGAGACCTCATTTAAGGAGATTAGTGCGAGGGTCAGTCTGTGCTGGAAAATTA
TTCATTGCACCTCTAATTATGGTTTTGGGATTGGCACTAGGGGCCATAGCGGTTGTAATCGGTTTATTTGTATTTCCTATCTATTGCCTT
TGTAAAAAACAGAGAAAACGATCACGGACAGGTATGCACTGGTAACATGCAGATGATTTCATCCAGCTAAGCTGGTTGGAGTAGGAGCGA
TACCAAAGGGTACACCCATCTGTGAGTCACATCTTGAAAAACACTGAGAGGAACCTTCTACCATCTCATCTCCCAGTGATTCTCCGTGGG
CCACAATGCCTCTAGCTATGGTGCACTCCCAACATGGTATCCTGTCCTTTCCCTAAACAAATTGCTGCTGCTTTTAAAAAATGGTCACTT
TCATAAACTATAAACATCTATATCATAACTCTGACCTTTGTGGTTCTTGGAAGAAGATATTTTAAGAACCAGTTATCCTAAGAATTCTGA
GCACGCCTCTTCTGAGAATTGCTTGGACTGTCTTTGAACTCTGCACCTCCTTCCAGGCCATCTTGTGAGACTTGGTGTTAATAGCTGAAG
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TCTTTTATCTTTCAAATGTTATAATTGCAAAAAATCTCAATGTCCAAAAGGGAATGAGTGAAACTAAATTAATGAGAAGAATATTAAGTT
ACTGAAGTGTATATGCGTAGGGGCGTGAATGTGTGTGTATATAAATATGTATTAAAACTAGGCCCAGTAACCTTGTACTTACCCAGTTCC
ATGCCGCTACACTATTTTTCCACATTTTCATAGACCTATTGAAAGATGATGGCTCCTTTGTGGACATAATTTAGCAATGTATTAAATTAA

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Fusion Gene PPI Analysis for GRIK2-RNF217


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for GRIK2-RNF217


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status
HgeneGRIK2Q13002DB00849MethylphenobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved
HgeneGRIK2Q13002DB00849MethylphenobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved
HgeneGRIK2Q13002DB00237ButabarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Illicit
HgeneGRIK2Q13002DB00237ButabarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Illicit
HgeneGRIK2Q13002DB00241ButalbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Illicit
HgeneGRIK2Q13002DB00241ButalbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Illicit
HgeneGRIK2Q13002DB00306TalbutalAntagonistSmall moleculeApproved|Illicit
HgeneGRIK2Q13002DB00306TalbutalAntagonistSmall moleculeApproved|Illicit
HgeneGRIK2Q13002DB01351AmobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Illicit
HgeneGRIK2Q13002DB01351AmobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Illicit
HgeneGRIK2Q13002DB01353ButobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Illicit
HgeneGRIK2Q13002DB01353ButobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Illicit
HgeneGRIK2Q13002DB01174PhenobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Investigational
HgeneGRIK2Q13002DB01174PhenobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Investigational
HgeneGRIK2Q13002DB00312PentobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Investigational|Vet_approved
HgeneGRIK2Q13002DB00312PentobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Investigational|Vet_approved
HgeneGRIK2Q13002DB00142Glutamic acidSmall moleculeApproved|Nutraceutical
HgeneGRIK2Q13002DB00142Glutamic acidSmall moleculeApproved|Nutraceutical
HgeneGRIK2Q13002DB00418SecobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Vet_approved
HgeneGRIK2Q13002DB00418SecobarbitalAntagonistSmall moleculeApproved|Vet_approved
HgeneGRIK2Q13002DB00599ThiopentalAntagonistSmall moleculeApproved|Vet_approved
HgeneGRIK2Q13002DB00599ThiopentalAntagonistSmall moleculeApproved|Vet_approved
HgeneGRIK2Q13002DB00794PrimidoneAntagonistSmall moleculeApproved|Vet_approved
HgeneGRIK2Q13002DB00794PrimidoneAntagonistSmall moleculeApproved|Vet_approved

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Related Diseases for GRIK2-RNF217


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneGRIK2C0005586Bipolar Disorder3CTD_human;PSYGENET
HgeneGRIK2C0004352Autistic Disorder2CTD_human
HgeneGRIK2C0005587Depression, Bipolar1CTD_human
HgeneGRIK2C0006142Malignant neoplasm of breast1CTD_human;UNIPROT
HgeneGRIK2C0007102Malignant tumor of colon1CTD_human
HgeneGRIK2C0007131Non-Small Cell Lung Carcinoma1CTD_human
HgeneGRIK2C0009375Colonic Neoplasms1CTD_human
HgeneGRIK2C0013146Drug abuse1CTD_human
HgeneGRIK2C0013170Drug habituation1CTD_human
HgeneGRIK2C0013222Drug Use Disorders1CTD_human
HgeneGRIK2C0014859Esophageal Neoplasms1CTD_human
HgeneGRIK2C0016722Frigidity1CTD_human
HgeneGRIK2C0017636Glioblastoma1CTD_human
HgeneGRIK2C0020594Hypoactive Sexual Desire Disorder1CTD_human
HgeneGRIK2C0023903Liver neoplasms1CTD_human
HgeneGRIK2C0024232Lymphatic Metastasis1CTD_human
HgeneGRIK2C0024713Manic Disorder1CTD_human
HgeneGRIK2C0029231Organic Mental Disorders, Substance-Induced1CTD_human
HgeneGRIK2C0029261Orgasmic Disorder1CTD_human
HgeneGRIK2C0033953Psychosexual Disorders1CTD_human
HgeneGRIK2C0036341Schizophrenia1CTD_human
HgeneGRIK2C0036902Sexual Arousal Disorder1CTD_human
HgeneGRIK2C0038580Substance Dependence1CTD_human
HgeneGRIK2C0038586Substance Use Disorders1CTD_human
HgeneGRIK2C0236969Substance-Related Disorders1CTD_human
HgeneGRIK2C0334588Giant Cell Glioblastoma1CTD_human
HgeneGRIK2C0338831Manic1CTD_human
HgeneGRIK2C0345904Malignant neoplasm of liver1CTD_human
HgeneGRIK2C0525045Mood Disorders1PSYGENET
HgeneGRIK2C0546837Malignant neoplasm of esophagus1CTD_human
HgeneGRIK2C0678222Breast Carcinoma1CTD_human
HgeneGRIK2C0740858Substance abuse problem1CTD_human
HgeneGRIK2C0919267ovarian neoplasm1CTD_human
HgeneGRIK2C1140680Malignant neoplasm of ovary1CTD_human
HgeneGRIK2C1257931Mammary Neoplasms, Human1CTD_human
HgeneGRIK2C1458155Mammary Neoplasms1CTD_human
HgeneGRIK2C1510472Drug Dependence1CTD_human
HgeneGRIK2C1621958Glioblastoma Multiforme1CTD_human
HgeneGRIK2C1970198MENTAL RETARDATION, AUTOSOMAL RECESSIVE 61CTD_human;GENOMICS_ENGLAND
HgeneGRIK2C4316881Prescription Drug Abuse1CTD_human
HgeneGRIK2C4704874Mammary Carcinoma, Human1CTD_human