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Fusion gene:EMSY-ACER3 (FusionGDB2 ID:HG56946TG55331)

Fusion Gene Summary for EMSY-ACER3

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: EMSY-ACER3
Fusion gene ID: hg56946tg55331
HgeneTgene
Gene symbol

EMSY

ACER3

Gene ID

56946

55331

Gene nameEMSY transcriptional repressor, BRCA2 interactingalkaline ceramidase 3
SynonymsC11orf30|GL002APHC|PHCA|PLDECO
Cytomap('C11orf30','EMSY')('ACER3','ACER3')

11q13.5

11q13.5

Type of geneprotein-codingprotein-coding
DescriptionBRCA2-interacting transcriptional repressor EMSYEMSY, BRCA2 interacting transcriptional repressorprotein EMSYalkaline ceramidase 3alkCDase 3alkaline CDase 3alkaline dihydroceramidase SB89alkaline phytoceramidasephytoceramidase, alkaline
Modification date2020031320200320
UniProtAcc..
Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000334736, ENST00000343878, 
ENST00000524490, ENST00000524767, 
ENST00000525038, ENST00000525919, 
ENST00000529032, ENST00000533248, 
ENST00000525959, ENST00000533988, 
ENST00000334736, ENST00000343878, 
ENST00000524490, ENST00000524767, 
ENST00000525038, ENST00000525919, 
ENST00000525959, ENST00000529032, 
ENST00000533248, ENST00000533988, 
Fusion gene scores* DoF score9 X 10 X 4=36013 X 10 X 5=650
# samples 1415
** MAII scorelog2(14/360*10)=-1.36257007938471
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(15/650*10)=-2.11547721741994
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: EMSY [Title/Abstract] AND ACER3 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointC11orf30(76183884)-ACER3(76637600), # samples:1
C11orf30(76183884)-ACER3(76637601), # samples:1
EMSY(76183884)-ACER3(76637601), # samples:1
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.C11orf30-ACER3 seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a CGC by not retaining the major functional domain in the partially deleted in-frame ORF.
C11orf30-ACER3 seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a CGC by not retaining the major functional domain in the partially deleted in-frame ORF.
C11orf30-ACER3 seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a essential gene by not retaining the major functional domain in the partially deleted in-frame ORF.
C11orf30-ACER3 seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a essential gene by not retaining the major functional domain in the partially deleted in-frame ORF.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgeneACER3

GO:0043067

regulation of programmed cell death

20068046

TgeneACER3

GO:0046512

sphingosine biosynthetic process

20068046

TgeneACER3

GO:0046514

ceramide catabolic process

30575723

TgeneACER3

GO:0071602

phytosphingosine biosynthetic process

11356846|20068046


check buttonFusion gene breakpoints across C11orf30 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure
check buttonFusion gene breakpoints across ACER3 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4BRCATCGA-BH-A0HL-01AC11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+
ChimerDB4BRCATCGA-BH-A0HL-01AEMSYchr11

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+ACER3chr11

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+
ChimerDB4BRCATCGA-BH-A0HLC11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+


Top

Fusion Gene ORF analysis for EMSY-ACER3

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
5CDS-3UTRENST00000334736ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-3UTRENST00000334736ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-3UTRENST00000343878ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-3UTRENST00000343878ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-3UTRENST00000524490ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-3UTRENST00000524490ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-3UTRENST00000524767ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-3UTRENST00000524767ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
5CDS-3UTRENST00000525038ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
5CDS-3UTRENST00000529032ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
5CDS-3UTRENST00000533248ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000334736ENST00000526597C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000334736ENST00000538157C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000334736ENST00000538157C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+
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76183884

+ACER3chr11

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+
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+
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+ACER3chr11

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+
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76183884

+ACER3chr11

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+
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+
5CDS-5UTRENST00000524490ENST00000526597C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000524490ENST00000538157C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000524490ENST00000538157C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000524767ENST00000526597C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637600

+
5CDS-5UTRENST00000524767ENST00000538157C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
5CDS-5UTRENST00000524767ENST00000538157C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000525038ENST00000526597C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637600

+
5CDS-5UTRENST00000525038ENST00000538157C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000525038ENST00000538157C11orf30chr11

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+
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+
5CDS-5UTRENST00000525919ENST00000526597C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000525919ENST00000538157C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000525919ENST00000538157C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+
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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000529032ENST00000538157C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000529032ENST00000538157C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000533248ENST00000526597C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000533248ENST00000538157C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-5UTRENST00000533248ENST00000538157C11orf30chr11

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+
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+
5CDS-intronENST00000334736ENST00000533873C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-intronENST00000334736ENST00000544113C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
5CDS-intronENST00000334736ENST00000544113C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
5CDS-intronENST00000343878ENST00000533873C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
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+
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+
5CDS-intronENST00000525038ENST00000533873C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+
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+
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+
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76637600

+
5CDS-intronENST00000525919ENST00000544113C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+
5CDS-intronENST00000529032ENST00000533873C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+
5CDS-intronENST00000529032ENST00000544113C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
5CDS-intronENST00000529032ENST00000544113C11orf30chr11

76183884

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+
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76183884

+ACER3chr11

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+
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76183884

+ACER3chr11

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+
5CDS-intronENST00000533248ENST00000544113C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
5CDS-intronENST00000533248ENST00000544113C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637600

+
In-frameENST00000334736ENST00000532485C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
In-frameENST00000334736ENST00000532485C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637600

+
In-frameENST00000343878ENST00000532485C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
In-frameENST00000343878ENST00000532485C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637600

+
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+
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+
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+
In-frameENST00000524767ENST00000532485C11orf30chr11

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+
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+
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+
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+
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+
In-frameENST00000529032ENST00000532485C11orf30chr11

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+
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+
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+
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+
intron-3CDSENST00000525959ENST00000532485C11orf30chr11

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+
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+
intron-3CDSENST00000533988ENST00000532485C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
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+ACER3chr11

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+
intron-3UTRENST00000525959ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
intron-3UTRENST00000533988ENST00000530182C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+
intron-3UTRENST00000533988ENST00000530182C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
intron-5UTRENST00000525959ENST00000526597C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
intron-5UTRENST00000525959ENST00000526597C11orf30chr11

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+
intron-5UTRENST00000525959ENST00000538157C11orf30chr11

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+ACER3chr11

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+
intron-5UTRENST00000525959ENST00000538157C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

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+
intron-5UTRENST00000533988ENST00000526597C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
intron-5UTRENST00000533988ENST00000526597C11orf30chr11

76183884

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76637600

+
intron-5UTRENST00000533988ENST00000538157C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
intron-5UTRENST00000533988ENST00000538157C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637600

+
intron-intronENST00000525959ENST00000533873C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
intron-intronENST00000525959ENST00000533873C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637600

+
intron-intronENST00000525959ENST00000544113C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
intron-intronENST00000525959ENST00000544113C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637600

+
intron-intronENST00000533988ENST00000533873C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
intron-intronENST00000533988ENST00000533873C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637600

+
intron-intronENST00000533988ENST00000544113C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637601

+
intron-intronENST00000533988ENST00000544113C11orf30chr11

76183884

+ACER3chr11

76637600

+

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)
BP loci
(transcript)
Predicted start
(transcript)
Predicted stop
(transcript)
Seq length
(amino acids)
ENST00000524490C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637600+842512541431954603
ENST00000334736C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637600+842212511431951602
ENST00000343878C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637600+842212511431951602
ENST00000533248C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637600+83601189391889616
ENST00000525919C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637600+83211150391850603
ENST00000524767C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637600+83631192391892617
ENST00000525038C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637600+83631192391892617
ENST00000529032C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637600+8279110801808602
ENST00000524490C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637601+842512541431954603
ENST00000334736C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637601+842212511431951602
ENST00000343878C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637601+842212511431951602
ENST00000533248C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637601+83601189391889616
ENST00000525919C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637601+83211150391850603
ENST00000524767C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637601+83631192391892617
ENST00000525038C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637601+83631192391892617
ENST00000529032C11orf30chr1176183884+ENST00000532485ACER3chr1176637601+8279110801808602

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000524490ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.0014949770.998505
ENST00000334736ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.0012663390.9987337
ENST00000343878ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.0012663390.9987337
ENST00000533248ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.0015233880.99847656
ENST00000525919ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.0014865370.9985134
ENST00000524767ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.001699420.9983006
ENST00000525038ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.001699420.9983006
ENST00000529032ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.0012310560.99876887
ENST00000524490ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637601+0.0014949770.998505
ENST00000334736ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637601+0.0012663390.9987337
ENST00000343878ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637601+0.0012663390.9987337
ENST00000533248ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637601+0.0015233880.99847656
ENST00000525919ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637601+0.0014865370.9985134
ENST00000524767ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637601+0.001699420.9983006
ENST00000525038ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637601+0.001699420.9983006
ENST00000529032ENST00000532485C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637601+0.0012310560.99876887

Top

Fusion Genomic Features for EMSY-ACER3


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)
C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.0116065150.9883935
C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.0116065150.9883935
C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.0116065150.9883935
C11orf30chr1176183884+ACER3chr1176637600+0.0116065150.9883935

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.
genomic feature of top 1%

Top

Fusion Protein Features for EMSY-ACER3


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/:76183884/:76637600)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
..
FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000334736+821209_2133691323.0Compositional biasNote=Poly-Ser
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000343878+820209_2133691156.0Compositional biasNote=Poly-Ser
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000529032+720209_2133691323.0Compositional biasNote=Poly-Ser
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000334736+821209_2133691323.0Compositional biasNote=Poly-Ser
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000343878+820209_2133691156.0Compositional biasNote=Poly-Ser
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000529032+720209_2133691323.0Compositional biasNote=Poly-Ser
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000334736+82116_1003691323.0DomainENT
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000343878+82016_1003691156.0DomainENT
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000529032+72016_1003691323.0DomainENT
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000334736+82116_1003691323.0DomainENT
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000343878+82016_1003691156.0DomainENT
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000529032+72016_1003691323.0DomainENT
TgeneACER3chr11:76183884chr11:76637600ENST00000532485011109_11834268.0Topological domainLumenal
TgeneACER3chr11:76183884chr11:76637600ENST00000532485011140_14134268.0Topological domainCytoplasmic
TgeneACER3chr11:76183884chr11:76637600ENST00000532485011163_17334268.0Topological domainLumenal
TgeneACER3chr11:76183884chr11:76637600ENST00000532485011195_21534268.0Topological domainCytoplasmic
TgeneACER3chr11:76183884chr11:76637600ENST00000532485011237_26734268.0Topological domainLumenal
TgeneACER3chr11:76183884chr11:76637600ENST0000053248501156_6134268.0Topological domainLumenal
TgeneACER3chr11:76183884chr11:76637600ENST0000053248501183_8734268.0Topological domainCytoplasmic
TgeneACER3chr11:76183884chr11:76637600ENST0000054411306109_1180135.0Topological domainLumenal
TgeneACER3chr11:76183884chr11:76637600ENST0000054411306140_1410135.0Topological domainCytoplasmic
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- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
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Fusion Gene Sequence for EMSY-ACER3


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>10690_10690_1_C11orf30-ACER3_C11orf30_chr11_76183884_ENST00000334736_ACER3_chr11_76637600_ENST00000532485_length(transcript)=8422nt_BP=1251nt
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GCTGTTCAGATGAAGATGAAAAACCCAGAAAACGAAGGCGAACAAACTCTTCCAGCTCCTCTCCTGTTGTTCTAAAGGAAGTTCCAAAGG
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CATCACCAAGCTCAACCTTCGTGCCCAACATTCTCTCCAAATCCCATAACTATGCAGCAGTCACTAAGCTTGTACCAACGTCAGTCATTG
CTTCTACAACCCAGAAGCCACCAGTTGTTATAACTGCTTCACAGTCCTCTCTGGTCAGTAATAGCAGCAGTGGCAGCAGCAGTTCTACAC
CATCACCTATTCCTAATACAGTTGCAGTAACAGCTGTGGTGTCCTCTACACCATCTGTGGTCATGTCAACAGTAGCACAAGGGAATACAG
TGAGTAACCTGATCATGATTATACCTCCAATGTTCGGTGCAGTTCAGAGTGTTAGAGACGGTCTGGAAAAGCGGTACATTGCTTCTTATT
TAGCACTCACAGTGGTAGGAATGGGATCCTGGTGCTTCCACATGACTCTGAAATATGAAATGCAGCTATTGGATGAACTCCCAATGATAT
ACAGCTGTTGCATATTTGTGTACTGCATGTTTGAATGTTTCAAGATCAAGAACTCAGTAAACTACCATCTGCTTTTTACCTTAGTTCTAT
TCAGTTTAATAGTAACCACAGTTTACCTTAAGGTAAAAGAGCCGATATTCCATCAGGTCATGTATGGAATGTTGGTCTTTACATTAGTAC
TTCGATCTATTTATATTGTTACATGGGTTTATCCATGGCTTAGAGGACTGGGTTATACATCATTGGGTATATTTTTATTGGGATTTTTAT
TTTGGAATATAGATAACATATTTTGTGAGTCACTGAGGAACTTTCGAAAGAAGGTACCACCTATCATAGGTATTACCACACAATTTCATG
CATGGTGGCATATTTTAACTGGCCTTGGTTCCTATCTTCACATCCTTTTCAGTTTGTATACAAGAACACTTTACCTGAGATATAGGCCAA
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ACAGTTTGTGCTGGTTATAAGAAATTAACCTTCTTTTCTTTTTGCCAAGGGTTGCATGTGAATTATACCTTTCTTAATATTTGATTAAAT
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Fusion Gene PPI Analysis for EMSY-ACER3


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000334736+821104_108369.33333333333331323.0ZMYND11
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000343878+820104_108369.33333333333331156.0ZMYND11
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000529032+720104_108369.33333333333331323.0ZMYND11
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000334736+821104_108369.33333333333331323.0ZMYND11
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000343878+820104_108369.33333333333331156.0ZMYND11
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000529032+720104_108369.33333333333331323.0ZMYND11


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000334736+8211_478369.33333333333331323.0BRCA2
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000343878+8201_478369.33333333333331156.0BRCA2
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000529032+7201_478369.33333333333331323.0BRCA2
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000533988+141_478083.0BRCA2
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000334736+8211_478369.33333333333331323.0BRCA2
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000343878+8201_478369.33333333333331156.0BRCA2
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000529032+7201_478369.33333333333331323.0BRCA2
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000533988+141_478083.0BRCA2
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637600ENST00000533988+14104_108083.0ZMYND11
HgeneC11orf30chr11:76183884chr11:76637601ENST00000533988+14104_108083.0ZMYND11


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for EMSY-ACER3


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for EMSY-ACER3


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneEMSYC0006142Malignant neoplasm of breast1CTD_human
HgeneEMSYC0011615Dermatitis, Atopic1CTD_human
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HgeneEMSYC0086196Eczema, Infantile1CTD_human
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HgeneEMSYC1458155Mammary Neoplasms1CTD_human
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HgeneEMSYC4704874Mammary Carcinoma, Human1CTD_human
HgeneEMSYC4722327PROSTATE CANCER, HEREDITARY, 11CTD_human
TgeneC4540358LEUKODYSTROPHY, PROGRESSIVE, EARLY CHILDHOOD-ONSET2ORPHANET;UNIPROT
TgeneC0025202melanoma1CTD_human