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Fusion gene:ANXA6-ABI1 (FusionGDB2 ID:5078)

Fusion Gene Summary for ANXA6-ABI1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: ANXA6-ABI1
Fusion gene ID: 5078
HgeneTgene
Gene symbol

ANXA6

ABI1

Gene ID

309

10006

Gene nameannexin A6abl interactor 1
SynonymsANX6|CBP68|CPB-II|p68|p70ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1
Cytomap

5q33.1

10p12.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionannexin A667 kDa calelectrinannexin VI (p68)annexin-6calcium-binding protein p68calelectrincalphobindin IIchromobindin-20lipocortin VItestis secretory sperm-binding protein Li 198aabl interactor 1Abelson interactor 1Abl-interactor protein 1 longabl-binding protein 4eps8 SH3 domain-binding proteininteractor protein AblBP4nap1 binding proteinspectrin SH3 domain-binding protein 1
Modification date2020031320200327
UniProtAcc

P08133

Q8IZP0

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000354546, ENST00000356496, 
ENST00000377751, ENST00000521512, 
ENST00000523714, ENST00000519610, 
ENST00000473481, ENST00000346832, 
ENST00000355394, ENST00000359188, 
ENST00000376134, ENST00000376137, 
ENST00000376138, ENST00000376139, 
ENST00000376140, ENST00000376142, 
ENST00000376160, ENST00000376166, 
ENST00000376170, ENST00000490841, 
ENST00000536334, 
Fusion gene scores* DoF score6 X 6 X 4=14414 X 8 X 5=560
# samples 613
** MAII scorelog2(6/144*10)=-1.26303440583379
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(13/560*10)=-2.10691520391651
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: ANXA6 [Title/Abstract] AND ABI1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointANXA6(150483131)-ABI1(27112234), # samples:1
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.ANXA6-ABI1 seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a CGC due to the frame-shifted ORF.
ANXA6-ABI1 seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a essential gene due to the frame-shifted ORF.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgeneABI1

GO:0018108

peptidyl-tyrosine phosphorylation

17101133


check buttonFusion gene breakpoints across ANXA6 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across ABI1 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4BRCATCGA-A8-A081-01AANXA6chr5

150483131

-ABI1chr10

27112234

-


Top

Fusion Gene ORF analysis for ANXA6-ABI1

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
5CDS-intronENST00000354546ENST00000473481ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000356496ENST00000473481ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000377751ENST00000473481ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000521512ENST00000473481ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000523714ENST00000473481ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000346832ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000355394ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000359188ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000376134ANXA6chr5

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000376137ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000376138ANXA6chr5

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000376139ANXA6chr5

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000376140ANXA6chr5

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000376142ANXA6chr5

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000376160ANXA6chr5

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000376166ANXA6chr5

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000376170ANXA6chr5

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000490841ANXA6chr5

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Frame-shiftENST00000523714ENST00000536334ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000354546ENST00000346832ANXA6chr5

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In-frameENST00000354546ENST00000355394ANXA6chr5

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In-frameENST00000354546ENST00000359188ANXA6chr5

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In-frameENST00000354546ENST00000376134ANXA6chr5

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In-frameENST00000354546ENST00000376137ANXA6chr5

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In-frameENST00000354546ENST00000376139ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000354546ENST00000376142ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000354546ENST00000376166ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000354546ENST00000376170ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000356496ENST00000355394ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000356496ENST00000376134ANXA6chr5

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In-frameENST00000356496ENST00000376137ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000356496ENST00000376138ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000356496ENST00000376139ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000356496ENST00000376140ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000356496ENST00000376142ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000356496ENST00000376160ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000356496ENST00000376166ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000356496ENST00000376170ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000356496ENST00000490841ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000377751ENST00000376138ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000377751ENST00000376170ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000377751ENST00000490841ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000521512ENST00000359188ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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In-frameENST00000521512ENST00000376137ANXA6chr5

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150483131

-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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150483131

-ABI1chr10

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intron-3CDSENST00000519610ENST00000359188ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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intron-3CDSENST00000519610ENST00000376134ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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intron-3CDSENST00000519610ENST00000376137ANXA6chr5

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-ABI1chr10

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intron-3CDSENST00000519610ENST00000376138ANXA6chr5

150483131

-ABI1chr10

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intron-3CDSENST00000519610ENST00000376139ANXA6chr5

150483131

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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intron-3CDSENST00000519610ENST00000376160ANXA6chr5

150483131

-ABI1chr10

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intron-3CDSENST00000519610ENST00000376166ANXA6chr5

150483131

-ABI1chr10

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intron-3CDSENST00000519610ENST00000376170ANXA6chr5

150483131

-ABI1chr10

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intron-3CDSENST00000519610ENST00000490841ANXA6chr5

150483131

-ABI1chr10

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intron-3CDSENST00000519610ENST00000536334ANXA6chr5

150483131

-ABI1chr10

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intron-intronENST00000519610ENST00000473481ANXA6chr5

150483131

-ABI1chr10

27112234

-

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000354546ANXA6chr5150483131-ENST00000376170ABI1chr1027112234-540621904534281127
ENST00000354546ANXA6chr5150483131-ENST00000359188ABI1chr1027112234-549321904535151156
ENST00000354546ANXA6chr5150483131-ENST00000376142ABI1chr1027112234-557721904535991184
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check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
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ENST00000521512ENST00000376140ANXA6chr5150483131-ABI1chr1027112234-0.0040719710.995928

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Fusion Genomic Features for ANXA6-ABI1


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

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Fusion Protein Features for ANXA6-ABI1


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr5:150483131/chr10:27112234)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
ANXA6

P08133

ABI1

Q8IZP0

FUNCTION: May associate with CD21. May regulate the release of Ca(2+) from intracellular stores.FUNCTION: May act in negative regulation of cell growth and transformation by interacting with nonreceptor tyrosine kinases ABL1 and/or ABL2. May play a role in regulation of EGF-induced Erk pathway activation. Involved in cytoskeletal reorganization and EGFR signaling. Together with EPS8 participates in transduction of signals from Ras to Rac. In vitro, a trimeric complex of ABI1, EPS8 and SOS1 exhibits Rac specific guanine nucleotide exchange factor (GEF) activity and ABI1 seems to act as an adapter in the complex. Regulates ABL1/c-Abl-mediated phosphorylation of ENAH. Recruits WASF1 to lamellipodia and there seems to regulate WASF1 protein level. In brain, seems to regulate the dendritic outgrowth and branching as well as to determine the shape and number of synaptic contacts of developing neurons. {ECO:0000269|PubMed:11003655, ECO:0000269|PubMed:18328268}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000354546-2526175_247654674.0RepeatAnnexin 3
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000354546-252620_91654674.0RepeatAnnexin 1
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000354546-2526251_322654674.0RepeatAnnexin 4
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000354546-2526363_434654674.0RepeatAnnexin 5
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000354546-2526435_506654674.0RepeatAnnexin 6
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000354546-2526521_595654674.0RepeatAnnexin 7
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000354546-252692_163654674.0RepeatAnnexin 2
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000523714-2425175_247622642.0RepeatAnnexin 3
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000523714-242520_91622642.0RepeatAnnexin 1
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000523714-2425251_322622642.0RepeatAnnexin 4
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000523714-2425363_434622642.0RepeatAnnexin 5
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000523714-2425435_506622642.0RepeatAnnexin 6
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000523714-2425521_595622642.0RepeatAnnexin 7
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000523714-242592_163622642.0RepeatAnnexin 2
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TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000376138010260_41839453.0Compositional biasNote=Pro-rich
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000376139010260_41839477.0Compositional biasNote=Pro-rich
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000376140011260_41839482.0Compositional biasNote=Pro-rich
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000376142012260_41839509.0Compositional biasNote=Pro-rich
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TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000376170010260_41839452.0Compositional biasNote=Pro-rich
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000049084107260_41839330.0Compositional biasNote=Pro-rich
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000346832112446_50556497.0DomainSH3
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000359188011446_50539481.0DomainSH3
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TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000376138010446_50539453.0DomainSH3
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TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000376139010446_50539477.0DomainSH3
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TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000376142012446_50539509.0DomainSH3
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TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000037616609446_50539447.0DomainSH3
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TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST00000376170010446_50539452.0DomainSH3
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000037617001045_10739452.0Domaint-SNARE coiled-coil homology
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000049084107446_50539330.0DomainSH3
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST000004908410745_10739330.0Domaint-SNARE coiled-coil homology

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000354546-2526599_670654674.0RepeatAnnexin 8
HgeneANXA6chr5:150483131chr10:27112234ENST00000523714-2425599_670622642.0RepeatAnnexin 8
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000034683211245_10756497.0Domaint-SNARE coiled-coil homology
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000034683211218_7956497.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000035918801118_7939481.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000037613801018_7939453.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000037613901018_7939477.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000037614001118_7939482.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000037614201218_7939509.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST000003761660918_7939447.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST0000037617001018_7939452.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr5:150483131chr10:27112234ENST000004908410718_7939330.0RegionRequired for binding to WASF1


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Fusion Gene Sequence for ANXA6-ABI1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>5078_5078_1_ANXA6-ABI1_ANXA6_chr5_150483131_ENST00000354546_ABI1_chr10_27112234_ENST00000346832_length(transcript)=5487nt_BP=2190nt
AGAGGGGTGGGGTGGAGGAGGGAGGCGGGCGCGCCGGATTGGCCTCTGCGCGCCACGTGTCCGGCTCGGAGCCCACGGCTGTCCTCCCGG
TCCGCCCCGCGCTGCGGTTGCTGCTGGGCTAACGGGCTCCGATCCAGCGAGCGCTGCGTCCTCGAGTCCCTGCGCCCGTGCGTCCGTCTG
CGACCCGAGGCCTCCGCTGCGCGTGGATTCTGCTGCGAACCGGAGACCATGGCCAAACCAGCACAGGGTGCCAAGTACCGGGGCTCCATC
CATGACTTCCCAGGCTTTGACCCCAACCAGGATGCCGAGGCTCTGTACACTGCCATGAAGGGCTTTGGCAGTGACAAGGAGGCCATACTG
GACATAATCACCTCACGGAGCAACAGGCAGAGGCAGGAGGTCTGCCAGAGCTACAAGTCCCTCTACGGCAAGGACCTCATTGCTGATTTA
AAGTATGAATTGACGGGCAAGTTTGAACGGTTGATTGTGGGCCTGATGAGGCCACCTGCCTATTGTGATGCCAAAGAAATTAAAGATGCC
ATCTCGGGCATTGGCACTGATGAGAAGTGCCTCATTGAGATCTTGGCTTCCCGGACCAATGAGCAGATGCACCAGCTGGTGGCAGCATAC
AAAGATGCCTACGAGCGGGACCTGGAGGCTGACATCATCGGCGACACCTCTGGCCACTTCCAGAAGATGCTTGTGGTCCTGCTCCAGGGA
ACCAGGGAGGAGGATGACGTAGTGAGCGAGGACCTGGTACAACAGGATGTCCAGGACCTATACGAGGCAGGGGAACTGAAATGGGGAACA
GATGAAGCCCAGTTCATTTACATCTTGGGAAATCGCAGCAAGCAGCATCTTCGGTTGGTGTTCGATGAGTATCTGAAGACCACAGGGAAG
CCGATTGAAGCCAGCATCCGAGGGGAGCTGTCTGGGGACTTTGAGAAGCTAATGCTGGCCGTAGTGAAGTGTATCCGGAGCACCCCGGAA
TATTTTGCTGAAAGGCTCTTCAAGGCTATGAAGGGCCTGGGGACTCGGGACAACACCCTGATCCGCATCATGGTCTCCCGTAGTGAGTTG
GACATGCTCGACATTCGGGAGATCTTCCGGACCAAGTATGAGAAGTCCCTCTACAGCATGATCAAGAATGACACCTCTGGCGAGTACAAG
AAGACTCTGCTGAAGCTGTCTGGGGGAGATGATGATGCTGCTGGCCAGTTCTTCCCGGAGGCAGCGCAGGTGGCCTATCAGATGTGGGAA
CTTAGTGCAGTGGCCCGAGTAGAGCTGAAGGGAACTGTGCGCCCAGCCAATGACTTCAACCCTGACGCAGATGCCAAAGCGCTGCGGAAA
GCCATGAAGGGACTCGGGACTGACGAAGACACAATCATCGATATCATCACGCACCGCAGCAATGTCCAGCGGCAGCAGATCCGGCAGACC
TTCAAGTCTCACTTTGGCCGGGACTTAATGACTGACCTGAAGTCTGAGATCTCTGGAGACCTGGCAAGGCTGATTCTGGGGCTCATGATG
CCACCGGCCCATTACGATGCCAAGCAGTTGAAGAAGGCCATGGAGGGAGCCGGCACAGATGAAAAGGCTCTTATTGAAATCCTGGCCACT
CGGACCAATGCTGAAATCCGGGCCATCAATGAGGCCTATAAGGAGGACTATCACAAGTCCCTGGAGGATGCTCTGAGCTCAGACACATCT
GGCCACTTCAGGAGGATCCTCATTTCTCTGGCCACGGGGCATCGTGAGGAGGGAGGAGAAAACCTGGACCAGGCACGGGAAGATGCCCAG
GTGGCTGCTGAGATCTTGGAAATAGCAGACACACCTAGTGGAGACAAAACTTCCTTGGAGACACGTTTCATGACGATCCTGTGTACCCGG
AGCTATCCGCACCTCCGGAGAGTCTTCCAGGAGTTCATCAAGATGACCAACTATGACGTGGAGCACACCATCAAGAAGGAGATGTCTGGG
GATGTCAGGGATGCATTTGTGGCCATTGTTCAAAGTGTCAAGAACAAGCCTCTCTTCTTTGCCGACAAACTTTACAAATCCATGAAGGGT
GCTGGCACAGATGAGAAGACTCTGACCAGGATCATGGTATCCCGCAGTGAGATTGACCTGCTCAACATCCGGAGGGAATTCATTGAGAAA
TATGACAAGTCTCTCCACCAAGCCATTGAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGACCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCT
AGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAGTTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCC
ATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATATTCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCA
AGAACTCACAAAATAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGATGTG
GGCCATGGTGTCAAGTGGCTAAAAGCCAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAAATCCTCCTACTCAG
AAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTTATAAAACCCTGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTT
CCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGTCAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACAC
AGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGAAGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCC
ACTATTGGACCAGAAAACATTTCTGTCCCTCCTCCTTCTGGAGCTCCACCAGCACCACCTCTGGCACCACTTCTCCCAGTGAGCACTGTG
ATAGCAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCTACTACTTCTTCGACATCT
TCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCA
ATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCA
GTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATTATATT
GAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGCAATCATTTATGTTATAAAGAAG
AATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCCTGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCACTATACTGAT
TAATTTTTTTTTTTCTTTTGAAGTAGATTCTTATTACTCAGTCATACTGTGGGACTATTATGGTTAACAGAACTGTCTTAATATGTTTTA
AAATGTGCCCATATTTTCAGAACATGCTGTTTTATTGGTAAATTGAATGTCTACCTGTAAGCATAAATCTTTGAGGCAGTTTATGTATTG
CTGAATAGCAATTTATACAAGAAGCTGTCCATAACTGATTATGCTTATGTACTTACTTACACATTTTTAACTTTATGACCAGCCTAAATA
TTCTGGGGGAAGTGGGGTATAATATTTAACGAATCATGATTCAGATTGTACCATTACATGTTTCAGTGCAGCATGGTTACTAACGCTATG
TCAGACTAATATTAAAATCAGAAAATTTAAATGCTGGTGCTGGTCAGACTTTTTTTGTTAGATTCTCTCATTTAAAAAAAATACTGTTTG
TTTAAAGCATGCATAAAAATTTATGTATTGAAATATACTTAAAAATTCAAGATGCTTCCCATTTGTGTAATATTTACCTGGAGGACTCGT
ACTTAGGTGTCTTAACGTGAATTGAGTCTCCAAGGTCTCCATGTGAAACAAGCAAAAAGAGAATTATCTGTAATGTTGTAATTTGTACCT
AAGTTTTTTAATGAGTGAAATTTGCATTATAAACTTTTTCCATTCATAAATACATAAGTGAACCAAAGGTTTTTGTCCTTTCCTTCACTG
ATTTGCTTTAAAAAAAATAAAAGATAATGATTTATTGCAGAATTATGATTCTATTTTCTCAATATGTTAACTTGGAAAAAAATTTTAGCC
TTATCTTAATCTGTCCCAACAGCAATGTGACGGATTTTTGCAGATTCAAAATCTGCAATGGTTATTTACAAGTCAATCTACTGAATTCCT
TTTTTAAATAATCTTTTGAAACTAAGAAAATGTGTCAAATTGTGTGCATTCATTCTGTAGGTAAAATTCTTAAGGATTGCCATGTCAGTC
CTTCAGTTGTACAGTGAACTGTTGTACACTGGTTCAATGAAAGGAAGTTAAAAGTACCTTTTACATATTGTAAAAGTGGATACAGTTGAT
TTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCACTAGCAACATTAGAATTTTAAAATAAAATAATTGGGAAAGAAGGTGGGTCATGTA
TTAATCAGTGAACAGAGATTTACCTAACCAACAGACTTGGATTGTCTTTTGACATAATCAAAATGCAACACATGCACTTTGTGTGTCTCC
TCTTAATTGAAGGGAGGGCTGAGGGATGTTTTCTCTTCTTGTCTTGTGTATAATTCTCTATTGCTTAGGATATTAAAGTAGAGCACTCAA
GTGTGGGTTTCTGTGTTATTGAGGATTTGTTTGGAATTCAAATTACAGTTATGTACTGGATGCTACAGACTTATAACAGCATAGTGAATG
GTAAGACTAGTGCAAAACAGTTATTTCTGAAAATTAAAGACCATTATTGCTACCAAATCAATGTGACTATTTCATATGCATTTTGCCTTT
GTTAATTTTAAACAAACAAAGTATCATTAGTGATCAGCTAGCTACCTTCTACTTTCCATTTTTCAAGTGGATTGTTCTCTTAATTTGTAT
ATAACCTGTTGTCTAAATTTTATGTACAGTCTTTTATAATAAACCATTCTCCTATATGAAATTTTGGATACTGTTAAAATATAACTCATG
TGGACTTCAATGCAGACTTCACATTTTTCTGACCTTTACTCCTACGGTAAATCAAGACAAACCATTTGAATTTTAACATTGGTTATTTAT
TTGTGTAATGGCCTTACATGTGGATATTAACAGTGTAAACAATACCACATATAACCATCAAGATACCTTGATTATAATTTATAGGACTAG

>5078_5078_1_ANXA6-ABI1_ANXA6_chr5_150483131_ENST00000354546_ABI1_chr10_27112234_ENST00000346832_length(amino acids)=1155AA_BP=715
MRATCPARSPRLSSRSAPRCGCCWANGLRSSERCVLESLRPCVRLRPEASAARGFCCEPETMAKPAQGAKYRGSIHDFPGFDPNQDAEAL
YTAMKGFGSDKEAILDIITSRSNRQRQEVCQSYKSLYGKDLIADLKYELTGKFERLIVGLMRPPAYCDAKEIKDAISGIGTDEKCLIEIL
ASRTNEQMHQLVAAYKDAYERDLEADIIGDTSGHFQKMLVVLLQGTREEDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELKWGTDEAQFIYILGNRSKQ
HLRLVFDEYLKTTGKPIEASIRGELSGDFEKLMLAVVKCIRSTPEYFAERLFKAMKGLGTRDNTLIRIMVSRSELDMLDIREIFRTKYEK
SLYSMIKNDTSGEYKKTLLKLSGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVARVELKGTVRPANDFNPDADAKALRKAMKGLGTDEDTIIDI
ITHRSNVQRQQIRQTFKSHFGRDLMTDLKSEISGDLARLILGLMMPPAHYDAKQLKKAMEGAGTDEKALIEILATRTNAEIRAINEAYKE
DYHKSLEDALSSDTSGHFRRILISLATGHREEGGENLDQAREDAQVAAEILEIADTPSGDKTSLETRFMTILCTRSYPHLRRVFQEFIKM
TNYDVEHTIKKEMSGDVRDAFVAIVQSVKNKPLFFADKLYKSMKGAGTDEKTLTRIMVSRSEIDLLNIRREFIEKYDKSLHQAIEATDKR
KALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPV
RYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQH
SPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPENISVPPPSGAPPAPPLAPLLPVSTVIAAPGSAPGSQYGTM
TRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYND

--------------------------------------------------------------
>5078_5078_2_ANXA6-ABI1_ANXA6_chr5_150483131_ENST00000354546_ABI1_chr10_27112234_ENST00000355394_length(transcript)=5577nt_BP=2190nt
AGAGGGGTGGGGTGGAGGAGGGAGGCGGGCGCGCCGGATTGGCCTCTGCGCGCCACGTGTCCGGCTCGGAGCCCACGGCTGTCCTCCCGG
TCCGCCCCGCGCTGCGGTTGCTGCTGGGCTAACGGGCTCCGATCCAGCGAGCGCTGCGTCCTCGAGTCCCTGCGCCCGTGCGTCCGTCTG
CGACCCGAGGCCTCCGCTGCGCGTGGATTCTGCTGCGAACCGGAGACCATGGCCAAACCAGCACAGGGTGCCAAGTACCGGGGCTCCATC
CATGACTTCCCAGGCTTTGACCCCAACCAGGATGCCGAGGCTCTGTACACTGCCATGAAGGGCTTTGGCAGTGACAAGGAGGCCATACTG
GACATAATCACCTCACGGAGCAACAGGCAGAGGCAGGAGGTCTGCCAGAGCTACAAGTCCCTCTACGGCAAGGACCTCATTGCTGATTTA
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CTTCAGTTGTACAGTGAACTGTTGTACACTGGTTCAATGAAAGGAAGTTAAAAGTACCTTTTACATATTGTAAAAGTGGATACAGTTGAT
TTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCACTAGCAACATTAGAATTTTAAAATAAAATAATTGGGAAAGAAGGTGGGTCATGTA
TTAATCAGTGAACAGAGATTTACCTAACCAACAGACTTGGATTGTCTTTTGACATAATCAAAATGCAACACATGCACTTTGTGTGTCTCC
TCTTAATTGAAGGGAGGGCTGAGGGATGTTTTCTCTTCTTGTCTTGTGTATAATTCTCTATTGCTTAGGATATTAAAGTAGAGCACTCAA
GTGTGGGTTTCTGTGTTATTGAGGATTTGTTTGGAATTCAAATTACAGTTATGTACTGGATGCTACAGACTTATAACAGCATAGTGAATG
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ATGTCAGTCCTTCAGTTGTACAGTGAACTGTTGTACACTGGTTCAATGAAAGGAAGTTAAAAGTACCTTTTACATATTGTAAAAGTGGAT
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CTCTGTACACTGCCATGAAGGGCTTTGGCAGTGACAAGGAGGCCATACTGGACATAATCACCTCACGGAGCAACAGGCAGAGGCAGGAGG
TCTGCCAGAGCTACAAGTCCCTCTACGGCAAGGACCTCATTGCTGATTTAAAGTATGAATTGACGGGCAAGTTTGAACGGTTGATTGTGG
GCCTGATGAGGCCACCTGCCTATTGTGATGCCAAAGAAATTAAAGATGCCATCTCGGGCATTGGCACTGATGAGAAGTGCCTCATTGAGA
TCTTGGCTTCCCGGACCAATGAGCAGATGCACCAGCTGGTGGCAGCATACAAAGATGCCTACGAGCGGGACCTGGAGGCTGACATCATCG
GCGACACCTCTGGCCACTTCCAGAAGATGCTTGTGGTCCTGCTCCAGGGAACCAGGGAGGAGGATGACGTAGTGAGCGAGGACCTGGTAC
AACAGGATGTCCAGGACCTATACGAGGCAGGGGAACTGAAATGGGGAACAGATGAAGCCCAGTTCATTTACATCTTGGGAAATCGCAGCA
AGCAGCATCTTCGGTTGGTGTTCGATGAGTATCTGAAGACCACAGGGAAGCCGATTGAAGCCAGCATCCGAGGGGAGCTGTCTGGGGACT
TTGAGAAGCTAATGCTGGCCGTAGTGAAGTGTATCCGGAGCACCCCGGAATATTTTGCTGAAAGGCTCTTCAAGGCTATGAAGGGCCTGG
GGACTCGGGACAACACCCTGATCCGCATCATGGTCTCCCGTAGTGAGTTGGACATGCTCGACATTCGGGAGATCTTCCGGACCAAGTATG
AGAAGTCCCTCTACAGCATGATCAAGAATGACACCTCTGGCGAGTACAAGAAGACTCTGCTGAAGCTGTCTGGGGGAGATGATGATGCTG
CTGGCCAGTTCTTCCCGGAGGCAGCGCAGGTGGCCTATCAGATGTGGGAACTTAGTGCAGTGGCCCGAGTAGAGCTGAAGGGAACTGTGC
GCCCAGCCAATGACTTCAACCCTGACGCAGATGCCAAAGCGCTGCGGAAAGCCATGAAGGGACTCGGGACTGACGAAGACACAATCATCG
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TGGAGGGAGCCGGCACAGATGAAAAGGCTCTTATTGAAATCCTGGCCACTCGGACCAATGCTGAAATCCGGGCCATCAATGAGGCCTATA
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AGATGCTTCCCATTTGTGTAATATTTACCTGGAGGACTCGTACTTAGGTGTCTTAACGTGAATTGAGTCTCCAAGGTCTCCATGTGAAAC
AAGCAAAAAGAGAATTATCTGTAATGTTGTAATTTGTACCTAAGTTTTTTAATGAGTGAAATTTGCATTATAAACTTTTTCCATTCATAA
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TCTATTTTCTCAATATGTTAACTTGGAAAAAAATTTTAGCCTTATCTTAATCTGTCCCAACAGCAATGTGACGGATTTTTGCAGATTCAA
AATCTGCAATGGTTATTTACAAGTCAATCTACTGAATTCCTTTTTTAAATAATCTTTTGAAACTAAGAAAATGTGTCAAATTGTGTGCAT
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AAAAGTACCTTTTACATATTGTAAAAGTGGATACAGTTGATTTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCACTAGCAACATTAGA
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ATAATTCTCTATTGCTTAGGATATTAAAGTAGAGCACTCAAGTGTGGGTTTCTGTGTTATTGAGGATTTGTTTGGAATTCAAATTACAGT
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AAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATATTCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGA
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TAAAATTCTTAAGGATTGCCATGTCAGTCCTTCAGTTGTACAGTGAACTGTTGTACACTGGTTCAATGAAAGGAAGTTAAAAGTACCTTT
TACATATTGTAAAAGTGGATACAGTTGATTTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCACTAGCAACATTAGAATTTTAAAATAA
AATAATTGGGAAAGAAGGTGGGTCATGTATTAATCAGTGAACAGAGATTTACCTAACCAACAGACTTGGATTGTCTTTTGACATAATCAA
AATGCAACACATGCACTTTGTGTGTCTCCTCTTAATTGAAGGGAGGGCTGAGGGATGTTTTCTCTTCTTGTCTTGTGTATAATTCTCTAT
TGCTTAGGATATTAAAGTAGAGCACTCAAGTGTGGGTTTCTGTGTTATTGAGGATTTGTTTGGAATTCAAATTACAGTTATGTACTGGAT
GCTACAGACTTATAACAGCATAGTGAATGGTAAGACTAGTGCAAAACAGTTATTTCTGAAAATTAAAGACCATTATTGCTACCAAATCAA
TGTGACTATTTCATATGCATTTTGCCTTTGTTAATTTTAAACAAACAAAGTATCATTAGTGATCAGCTAGCTACCTTCTACTTTCCATTT
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ACCTTCTACTTTCCATTTTTCAAGTGGATTGTTCTCTTAATTTGTATATAACCTGTTGTCTAAATTTTATGTACAGTCTTTTATAATAAA
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CATTCTCCTATATGAAATTTTGGATACTGTTAAAATATAACTCATGTGGACTTCAATGCAGACTTCACATTTTTCTGACCTTTACTCCTA
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TGCAGAATTATGATTCTATTTTCTCAATATGTTAACTTGGAAAAAAATTTTAGCCTTATCTTAATCTGTCCCAACAGCAATGTGACGGAT
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AATGAAAGGAAGTTAAAAGTACCTTTTACATATTGTAAAAGTGGATACAGTTGATTTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCA
CTAGCAACATTAGAATTTTAAAATAAAATAATTGGGAAAGAAGGTGGGTCATGTATTAATCAGTGAACAGAGATTTACCTAACCAACAGA
CTTGGATTGTCTTTTGACATAATCAAAATGCAACACATGCACTTTGTGTGTCTCCTCTTAATTGAAGGGAGGGCTGAGGGATGTTTTCTC
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TGCTTATGTACTTACTTACACATTTTTAACTTTATGACCAGCCTAAATATTCTGGGGGAAGTGGGGTATAATATTTAACGAATCATGATT
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ATTATGATTCTATTTTCTCAATATGTTAACTTGGAAAAAAATTTTAGCCTTATCTTAATCTGTCCCAACAGCAATGTGACGGATTTTTGC
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TGCCGAGGCTCTGTACACTGCCATGAAGGGCTTTGGCAGTGACAAGGAGGCCATACTGGACATAATCACCTCACGGAGCAACAGGCAGAG
GCAGGAGGTCTGCCAGAGCTACAAGTCCCTCTACGGCAAGGACCTCATTGCTGATTTAAATGAGTTGGACATGCTCGACATTCGGGAGAT
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GCAGTTGAAGAAGGCCATGGAGGGAGCCGGCACAGATGAAAAGGCTCTTATTGAAATCCTGGCCACTCGGACCAATGCTGAAATCCGGGC
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ATTCTTATTACTCAGTCATACTGTGGGACTATTATGGTTAACAGAACTGTCTTAATATGTTTTAAAATGTGCCCATATTTTCAGAACATG
CTGTTTTATTGGTAAATTGAATGTCTACCTGTAAGCATAAATCTTTGAGGCAGTTTATGTATTGCTGAATAGCAATTTATACAAGAAGCT
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KPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVADSPTPPPPPPPDDIPMFDD
SPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNY

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Fusion Gene PPI Analysis for ANXA6-ABI1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for ANXA6-ABI1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for ANXA6-ABI1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource