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Fusion Gene Summary | |
Fusion Gene ORF analysis | |
Fusion Genomic Features | |
Fusion Protein Features | |
Fusion Gene Sequence | |
Fusion Gene PPI analysis | |
Related Drugs | |
Related Diseases |
Fusion gene:MAGI1-LPP (FusionGDB2 ID:50784) |
Fusion Gene Summary for MAGI1-LPP |
Fusion gene summary |
Fusion gene information | Fusion gene name: MAGI1-LPP | Fusion gene ID: 50784 | Hgene | Tgene | Gene symbol | MAGI1 | LPP | Gene ID | 154043 | 4026 |
Gene name | CNKSR family member 3 | LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma | |
Synonyms | CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 | - | |
Cytomap | 6q25.2 | 3q27.3-q28 | |
Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
Description | connector enhancer of kinase suppressor of ras 3CNK homolog protein 3connector enhancer of KSR 3maguin-like proteinmembrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 1membrane-associated guanylate kinase-interacting protein-like 1 | lipoma-preferred partnerLIM proteinlipoma preferred partner | |
Modification date | 20200320 | 20200313 | |
UniProtAcc | Q96QZ7 | Q93052 | |
Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000330909, ENST00000402939, ENST00000483466, ENST00000497477, ENST00000470990, | ENST00000471917, ENST00000312675, ENST00000448637, ENST00000543006, | |
Fusion gene scores | * DoF score | 19 X 13 X 10=2470 | 25 X 27 X 9=6075 |
# samples | 23 | 34 | |
** MAII score | log2(23/2470*10)=-3.42480527552766 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | log2(34/6075*10)=-4.1592777572428 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | |
Context | PubMed: MAGI1 [Title/Abstract] AND LPP [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
Most frequent breakpoint | MAGI1(66023670)-LPP(188326948), # samples:1 MAGI1(66023671)-LPP(188326949), # samples:1 | ||
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event. |
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
Fusion gene breakpoints across MAGI1 (5'-gene) * Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window. |
Fusion gene breakpoints across LPP (3'-gene) * Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window. |
Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
Source | Disease | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
ChimerDB4 | Non-Cancer | TCGA-CG-5730-11A | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
ChimerDB4 | Non-Cancer | TCGA-CG-5730-11A | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
Top |
Fusion Gene ORF analysis for MAGI1-LPP |
Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
5CDS-3UTR | ENST00000330909 | ENST00000471917 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
5CDS-3UTR | ENST00000330909 | ENST00000471917 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
5CDS-3UTR | ENST00000402939 | ENST00000471917 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
5CDS-3UTR | ENST00000402939 | ENST00000471917 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
5CDS-3UTR | ENST00000483466 | ENST00000471917 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
5CDS-3UTR | ENST00000483466 | ENST00000471917 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
5CDS-3UTR | ENST00000497477 | ENST00000471917 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
5CDS-3UTR | ENST00000497477 | ENST00000471917 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000330909 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000330909 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000330909 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000330909 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000330909 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000330909 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000402939 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000402939 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000402939 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000402939 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000402939 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000402939 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000483466 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000483466 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000483466 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000483466 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000483466 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000483466 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000497477 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000497477 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000497477 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000497477 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
In-frame | ENST00000497477 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
In-frame | ENST00000497477 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
intron-3CDS | ENST00000470990 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
intron-3CDS | ENST00000470990 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
intron-3CDS | ENST00000470990 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
intron-3CDS | ENST00000470990 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
intron-3CDS | ENST00000470990 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
intron-3CDS | ENST00000470990 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
intron-3UTR | ENST00000470990 | ENST00000471917 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + |
intron-3UTR | ENST00000470990 | ENST00000471917 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + |
ORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. |
Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand | Seq length (transcript) | BP loci (transcript) | Predicted start (transcript) | Predicted stop (transcript) | Seq length (amino acids) |
ENST00000330909 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000448637 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 5573 | 313 | 250 | 1170 | 306 |
ENST00000330909 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000312675 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000330909 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000543006 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000402939 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000448637 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 5573 | 313 | 250 | 1170 | 306 |
ENST00000402939 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000312675 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000402939 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000543006 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000483466 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000448637 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 5815 | 555 | 492 | 1412 | 306 |
ENST00000483466 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000312675 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 18158 | 555 | 492 | 1964 | 490 |
ENST00000483466 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000543006 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 18158 | 555 | 492 | 1964 | 490 |
ENST00000497477 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000448637 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 5573 | 313 | 250 | 1170 | 306 |
ENST00000497477 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000312675 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000497477 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | ENST00000543006 | LPP | chr3 | 188326948 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000330909 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000448637 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 5573 | 313 | 250 | 1170 | 306 |
ENST00000330909 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000312675 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000330909 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000543006 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000402939 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000448637 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 5573 | 313 | 250 | 1170 | 306 |
ENST00000402939 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000312675 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000402939 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000543006 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000483466 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000448637 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 5815 | 555 | 492 | 1412 | 306 |
ENST00000483466 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000312675 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 18158 | 555 | 492 | 1964 | 490 |
ENST00000483466 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000543006 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 18158 | 555 | 492 | 1964 | 490 |
ENST00000497477 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000448637 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 5573 | 313 | 250 | 1170 | 306 |
ENST00000497477 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000312675 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
ENST00000497477 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | ENST00000543006 | LPP | chr3 | 188326949 | + | 17916 | 313 | 250 | 1722 | 490 |
DeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated. |
Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand | No-coding score | Coding score |
ENST00000330909 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.001117985 | 0.998882 |
ENST00000330909 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000330909 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000402939 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.001117985 | 0.998882 |
ENST00000402939 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000402939 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000483466 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.001190143 | 0.9988098 |
ENST00000483466 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.000330217 | 0.9996698 |
ENST00000483466 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.000330217 | 0.9996698 |
ENST00000497477 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.001117985 | 0.998882 |
ENST00000497477 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000497477 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023670 | - | LPP | chr3 | 188326948 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000330909 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.001117985 | 0.998882 |
ENST00000330909 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000330909 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000402939 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.001117985 | 0.998882 |
ENST00000402939 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000402939 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000483466 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.001190143 | 0.9988098 |
ENST00000483466 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.000330217 | 0.9996698 |
ENST00000483466 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.000330217 | 0.9996698 |
ENST00000497477 | ENST00000448637 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.001117985 | 0.998882 |
ENST00000497477 | ENST00000312675 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
ENST00000497477 | ENST00000543006 | MAGI1 | chr3 | 66023671 | - | LPP | chr3 | 188326949 | + | 0.000336953 | 0.999663 |
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Fusion Genomic Features for MAGI1-LPP |
FusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints. |
Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand | 1-p | p (fusion gene breakpoint) |
Distribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page. |
Distribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page. |
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Fusion Protein Features for MAGI1-LPP |
Four levels of functional features of fusion genes Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr3:66023670/chr3:188326948) - FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels. - How to search 1. Put your fusion gene symbol. 2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled. 4. Go down and press 'Search' tab twice. 4. Go down to have the hyperlink of the search result. 5. Click the hyperlink. 6. See the FGviewer result for your fusion gene. |
Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
Hgene | Tgene |
MAGI1 | LPP |
FUNCTION: May play a role as scaffolding protein at cell-cell junctions. May regulate acid-induced ASIC3 currents by modulating its expression at the cell surface (By similarity). {ECO:0000250}. | FUNCTION: May play a structural role at sites of cell adhesion in maintaining cell shape and motility. In addition to these structural functions, it may also be implicated in signaling events and activation of gene transcription. May be involved in signal transduction from cell adhesion sites to the nucleus allowing successful integration of signals arising from soluble factors and cell-cell adhesion sites. Also suggested to serve as a scaffold protein upon which distinct protein complexes are assembled in the cytoplasm and in the nucleus. {ECO:0000269|PubMed:10637295}. |
Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 17_105 | 104 | 1288.0 | Domain | PDZ 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 17_105 | 104 | 1463.0 | Domain | PDZ 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 17_105 | 104 | 1257.0 | Domain | PDZ 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 17_105 | 104 | 1161.0 | Domain | PDZ 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 17_105 | 104 | 1288.0 | Domain | PDZ 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 17_105 | 104 | 1463.0 | Domain | PDZ 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 17_105 | 104 | 1257.0 | Domain | PDZ 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 17_105 | 104 | 1161.0 | Domain | PDZ 1 |
Tgene | LPP | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000312675 | 4 | 11 | 414_473 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 1 | |
Tgene | LPP | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000312675 | 4 | 11 | 474_534 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 2 | |
Tgene | LPP | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000312675 | 4 | 11 | 535_603 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 3 | |
Tgene | LPP | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000543006 | 4 | 11 | 414_473 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 1 | |
Tgene | LPP | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000543006 | 4 | 11 | 474_534 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 2 | |
Tgene | LPP | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000543006 | 4 | 11 | 535_603 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 3 | |
Tgene | LPP | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000312675 | 4 | 11 | 414_473 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 1 | |
Tgene | LPP | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000312675 | 4 | 11 | 474_534 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 2 | |
Tgene | LPP | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000312675 | 4 | 11 | 535_603 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 3 | |
Tgene | LPP | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000543006 | 4 | 11 | 414_473 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 1 | |
Tgene | LPP | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000543006 | 4 | 11 | 474_534 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 2 | |
Tgene | LPP | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000543006 | 4 | 11 | 535_603 | 143 | 613.0 | Domain | LIM zinc-binding 3 |
- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 1341_1344 | 104 | 1288.0 | Compositional bias | Note=Poly-Ala |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 1398_1401 | 104 | 1288.0 | Compositional bias | Note=Poly-Arg |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 402_421 | 104 | 1288.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gln |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 662_665 | 104 | 1288.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 978_988 | 104 | 1288.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 1341_1344 | 104 | 1463.0 | Compositional bias | Note=Poly-Ala |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 1398_1401 | 104 | 1463.0 | Compositional bias | Note=Poly-Arg |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 402_421 | 104 | 1463.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gln |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 662_665 | 104 | 1463.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 978_988 | 104 | 1463.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 1341_1344 | 104 | 1257.0 | Compositional bias | Note=Poly-Ala |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 1398_1401 | 104 | 1257.0 | Compositional bias | Note=Poly-Arg |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 402_421 | 104 | 1257.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gln |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 662_665 | 104 | 1257.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 978_988 | 104 | 1257.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 1341_1344 | 104 | 1161.0 | Compositional bias | Note=Poly-Ala |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 1398_1401 | 104 | 1161.0 | Compositional bias | Note=Poly-Arg |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 402_421 | 104 | 1161.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gln |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 662_665 | 104 | 1161.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 978_988 | 104 | 1161.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 1341_1344 | 104 | 1288.0 | Compositional bias | Note=Poly-Ala |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 1398_1401 | 104 | 1288.0 | Compositional bias | Note=Poly-Arg |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 402_421 | 104 | 1288.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gln |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 662_665 | 104 | 1288.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 978_988 | 104 | 1288.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 1341_1344 | 104 | 1463.0 | Compositional bias | Note=Poly-Ala |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 1398_1401 | 104 | 1463.0 | Compositional bias | Note=Poly-Arg |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 402_421 | 104 | 1463.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gln |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 662_665 | 104 | 1463.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 978_988 | 104 | 1463.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 1341_1344 | 104 | 1257.0 | Compositional bias | Note=Poly-Ala |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 1398_1401 | 104 | 1257.0 | Compositional bias | Note=Poly-Arg |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 402_421 | 104 | 1257.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gln |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 662_665 | 104 | 1257.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 978_988 | 104 | 1257.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 1341_1344 | 104 | 1161.0 | Compositional bias | Note=Poly-Ala |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 1398_1401 | 104 | 1161.0 | Compositional bias | Note=Poly-Arg |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 402_421 | 104 | 1161.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gln |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 662_665 | 104 | 1161.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 978_988 | 104 | 1161.0 | Compositional bias | Note=Poly-Gly |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 1124_1206 | 104 | 1288.0 | Domain | PDZ 6 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 300_333 | 104 | 1288.0 | Domain | WW 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 359_392 | 104 | 1288.0 | Domain | WW 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 472_554 | 104 | 1288.0 | Domain | PDZ 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 643_721 | 104 | 1288.0 | Domain | PDZ 3 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 813_895 | 104 | 1288.0 | Domain | PDZ 4 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 96_287 | 104 | 1288.0 | Domain | Guanylate kinase-like |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 1124_1206 | 104 | 1463.0 | Domain | PDZ 6 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 300_333 | 104 | 1463.0 | Domain | WW 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 359_392 | 104 | 1463.0 | Domain | WW 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 472_554 | 104 | 1463.0 | Domain | PDZ 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 643_721 | 104 | 1463.0 | Domain | PDZ 3 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 813_895 | 104 | 1463.0 | Domain | PDZ 4 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 96_287 | 104 | 1463.0 | Domain | Guanylate kinase-like |
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Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 643_721 | 104 | 1257.0 | Domain | PDZ 3 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 813_895 | 104 | 1257.0 | Domain | PDZ 4 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 96_287 | 104 | 1257.0 | Domain | Guanylate kinase-like |
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Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 300_333 | 104 | 1161.0 | Domain | WW 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 359_392 | 104 | 1161.0 | Domain | WW 2 |
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Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 643_721 | 104 | 1161.0 | Domain | PDZ 3 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 813_895 | 104 | 1161.0 | Domain | PDZ 4 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 96_287 | 104 | 1161.0 | Domain | Guanylate kinase-like |
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Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 300_333 | 104 | 1288.0 | Domain | WW 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 359_392 | 104 | 1288.0 | Domain | WW 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 472_554 | 104 | 1288.0 | Domain | PDZ 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 643_721 | 104 | 1288.0 | Domain | PDZ 3 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 813_895 | 104 | 1288.0 | Domain | PDZ 4 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 96_287 | 104 | 1288.0 | Domain | Guanylate kinase-like |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 1124_1206 | 104 | 1463.0 | Domain | PDZ 6 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 300_333 | 104 | 1463.0 | Domain | WW 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 359_392 | 104 | 1463.0 | Domain | WW 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 472_554 | 104 | 1463.0 | Domain | PDZ 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 643_721 | 104 | 1463.0 | Domain | PDZ 3 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 813_895 | 104 | 1463.0 | Domain | PDZ 4 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 96_287 | 104 | 1463.0 | Domain | Guanylate kinase-like |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 1124_1206 | 104 | 1257.0 | Domain | PDZ 6 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 300_333 | 104 | 1257.0 | Domain | WW 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 359_392 | 104 | 1257.0 | Domain | WW 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 472_554 | 104 | 1257.0 | Domain | PDZ 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 643_721 | 104 | 1257.0 | Domain | PDZ 3 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 813_895 | 104 | 1257.0 | Domain | PDZ 4 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 96_287 | 104 | 1257.0 | Domain | Guanylate kinase-like |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 1124_1206 | 104 | 1161.0 | Domain | PDZ 6 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 300_333 | 104 | 1161.0 | Domain | WW 1 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 359_392 | 104 | 1161.0 | Domain | WW 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 472_554 | 104 | 1161.0 | Domain | PDZ 2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 643_721 | 104 | 1161.0 | Domain | PDZ 3 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 813_895 | 104 | 1161.0 | Domain | PDZ 4 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 96_287 | 104 | 1161.0 | Domain | Guanylate kinase-like |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 103_110 | 104 | 1288.0 | Nucleotide binding | ATP |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 103_110 | 104 | 1463.0 | Nucleotide binding | ATP |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 103_110 | 104 | 1257.0 | Nucleotide binding | ATP |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 103_110 | 104 | 1161.0 | Nucleotide binding | ATP |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 103_110 | 104 | 1288.0 | Nucleotide binding | ATP |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 103_110 | 104 | 1463.0 | Nucleotide binding | ATP |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 103_110 | 104 | 1257.0 | Nucleotide binding | ATP |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 103_110 | 104 | 1161.0 | Nucleotide binding | ATP |
Tgene | LPP | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000312675 | 4 | 11 | 41_370 | 143 | 613.0 | Compositional bias | Note=Pro-rich | |
Tgene | LPP | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000543006 | 4 | 11 | 41_370 | 143 | 613.0 | Compositional bias | Note=Pro-rich | |
Tgene | LPP | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000312675 | 4 | 11 | 41_370 | 143 | 613.0 | Compositional bias | Note=Pro-rich | |
Tgene | LPP | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000543006 | 4 | 11 | 41_370 | 143 | 613.0 | Compositional bias | Note=Pro-rich |
Top |
Fusion Gene Sequence for MAGI1-LPP |
For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones. |
>50784_50784_1_MAGI1-LPP_MAGI1_chr3_66023670_ENST00000330909_LPP_chr3_188326948_ENST00000312675_length(transcript)=17916nt_BP=313nt ATGTCCAAAGTGATCCAGAAGAAGAACCACTGGACTAGCAGGGTTCACGAATGCACCGTGAAGCGGGGACCCCAGGGCGAGCTGGGGGTG ACGGTGCTGGGAGGCGCGGAGCACGGGGAGTTTCCGTACGTCGGAGCGGTGGCGGCGGTCGAGGCAGCGGGGCTTCCCGGCGGCGGCGAG GGCCCGAGGCTGGGCGAAGGGGAGCTGCTTCTGGAGGTGCAGGGGGTCCGGGTGTCCGGCTTGCCCCGCTATGACGTGCTGGGGGTCATC GACAGCTGCAAGGAGGCCGTCACCTTCAAGGCCGTCAGACAAGAGCTCCACTGGTTCAACAGCCTCTCCTCCAGTTTCGACCCCAGTCAC AGGACACAAGAGAATGGTCATCCCGAACCAACCCCCTCTAACAGCAACCAAGAAGTCTACATTGAAACCACAGCCTGCACCCCAGGCTGG ACCCATCCCTGTGGCTCCAATCGGAACACTCAAACCCCAGCCTCAGCCAGTCCCAGCCTCCTACACCACGGCCTCCACTTCTTCAAGGCC TACCTTTAATGTGCAGGTGAAGTCAGCCCAGCCCAGCCCTCATTATATGGCTGCCCCTTCATCAGGACAAATTTATGGCTCAGGGCCCCA GGGCTATAACACTCAGCCAGTTCCTGTCTCTGGGCAGTGTCCACCTCCTTCAACACGGGGAGGCATGGATTATGCCTACATTCCACCACC AGGACTTCAGCCGGAGCCTGGGTATGGGTATGCCCCCAACCAGGGACGCTATTATGAAGGCTACTATGCAGCAGGGCCAGGCTATGGGGG CAGAAATGACTCTGACCCTACCTATGGTCAACAAGGTCACCCAAATACCTGGAAACGGGAACCAGGGTACACTCCTCCTGGAGCAGGGAA CCAGAACCCTCCTGGGATGTATCCAGTCACTGGTCCCAAGAAGACCTATATCACAGATCCTGTTTCAGCCCCCTGTGCGCCACCATTGCA GCCAAAGGGTGGCCATTCAGGGCAACTGGGGCCTTCGTCAGTTGCCCCTTCATTCCGCCCAGAGGATGAGCTTGAGCACCTGACCAAAAA GATGCTGTATGACATGGAAAATCCACCTGCTGACGAATACTTTGGCCGCTGTGCTCGCTGTGGAGAAAACGTAGTTGGGGAAGGTACAGG ATGCACTGCCATGGATCAGGTCTTCCACGTGGATTGTTTTACCTGCATCATCTGCAACAACAAGCTCCGAGGGCAGCCATTCTATGCTGT GGAAAAGAAAGCATACTGCGAGCCCTGCTACATTAATACTCTGGAGCAGTGCAATGTGTGTTCCAAGCCCATCATGGAGCGGATTCTCCG AGCCACCGGGAAGGCCTATCATCCTCACTGTTTCACCTGCGTGATGTGCCACCGCAGCCTGGATGGGATCCCATTCACTGTGGATGCTGG CGGGCTCATTCACTGCATTGAGGACTTCCACAAGAAATTTGCCCCGCGATGTTCTGTGTGCAAGGAGCCTATTATGCCAGCCCCGGGCCA GGAGGAGACTGTCCGTATTGTGGCTTTGGATCGAGATTTCCATGTTCACTGCTACCGATGCGAGGATTGCGGTGGTCTCCTGTCTGAAGG AGATAACCAAGGCTGCTACCCCTTGGATGGGCACATCCTCTGCAAGACCTGCAACTCTGCCCGCATCAGGGTGTTGACCGCCAAGGCGAG CACTGACCTTTAGATTCAGTCACCTGTTCAGCCGGCACTGAGAAGAACGAACACAAGAAAAAGATAAGAAATACTAGAGTAAAGGCCATC AAACTACGCGATAGTCTCTGTTCTTCATCTGCTATTAACCTTGCCTTAGAAACACATAAATTATGAGATTTTTTTTAAAAGTTGTTACCA AATACACATTTCACATTGAATCATGTAGGATCTTGATGGGCCTTTGTTCCCAAGGACTTCCACATTTTTGCACAGATTATGCTCCATCCC ATTCACTTCTGCATTCCTGTAACTTTTAATCCCTATGTTTGTCTCACTTTTCATCTGGTTGAATGGCTTTTCTTAGTGTGGTATTTGCTG TCACATAGTTTTTCCTGGGTGAGTCTGCCAACTCACAGGTGCTTTTAGGCTTGAAATCTCCATCCTATCATTTCCGTTTTGCCTGTGACT GTAAAGAGTAGCCATTCTTTTCCCATGTATTGAAGAGGATATTCTTCTCTTGCTTTATACTACTCACGTCCTTGGGGAGGGAAATGCACA ATTTTTTTTTGTTAGGCTGTAAAGAATTTAAGCTGTAAATTACATAAGTTAGAACAAGCCCAAATTTAATTTGCAACCATCAGAATTCAG AATCTATAGTGACCAGTGATCAAGGCTAATTGGAAAAGAGTTATCGGCCCATAGCTAATAAGTAGTGACAGACAACCAAGCTTCAATATT TTTCTAAAGAAATTACAGGTGGGATATGCTAGAAAAGGCATTTTGGGGTTATGTTTAAAAAAACATTATTGTCCCACAATATTACCTTAA GATTTTTCTTTTCCGCACTACCTGAACATTGTAATACAGACAAACTTGATTTCTTCTAGAAGATAACATTTTCAATACTGTCCCACTTCT CATCTTAAAAATATTGTCATGTTTATTCTAATATCCAACACAACTATCAAAATTGCCTTTTTCTCTAGAGGATGAAGGCTGTGAAAAAAC CGTTCAAATTCTCTTCTTTTTCTTTTTTATTACCAGGTCCATTTTGCCTGACAATTGCAAATCAGAGCATACAAAATAAAACTGTGCAGT TTTGTTTGGTTTACTTTCAAAAGAGTAGAAAGCTTGAAAAGATTCTGAAACCACAGTTTCATTATTCTCATAATCCTTCTGCAACTGAAA TTACATATTGCAGGAGACATTTTCATATCATCAATGTGACATTTACACCACACTTTCAAAGACAATCACTGAAACAAAAATTGTCTTTAT GAGCTAAAAATATGCAGAATCTCTGCCTAGAATCTTTATTCAAACTTTTATTAGCCAGTGAAACACTTGCTTGCCAACTGCCAAGCCATA CTTATTAAGTTCGAACATGTTTCACTTAAGGAGAGACACCTAGCTTAGTCATGGCAAGTTGCCATTTTGTAAACTAAGGATTTTGGACTG AGATTTCTTAAATCTTTCTTCAAATCTCCCACAAGTATATACTTTTAAATTATGGAGTATTTTAAGTCTACAAAAAGGTATAAATAATAA TATAATGAATTCCTATATACCTAATACCCAGTTTAAGACACCAAATATAACAAGTATAATTACATCCTCCAATGTACCGTTTCCTTATTC CACAGATATCTTTTTCATTATTGTGAAGTGATGTTCAGATTTCTAGTTTTTTTTCTAGTTTTTAATTTTAACATCAGAACTGAAATAAAA AATTATGGATACGTGTTTTGAATTGCAAACTATTCCTCAGGAATTCCAATTAAATTTATTTTACTTGAATAGGAATGATCATAAAAGTGA TTCTTTTTTTGTGACTAGAAATTCTTAAGCCGATGGTCACTATAGCTCATCCTTAATGTATGGCTCATTTGCTTTTGTCACTAAACGGTT TTGTGTTAGAACCACCAAAATTATAGCTTTTAAGAGCTTCCTTTGACCACTGTCTTTTTCTTACCCTAGTTCTCTTATCTTTGATCGTAT ATTTCTCATAATGTGAAATATGATGAGATTCACTTAGGGGCAGCATGTTAGTTTTGGGAGGCAATGTCAACTGTGTCTCTGAATTCCTGT CTTCCAAATTGAAGCCAGACCATGCTGATGACCTCAAGTAGCACTGACTATTTGACAATAGGGCTGATAATGTAATCGGCTTGAATTTTG ACTTAGTAACTTTTTATGTAATACTTTCGGAGAAATTCTCTTTAGGACAAAGCAGAGAGTCCAATTTATTGAGGGATAGATTGTATCTCT TAAAGTGGTCATATTATTATTAATTTTGCCAAAAGAAGAAGAATTTATTGAATATTTATACTATAAAATGCAGTAACATTCTACTTGCTT ATTACATTTAAATCCTTGTGTAACTGAATGTTTACATGTCAAGAGGAAAAGCTGTAAGAAAATGCTGTCACAGACCCATCCCTGTGGCAT CGTCAGCAGAATACTGCTTGCTTACAATCTTTATTATGCATTCTTATAACATAACCTCAGAGTATCTTTACCAAAGGTTTTTAAAGTAAA TCTCTTTTTAAGATAGACTTATTCTTTTATAATAATGAATGTGCACTCATACATATGTAGAAACATTTAGATTTAGAGTTTTTTTTTTCT TTCACAAGGTATAATAAGGAAAGGATCCTACAATATTTTATTCTAGGGTTTCTTAAATATATGATTTATATTACTGTCTTTTCTATTAAT CATTTGATTTAAACAATGCCAAGTCACTCTTTTTTAGTTGCATGAAATTTTGCCTGCAACAGAGAGAAAAAGATTGTATTACTTTAATGA TTATAATCATACTGTCTGCTGATATAATATCATAATTGTTGTGGTTTAAATACATAAATAGTAGAAAAATCAGAGTCTATAACAGAAAGT TTGTAAAAATATACTGATTTTGAAAAGTATCAGGAATATAAATATTTGGTAATTCTGTGTAACAAGAGAGACATGGAAAAGGAAAAAAAT CCACTATATCATGGGCTCTGCAGAACATATCAAAATAGGATTTCTTAAATTTTTCAACCCCCAGACCATACTGACTCAACATGGAGTCTC 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AAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTGGGAAATATTGGTGTATAATCCCCATGTCTAACAAGGAAGAAGTCAAAAGCAAAAGATAGTGGTATTG CCGAAAACTCATTATTTCTAGTTAGTTCATCTGTGGAAAAGGATATCGTTCTTGAGGAGAGGGGTTCTATTATGCTATAGTTTTCTATGG AAATGTACAAATGCTTTCCTCATTGCTCTGGATGACTATTTAGTTTAAATAATATACCTTTGTCATGGGGAAGACCATGATTGTGGCTTC TTCTACCCCAACTTTGAATGAGAGAGCACTGTAAGCAGAAACTGCCATCAGTCTCCTGGGCAGGACCTGGAGGTAACTTTCTGAGCTGTA AAATAGTAATTCCTAAGAGAGCTTACAAACTGCTTCCACACAGAAAATAGCGCAGGGAGGACAGTTATTAGTACCCCTATTCTAGAAGAG AAAGCTGAGGCTCAAGCCATTAAGTGACTTGCCAAAAGCTGTGACATAGCTGGGAAGTGGCAGATTTGGGGATATAACCAGGTCTTGCAA GTCCAGTGCTGTCTCCAAAGTAGCCACGCTCACAGCTGAGAACACCTTAGAGGACAATATCGACTTCTTACAGACTACCAAGCCCCCAGT CATCCAGGGAAATTCAGAGACCAATTGACTGCCAGGTGGCAAATCCACATGTGTACTGCGGTCTTTAGAGATCATTTAGAGCTTGCACAC ATCTGTGTCTTCTTGTGGGAAACCTCTAGGTATTCTGTCTGATCAGCACTGTGAGGAAGTTGGTGGGAAAAGGCCACTGATAAGAACAAA CAATGGGCAGAAGGAAGCACATTGCAATAAATTTCCCCAGAGAGAGTTCCTTTACATTCCATTCACCAAAAACCTCTCTGGAACTGTCAG GTTCAGAATATCAACCAAGACCATATCATTTAGAATTCATTGGCATGTAGAGGTGACTCGATTCCTAAAAGAAGCCTCTCTCCCATGAAC CACGATGTACGTTCCACAGAGGCAGAAACCGCCGTAGGTTAGCAATGCATTTTAGTCTTTCTCTCCATTCACATTTACTGAGAGCACACC ACGTGCATGTTGCTGCAACAGGCATTTCCGATAGAGCCGATCCATGAGCTAACAATGTCTGAAAACAAATGTTATGGAACTGTTGGCATT TCTGAGATTTGGCCTTTGCCATTTGATAGACTTTGCTTCCCAGGATGCTGTCATTTTGTGATTTTTTATAATTACAAGGAATTTGGTACC ATGTTGTTTTCAAAAAACCTCCTAGAAAGTCTCCATGTATGCTCTAGAAGTTGCTCTACGTAACAGTTCAGCAAGCAAGTGTTCCTTCTC TTGAGCTGCGTCCCTCAGGAAGCTGTACCTTTAGGGTGTGCTTTCCACTTTTTATTTCCTCTCATTTCACTCCTTTCATTGTTTGCTATA TCCTAAAATATGTGAAGTGAGAGAAAAAATATCATTTCTTCTCATTAAATCTCCTGCATTAAATCTAAGAATCCTTTAAAATAATCACAC CTGATAAGTGTTTTATGCATTTCCCTCCCTGGAGTGTTATCATCCATCAAGCCAGTATCATCATCCACCTGCTTATTCCTTGGGACTAAT GAGAGCCAAGTTAAATAGCAAATGACTTCTCACCCCTTCCTAGTCCTCATGCCTGAGGAATAAGGGCGACATTAATGGGAGCGGGAGAGT GGTGGCTTTGGTTGAGATGCACGTTCACAGACTAGAAAAGTGCCTCACCTCCATGGTGTATATGTGCCACCTTTTCTTAATCCAGTCTAT CATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAATAAACATAAGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCA TGATTTATAATCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCTCCACAC TGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTCACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCTTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTT TCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATAGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGG TGAGCATTTTTTCATGTGTTTCTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAG TTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCTCAAGGACAAAAAACCAAACACCACATGTTC TCACTCACAGGTGGGAATTGAACAATGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTGTGGGGTGGAGGGAGG AGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGCTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATGTATACATATGTAA CTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATGAAATAAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAGTGCCTCACC TCCCTGTGAGGCTTGATGAATATTGTGGCCAGTGAGTGGAAAATGATTCTTGTCGAATAGACAGAGTATTCCCACCCCAGGAATGGATTA ATAGAAGACACAATTTGAGCACTTCTCAGAATTATCTAGTATGCCTGAGTAGAGACTCACATGGGTGGAATCTGTGTTGTCTCATCAGAG GGAATAAAAAGACAATGAGGTGGTAAATGTGAAAAAAGCAGCCTTTTAGAAAAACATTATTTTCAAATACCTTTATAAATCATCTAATTT ATCTTCACATAATATAAAGAAAAAACTAATAAAAATTTTCGTATTTCACTTTACATAATATGTTCTCCCATATTTAGGGATCATACAATT GTATTGTCTTCAAAACACACACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACCCCTTCCAAGAAAGCTGATCCTTCAGAAAA TAAATCTTATTTTTAAGCACTTGGGTTTTCAGGCCAGAAAATTAATAAATCCTAAACCTGACCCATTTTTGTAACAGCTAAAAAGGAGAA GAAAAAGCTAGTTAAATTTTGTGTGGATCCATTTATCTCTTAAAATATGCCAAAGCAATTTGAGGTGGGGGTGGAAACAGGTATTTATCT CTCATGCGTGATTCTCTCTTTATATTTCTATCTGTTGGGAAAAGGGTAAAGAACTATTCTTGGTCATTATTGATGTATTGTGTTGCCACT TTGTATGGTGCCTGCTGTGCTTTATCCCGAGGCATAGCAGTAATCGTTACTATCTTGACTCTTTCCTTCATCACAAGAGAGTAAATATGA AGTCTGAATGTCGTTCCTCACCCCCAAATTGTTTAACTCTGCTTCCAAACTAGTTTAAGAAATGCAAAATGGGAAGAGCTAGCTTTTCTT AGATACATTTCTTCCTTTTTTATTCTTTCTTGGGAGACGTTAAGTATAAAAGGGAAAAAGTCAGTTCCTTCTTCTCTCTCTTTCTCTTTG GGTGACAGCAATGCTCACTTAGTAATTATAAACTGGAAATAGGAGAGTAGCTTGAGCAGGTTATGATATATCTGCCCAATGTGTTTCATT CCTTCAAACATAAACTTTGAGAGTAAAAGAGATTTTTATAATTTAAATGCCAACGACAGGAATGGCCTCATGTTTTAACTTTCAAATAAT AAATGGGGAGTTGGTATTTGGGCAGAGTTTGCATTTTACTAATCCTATATACTTTGAGCTTAGTTTTTAGAATTGTGTCAAATACATCAA CATATCAGGATTATAGTGCCAAAAATAGTTAAAGTGCCTTGGTCCTCCCTCTGTAGGCAGCAAATTGAAACTAACATGGGACCATGCCAT CCTTCTAGCATAATGGAGAAGTCTGAACTGAGGAGTATCTTTGATGAAAGACATTTAGGACCCTAGAAACTAAATCTTGTCACCAAGACT TTATAGTAAAGTAGTAGCAAAATTATTTTTAAAAGACTTTCTTCCTTTTACTACCCATTTCCTCTCTTGGGAAAGCTGATGAGCAAATTA TCCAAGACTCATTTCTTTATTAGGCAAAGTCAGAATATTTCCCCTCTGAAAATCTGAATTATGCCCTCATTCTTTTTCAAGAAATATCTC AAAGAGCAAATAGAATTAAACATGACACTTGATTGTCTGATTATTTGGCATGTATAAAATTATCATGTGGCTTAATGTGCCTTAAGTGAA AATTTAAACTTAGACCTGAAACCTTTACAGTTGGATGTAGCGTTGAGCTTTTGCATGTTTTCTGTATAATAAACCACTTTTGTTTTGTTT GTTTTGTCTTTTAACCTACACCTTTATCATTACTCTAACAGATTTAGGGCTTCTCTTTCTCTACAGCTAAGTAAGGGAATATGTGCAATT ATGAGACATACAAAAAAGGAAAGGGAAAGGACTTTCTAAGTAGCAAATCTGTGCCATGAAGTAGATGTGGCGTGAAGATACAGAGCCTGA GGATAGTAATTTTCCCTGAGCCACGCACACAGGCTTTTATTTCATGCCTTTTCTCTTTCTGTGCCGTCACCTTTGAGAAAAACGATTGCA CCTTCTCCAAGTCTGCCTTTTTAACAGCTACAGTTAAGTTGGCAAGACTTCCCCAGCTCTGAATATAGCCATTTGCCGACTCCGGCCTCT TTGCGAGACTGACTCAAATCTGTGATCTTCTGTTCAGCATACACATCAGCAAAGTGAGAAGATGAGCACTAAATATAGGCTCTATTAACT TTACTTTTAGATTTACTGCCTTCAAAAAGTGCCTATTCTGAGCAACATAAACGTTATTCCTTACATATGTATGTACACACGGTACCCAGA GTCGTACTGTGCAGCCTTCAAAAACATACCATCAGAAAGAGTAGGTGCTGAGATAAGGAAACTTTGCCAAATGAAAGAAAGTCACTCACT TCCAATATCCCCTCTCAAGCGGCTACCGTGAAACGGGCTGCAAACACATTCCCTGAGCATCCCTTGCTGATACAGCTTCTTTATATTTAT ATCCTACTGGATGGTAGCATATTGCTAAGGTTTCCTGTACTCTGCTTCAAGGGAATGTAAGCTTTATGGCATTGAAACATTTAGGGAAAA AAAAGATGTTTAAGAGAATTAATAGAGCCGTAGTCTGTATTAGGATGTGTGTCATATGTGTGTTCTATAAACTAAGCATCGGTGGGTTTA GAGTGTTAAAGTGTCAGCACATTCCTTCTCCTTTTGTCTCTCAGGCTAACATGAGAGAAAATAGAAAAGTCTTGGCTGTGGGGATTGGAA GCTCAGGGGGCCAAATGTCCTTGCCAGATCCTTAGAGCATTACTTTGACTCCTAAAAATAGTAGTGTATGTTATTTGATGGCTTTTGTTT CCATAGTTCCATCACTGACAAAACTGTCAATACTGTTGATGGAGCAGCAGCATAGCCTAGAGTGATGCATTCTTACCCAGAGGTGGCAAT AGGAGAGGGTCCATGTAAATAGGACGAGGTAGACAGTGCATGATTGTAGGAGAAGGGTTGAAGGGAGGACATGATTCCAAAAAAGATCGT TCTCAATGTGTCGTCTGACTCAACCAGCTGGCAGATTACACTTGCCAAGTCGTTCCCTTTCCTTCTAAGTCAGTTGGCTCCATATTCACT TGAATATGCCTCTGTTTGGGCAAAGCAAGATACCTCCACTTAACCTTTATCCAAGGAAGCTCTTGGTGTCCTCTTGGTCATAAAGTTGTC TCCTACCTAACCCAGTTTTACCAAATGGAAGTAAAAGGGGACAAACTATGGAAGATGGACTCCATGCCATTGCAGTCAGCCACCATTCTC TTTTCCATATAAGGAGCCCCATTACATAAGCTACGGGTGAGGTTGGAACAGCTATGTTTCATAATTTCAAGAGTGTGACCACCCTGCTCT AGTCATCATCATTGGATGAATCCAGTTGACTCTTTGGCAAAAGGGTGATACTTTTCACTAAAAATGCCTACTCTTCCTGTTGATGTTCCT TTTCTGTTTTTACCTTGTCCAATTTCCACACTAGTCATTTTTTTTATTTTTTAGAGGATCAGATTTTAGCGCTGGAAAATGAGTTCAAAA ATTTCAGTGTAATGTCATAAGGATGTTGGGATACAGAGATTTTTTTTTTCCTTGGAAACAAATGGACTGGGAAGAAACACAGCATGGCTT TGCTCTGAGTTTCAATCTGATGATTATGACCATGGAAGATAGTCTTATGTAAAGGTTAAATGGTGTTTACAAGTGGATAGATAAGGCGGA GATGGTGAGAAGCCGGGTTTTCTCTATGCTAAATGTGTCTACTAAGAGCAGCACTTCCTACTAGCTAAGCACAATCATAGCCCCACCGTG ATGAGCTGCTAGTCTGAATAACATTCCCTGACTTAGGGAAAGGCACACAAAAACATATAAAGAATATGTCTATTTTCATATGTGTGATAC TGACAGAGCCATGGTATTCCTAAAATATAGGTTTCTCTTTTTTCTTGTATTCTTAGCAAATTGCATTTATTCACTACATTACAAACCATC ACTGATGTATCCAAAATAGCACACATAGTTCAGTATGAAAATAAGAGAATAAAATCTGTTATAAGCAAGTGATTTAGGTATTTTCTTTTG TGTTTATGCATTATCTGACTATATTAAAACCTGTTTTTCTATTTACCTTCTATCAGTTTTCTCTACCAATTATGTTTTTTCAATGCTCTA TAAGAATGAATATGGAAATTATATTTCTTTTTTCTGTAAAAGAGTTGCAACTACTTTATTATATTTAGAAATCCAATAAACTTCTTATTA >50784_50784_24_MAGI1-LPP_MAGI1_chr3_66023671_ENST00000497477_LPP_chr3_188326949_ENST00000543006_length(amino acids)=490AA_BP=21 MTCWGSSTAARRPSPSRPSDKSSTGSTASPPVSTPVTGHKRMVIPNQPPLTATKKSTLKPQPAPQAGPIPVAPIGTLKPQPQPVPASYTT ASTSSRPTFNVQVKSAQPSPHYMAAPSSGQIYGSGPQGYNTQPVPVSGQCPPPSTRGGMDYAYIPPPGLQPEPGYGYAPNQGRYYEGYYA AGPGYGGRNDSDPTYGQQGHPNTWKREPGYTPPGAGNQNPPGMYPVTGPKKTYITDPVSAPCAPPLQPKGGHSGQLGPSSVAPSFRPEDE LEHLTKKMLYDMENPPADEYFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQPFYAVEKKAYCEPCYINTLEQCNVCSKP IMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSLDGIPFTVDAGGLIHCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRDFHVHCYRCEDC -------------------------------------------------------------- |
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Fusion Gene PPI Analysis for MAGI1-LPP |
Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in |
Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
- Retained PPIs in in-frame fusion. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
- Lost PPIs in in-frame fusion. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 970_1066 | 104.33333333333333 | 1288.0 | FCHSD2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 970_1066 | 104.33333333333333 | 1463.0 | FCHSD2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 970_1066 | 104.33333333333333 | 1257.0 | FCHSD2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023670 | chr3:188326948 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 970_1066 | 104.33333333333333 | 1161.0 | FCHSD2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000330909 | - | 1 | 25 | 970_1066 | 104.33333333333333 | 1288.0 | FCHSD2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000402939 | - | 1 | 23 | 970_1066 | 104.33333333333333 | 1463.0 | FCHSD2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000483466 | - | 1 | 23 | 970_1066 | 104.33333333333333 | 1257.0 | FCHSD2 |
Hgene | MAGI1 | chr3:66023671 | chr3:188326949 | ENST00000497477 | - | 1 | 21 | 970_1066 | 104.33333333333333 | 1161.0 | FCHSD2 |
- Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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Related Drugs for MAGI1-LPP |
Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08) |
Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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Related Diseases for MAGI1-LPP |
Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |