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Fusion gene:EWSR1-SP3 (FusionGDB2 ID:27857)

Fusion Gene Summary for EWSR1-SP3

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: EWSR1-SP3
Fusion gene ID: 27857
HgeneTgene
Gene symbol

EWSR1

SP3

Gene ID

2130

6670

Gene nameEWS RNA binding protein 1Sp3 transcription factor
SynonymsEWS|EWS-FLI1|bK984G1.4SPR2
Cytomap

22q12.2

2q31.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
DescriptionRNA-binding protein EWSEWS RNA-binding protein variant 6Ewing sarcoma breakpoint region 1Ewings sarcoma EWS-Fli1 (type 1) oncogenetranscription factor Sp3GC-binding transcription factor Sp3specificity protein 3
Modification date2020032920200313
UniProtAcc

Q01844

Q02447

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000331029, ENST00000332035, 
ENST00000332050, ENST00000333395, 
ENST00000397938, ENST00000406548, 
ENST00000414183, 		ENST00000483084, 
ENST00000310015, ENST00000418194, 
ENST00000455789, 
Fusion gene scores* DoF score44 X 91 X 16=640646 X 5 X 4=120
# samples 986
** MAII scorelog2(98/64064*10)=-6.03058831983342
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(6/120*10)=-1
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: EWSR1 [Title/Abstract] AND SP3 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpoint
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgeneSP3

GO:0006355

regulation of transcription, DNA-templated

12560508

TgeneSP3

GO:0045893

positive regulation of transcription, DNA-templated

12771217


check buttonFusion gene breakpoints across EWSR1 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.

check buttonFusion gene breakpoints across SP3 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerKB3..EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
ChimerKB3..EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-


Top

Fusion Gene ORF analysis for EWSR1-SP3

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
5CDS-intronENST00000331029ENST00000483084EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
5CDS-intronENST00000332035ENST00000483084EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
5CDS-intronENST00000332035ENST00000483084EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
5CDS-intronENST00000332050ENST00000483084EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
5CDS-intronENST00000333395ENST00000483084EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
5CDS-intronENST00000397938ENST00000483084EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
5CDS-intronENST00000397938ENST00000483084EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
5CDS-intronENST00000406548ENST00000483084EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
5CDS-intronENST00000406548ENST00000483084EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
5CDS-intronENST00000414183ENST00000483084EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
5CDS-intronENST00000414183ENST00000483084EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000331029ENST00000310015EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000331029ENST00000418194EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000331029ENST00000455789EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000332035ENST00000310015EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000332035ENST00000310015EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000332035ENST00000418194EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000332035ENST00000418194EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000332035ENST00000455789EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000332035ENST00000455789EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000332050ENST00000310015EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000332050ENST00000418194EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000332050ENST00000455789EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000333395ENST00000310015EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000333395ENST00000418194EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000333395ENST00000455789EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000397938ENST00000310015EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000397938ENST00000310015EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000397938ENST00000418194EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000397938ENST00000418194EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000397938ENST00000455789EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000397938ENST00000455789EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000406548ENST00000310015EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000406548ENST00000310015EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000406548ENST00000418194EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000406548ENST00000418194EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000406548ENST00000455789EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000406548ENST00000455789EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000414183ENST00000310015EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000414183ENST00000310015EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000414183ENST00000418194EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000414183ENST00000418194EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000414183ENST00000455789EWSR1chr22

29683123

+SP3chr2

174783513

-
In-frameENST00000414183ENST00000455789EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-3CDSENST00000331029ENST00000310015EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-3CDSENST00000331029ENST00000418194EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-3CDSENST00000331029ENST00000455789EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-3CDSENST00000332050ENST00000310015EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-3CDSENST00000332050ENST00000418194EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-3CDSENST00000332050ENST00000455789EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-3CDSENST00000333395ENST00000310015EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-3CDSENST00000333395ENST00000418194EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-3CDSENST00000333395ENST00000455789EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-intronENST00000331029ENST00000483084EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-intronENST00000332050ENST00000483084EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-
intron-intronENST00000333395ENST00000483084EWSR1chr22

29687588

+SP3chr2

174783513

-

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000332050EWSR1chr2229683123+ENST00000455789SP3chr2174783513-531011213281827499
ENST00000332050EWSR1chr2229683123+ENST00000310015SP3chr2174783513-531011213281827499
ENST00000332050EWSR1chr2229683123+ENST00000418194SP3chr2174783513-323911213281827499
ENST00000397938EWSR1chr2229683123+ENST00000455789SP3chr2174783513-530111123191818499
ENST00000397938EWSR1chr2229683123+ENST00000310015SP3chr2174783513-530111123191818499
ENST00000397938EWSR1chr2229683123+ENST00000418194SP3chr2174783513-323011123191818499
ENST00000406548EWSR1chr2229683123+ENST00000455789SP3chr2174783513-5046857641563499
ENST00000406548EWSR1chr2229683123+ENST00000310015SP3chr2174783513-5046857641563499
ENST00000406548EWSR1chr2229683123+ENST00000418194SP3chr2174783513-2975857641563499
ENST00000331029EWSR1chr2229683123+ENST00000455789SP3chr2174783513-5028839461545499
ENST00000331029EWSR1chr2229683123+ENST00000310015SP3chr2174783513-5028839461545499
ENST00000331029EWSR1chr2229683123+ENST00000418194SP3chr2174783513-2957839461545499
ENST00000414183EWSR1chr2229683123+ENST00000455789SP3chr2174783513-5021832211538505
ENST00000414183EWSR1chr2229683123+ENST00000310015SP3chr2174783513-5021832211538505
ENST00000414183EWSR1chr2229683123+ENST00000418194SP3chr2174783513-2950832211538505
ENST00000333395EWSR1chr2229683123+ENST00000455789SP3chr2174783513-5001812191518499
ENST00000333395EWSR1chr2229683123+ENST00000310015SP3chr2174783513-5001812191518499
ENST00000333395EWSR1chr2229683123+ENST00000418194SP3chr2174783513-2930812191518499
ENST00000332035EWSR1chr2229683123+ENST00000455789SP3chr2174783513-4825636111342443
ENST00000332035EWSR1chr2229683123+ENST00000310015SP3chr2174783513-4825636111342443
ENST00000332035EWSR1chr2229683123+ENST00000418194SP3chr2174783513-2754636111342443
ENST00000397938EWSR1chr2229687588+ENST00000455789SP3chr2174783513-552013313192037572
ENST00000397938EWSR1chr2229687588+ENST00000310015SP3chr2174783513-552013313192037572
ENST00000397938EWSR1chr2229687588+ENST00000418194SP3chr2174783513-344913313192037572
ENST00000406548EWSR1chr2229687588+ENST00000455789SP3chr2174783513-52621073641779571
ENST00000406548EWSR1chr2229687588+ENST00000310015SP3chr2174783513-52621073641779571
ENST00000406548EWSR1chr2229687588+ENST00000418194SP3chr2174783513-31911073641779571
ENST00000414183EWSR1chr2229687588+ENST00000455789SP3chr2174783513-52371048211754577
ENST00000414183EWSR1chr2229687588+ENST00000310015SP3chr2174783513-52371048211754577
ENST00000414183EWSR1chr2229687588+ENST00000418194SP3chr2174783513-31661048211754577
ENST00000332035EWSR1chr2229687588+ENST00000455789SP3chr2174783513-5044855111561516
ENST00000332035EWSR1chr2229687588+ENST00000310015SP3chr2174783513-5044855111561516
ENST00000332035EWSR1chr2229687588+ENST00000418194SP3chr2174783513-2973855111561516

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score

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Fusion Genomic Features for EWSR1-SP3


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

Top

Fusion Protein Features for EWSR1-SP3


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr22:/chr2:)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
EWSR1

Q01844

SP3

Q02447

FUNCTION: Might normally function as a transcriptional repressor. EWS-fusion-proteins (EFPS) may play a role in the tumorigenic process. They may disturb gene expression by mimicking, or interfering with the normal function of CTD-POLII within the transcription initiation complex. They may also contribute to an aberrant activation of the fusion protein target genes.FUNCTION: Transcriptional factor that can act as an activator or repressor depending on isoform and/or post-translational modifications. Binds to GT and GC boxes promoter elements. Competes with SP1 for the GC-box promoters. Weak activator of transcription but can activate a number of genes involved in different processes such as cell-cycle regulation, hormone-induction and house-keeping. {ECO:0000269|PubMed:10391891, ECO:0000269|PubMed:11812829, ECO:0000269|PubMed:12419227, ECO:0000269|PubMed:12837748, ECO:0000269|PubMed:15247228, ECO:0000269|PubMed:15494207, ECO:0000269|PubMed:15554904, ECO:0000269|PubMed:16781829, ECO:0000269|PubMed:17548428, ECO:0000269|PubMed:18187045, ECO:0000269|PubMed:18617891, ECO:0000269|PubMed:9278495}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note


Top

Fusion Gene Sequence for EWSR1-SP3


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>27857_27857_1_EWSR1-SP3_EWSR1_chr22_29683123_ENST00000331029_SP3_chr2_174783513_ENST00000310015_length(transcript)=5028nt_BP=839nt
GCGAGAGGGAGACGGACGTTGAGAGAACGAGGAGGAAGGAGAGAAAATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCA
GCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCCCACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGG
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GGTAGCTTGCACCTGTCCCAACTGTAAAGAAGGTGGTGGAAGAGGTACCAATCTTGGGAAAAAGAAGCAACACATTTGTCATATACCAGG
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GGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGC
TCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAA
GCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCCCCA
GGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGA
TCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCA
GCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCA
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ACATCTGAGAGCTCATCTGCGTTGGCATTCTGGAGAACGCCCTTTTGTTTGTAACTGGATGTACTGTGGTAAAAGATTTACTCGAAGTGA
TGAATTACAGAGGCACAGAAGAACACATACAGGTGAGAAGAAATTTGTTTGTCCAGAATGTTCAAAACGCTTTATGAGAAGTGACCACCT
TGCCAAACATATTAAAACACACCAGAATAAAAAAGGTATTCACTCTAGCAGTACAGTGCTGGCATCTGTGGAAGCTGCGCGAGATGATAC
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TGGGTTTTGTAGGTACTTTTGGAATCTAGAAGAAATGAAATTTTACCAAGTTATATAAAGAGAAAATTGAATTTAACAATGCGAATGGTA
GTCTAACCAAATGCATCAATCCTGTGTGGTTTAGTGTAAAAATGAGAACATGTTGGTATTTATCTATTGTAAGATAAAAAAGCTGGTGGG
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TAAGCATTACTCTTGTAAGATTTTGAAAACTACATTTTAACATGGAACTCTAGGGATAGTCACCTTTTAAATCCTGTTGAAAAGCCATGT
TTAAGATTTAATTTGCCAAAATAATGTCTTGTTAATATTCTTTCAATAACGAAGTTGGGCAATATAACCAATGTTTAAAAAAGTTTAAAA
TGTATAAGTTGAGGCATTTGGGTGGTAAGAGAATGTTATAGTGAATTATCCCTTTTCTTGACTATTGGAGGACCAAAAAAATAAGGTGTA
TTGCGTCTTAGCAGTGATTTTTATCCAATCTTGTTTCCAAAAACCATGTCTCCCAGGGCCTTAAAAGCCATCATGTAAATTACCAGTAAA
GTGTAACATATGCAAACATAACAAAATCACTTCCATAGTGACGATACTCCAACCATATGGATATTAGTCATAGAAGAACTAGAGGTTTTA
TGATATTTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTGTCTAGGTAGTCAGTCTGCACTTAAATATCAATCATTTTCCTTTTTTGCTTCTTCCCTTAA
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GGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGA
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GCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCA
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AGAAGGTGGTGGAAGAGGTACCAATCTTGGGAAAAAGAAGCAACACATTTGTCATATACCAGGATGTGGTAAAGTCTATGGGAAGACCTC
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TGCCAAACATATTAAAACACACCAGAATAAAAAAGGTATTCACTCTAGCAGTACAGTGCTGGCATCTGTGGAAGCTGCGCGAGATGATAC
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CAGCAATCAAGATATCCTTACCAACACTGAAATACCTTTACAGCTTGTCACAGTTTCTGGAAATGAGACAATGGAGTAAATATTACACAA
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TGGGTTTTGTAGGTACTTTTGGAATCTAGAAGAAATGAAATTTTACCAAGTTATATAAAGAGAAAATTGAATTTAACAATGCGAATGGTA
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TGAAAGAAATCATGTTATGATAAAAAATTTTGTAATTTTCTTGATGACTGGAATTTTTATTATGCATAACTGACAAATCAAGTTTCCAAG
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TGATATTTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTGTCTAGGTAGTCAGTCTGCACTTAAATATCAATCATTTTCCTTTTTTGCTTCTTCCCTTAA
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TTCAATTCAAAAATGTACAAAATAAAGTTACATTGCTGGTCTTGTAAGAGCTATACAGTTTTCCTAAATGTATACCTGTAACTGCAGCAG
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GTATTATAACAGTGTGGTAGTTAATAAAACACTATTTTTTTTTCTTTTGAGTTTGTTGTATTCCTATGCATAAAAAATATTGCAGTGGTA
TGGGGTAAGAATTGGTGGTTTATTTTTCTTCAACTTGGCTTTTTATTTTTAGATTCTTGATTTTAGACACTGAATTGTAAACAGGCATTT
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TACCTTGAATACCAATGACCTAACACACTTAAGAGTACAGGTGGTAGATGAAGAAGGGGACCAACAACATCAAGAAGGAAAAAGACTTCG
GAGGGTAGCTTGCACCTGTCCCAACTGTAAAGAAGGTGGTGGAAGAGGTACCAATCTTGGGAAAAAGAAGCAACACATTTGTCATATACC
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GGCATCTGTGGAAGCTGCGCGAGATGATACTTTGATTACTGCAGGAGGAACAACGCTTATCCTTGCAAATATTCAACAAGGTTCTGTTTC
AGGGATAGGAACTGTTAATACTTCCGCCACCAGCAATCAAGATATCCTTACCAACACTGAAATACCTTTACAGCTTGTCACAGTTTCTGG
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TTCCTAAATGTATACCTGTAACTGCAGCAGTTCACCTATTTCAAAAATTTGGAATTCTGTTCATTTGTTATTCTTAAGACCACCTCAAAT
TTAAAGGCTACCTTATTGTACGTTTAAAGTGTATTATAACAGTGTGGTAGTTAATAAAACACTATTTTTTTTTCTTTTGAGTTTGTTGTA
TTCCTATGCATAAAAAATATTGCAGTGGTATGGGGTAAGAATTGGTGGTTTATTTTTCTTCAACTTGGCTTTTTATTTTTAGATTCTTGA
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CAAGCGTTGGTAACCATGGCAGGAGTTACTTGAAAAAGTTGCCTTTGAATTTGCATGTGTTTCATCATTATAAAGGCAGAGTAGGAGGAA
AGAGTATTAATGTGATTGTGTATTGTAGATGTTTTAAAGTAAAAATCAAGTTTCTTAACACATGTATACAGTGGGGGTAAAGATGTCCAT
TTTCTGTTTTCCAGGCCCAGTCTGACTCTGTCTGTAATACCTGATTGCATTGGAGAACTCTAGACACGCATAAACATGGACAGTTTTTCT
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TACAGGGATTAGATTTTGAATCTTAAAATCCTTTAGGTAATTTTTAGAATTTTTAAATTAAGATTAATGTGAAGAGAATTAAGTGAGCAG
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TTTTTGTAAAGGCTAGAGTTAGTGCATATTGAATATATTTATGTACAAATAATTCCTGTTGTAACATTTAGTGGACGCGATTATCTGTAT
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GAAATTGCTGGGGAGCATTTTAGAGATTCCATAGGCCTGGTAGCCACCTCAGCTTACTAAATCAACATCTCTGGAGATGGAGTGTATATG
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ATATTAGTCATAGAAGAACTAGAGGTTTTATGATATTTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTGTCTAGGTAGTCAGTCTGCACTTAAATATCA
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TCTTTTTATTTTTTAATTATTGTTTATATTTTCAATTCAAAAATGTACAAAATAAAGTTACATTGCTGGTCTTGTAAGAGCTATACAGTT
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TTCCTATGCATAAAAAATATTGCAGTGGTATGGGGTAAGAATTGGTGGTTTATTTTTCTTCAACTTGGCTTTTTATTTTTAGATTCTTGA
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Fusion Gene PPI Analysis for EWSR1-SP3


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for EWSR1-SP3


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for EWSR1-SP3


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource