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Fusion Gene PPI analysis

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Fusion gene:GRB2-ACOX1 (FusionGDB2 ID:34637)

Fusion Gene Summary for GRB2-ACOX1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: GRB2-ACOX1
Fusion gene ID: 34637
HgeneTgene
Gene symbol

GRB2

ACOX1

Gene ID

2885

51

Gene namegrowth factor receptor bound protein 2acyl-CoA oxidase 1
SynonymsASH|EGFRBP-GRB2|Grb3-3|MST084|MSTP084|NCKAP2ACOX|PALMCOX|SCOX
Cytomap

17q25.1

17q25.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptiongrowth factor receptor-bound protein 2HT027SH2/SH3 adapter GRB2abundant SRC homologyepidermal growth factor receptor-binding protein GRB2epididymis secretory sperm binding proteingrowth factor receptor-bound protein 3protein Ashperoxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1AOXacyl-CoA oxidase 1, palmitoylacyl-CoA oxidase, straight-chainacyl-Coenzyme A oxidase 1, palmitoylpalmitoyl-CoA oxidaseperoxisomal fatty acyl-CoA oxidasestraight-chain acyl-CoA oxidase
Modification date2020032720200313
UniProtAcc

P62993

Q15067

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000316615, ENST00000316804, 
ENST00000392562, ENST00000392563, 
ENST00000392564, ENST00000578961, 
ENST00000462266, 		ENST00000591857, 
ENST00000293217, ENST00000301608, 
ENST00000537812, 
Fusion gene scores* DoF score18 X 13 X 11=257411 X 11 X 8=968
# samples 2514
** MAII scorelog2(25/2574*10)=-3.36401205355861
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(14/968*10)=-2.78958022032963
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: GRB2 [Title/Abstract] AND ACOX1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointGRB2(73389632)-ACOX1(73949701), # samples:2
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.GRB2-ACOX1 seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a cell metabolism gene due to the frame-shifted ORF.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgeneACOX1

GO:0006629

lipid metabolic process

8117268


check buttonFusion gene breakpoints across GRB2 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across ACOX1 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4BRCATCGA-AN-A0FJ-01AGRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
ChimerDB4BRCATCGA-AN-A0FJ-01AGRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
ChimerDB4BRCATCGA-AN-A0FJGRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
ChimerDB4UCSTCGA-N5-A4RU-01AGRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-


Top

Fusion Gene ORF analysis for GRB2-ACOX1

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
5CDS-intronENST00000316615ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
5CDS-intronENST00000316615ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000316615ENST00000591857GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000316615ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-
5CDS-intronENST00000316804ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
5CDS-intronENST00000316804ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000316804ENST00000591857GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000316804ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-
5CDS-intronENST00000392562ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
5CDS-intronENST00000392562ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000392562ENST00000591857GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000392562ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

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-
5CDS-intronENST00000392563ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
5CDS-intronENST00000392563ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000392563ENST00000591857GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000392563ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-
5CDS-intronENST00000392564ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
5CDS-intronENST00000392564ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000392564ENST00000591857GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000392564ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-
5CDS-intronENST00000578961ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
5CDS-intronENST00000578961ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000578961ENST00000591857GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
5CDS-intronENST00000578961ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-
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73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
Frame-shiftENST00000316615ENST00000293217GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
Frame-shiftENST00000316615ENST00000293217GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
Frame-shiftENST00000316615ENST00000293217GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-
Frame-shiftENST00000316615ENST00000301608GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
Frame-shiftENST00000316615ENST00000301608GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
Frame-shiftENST00000316615ENST00000301608GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
Frame-shiftENST00000316615ENST00000301608GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-
Frame-shiftENST00000316615ENST00000537812GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
Frame-shiftENST00000316615ENST00000537812GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
Frame-shiftENST00000316615ENST00000537812GRB2chr17

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-ACOX1chr17

73949701

-
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-
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-ACOX1chr17

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-
Frame-shiftENST00000316804ENST00000293217GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
Frame-shiftENST00000316804ENST00000293217GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
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-ACOX1chr17

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-
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73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
Frame-shiftENST00000316804ENST00000301608GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
Frame-shiftENST00000316804ENST00000301608GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
Frame-shiftENST00000316804ENST00000301608GRB2chr17

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-ACOX1chr17

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-
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-
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-
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73949701

-
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-ACOX1chr17

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-
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-
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-
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-
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-
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-ACOX1chr17

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-
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-ACOX1chr17

73949701

-
Frame-shiftENST00000392562ENST00000301608GRB2chr17

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-ACOX1chr17

73949701

-
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-ACOX1chr17

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-ACOX1chr17

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-
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-ACOX1chr17

73947658

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Frame-shiftENST00000392563ENST00000537812GRB2chr17

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Frame-shiftENST00000392564ENST00000537812GRB2chr17

73389632

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Frame-shiftENST00000578961ENST00000293217GRB2chr17

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73947658

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Frame-shiftENST00000578961ENST00000301608GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

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Frame-shiftENST00000578961ENST00000537812GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

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Frame-shiftENST00000578961ENST00000537812GRB2chr17

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73945978

-
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73389631

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In-frameENST00000392564ENST00000537812GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

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In-frameENST00000578961ENST00000537812GRB2chr17

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-ACOX1chr17

73949701

-
In-frameENST00000578961ENST00000537812GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000293217GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000293217GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000293217GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000293217GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000301608GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000301608GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000301608GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000301608GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000537812GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000537812GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000537812GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
intron-3CDSENST00000462266ENST00000537812GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-
intron-intronENST00000462266ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73947658

-
intron-intronENST00000462266ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73949701

-
intron-intronENST00000462266ENST00000591857GRB2chr17

73389631

-ACOX1chr17

73949701

-
intron-intronENST00000462266ENST00000591857GRB2chr17

73389632

-ACOX1chr17

73945978

-

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000392563GRB2chr1773389632-ENST00000293217ACOX1chr1773949701-6556106281314428
ENST00000392563GRB2chr1773389632-ENST00000537812ACOX1chr1773949701-6548106281314428
ENST00000392563GRB2chr1773389632-ENST00000301608ACOX1chr1773949701-1486106281314428
ENST00000392564GRB2chr1773389632-ENST00000293217ACOX1chr1773949701-67643142361522428
ENST00000392564GRB2chr1773389632-ENST00000537812ACOX1chr1773949701-67563142361522428
ENST00000392564GRB2chr1773389632-ENST00000301608ACOX1chr1773949701-16943142361522428
ENST00000578961GRB2chr1773389632-ENST00000293217ACOX1chr1773949701-67032531751461428
ENST00000578961GRB2chr1773389632-ENST00000537812ACOX1chr1773949701-66952531751461428
ENST00000578961GRB2chr1773389632-ENST00000301608ACOX1chr1773949701-16332531751461428
ENST00000392563GRB2chr1773389631-ENST00000293217ACOX1chr1773949701-6556106281314428
ENST00000392563GRB2chr1773389631-ENST00000537812ACOX1chr1773949701-6548106281314428
ENST00000392563GRB2chr1773389631-ENST00000301608ACOX1chr1773949701-1486106281314428
ENST00000392564GRB2chr1773389631-ENST00000293217ACOX1chr1773949701-67643142361522428
ENST00000392564GRB2chr1773389631-ENST00000537812ACOX1chr1773949701-67563142361522428
ENST00000392564GRB2chr1773389631-ENST00000301608ACOX1chr1773949701-16943142361522428
ENST00000578961GRB2chr1773389631-ENST00000293217ACOX1chr1773949701-67032531751461428
ENST00000578961GRB2chr1773389631-ENST00000537812ACOX1chr1773949701-66952531751461428
ENST00000578961GRB2chr1773389631-ENST00000301608ACOX1chr1773949701-16332531751461428

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000392563ENST00000293217GRB2chr1773389632-ACOX1chr1773949701-0.0003014670.9996985
ENST00000392563ENST00000537812GRB2chr1773389632-ACOX1chr1773949701-0.0003012790.99969876
ENST00000392563ENST00000301608GRB2chr1773389632-ACOX1chr1773949701-0.0033387950.9966612
ENST00000392564ENST00000293217GRB2chr1773389632-ACOX1chr1773949701-0.0003288950.9996711
ENST00000392564ENST00000537812GRB2chr1773389632-ACOX1chr1773949701-0.0003291180.99967086
ENST00000392564ENST00000301608GRB2chr1773389632-ACOX1chr1773949701-0.0040092350.9959908
ENST00000578961ENST00000293217GRB2chr1773389632-ACOX1chr1773949701-0.0003142050.99968576
ENST00000578961ENST00000537812GRB2chr1773389632-ACOX1chr1773949701-0.0003137650.99968624
ENST00000578961ENST00000301608GRB2chr1773389632-ACOX1chr1773949701-0.003994630.99600536
ENST00000392563ENST00000293217GRB2chr1773389631-ACOX1chr1773949701-0.0003014670.9996985
ENST00000392563ENST00000537812GRB2chr1773389631-ACOX1chr1773949701-0.0003012790.99969876
ENST00000392563ENST00000301608GRB2chr1773389631-ACOX1chr1773949701-0.0033387950.9966612
ENST00000392564ENST00000293217GRB2chr1773389631-ACOX1chr1773949701-0.0003288950.9996711
ENST00000392564ENST00000537812GRB2chr1773389631-ACOX1chr1773949701-0.0003291180.99967086
ENST00000392564ENST00000301608GRB2chr1773389631-ACOX1chr1773949701-0.0040092350.9959908
ENST00000578961ENST00000293217GRB2chr1773389631-ACOX1chr1773949701-0.0003142050.99968576
ENST00000578961ENST00000537812GRB2chr1773389631-ACOX1chr1773949701-0.0003137650.99968624
ENST00000578961ENST00000301608GRB2chr1773389631-ACOX1chr1773949701-0.003994630.99600536

Top

Fusion Genomic Features for GRB2-ACOX1


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

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Fusion Protein Features for GRB2-ACOX1


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr17:73389632/chr17:73949701)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
GRB2

P62993

ACOX1

Q15067

FUNCTION: Adapter protein that provides a critical link between cell surface growth factor receptors and the Ras signaling pathway. {ECO:0000269|PubMed:1322798, ECO:0000269|PubMed:19815557}.; FUNCTION: [Isoform 2]: Does not bind to phosphorylated epidermal growth factor receptor (EGFR) but inhibits EGF-induced transactivation of a RAS-responsive element. Acts as a dominant negative protein over GRB2 and by suppressing proliferative signals, may trigger active programmed cell death. {ECO:0000269|PubMed:8178156}.FUNCTION: Catalyzes the desaturation of acyl-CoAs to 2-trans-enoyl-CoAs. First enzyme of the fatty acid beta-oxidation pathway. {ECO:0000269|PubMed:15060085, ECO:0000269|PubMed:17458872, ECO:0000269|PubMed:17603022, ECO:0000269|PubMed:32169171}.; FUNCTION: [Isoform 1]: Shows highest activity against medium-chain fatty acyl-CoAs and activity decreases with increasing chain length. {ECO:0000269|PubMed:17603022}.; FUNCTION: [Isoform 2]: Is active against a much broader range of substrates and shows activity towards very long-chain acyl-CoAs. Is twice as active as isoform 1 against 16-hydroxy-palmitoyl-CoA and is 25% more active against 1,16-hexadecanodioyl-CoA. {ECO:0000269|PubMed:17603022}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneACOX1chr17:73389631chr17:73949701ENST00000293217514658_660258661.0MotifNote=Microbody targeting signal
TgeneACOX1chr17:73389631chr17:73949701ENST00000301608514658_660258661.0MotifNote=Microbody targeting signal
TgeneACOX1chr17:73389631chr17:73949701ENST00000537812514658_660220623.0MotifNote=Microbody targeting signal
TgeneACOX1chr17:73389632chr17:73949701ENST00000293217514658_660258661.0MotifNote=Microbody targeting signal
TgeneACOX1chr17:73389632chr17:73949701ENST00000301608514658_660258661.0MotifNote=Microbody targeting signal
TgeneACOX1chr17:73389632chr17:73949701ENST00000537812514658_660220623.0MotifNote=Microbody targeting signal

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000316615-25156_21526177.0DomainSH3 2
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000316615-251_5826177.0DomainSH3 1
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000316615-2560_15226177.0DomainSH2
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000316804-26156_21526218.0DomainSH3 2
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000316804-261_5826218.0DomainSH3 1
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000316804-2660_15226218.0DomainSH2
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000392562-26156_21526218.0DomainSH3 2
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000392562-261_5826218.0DomainSH3 1
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000392562-2660_15226218.0DomainSH2
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000392563-14156_21526177.0DomainSH3 2
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000392563-141_5826177.0DomainSH3 1
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000392563-1460_15226177.0DomainSH2
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000392564-15156_21526218.0DomainSH3 2
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000392564-151_5826218.0DomainSH3 1
HgeneGRB2chr17:73389631chr17:73949701ENST00000392564-1560_15226218.0DomainSH2
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000316615-25156_21526177.0DomainSH3 2
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000316615-251_5826177.0DomainSH3 1
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000316615-2560_15226177.0DomainSH2
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000316804-26156_21526218.0DomainSH3 2
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000316804-261_5826218.0DomainSH3 1
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000316804-2660_15226218.0DomainSH2
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000392562-26156_21526218.0DomainSH3 2
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000392562-261_5826218.0DomainSH3 1
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000392562-2660_15226218.0DomainSH2
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000392563-14156_21526177.0DomainSH3 2
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000392563-141_5826177.0DomainSH3 1
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000392563-1460_15226177.0DomainSH2
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000392564-15156_21526218.0DomainSH3 2
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000392564-151_5826218.0DomainSH3 1
HgeneGRB2chr17:73389632chr17:73949701ENST00000392564-1560_15226218.0DomainSH2


Top

Fusion Gene Sequence for GRB2-ACOX1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>34637_34637_1_GRB2-ACOX1_GRB2_chr17_73389631_ENST00000392563_ACOX1_chr17_73949701_ENST00000293217_length(transcript)=6556nt_BP=106nt
GGCTGCTGAGCACTGAGCAGCGCTCAGAATGGAAGCCATCGCCAAATATGACTTCAAAGCTACTGCAGACGACGAGCTGAGCTTCAAAAG
GGGGGACATCCTCAAGGTGAAGCCTGATGGCACATACGTGAAACCGCTGAGTAACAAGCTGACTTACGGGACCATGGTGTTTGTCAGGTC
CTTCCTTGTGGGAGAAGCTGCTCGGGCTCTGTCTAAGGCGTGCACCATTGCCATCCGATACAGCGCTGTGAGGCACCAGTCTGAAATCAA
GCCAGGTGAACCAGAACCACAGATTTTGGATTTTCAAACCCAGCAGTATAAACTCTTTCCACTCCTGGCCACTGCCTATGCCTTCCAGTT
TGTGGGCGCATACATGAAGGAGACCTATCACCGGATTAACGAAGGCATTGGTCAAGGGGACCTGAGTGAACTGCCTGAGCTTCATGCCCT
CACCGCTGGACTGAAGGCTTTCACCTCCTGGACTGCAAACACTGGCATTGAAGCATGTCGGATGGCTTGTGGTGGGCATGGCTATTCTCA
TTGCAGTGGTCTTCCAAATATTTATGTCAATTTCACCCCAAGCTGTACCTTTGAGGGAGAAAACACTGTCATGATGCTCCAGACGGCTAG
GTTCCTGATGAAAAGTTATGATCAGGTGCACTCAGGAAAGTTGGTGTGTGGCATGGTGTCCTATTTGAACGACCTGCCCAGTCAGCGCAT
CCAGCCACAGCAGGTAGCAGTCTGGCCAACCATGGTGGATATCAACAGCCCCGAAAGCCTAACCGAAGCATATAAACTCCGTGCAGCCAG
ATTAGTAGAAATTGCTGCAAAAAACCTTCAAAAAGAAGTGATTCACAGAAAAAGCAAGGAGGTAGCTTGGAACCTAACTTCTGTTGACCT
TGTTCGAGCAAGTGAGGCACATTGCCACTATGTGGTAGTTAAGCTCTTTTCAGAAAAACTCCTCAAAATTCAAGATAAAGCCATTCAAGC
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AACATTCACCGTGTTCATATGCTTTCTGAGAAGTCACCACTTGTAATTTCAGATCACATACACCTGAAGGCATTTTATAGTTCCTAAAGT
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TTATTTTTTTTTATTTTTGGAAATAGGGTATGGCTATGTTGCCTTGGGCCCGTCATGAACTCCTAGCCTCAGGTGACCCTCCCACCTCAG
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CTCCCACTCCCCCCACACTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCCACAAGCCACCTCACCCAGCCAACATGTTACATCTTAATTC
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TTATTTTAAAATATTGATGGTGGGGTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGTTGTCTTGCTCTTTCACCCAGGGTAGAGTGC
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CATATGTGCACATTCCTAGATTCAAGGGTGTTTTTGCCTTAAATTTAAGTGGGTCATTGGTTGTCTTGGGAAGATCATGGAAAATTCGGG
ATTTTTTAGAATTCTGAACCAAAATATGTTTTGAGTGTTTCTTAGTAAATGTGTGATCTTCCACCTTCCACATTCAGACTGCGGACTACA
CTTCATAAATGCCTTTTTATTTCCAGTTATGGATTCAACTAAATGACTGCCTTGGGAGCACATAATTACTTTGCTACCTTTTTCCCCCTT
TGCTGTTGTGGCTCGAGTTTGGTTCTCACCTGAGAAGATGCATTGAGCATATGTTGTTACCCAGCCCTGGCTTAATGGTGTCCTGTGGGG
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AGGAAGTATAGGGAAACCTCTCAGCTGTGGCACTGTTGTAGCTTTGGAGTGCAGAGTGTAACTCTGGGACAATCAGATTTCACATATTCT
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CACAGAAAAACCCTTTGACACAAACCATGTGTTCTGATTTTTGGTTCAGAAAATATTGAAACTGTGAGTTGTTTTTTTTTTAACAACTGG
GAAAAAACAAAAACAAAAAACTATAGTTAGAAAAATGGAAGTTCCATAGGTTCTATTTCTTACTCTATGTATGGCTTTGTTTTCAGTCTA
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Fusion Gene PPI Analysis for GRB2-ACOX1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for GRB2-ACOX1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for GRB2-ACOX1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource