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Fusion Gene Summary

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Fusion gene:LTBP1-YIPF4 (FusionGDB2 ID:50027)

Fusion Gene Summary for LTBP1-YIPF4

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: LTBP1-YIPF4
Fusion gene ID: 50027
HgeneTgene
Gene symbol

LTBP1

YIPF4

Gene ID

4052

84272

Gene namelatent transforming growth factor beta binding protein 1Yip1 domain family member 4
Synonyms-FinGER4|Nbla11189
Cytomap

2p22.3

2p22.3

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionlatent-transforming growth factor beta-binding protein 1LTBP-1TGF-beta1-BP-1transforming growth factor beta-1-binding protein 1protein YIPF4YIP1 family member 4putative protein product of Nbla11189
Modification date2020032920200313
UniProtAcc..
Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000404816, ENST00000354476, 
ENST00000390003, ENST00000418533, 
ENST00000402934, ENST00000404525, 
ENST00000407925, ENST00000272273, 
ENST00000498013, 		ENST00000238831, 
Fusion gene scores* DoF score19 X 16 X 9=27365 X 6 X 5=150
# samples 297
** MAII scorelog2(29/2736*10)=-3.23794342487096
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(7/150*10)=-1.09953567355091
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: LTBP1 [Title/Abstract] AND YIPF4 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointLTBP1(33413918)-YIPF4(32526451), # samples:2
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneLTBP1

GO:0035583

sequestering of TGFbeta in extracellular matrix

2022183|8617200

HgeneLTBP1

GO:1901388

regulation of transforming growth factor beta activation

2022183|8617200


check buttonFusion gene breakpoints across LTBP1 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.

check buttonFusion gene breakpoints across YIPF4 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4STADTCGA-BR-A4QILTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526450

+
ChimerDB4STADTCGA-BR-A4QI-01ALTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526451

+
ChimerDB4STADTCGA-BR-A4QI-01ALTBP1chr2

33413918

-YIPF4chr2

32526451

+


Top

Fusion Gene ORF analysis for LTBP1-YIPF4

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000404816ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526450

+
In-frameENST00000354476ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526450

+
In-frameENST00000390003ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526450

+
In-frameENST00000418533ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526450

+
In-frameENST00000402934ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526450

+
In-frameENST00000404525ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526450

+
In-frameENST00000407925ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526450

+
intron-3CDSENST00000272273ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526450

+
intron-3CDSENST00000498013ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526450

+
In-frameENST00000404816ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526451

+
In-frameENST00000354476ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526451

+
In-frameENST00000390003ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526451

+
In-frameENST00000418533ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526451

+
In-frameENST00000402934ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526451

+
In-frameENST00000404525ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526451

+
In-frameENST00000407925ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526451

+
intron-3CDSENST00000272273ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526451

+
intron-3CDSENST00000498013ENST00000238831LTBP1chr2

33413918

+YIPF4chr2

32526451

+

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000404816LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526450+132742054322305757
ENST00000354476LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526450+129441724111975654
ENST00000390003LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526450+120848641411115324
ENST00000418533LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526450+120848641411115324
ENST00000402934LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526450+120568361131087324
ENST00000404525LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526450+12042822991073324
ENST00000407925LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526450+12024804811055324
ENST00000404816LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526451+132742054322305757
ENST00000354476LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526451+129441724111975654
ENST00000390003LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526451+120848641411115324
ENST00000418533LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526451+120848641411115324
ENST00000402934LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526451+120568361131087324
ENST00000404525LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526451+12042822991073324
ENST00000407925LTBP1chr233413918+ENST00000238831YIPF4chr232526451+12024804811055324

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000404816ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+0.000873850.99912614
ENST00000354476ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+0.0008138080.9991862
ENST00000390003ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+0.0003210750.99967897
ENST00000418533ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+0.0003210750.99967897
ENST00000402934ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+0.0003114220.9996886
ENST00000404525ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+0.0003089660.999691
ENST00000407925ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+0.0003102340.9996898
ENST00000404816ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526451+0.000873850.99912614
ENST00000354476ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526451+0.0008138080.9991862
ENST00000390003ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526451+0.0003210750.99967897
ENST00000418533ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526451+0.0003210750.99967897
ENST00000402934ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526451+0.0003114220.9996886
ENST00000404525ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526451+0.0003089660.999691
ENST00000407925ENST00000238831LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526451+0.0003102340.9996898

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Fusion Genomic Features for LTBP1-YIPF4


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)
LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+1.40E-050.99998593
LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+1.40E-050.99998593
LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+1.40E-050.99998593
LTBP1chr233413918+YIPF4chr232526450+1.40E-050.99998593

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

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Fusion Protein Features for LTBP1-YIPF4


check button Go to

FGviewer for the breakpoints of chr2:33413918-chr2:32526450

.
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
..
FUNCTION: Might normally function as a transcriptional repressor. EWS-fusion-proteins (EFPS) may play a role in the tumorigenic process. They may disturb gene expression by mimicking, or interfering with the normal function of CTD-POLII within the transcription initiation complex. They may also contribute to an aberrant activation of the fusion protein target genes.FUNCTION: Might normally function as a transcriptional repressor. EWS-fusion-proteins (EFPS) may play a role in the tumorigenic process. They may disturb gene expression by mimicking, or interfering with the normal function of CTD-POLII within the transcription initiation complex. They may also contribute to an aberrant activation of the fusion protein target genes.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000354476+734100_130567.01723.0Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000390003+330100_130241.01397.0Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000404525+330100_130241.01343.0Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000404816+734100_130567.01722.0Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000407925+330100_130241.01396.0Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000354476+734100_130567.01723.0Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000390003+330100_130241.01397.0Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000404525+330100_130241.01343.0Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000404816+734100_130567.01722.0Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000407925+330100_130241.01396.0Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000354476+734187_219567.01723.0DomainEGF-like 1
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000354476+734399_431567.01723.0DomainEGF-like 2
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000390003+330187_219241.01397.0DomainEGF-like 1
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000404525+330187_219241.01343.0DomainEGF-like 1
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000404816+734187_219567.01722.0DomainEGF-like 1
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000404816+734399_431567.01722.0DomainEGF-like 2
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526450ENST00000407925+330187_219241.01396.0DomainEGF-like 1
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000354476+734187_219567.01723.0DomainEGF-like 1
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000354476+734399_431567.01723.0DomainEGF-like 2
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000390003+330187_219241.01397.0DomainEGF-like 1
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000404525+330187_219241.01343.0DomainEGF-like 1
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000404816+734187_219567.01722.0DomainEGF-like 1
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000404816+734399_431567.01722.0DomainEGF-like 2
HgeneLTBP1chr2:33413918chr2:32526451ENST00000407925+330187_219241.01396.0DomainEGF-like 1
TgeneYIPF4chr2:33413918chr2:32526450ENST0000023883136160_166161.0245.0Topological domainCytoplasmic
TgeneYIPF4chr2:33413918chr2:32526450ENST0000023883136188_195161.0245.0Topological domainExtracellular
TgeneYIPF4chr2:33413918chr2:32526450ENST0000023883136217_223161.0245.0Topological domainCytoplasmic
TgeneYIPF4chr2:33413918chr2:32526451ENST0000023883136160_166161.0245.0Topological domainCytoplasmic
TgeneYIPF4chr2:33413918chr2:32526451ENST0000023883136188_195161.0245.0Topological domainExtracellular
TgeneYIPF4chr2:33413918chr2:32526451ENST0000023883136217_223161.0245.0Topological domainCytoplasmic
TgeneYIPF4chr2:33413918chr2:32526450ENST0000023883136167_187161.0245.0TransmembraneHelical
TgeneYIPF4chr2:33413918chr2:32526450ENST0000023883136196_216161.0245.0TransmembraneHelical
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Fusion Gene Sequence for LTBP1-YIPF4


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>In-frame_ENST00000404816_ENST00000238831_TCGA-BR-A4QI_LTBP1_chr2_33413918_+_YIPF4_chr2_32526450_length(transcript)=13274nt_BP=2054nt
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CTCCCCTCGCCCCTCCCCGCTCCCCGGGCTCCGCGCTCCCCACCCCCACGCCCTCCTCCTGCTCCCAGCCACAATCGGCCGGGGTCTGGG
GCCGCTCAGCTGCCCGCAGAGCCTCCTCCCTCGCCACCGACTTGGTCTCCTCCCGCCTTTCCCGGGCTCTCGGCAGCTCTCGGGGGAGCC
CGAACGCGCGGGGAAAGGCGAGCCGCACGGCCGGGGGAGGGGGCCGGACCGCGCGCGACCGGTCGCGCCCGCTGGGGCCCGCGATGGCGG
GGGCCTGGCTCAGGTGGGGGCTCCTGCTCTGGGCAGGGCTCCTCGCGTCCTCGGCGCACGGCCGGCTGCGGAGGATCACCTACGTGGTGC
ACCCGGGCCCCGGCCTGGCAGCCGGCGCCTTGCCCCTGAGCGGGCCCCCGCGTTCGCGGACATTCAACGTCGCGCTCAACGCCAGGTACA
GCCGCAGCTCGGCGGCTGCCGGCGCCCCCAGCCGTGCCTCCCCCGGGGTCCCCTCGGAGAGGACCCGGCGCACGAGCAAGCCGGGCGGCG
CGGCCCTGCAGGGGCTCAGACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGAGCCTGCGCGTCCCGCGGTCCCCGGCGGGCAGCTCCACCCCAATCCCG
GCGGCCACCCGGCAGCCGCCCCGTTCACCAAACAAGGCAGGCAAGTTGTGCGCTCCAAGGTGCCGCAGGAGACCCAGAGCGGCGGAGGCT
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CCCAGAGGTGCACCAAACCTAGCTGTGTTCCGCCATGTCAGAATGGAGGGATGTGTCTCCGGCCACAACTCTGTGTGTGTAAACCAGGGA
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AGCCTCCCAAAGTGCCGGGATTACAGGTGTCAGCCACCGCACCAGGCCAGTTCATTAGAATTTTTAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTA
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TGCCCGGCACTTTTGTTTTTAAAATAATATCTTACTTTCATATGATTCTTTCAGACTGTGGTATGGCATTCTGAAGCAAGTCTTAACAGA
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GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGACCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGACTC
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CCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGAATCCGTCTCAAAAAAAAAAAAA
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TCACGAGGTCAGGGGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCCGGGCGTGGTAGCA
GGCGCCTGTAGTCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGCGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTAAGCAGAGATCGCGCC
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CTTATTTTGCTGGGGACTCAGCCAATTAATTTCACAAATTGTAAAACTATTTCAAGAAATGAGAAAAAGAGGCCTGTGGTGGTAAGCAAG
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CCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCATCACCACACCCGGCTAATTTTTTTGTTTTTAGTAAAGACGGTTTCTCCATGTAGGCCAAGCGG
GTCTTGAACTCCCAACCTCCGGTGATCTGCCCACCTCAACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGACACTGTGCCCAGCCTGTCA
GAGCTTTTGAGTAGAAATACGGTATCAGAAATGTGCTTTATTTTATTTTATTAGACAAAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGT
GGCGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACC
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GCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAACCACTGCGCCCAGCCAGAAACGTGCTTTTAATACTAAAGGCCAAGATATGCA
ATTATACTCTTGACATATATTCAACCGAAATGCATGTACATGTACCATAAGAGACATATGTACAAGAATGTGCACAGTTAACATTATTCA
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TGAACTAAAGCCGCATACAAAAACATGAAGAATTTCACAAGTATTATGTTGAGTGAAAAAGACAAAGAATTTGTACTGTATTACTTCATT
TATATGAAGTTCAAACACAGGCAAAATTAAGCTATAGTGTTTAGGGATGCATACTGAAATGCAGTCTTTTAAAACAGCTTTAGAATTCCT
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GAATTATACCCAATTAATTATACATGGGAAGGTGATGAAGGTAGCATGTCAAATTGGTATAAAAAGATGGAATATTAAATAAGTGGGGAT
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ATCCAAGGTTACATAATCCATAACTGATATGGCAGTTTAACAGTGTTATTAAGAACTCAAGGTCCATTTATTGCTCTATTCTGCCATCTT
TGGTGAGTGGCTTTCATCCTCATTGTCTCAGAAAAGTTATTTCACCTCTAAGTATTACATCTACATTTCAAGCAGGAAGAAGATGAAGCT
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TGCGCGCGGTGGCTCACGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCCTGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGTT
AACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAACATATAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTGAGGCAGGAG
AGTGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGGCAAGACTCCGTCTCA
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GAGGCAGGAGAGTGGCATGAACCCGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGGCAAGA
CTCCGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAATATAAAGCTGGATCTATACCTCACTCCTTATACCAAAGTACATTACCCTTGTATCAAATATTTT
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GGGATTATAAGCAGATATGATATTTCACTGATAGAGACCAGCATGACTGTCTCAATTGTTAAACTATTGAAATGCATCTGTGTCAATGGT

>In-frame_ENST00000407925_ENST00000238831_TCGA-BR-A4QI-01A_LTBP1_chr2_33413918_+_YIPF4_chr2_32526451_length(amino acids)=324AA_start in transcript=81_stop in transcript=1055
MDTKLMCLLFFFSLPPLLVSNHTGRIKVVFTPSICKVTCTKGSCQNSCEKGNTTTLISENGHAADTLTATNFRVVICHLPCMNGGQCSSR
DKCQCPPNFTGKLCQIPVHGASVPKLYQHSQQPGKALGTHVIHSTHTLPLTVTSQQGVKVKFPPNIVNIHVKHPPEASVQIHQVSRIDGP
TGQKTKEAQPGQSQVSYQGLPVQKTQTIHSTYSHQQVIPHVYPVAAKTQLGRCFQETIGSQVAYGQVLGVIGYSLLPLIVIAPVLLVVGS

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Fusion Gene PPI Analysis for LTBP1-YIPF4


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for LTBP1-YIPF4


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for LTBP1-YIPF4


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneLTBP1C0023893Liver Cirrhosis, Experimental1CTD_human
HgeneLTBP1C0409959Osteoarthritis, Knee1CTD_human