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Fusion gene:KIAA0391-FAM177A1 (FusionGDB2 ID:42125)

Fusion Gene Summary for KIAA0391-FAM177A1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: KIAA0391-FAM177A1
Fusion gene ID: 42125
HgeneTgene
Gene symbol

KIAA0391

FAM177A1

Gene ID

9692

283635

Gene nameprotein only RNase P catalytic subunitfamily with sequence similarity 177 member A1
SynonymsKIAA0391|MRPP3C14orf24
Cytomap

14q13.2

14q13.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionmitochondrial ribonuclease P catalytic subunitmitochondrial RNase P protein 3mitochondrial RNase P subunit 3mitochondrial ribonuclease P protein 3proteinaceous RNase Pprotein FAM177A1
Modification date2020031320200313
UniProtAcc.

Q8N128

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000250377, ENST00000321130, 
ENST00000534898, ENST00000557565, 
ENST00000603544, ENST00000604948, 
ENST00000605870, ENST00000603588, 
ENST00000554052, ENST00000280987, 
ENST00000382406, ENST00000396472, 
Fusion gene scores* DoF score2 X 1 X 2=410 X 10 X 4=400
# samples 212
** MAII scorelog2(2/4*10)=2.32192809488736log2(12/400*10)=-1.73696559416621
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: KIAA0391 [Title/Abstract] AND FAM177A1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointFAM177A1(35522657)-KIAA0391(35649876), # samples:2
KIAA0391(35649983)-FAM177A1(35546356), # samples:5
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneKIAA0391

GO:0097745

mitochondrial tRNA 5'-end processing

25953853


check buttonFusion gene breakpoints across KIAA0391 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across FAM177A1 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4HNSCTCGA-CV-A45U-01AKIAA0391chr14

35649983

-FAM177A1chr14

35546356

+
ChimerDB4HNSCTCGA-CV-A45UKIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
ChimerDB4HNSCTCGA-CV-A45UKIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
ChimerDB4KIRCTCGA-B0-4849-01AKIAA0391chr14

35649983

-FAM177A1chr14

35546356

+
ChimerDB4KIRCTCGA-B0-4849-01AKIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+


Top

Fusion Gene ORF analysis for KIAA0391-FAM177A1

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
5CDS-intronENST00000250377ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
5CDS-intronENST00000250377ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
5CDS-intronENST00000321130ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
5CDS-intronENST00000321130ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
5CDS-intronENST00000534898ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
5CDS-intronENST00000534898ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
5CDS-intronENST00000557565ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
5CDS-intronENST00000557565ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
5CDS-intronENST00000603544ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
5CDS-intronENST00000603544ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
5CDS-intronENST00000604948ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
5CDS-intronENST00000604948ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
5CDS-intronENST00000605870ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
5CDS-intronENST00000605870ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000250377ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000250377ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000250377ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000250377ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000250377ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000250377ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000321130ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000321130ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000321130ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000321130ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000321130ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000321130ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000534898ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000534898ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000534898ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000534898ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000534898ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000534898ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000557565ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000557565ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000557565ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000557565ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000557565ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000557565ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000603544ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000603544ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000603544ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000603544ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000603544ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000603544ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000604948ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000604948ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000604948ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000604948ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000604948ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000604948ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000605870ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000605870ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000605870ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000605870ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
In-frameENST00000605870ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
In-frameENST00000605870ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
intron-3CDSENST00000603588ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
intron-3CDSENST00000603588ENST00000280987KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
intron-3CDSENST00000603588ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
intron-3CDSENST00000603588ENST00000382406KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
intron-3CDSENST00000603588ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
intron-3CDSENST00000603588ENST00000396472KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+
intron-intronENST00000603588ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546355

+
intron-intronENST00000603588ENST00000554052KIAA0391chr14

35649983

+FAM177A1chr14

35546356

+

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000604948KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546355+36301105761476466
ENST00000604948KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546355+16361105761476466
ENST00000604948KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546355+36321105761476466
ENST00000557565KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546355+418116563812027548
ENST00000557565KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546355+218716563812027548
ENST00000557565KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546355+418316563812027548
ENST00000250377KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546355+416716423672013548
ENST00000250377KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546355+217316423672013548
ENST00000250377KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546355+416916423672013548
ENST00000321130KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546355+411815933661964532
ENST00000321130KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546355+212415933661964532
ENST00000321130KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546355+412015933661964532
ENST00000534898KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546355+416016353602006548
ENST00000534898KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546355+216616353602006548
ENST00000534898KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546355+416216353602006548
ENST00000603544KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546355+417616514242022532
ENST00000603544KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546355+218216514242022532
ENST00000603544KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546355+417816514242022532
ENST00000605870KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546355+3003478280849189
ENST00000605870KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546355+1009478280849189
ENST00000605870KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546355+3005478280849189
ENST00000604948KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546356+36301105761476466
ENST00000604948KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546356+16361105761476466
ENST00000604948KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546356+36321105761476466
ENST00000557565KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546356+418116563812027548
ENST00000557565KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546356+218716563812027548
ENST00000557565KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546356+418316563812027548
ENST00000250377KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546356+416716423672013548
ENST00000250377KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546356+217316423672013548
ENST00000250377KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546356+416916423672013548
ENST00000321130KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546356+411815933661964532
ENST00000321130KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546356+212415933661964532
ENST00000321130KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546356+412015933661964532
ENST00000534898KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546356+416016353602006548
ENST00000534898KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546356+216616353602006548
ENST00000534898KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546356+416216353602006548
ENST00000603544KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546356+417616514242022532
ENST00000603544KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546356+218216514242022532
ENST00000603544KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546356+417816514242022532
ENST00000605870KIAA0391chr1435649983+ENST00000396472FAM177A1chr1435546356+3003478280849189
ENST00000605870KIAA0391chr1435649983+ENST00000382406FAM177A1chr1435546356+1009478280849189
ENST00000605870KIAA0391chr1435649983+ENST00000280987FAM177A1chr1435546356+3005478280849189

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000604948ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0001218230.99987817
ENST00000604948ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0003098390.9996902
ENST00000604948ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.000121610.9998784
ENST00000557565ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0002243360.9997757
ENST00000557565ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0004805330.99951947
ENST00000557565ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0002244880.99977547
ENST00000250377ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0002228380.99977714
ENST00000250377ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0004772250.9995228
ENST00000250377ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0002229890.999777
ENST00000321130ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0001825720.99981743
ENST00000321130ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0004518530.99954814
ENST00000321130ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0001827560.9998173
ENST00000534898ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0002242120.9997758
ENST00000534898ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0004918380.99950814
ENST00000534898ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0002243660.9997756
ENST00000603544ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0002103350.99978966
ENST00000603544ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0006032520.9993968
ENST00000603544ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0002106550.9997894
ENST00000605870ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0017528530.99824715
ENST00000605870ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.0018774570.9981225
ENST00000605870ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+0.001434510.9985655
ENST00000604948ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0001218230.99987817
ENST00000604948ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0003098390.9996902
ENST00000604948ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.000121610.9998784
ENST00000557565ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0002243360.9997757
ENST00000557565ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0004805330.99951947
ENST00000557565ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0002244880.99977547
ENST00000250377ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0002228380.99977714
ENST00000250377ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0004772250.9995228
ENST00000250377ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0002229890.999777
ENST00000321130ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0001825720.99981743
ENST00000321130ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0004518530.99954814
ENST00000321130ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0001827560.9998173
ENST00000534898ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0002242120.9997758
ENST00000534898ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0004918380.99950814
ENST00000534898ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0002243660.9997756
ENST00000603544ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0002103350.99978966
ENST00000603544ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0006032520.9993968
ENST00000603544ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0002106550.9997894
ENST00000605870ENST00000396472KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0017528530.99824715
ENST00000605870ENST00000382406KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.0018774570.9981225
ENST00000605870ENST00000280987KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546356+0.001434510.9985655

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Fusion Genomic Features for KIAA0391-FAM177A1


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)
KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+2.16E-060.99999785
KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+2.16E-060.99999785
KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+2.16E-060.99999785
KIAA0391chr1435649983+FAM177A1chr1435546355+2.16E-060.99999785

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.
genomic feature of top 1%

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Fusion Protein Features for KIAA0391-FAM177A1


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr14:35522657/chr14:35649876)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
.FAM177A1

Q8N128

FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneFAM177A1chr14:35649983chr14:35546355ENST0000028098715136_173113237.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255
TgeneFAM177A1chr14:35649983chr14:35546355ENST0000038240626136_17390214.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255
TgeneFAM177A1chr14:35649983chr14:35546355ENST0000039647237136_17390214.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255
TgeneFAM177A1chr14:35649983chr14:35546356ENST0000028098715136_173113237.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255
TgeneFAM177A1chr14:35649983chr14:35546356ENST0000038240626136_17390214.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255
TgeneFAM177A1chr14:35649983chr14:35546356ENST0000039647237136_17390214.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546355ENST00000250377+58342_578330489.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546355ENST00000321130+47342_578409568.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546355ENST00000534898+58342_578425584.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546355ENST00000603544+47342_578409568.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546355ENST00000604948+58342_578330489.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546355ENST00000605870+47342_57853212.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546356ENST00000250377+58342_578330489.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546356ENST00000321130+47342_578409568.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546356ENST00000534898+58342_578425584.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546356ENST00000603544+47342_578409568.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546356ENST00000604948+58342_578330489.0DomainNote=PRORP
HgeneKIAA0391chr14:35649983chr14:35546356ENST00000605870+47342_57853212.0DomainNote=PRORP


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Fusion Gene Sequence for KIAA0391-FAM177A1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
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ATTAATAGCCTTCTAAACAGCATTAAGTTTTCAATTTTAATATATCTATATAAAATATAGTGTCAAAGAAAGTAACATCAATATAGTGGG
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TTAACTTCATTCGAGATAGTACCTCTCACTCACAGATATTTATTTGGTTATCAAGTGAAGATAGGTGTGTCTAAAAGTGATCTTCTGAAT
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TCGGATGAAGAAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACAGGATGTCTGAAGAAGCAGAAAAACAATATCAACAGAATAAATTGCAGAC
TGATTCCATTGTTCAGACAGATCAACCAGAGACAGTGATATCCAGCTCATTTGTGAATGTCAATTTTGAAATGGAGGGAGACAGTGAAGT
AATTATGGAAAGCAAGCAAAATCCAGTCTCTGTCCCACCATAAAATGAAATGACTATCAAGCTTCAAACTCTTAAGTTTTTTTTTTTTAA
TACAAAAACTTTCACATTCTTTATTCAGTGGGACTTAATACAATTATTTATATTTTAAATTATTAAAGTATCTGGAAAGGGAAAATGTTT
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GAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTTGGGGGGAAAAAAGTATATATATA
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Fusion Gene PPI Analysis for KIAA0391-FAM177A1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for KIAA0391-FAM177A1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for KIAA0391-FAM177A1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource