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Fusion gene:CUX1-DGKB (FusionGDB2 ID:20725)

Fusion Gene Summary for CUX1-DGKB

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: CUX1-DGKB
Fusion gene ID: 20725
HgeneTgene
Gene symbol

CUX1

DGKB

Gene ID

1523

1607

Gene namecut like homeobox 1diacylglycerol kinase beta
SynonymsCASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75DAGK2|DGK|DGK-BETA
Cytomap

7q22.1

7p21.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionprotein CASPHomeobox protein cut-like 1CCAAT displacement proteinCUX1 gene Alternatively Spliced Productcut homologgolgi integral membrane protein 6homeobox protein cux-1putative protein product of Nbla10317diacylglycerol kinase beta90 kDa diacylglycerol kinaseDAG kinase betadiacylglycerol kinase, beta 90kDadiglyceride kinase beta
Modification date2020032020200313
UniProtAcc

P39880

Q9Y6T7

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000560541, ENST00000292535, 
ENST00000292538, ENST00000360264, 
ENST00000393824, ENST00000425244, 
ENST00000437600, ENST00000546411, 
ENST00000549414, ENST00000550008, 
ENST00000556210, ENST00000547394, 
ENST00000258767, ENST00000399322, 
ENST00000402815, ENST00000403951, 
ENST00000403963, ENST00000407950, 
ENST00000444700, ENST00000406247, 
Fusion gene scores* DoF score32 X 26 X 13=1081619 X 16 X 9=2736
# samples 3719
** MAII scorelog2(37/10816*10)=-4.86949797576587
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(19/2736*10)=-3.84799690655495
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: CUX1 [Title/Abstract] AND DGKB [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointCUX1(101671425)-DGKB(14881075), # samples:2
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgeneDGKB

GO:0046486

glycerolipid metabolic process

22627129

TgeneDGKB

GO:0046834

lipid phosphorylation

22627129


check buttonFusion gene breakpoints across CUX1 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across DGKB (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4GBMTCGA-14-0790-01BCUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-


Top

Fusion Gene ORF analysis for CUX1-DGKB

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
3UTR-3CDSENST00000560541ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-3CDSENST00000560541ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-5UTRENST00000560541ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-5UTRENST00000560541ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-5UTRENST00000560541ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-5UTRENST00000560541ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-5UTRENST00000560541ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-intronENST00000560541ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292535ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292535ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292535ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292535ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292535ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292538ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292538ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292538ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292538ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292538ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000360264ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000360264ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000360264ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000360264ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000360264ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000393824ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000393824ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000393824ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000393824ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000393824ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000425244ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000425244ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000425244ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000425244ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000425244ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000437600ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000437600ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000437600ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000437600ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000437600ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000546411ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000546411ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000546411ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000546411ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000546411ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000549414ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000549414ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000549414ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000549414ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000549414ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000550008ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000550008ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000550008ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000550008ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000550008ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000556210ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000556210ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000556210ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000556210ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000556210ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000292535ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000292538ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000360264ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000393824ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000425244ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000437600ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000546411ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000549414ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000550008ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000556210ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000292535ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000292535ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000292538ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000292538ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000360264ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000360264ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000393824ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000393824ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000425244ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000425244ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000437600ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000437600ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000546411ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000546411ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000549414ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000549414ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000550008ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000550008ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000556210ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000556210ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-3CDSENST00000547394ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-3CDSENST00000547394ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-5UTRENST00000547394ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-5UTRENST00000547394ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-5UTRENST00000547394ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-5UTRENST00000547394ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-5UTRENST00000547394ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-intronENST00000547394ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000437600CUX1chr7101671425+ENST00000399322DGKBchr714881075-72585747103175821
ENST00000437600CUX1chr7101671425+ENST00000258767DGKBchr714881075-72585747103175821
ENST00000292538CUX1chr7101671425+ENST00000399322DGKBchr714881075-69322483842849821
ENST00000292538CUX1chr7101671425+ENST00000258767DGKBchr714881075-69322483842849821
ENST00000393824CUX1chr7101671425+ENST00000399322DGKBchr714881075-68181342702735821
ENST00000393824CUX1chr7101671425+ENST00000258767DGKBchr714881075-68181342702735821
ENST00000360264CUX1chr7101671425+ENST00000399322DGKBchr714881075-69262423782843821
ENST00000360264CUX1chr7101671425+ENST00000258767DGKBchr714881075-69262423782843821
ENST00000425244CUX1chr7101671425+ENST00000399322DGKBchr714881075-69162323682833821
ENST00000425244CUX1chr7101671425+ENST00000258767DGKBchr714881075-69162323682833821
ENST00000292535CUX1chr7101671425+ENST00000399322DGKBchr714881075-69112273632828821
ENST00000292535CUX1chr7101671425+ENST00000258767DGKBchr714881075-69112273632828821
ENST00000549414CUX1chr7101671425+ENST00000399322DGKBchr714881075-68731893252790821
ENST00000549414CUX1chr7101671425+ENST00000258767DGKBchr714881075-68731893252790821
ENST00000556210CUX1chr7101671425+ENST00000399322DGKBchr714881075-68731893252790821
ENST00000556210CUX1chr7101671425+ENST00000258767DGKBchr714881075-68731893252790821
ENST00000550008CUX1chr7101671425+ENST00000399322DGKBchr714881075-68731893252790821
ENST00000550008CUX1chr7101671425+ENST00000258767DGKBchr714881075-68731893252790821
ENST00000546411CUX1chr7101671425+ENST00000399322DGKBchr714881075-68731893252790821
ENST00000546411CUX1chr7101671425+ENST00000258767DGKBchr714881075-68731893252790821

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000437600ENST00000399322CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002661150.99973387
ENST00000437600ENST00000258767CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002828770.99971706
ENST00000292538ENST00000399322CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002564390.9997435
ENST00000292538ENST00000258767CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002740650.9997259
ENST00000393824ENST00000399322CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002412010.9997588
ENST00000393824ENST00000258767CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002591160.9997409
ENST00000360264ENST00000399322CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002555050.9997445
ENST00000360264ENST00000258767CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002735390.9997265
ENST00000425244ENST00000399322CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002559520.999744
ENST00000425244ENST00000258767CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002738120.9997261
ENST00000292535ENST00000399322CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002554670.9997445
ENST00000292535ENST00000258767CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002730260.99972695
ENST00000549414ENST00000399322CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002556740.99974436
ENST00000549414ENST00000258767CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002732920.9997267
ENST00000556210ENST00000399322CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002556740.99974436
ENST00000556210ENST00000258767CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002732920.9997267
ENST00000550008ENST00000399322CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002556740.99974436
ENST00000550008ENST00000258767CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002732920.9997267
ENST00000546411ENST00000399322CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002556740.99974436
ENST00000546411ENST00000258767CUX1chr7101671425+DGKBchr714881075-0.0002732920.9997267

Top

Fusion Genomic Features for CUX1-DGKB


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

Top

Fusion Protein Features for CUX1-DGKB


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr7:101671425/chr7:14881075)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
CUX1

P39880

DGKB

Q9Y6T7

FUNCTION: Transcription factor involved in the control of neuronal differentiation in the brain. Regulates dendrite development and branching, and dendritic spine formation in cortical layers II-III. Also involved in the control of synaptogenesis. In addition, it has probably a broad role in mammalian development as a repressor of developmentally regulated gene expression. May act by preventing binding of positively-activing CCAAT factors to promoters. Component of nf-munr repressor; binds to the matrix attachment regions (MARs) (5' and 3') of the immunoglobulin heavy chain enhancer. Represses T-cell receptor (TCR) beta enhancer function by binding to MARbeta, an ATC-rich DNA sequence located upstream of the TCR beta enhancer. Binds to the TH enhancer; may require the basic helix-loop-helix protein TCF4 as a coactivator. {ECO:0000250|UniProtKB:P53564}.; FUNCTION: [CDP/Cux p110]: Plays a role in cell cycle progression, in particular at the G1/S transition. As cells progress into S phase, a fraction of CUX1 molecules is proteolytically processed into N-terminally truncated proteins of 110 kDa. While CUX1 only transiently binds to DNA and carries the CCAAT-displacement activity, CDP/Cux p110 makes a stable interaction with DNA and stimulates expression of genes such as POLA1. {ECO:0000269|PubMed:15099520}.FUNCTION: Diacylglycerol kinase that converts diacylglycerol/DAG into phosphatidic acid/phosphatidate/PA and regulates the respective levels of these two bioactive lipids (PubMed:11719522). Thereby, acts as a central switch between the signaling pathways activated by these second messengers with different cellular targets and opposite effects in numerous biological processes (Probable). Has a higher activity with long-chain diacylglycerols like 1,2-di-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycerol compared to 1,2-didecanoyl-sn-glycerol (By similarity). Specifically expressed in brain, it regulates neuron-specific morphological changes including neurite branching and neurite spine formation (By similarity). {ECO:0000250|UniProtKB:P49621, ECO:0000250|UniProtKB:Q6NS52, ECO:0000269|PubMed:11719522, ECO:0000305}.; FUNCTION: [Isoform 2]: Does not associate with membranes but has a diacylglycerol kinase activity. {ECO:0000269|PubMed:11719522}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000399322-125162_17323805.0Calcium binding1
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000399322-125207_21823805.0Calcium binding2
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000403951026162_1730805.0Calcium binding1
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000403951026207_2180805.0Calcium binding2
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000406247024162_1730774.0Calcium binding1
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000406247024207_2180774.0Calcium binding2
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000399322-125149_18423805.0DomainEF-hand 1
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000399322-125194_22923805.0DomainEF-hand 2
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000399322-125434_56823805.0DomainDAGKc
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000403951026149_1840805.0DomainEF-hand 1
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000403951026194_2290805.0DomainEF-hand 2
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000403951026434_5680805.0DomainDAGKc
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000406247024149_1840774.0DomainEF-hand 1
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000406247024194_2290774.0DomainEF-hand 2
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000406247024434_5680774.0DomainDAGKc
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000399322-125771_80423805.0RegionRequired for association with membranes and function in neurite spine formation
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000403951026771_8040805.0RegionRequired for association with membranes and function in neurite spine formation
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000406247024771_8040774.0RegionRequired for association with membranes and function in neurite spine formation
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000399322-125244_29423805.0Zinc fingerPhorbol-ester/DAG-type 1
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000399322-125309_35823805.0Zinc fingerPhorbol-ester/DAG-type 2
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000403951026244_2940805.0Zinc fingerPhorbol-ester/DAG-type 1
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000403951026309_3580805.0Zinc fingerPhorbol-ester/DAG-type 2
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000406247024244_2940774.0Zinc fingerPhorbol-ester/DAG-type 1
TgeneDGKBchr7:101671425chr7:14881075ENST00000406247024309_3580774.0Zinc fingerPhorbol-ester/DAG-type 2

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000292535+32456_407631506.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000292538+323502_55674679.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000292538+32367_45074679.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255
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HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000292535+3241406_1438631506.0Compositional biasNote=Ala-rich
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000360264+3241406_1438741517.0Compositional biasNote=Ala-rich
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000425244+3221406_143874633.0Compositional biasNote=Ala-rich
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000546411+3241406_1438631404.0Compositional biasNote=Ala-rich
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000549414+3231406_1438631484.0Compositional biasNote=Ala-rich
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000550008+3221406_1438631450.0Compositional biasNote=Ala-rich
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000556210+3221406_1438631348.0Compositional biasNote=Ala-rich
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000292535+3241117_1204631506.0DNA bindingCUT 3
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000292535+3241244_1303631506.0DNA bindingHomeobox
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000292535+324542_629631506.0DNA bindingCUT 1
HgeneCUX1chr7:101671425chr7:14881075ENST00000292535+324934_1021631506.0DNA bindingCUT 2
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Fusion Gene Sequence for CUX1-DGKB


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>20725_20725_1_CUX1-DGKB_CUX1_chr7_101671425_ENST00000292535_DGKB_chr7_14881075_ENST00000258767_length(transcript)=6911nt_BP=227nt
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KFASQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSCVVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQAPMLMGPPPKTGLFCS

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Fusion Gene PPI Analysis for CUX1-DGKB


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for CUX1-DGKB


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for CUX1-DGKB


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource