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Fusion gene:KLK2-ETV1 (FusionGDB2 ID:43053)

Fusion Gene Summary for KLK2-ETV1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: KLK2-ETV1
Fusion gene ID: 43053
HgeneTgene
Gene symbol

KLK2

ETV1

Gene ID

3817

2115

Gene namekallikrein related peptidase 2ETS variant transcription factor 1
SynonymsKLK2A2|hGK-1|hK2ER81
Cytomap

19q13.33

7p21.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionkallikrein-2glandular kallikrein 2glandular kallikrein-1kallikrein 2, prostatictissue kallikrein-2ETS translocation variant 1ETS variant 1ets variant gene 1ets-related protein 81
Modification date2020031320200313
UniProtAcc.

P50549

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000597509, ENST00000325321, 
ENST00000358049, ENST00000391810, 
ENST00000242066, ENST00000343495, 
ENST00000399357, ENST00000403527, 
ENST00000403685, ENST00000405192, 
ENST00000405218, ENST00000405358, 
ENST00000420159, ENST00000430479, 
ENST00000476720, 
Fusion gene scores* DoF score21 X 19 X 4=159613 X 27 X 6=2106
# samples 3030
** MAII scorelog2(30/1596*10)=-2.41142624572647
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(30/2106*10)=-2.81147103052984
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: KLK2 [Title/Abstract] AND ETV1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointKLK2(51376775)-ETV1(13971374), # samples:3
KLK2(51378136)-ETV1(13971374), # samples:3
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.KLK2-ETV1 seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a CGC due to the frame-shifted ORF.
KLK2-ETV1 seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a IUPHAR drug target due to the frame-shifted ORF.
KLK2-ETV1 seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a CGC due to the frame-shifted ORF.
KLK2-ETV1 seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a transcription factor due to the frame-shifted ORF.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgeneETV1

GO:0045944

positive regulation of transcription by RNA polymerase II

12750007


check buttonFusion gene breakpoints across KLK2 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across ETV1 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4adenocarcinomaHM245385KLK2chr19

51376775

ETV1chr7

13946187
ChimerDB4PRADTCGA-ZG-A9LY-01AKLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
ChimerDB4PRADTCGA-ZG-A9LY-01AKLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13971373

-
ChimerDB4PRADTCGA-ZG-A9LY-01AKLK2chr19

51376775

-ETV1chr7

13971374

-
ChimerDB4PRADTCGA-ZG-A9LY-01AKLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
ChimerDB4PRADTCGA-ZG-A9LYKLK2chr19

51376775

+ETV1chr7

13971374

-
ChimerDB4PRADTCGA-ZG-A9LYKLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
ChimerKB3..KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
ChiTaRS5.0N/AHM245385KLK2chr19

51376775

+ETV1chr7

13971375

-
ChiTaRS5.0N/AHM245386KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-


Top

Fusion Gene ORF analysis for KLK2-ETV1

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000242066KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000242066KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000343495KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000343495KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000399357KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000399357KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000403527KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000403527KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000403685KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000403685KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000405192KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000405192KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000405218KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000405218KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000405358KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000405358KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000420159KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000420159KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000430479KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000430479KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-3CDSENST00000597509ENST00000430479KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
3UTR-5UTRENST00000597509ENST00000476720KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
3UTR-5UTRENST00000597509ENST00000476720KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
3UTR-5UTRENST00000597509ENST00000476720KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
3UTR-intronENST00000597509ENST00000242066KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
3UTR-intronENST00000597509ENST00000343495KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
3UTR-intronENST00000597509ENST00000399357KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
3UTR-intronENST00000597509ENST00000403527KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
3UTR-intronENST00000597509ENST00000403685KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
3UTR-intronENST00000597509ENST00000405192KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
3UTR-intronENST00000597509ENST00000405218KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
3UTR-intronENST00000597509ENST00000405358KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
3UTR-intronENST00000597509ENST00000420159KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-5UTRENST00000325321ENST00000476720KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-5UTRENST00000325321ENST00000476720KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13971373

-
5CDS-5UTRENST00000325321ENST00000476720KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
5CDS-5UTRENST00000325321ENST00000476720KLK2chr19

51376775

+ETV1chr7

13971374

-
5CDS-5UTRENST00000325321ENST00000476720KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
5CDS-5UTRENST00000325321ENST00000476720KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-5UTRENST00000325321ENST00000476720KLK2chr19

51376775

+ETV1chr7

13971375

-
5CDS-5UTRENST00000358049ENST00000476720KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-5UTRENST00000358049ENST00000476720KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13971373

-
5CDS-5UTRENST00000358049ENST00000476720KLK2chr19

51378135

+ETV1chr7

13971373

-
5CDS-5UTRENST00000358049ENST00000476720KLK2chr19

51376775

+ETV1chr7

13971374

-
5CDS-5UTRENST00000358049ENST00000476720KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13971374

-
5CDS-5UTRENST00000358049ENST00000476720KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-5UTRENST00000358049ENST00000476720KLK2chr19

51376775

+ETV1chr7

13971375

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000242066KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000343495KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000399357KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000403527KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000403527KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000403685KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000403685KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000405192KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000405192KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000405218KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000405218KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000405358KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000405358KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000420159KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000325321ENST00000476720KLK2chr19

51376775

ETV1chr7

13946187

5CDS-intronENST00000358049ENST00000242066KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000343495KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000399357KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000403527KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000403527KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000403685KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000403685KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000405192KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000405192KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000405218KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000405218KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000405358KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000405358KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000420159KLK2chr19

51378136

+ETV1chr7

13975521

-
5CDS-intronENST00000358049ENST00000476720KLK2chr19

51376775

ETV1chr7

13946187

5UTR-3CDSENST00000391810ENST00000242066KLK2chr19

51376775

ETV1chr7

13946187

5UTR-3CDSENST00000391810ENST00000242066KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5UTR-3CDSENST00000391810ENST00000242066KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13971373

-
5UTR-3CDSENST00000391810ENST00000242066KLK2chr19

51376775

+ETV1chr7

13971374

-
5UTR-3CDSENST00000391810ENST00000242066KLK2chr19

51376775

+ETV1chr7

13971375

-
5UTR-3CDSENST00000391810ENST00000343495KLK2chr19

51376775

ETV1chr7

13946187

5UTR-3CDSENST00000391810ENST00000343495KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13950931

-
5UTR-3CDSENST00000391810ENST00000343495KLK2chr19

51376774

+ETV1chr7

13971373

-
5UTR-3CDSENST00000391810ENST00000343495KLK2chr19

51376775

+ETV1chr7

13971374

-
5UTR-3CDSENST00000391810ENST00000343495KLK2chr19

51376775

+ETV1chr7

13971375

-
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-
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51376775

ETV1chr7

13946187


check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
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check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
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ENST00000325321ENST00000405218KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.0005583390.9994417
ENST00000325321ENST00000403685KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.0080321270.99196786
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ENST00000358049ENST00000399357KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.0003563240.9996437
ENST00000358049ENST00000420159KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.0003563240.9996437
ENST00000358049ENST00000343495KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.0003563240.9996437
ENST00000358049ENST00000242066KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.0003563240.9996437
ENST00000358049ENST00000405192KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.0001844110.99981564
ENST00000358049ENST00000405358KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.000355070.9996449
ENST00000358049ENST00000403527KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.0004811950.9995189
ENST00000358049ENST00000405218KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.0004807770.9995192
ENST00000358049ENST00000403685KLK2chr1951378136+ETV1chr713971374-0.0051890380.99481094
ENST00000325321ENST00000430479KLK2chr1951376774+ETV1chr713950931-0.000315590.99968445
ENST00000325321ENST00000399357KLK2chr1951376774+ETV1chr713950931-0.00032250.99967754
ENST00000325321ENST00000420159KLK2chr1951376774+ETV1chr713950931-0.00032250.99967754
ENST00000325321ENST00000343495KLK2chr1951376774+ETV1chr713950931-0.00032250.99967754
ENST00000325321ENST00000242066KLK2chr1951376774+ETV1chr713950931-0.00032250.99967754
ENST00000358049ENST00000430479KLK2chr1951376774+ETV1chr713950931-0.0002986990.9997013
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ENST00000325321ENST00000430479KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0003653280.9996346
ENST00000325321ENST00000399357KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.000365150.99963486
ENST00000325321ENST00000420159KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.000365150.99963486
ENST00000325321ENST00000343495KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.000365150.99963486
ENST00000325321ENST00000242066KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.000365150.99963486
ENST00000325321ENST00000405192KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0002064130.9997936
ENST00000325321ENST00000405358KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.000390080.9996099
ENST00000325321ENST00000403527KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0005708830.99942905
ENST00000325321ENST00000405218KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0005583390.9994417
ENST00000325321ENST00000403685KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0080321270.99196786
ENST00000358049ENST00000430479KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0003563670.9996437
ENST00000358049ENST00000399357KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0003563240.9996437
ENST00000358049ENST00000420159KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0003563240.9996437
ENST00000358049ENST00000343495KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0003563240.9996437
ENST00000358049ENST00000242066KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0003563240.9996437
ENST00000358049ENST00000405192KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0001844110.99981564
ENST00000358049ENST00000405358KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.000355070.9996449
ENST00000358049ENST00000403527KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0004811950.9995189
ENST00000358049ENST00000405218KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0004807770.9995192
ENST00000358049ENST00000403685KLK2chr1951378135+ETV1chr713971373-0.0051890380.99481094
ENST00000325321ENST00000430479KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.406627630.5933724
ENST00000325321ENST00000399357KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.50408060.49591944
ENST00000325321ENST00000420159KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.50408060.49591944
ENST00000325321ENST00000343495KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.50408060.49591944
ENST00000325321ENST00000242066KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.50408060.49591944
ENST00000325321ENST00000405192KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.43020160.56979847
ENST00000325321ENST00000405358KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.564988260.43501177
ENST00000325321ENST00000403527KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.77829250.22170758
ENST00000325321ENST00000405218KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.880652960.11934702
ENST00000325321ENST00000403685KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.134776930.8652231
ENST00000358049ENST00000430479KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.391662450.6083376
ENST00000358049ENST00000399357KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.488034670.51196533
ENST00000358049ENST00000420159KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.488034670.51196533
ENST00000358049ENST00000343495KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.488034670.51196533
ENST00000358049ENST00000242066KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.488034670.51196533
ENST00000358049ENST00000405192KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.401118070.5988819
ENST00000358049ENST00000405358KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.532091860.46790814
ENST00000358049ENST00000403527KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.72752420.2724758
ENST00000358049ENST00000405218KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.87601220.12398781
ENST00000358049ENST00000403685KLK2chr1951376775ETV1chr7139461870.126196770.87380326

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Fusion Genomic Features for KLK2-ETV1


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

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Fusion Protein Features for KLK2-ETV1


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr19:51376775/chr7:13971374)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
.ETV1

P50549

FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.FUNCTION: Transcriptional activator that binds to DNA sequences containing the consensus pentanucleotide 5'-CGGA[AT]-3' (PubMed:7651741). Required for olfactory dopaminergic neuron differentiation; may directly activate expression of tyrosine hydroxylase (TH) (By similarity). {ECO:0000250|UniProtKB:P41164, ECO:0000269|PubMed:7651741}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneETV1chr19:51376774chr7:13950931ENST00000242066713335_415249460.0DNA bindingETS
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TgeneETV1chr19:51376774chr7:13950931ENST0000039935739335_415164375.0DNA bindingETS
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TgeneETV1chr19:51376774chr7:13950931ENST00000405192012335_4150455.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51376774chr7:13950931ENST00000405218713335_415267478.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51376774chr7:13950931ENST0000042015939335_415209420.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51376774chr7:13950931ENST00000430479814335_415267478.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378135chr7:13971373ENST00000242066613335_415166460.0DNA bindingETS
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TgeneETV1chr19:51378135chr7:13971373ENST00000405192612335_415184455.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378135chr7:13971373ENST00000405218613335_415184478.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378135chr7:13971373ENST0000042015929335_415126420.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378135chr7:13971373ENST00000430479714335_415184478.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378136chr7:13971374ENST00000242066613335_415166460.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378136chr7:13971374ENST00000343495613335_415166460.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378136chr7:13971374ENST0000039935729335_41581375.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378136chr7:13971374ENST00000403527310335_415144438.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378136chr7:13971374ENST00000403685512335_415166460.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378136chr7:13971374ENST00000405192612335_415184455.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378136chr7:13971374ENST00000405218613335_415184478.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378136chr7:13971374ENST0000042015929335_415126420.0DNA bindingETS
TgeneETV1chr19:51378136chr7:13971374ENST00000430479714335_415184478.0DNA bindingETS

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneKLK2chr19:51376774chr7:13950931ENST00000325321+1525_25815262.0DomainPeptidase S1
HgeneKLK2chr19:51376774chr7:13950931ENST00000358049+1525_25815224.0DomainPeptidase S1
HgeneKLK2chr19:51376774chr7:13950931ENST00000391810+1425_2580160.0DomainPeptidase S1
HgeneKLK2chr19:51378135chr7:13971373ENST00000325321+2525_25868262.0DomainPeptidase S1
HgeneKLK2chr19:51378135chr7:13971373ENST00000358049+2525_25868224.0DomainPeptidase S1
HgeneKLK2chr19:51378135chr7:13971373ENST00000391810+1425_2580160.0DomainPeptidase S1
HgeneKLK2chr19:51378136chr7:13971374ENST00000325321+2525_25868262.0DomainPeptidase S1
HgeneKLK2chr19:51378136chr7:13971374ENST00000358049+2525_25868224.0DomainPeptidase S1
HgeneKLK2chr19:51378136chr7:13971374ENST00000391810+1425_2580160.0DomainPeptidase S1


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Fusion Gene Sequence for KLK2-ETV1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>43053_43053_1_KLK2-ETV1_KLK2_chr19_51376774_ENST00000325321_ETV1_chr7_13950931_ENST00000242066_length(transcript)=5536nt_BP=271nt
GATCTAGTATGTGTGGAACAGCAAGTGCTGGCTCTCCCTCCCCTTCCACAGCTCTGGGTGTGGGAGGGGGTTGTCCAGCCTCCAGCAGCA
TGGGGAGGGCCTTGGTCAGCATCTAGGTGCCAACAGGGCAAGGGCGGGGTCCTGGAGAATGAAGGCTTTATAGGGCTCCTCAGGGAGGCC
CCCCAGCCCCAAACTCACCACCTGGCCGTGGACACCTGTGTCAGCATGTGGGACCTGGTTCTCTCCATCGCCTTGTCTGTGGGGTGCACT
GAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGC
CCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCC
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CTTTTCCTGTTGCATTATTCTATGGTCTGCCATGGACTGTGCACTTTATTTGAGGGTGGGTGGGAGTAATCTAAACATTTATTCTGTGTA
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GAAACTATATCATGTCTGTTTGATTTCATAACAACATAAGATAATGTTTATTTTATCGGGGTATCTATGGTACAGTTAATTTCACGTTGT
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AAATGAAGCAAAAAATATCTGTCTCCTTTTCACTTTCTTCAGTACATAAATACATTATTTAATCAATAAGAATTAACTGTACTAAATCAT
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AACAACATAAGATAATGTTTATTTTATCGGGGTATCTATGGTACAGTTAATTTCACGTTGTGTAAATATCCACTTGGAGACTATTTGCCT
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CTGTTCTAGTTACAGCAAACACTCTTTAAGAAAAATATCCAATACACTAAATAGGTACTATAGTAATTTTTAGACATGGTACCCATTGAT
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GCGATTTCAATGATTGTTGTTCATATACATCATGTATTATTTTGGCCCATTTTGGGCCTAAAAAAGAAAACTATGCCTTAAAAATCAGAA
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CTCTTTAAGAAAAATATCCAATACACTAAATAGGTACTATAGTAATTTTTAGACATGGTACCCATTGATATGCATTTAAACCTTTTACTG
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TACTATGACCATTTATAAGCAGTGCAGTTAACTACAGATAGCATTTCAGGACAAAATAGATGACTCAAACCATTTATTGCTTAAAAAATA
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TAAAATTTTTTAAGTTCTGTTTTGATTCCACTTTTTGGTTGAGTTTTTATGTTTTTGTTTTCAGGTAGATTAATAAATCTGGCAGCTGAT
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TAAAATTTTTTAAGTTCTGTTTTGATTCCACTTTTTGGTTGAGTTTTTATGTTTTTGTTTTCAGGTAGATTAATAAATCTGGCAGCTGAT
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CCCCAGCCCCAAACTCACCACCTGGCCGTGGACACCTGTGTCAGCATGTGGGACCTGGTTCTCTCCATCGCCTTGTCTGTGGGGTGCACT
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GGATGGGCACACTGTGGGGGTGTCCTGGTGCACCCCCAGTGGGTGCTCACAGCTGCCCATTGCCTAAAGAAATTTCGCCGCCAGCTTTCT
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GCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATT
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CCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCG
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CTTTTCCTGTTGCATTATTCTATGGTCTGCCATGGACTGTGCACTTTATTTGAGGGTGGGTGGGAGTAATCTAAACATTTATTCTGTGTA
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CCATTGATATGCATTTAAACCTTTTACTGCTGTGTTATGTTGATAACATATATAAATATTAGATAATGCTAATGCTTCTGCTGCTGTCTT
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CAGATAATCCAGGACAATCTCTCCATCTCAAGATCCTTAACTTAATGACGTGTGCCAAGTCCCTTTGGCTAGATAATTATTCATAGGTCC
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CTTTGACATACTTAAAAAAAAAACAGTTTATGGAAAGTACAGTTTAAGAGGAGAATTTGATTAGACTAAGTGGATATCTTTATAGAAATA
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CCCCAGCCCCAAACTCACCACCTGGCCGTGGACACCTGTGTCAGCATGTGGGACCTGGTTCTCTCCATCGCCTTGTCTGTGGGGTGCACT
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CTTTTCCTGTTGCATTATTCTATGGTCTGCCATGGACTGTGCACTTTATTTGAGGGTGGGTGGGAGTAATCTAAACATTTATTCTGTGTA
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GTAAATGGCAGTTTAATTGTTAGAAATGACTGTTTTTGCACCACTTGTAAAAAGGTATTTAGCGATTGCATTTGCTGTTTGTTGTTTTAT
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GTCTTTTAAATATTTTGAAGCCCATTTCAGTTAAATAATGACATGTCATGGTCCTTTGGAATCTTCATTTAAATGTTAAATCTGGAATCA
AAATGAAGCAAAAAATATCTGTCTCCTTTTCACTTTCTTCAGTACATAAATACATTATTTAATCAATAAGAATTAACTGTACTAAATCAT
GTATTATGCTGTTCTAGTTACAGCAAACACTCTTTAAGAAAAATATCCAATACACTAAATAGGTACTATAGTAATTTTTAGACATGGTAC
CCATTGATATGCATTTAAACCTTTTACTGCTGTGTTATGTTGATAACATATATAAATATTAGATAATGCTAATGCTTCTGCTGCTGTCTT
TTCTGTAATATTCTCTTTCATGCTGAATTTACTATGACCATTTATAAGCAGTGCAGTTAACTACAGATAGCATTTCAGGACAAAATAGAT
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CAGCTTGCTAAAGGAAACTGTGGAACCTTTTGTAACTTTTGGTGATATGGAAAATTATTTACAAACCGTCAAAGAATATGAGGAAGTTGC
TGTATGACATAGTGCTGGCACTGATATTATCCATCATCTCTTTTTGGACACTTCTGTAAATGTGATTGGATTGTTTGAAAGAAGATTTAA
AGTTTCAAAGTTTTTTGTTCTGTTTTTGCTTTGCATTTGGAGAAAATATTGAAAGCAGGGTATGTTGTTTCATTCACCTTGAAAAAACCA
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TGTAACCTGCGATTTCAATGATTGTTGTTCATATACATCATGTATTATTTTGGCCCATTTTGGGCCTAAAAAAGAAAACTATGCCTTAAA
AATCAGAACCTTTTCTCCCCACTATGCTTATGTGGCCATCTACAGCACTTAGAATAAAAACAGATGTTAAAATATTCAGTGAAAGTTTTA
TTGGAAAAAGGAATTGAGATATATAATTGAGATTTGGTGAAATTGAAGGAGAAAATTTAAGTGAGTCTTTAAAATATATTCTGAATGAAA
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TTTTGCTGTTTTAACGTAGTGACTCACTGAACTAAATACATAATTGACCAACATTAAGTGTATTTCCAATACAGAAGGGTTGAAAATATT
ACATTATAAACTCTTTTGAAAAATGTATCTAAAATTTTTTAAGTTCTGTTTTGATTCCACTTTTTGGTTGAGTTTTTATGTTTTTGTTTT
CAGGTAGATTAATAAATCTGGCAGCTGATTTCTGCAAGATTCTTGTGTTTTGAATTTCTCATTGAATTGGCTACTCAAACATAGAAATCA
TTTGTTAATGATGTAATGTCTTCTCTCAGCTTTTATCTTCACTGCTGTTTGCTGTCTCTTGATGATGACATGTTAATACCCAATAGATTA
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GACTGACAGTGCAGAACATTTTTCTCAAATCATGGGCGGATCTTGGAGGTCTAGTTTCCCGTAGATGCTGTAACCAATTACCACAACTTC
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CTTTTCCTGTTGCATTATTCTATGGTCTGCCATGGACTGTGCACTTTATTTGAGGGTGGGTGGGAGTAATCTAAACATTTATTCTGTGTA
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GAAACTATATCATGTCTGTTTGATTTCATAACAACATAAGATAATGTTTATTTTATCGGGGTATCTATGGTACAGTTAATTTCACGTTGT
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GTAAATGGCAGTTTAATTGTTAGAAATGACTGTTTTTGCACCACTTGTAAAAAGGTATTTAGCGATTGCATTTGCTGTTTGTTGTTTTAT
TTTGCTTTATATATGACTTGCAGAGGATAACCATAAAATGGGTAATTCTCTCTGAAGTTGAATAATCACCATGACTGTAAATGAGGGGCA
CAATTTTGGACTCTGGCGCCAAACTGAGTCATAGGCCAGTAGCATTACGTGTATCTGGTGCCACCTTGCTGTTTAGATACAAATCATACC
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TCACAAGAGAACAATGGCAGAAATGGTATTAGTTATATAATATTTAAGGACAAACTATATGTTTTGCTGTTTTAACGTAGTGACTCACTG
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GAAAACACTAAGTCATGAAACAGAAAAACAGAAGGTATGATAATAATAGTAATAACAGTTAAATCAGTGGTCTAATCCAGATTTTATTTT
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ATGTACATATTAAGCAATTCTACTAAGAATTGGAAAAATCAAGTTTCAAAAAGATGGTAATAGTTGGGCATGATACTAGAAAATTTCACC
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>43053_43053_72_KLK2-ETV1_KLK2_chr19_51378136_ENST00000358049_ETV1_chr7_13975521_ENST00000430479_length(amino acids)=424AA_BP=69
MWDLVLSIALSVGCTGAVPLIQSRIVGGWECEKHSQPWQVAVYSHGWAHCGGVLVHPQWVLTAAHCLKNAYDQKPQVGMRPSNPPTPSST
PVSPLHHASPNSTHTPKPDRAFPAHLPPSQSIPDSSYPMDHRFRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPMYQRQMSEPNIPFPPQGFKQEYHD
PVYEHNTMVGSAASQSFPPPLMIKQEPRDFAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAHPSRTEGCMFEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEPGMY
REGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYK

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Fusion Gene PPI Analysis for KLK2-ETV1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for KLK2-ETV1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for KLK2-ETV1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource