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Fusion gene:MBNL1-DCUN1D1 (FusionGDB2 ID:52002)

Fusion Gene Summary for MBNL1-DCUN1D1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: MBNL1-DCUN1D1
Fusion gene ID: 52002
HgeneTgene
Gene symbol

MBNL1

DCUN1D1

Gene ID

4154

54165

Gene namemuscleblind like splicing regulator 1defective in cullin neddylation 1 domain containing 1
SynonymsEXP|MBNLDCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3
Cytomap

3q25.1-q25.2

3q26.33

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionmuscleblind-like protein 1muscleblind-liketriplet-expansion RNA-binding proteinDCN1-like protein 1DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 1DCUN1 domain-containing protein 1RP42 homologdefective in cullin neddylation protein 1-like protein 1squamous cell carcinoma-related oncogene
Modification date2020032720200327
UniProtAcc

Q9NR56

Q96GG9

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000461436, ENST00000282486, 
ENST00000282488, ENST00000324196, 
ENST00000324210, ENST00000355460, 
ENST00000357472, ENST00000463374, 
ENST00000485509, ENST00000485910, 
ENST00000492948, ENST00000498502, 
ENST00000545754, ENST00000493459, 
ENST00000292782, ENST00000469954, 
Fusion gene scores* DoF score19 X 10 X 10=19004 X 4 X 3=48
# samples 216
** MAII scorelog2(21/1900*10)=-3.17753818555219
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(6/48*10)=0.321928094887362
effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (eGinPCFGs).
DoF>8 and MAII>0
Context

PubMed: MBNL1 [Title/Abstract] AND DCUN1D1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointMBNL1(152018156)-DCUN1D1(182683541), # samples:3
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneMBNL1

GO:0008380

RNA splicing

18335541

HgeneMBNL1

GO:0043484

regulation of RNA splicing

15257297|16946708


check buttonFusion gene breakpoints across MBNL1 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across DCUN1D1 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4LUSCTCGA-60-2696-01AMBNL1chr3

152018156

-DCUN1D1chr3

182683541

-
ChimerDB4LUSCTCGA-60-2696-01AMBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
ChimerDB4LUSCTCGA-60-2696MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
ChimerDB4LUSCTCGA-60-2696MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-


Top

Fusion Gene ORF analysis for MBNL1-DCUN1D1

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
3UTR-3CDSENST00000461436ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
3UTR-3CDSENST00000461436ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
3UTR-5UTRENST00000461436ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
3UTR-5UTRENST00000461436ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000282486ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000282488ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000324196ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000324210ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000355460ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000357472ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000463374ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000485509ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000485910ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000492948ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000498502ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5CDS-5UTRENST00000545754ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5UTR-3CDSENST00000282486ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5UTR-3CDSENST00000282488ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5UTR-3CDSENST00000324210ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5UTR-3CDSENST00000355460ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5UTR-3CDSENST00000493459ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5UTR-5UTRENST00000282486ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5UTR-5UTRENST00000282488ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5UTR-5UTRENST00000324210ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5UTR-5UTRENST00000355460ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
5UTR-5UTRENST00000493459ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000282486ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000282488ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000324196ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000324210ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000355460ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000357472ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000463374ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000485509ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000485910ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000492948ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000498502ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
In-frameENST00000545754ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-3CDSENST00000324196ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-3CDSENST00000357472ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-3CDSENST00000463374ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-3CDSENST00000485509ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-3CDSENST00000485910ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-3CDSENST00000492948ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-3CDSENST00000493459ENST00000292782MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-3CDSENST00000498502ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-3CDSENST00000545754ENST00000292782MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-5UTRENST00000324196ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-5UTRENST00000357472ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-5UTRENST00000463374ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-5UTRENST00000485509ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-5UTRENST00000485910ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-5UTRENST00000492948ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-5UTRENST00000493459ENST00000469954MBNL1chr3

152018156

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-5UTRENST00000498502ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-
intron-5UTRENST00000545754ENST00000469954MBNL1chr3

151986881

+DCUN1D1chr3

182683541

-

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000282488MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-9813201618422792316
ENST00000282486MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-9813201618422792316
ENST00000355460MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-9385158814142364316
ENST00000324210MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-889010939191869316
ENST00000498502MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-87609637891739316
ENST00000545754MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-87609637891739316
ENST00000357472MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-87609637891739316
ENST00000324196MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-87609637891739316
ENST00000485910MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-84826855111461316
ENST00000463374MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-84826855111461316
ENST00000492948MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-79711740950316
ENST00000485509MBNL1chr3152018156+ENST00000292782DCUN1D1chr3182683541-79711740950316

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000282488ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-8.91E-050.99991083
ENST00000282486ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-8.91E-050.99991083
ENST00000355460ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-9.00E-050.99991
ENST00000324210ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-8.15E-050.99991846
ENST00000498502ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-7.96E-050.9999205
ENST00000545754ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-7.96E-050.9999205
ENST00000357472ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-7.96E-050.9999205
ENST00000324196ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-7.96E-050.9999205
ENST00000485910ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-7.29E-050.99992704
ENST00000463374ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-7.29E-050.99992704
ENST00000492948ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-6.59E-050.9999341
ENST00000485509ENST00000292782MBNL1chr3152018156+DCUN1D1chr3182683541-6.59E-050.9999341

Top

Fusion Genomic Features for MBNL1-DCUN1D1


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

Top

Fusion Protein Features for MBNL1-DCUN1D1


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr3:152018156/chr3:182683541)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
MBNL1

Q9NR56

DCUN1D1

Q96GG9

FUNCTION: Mediates pre-mRNA alternative splicing regulation. Acts either as activator or repressor of splicing on specific pre-mRNA targets. Inhibits cardiac troponin-T (TNNT2) pre-mRNA exon inclusion but induces insulin receptor (IR) pre-mRNA exon inclusion in muscle. Antagonizes the alternative splicing activity pattern of CELF proteins. Regulates the TNNT2 exon 5 skipping through competition with U2AF2. Inhibits the formation of the spliceosome A complex on intron 4 of TNNT2 pre-mRNA. Binds to the stem-loop structure within the polypyrimidine tract of TNNT2 intron 4 during spliceosome assembly. Binds to the 5'-YGCU(U/G)Y-3'consensus sequence. Binds to the IR RNA. Binds to expanded CUG repeat RNA, which folds into a hairpin structure containing GC base pairs and bulged, unpaired U residues. {ECO:0000269|PubMed:10970838, ECO:0000269|PubMed:15257297, ECO:0000269|PubMed:16946708, ECO:0000269|PubMed:18335541, ECO:0000269|PubMed:19470458}.FUNCTION: Part of an E3 ubiquitin ligase complex for neddylation (PubMed:18826954). Promotes neddylation of cullin components of E3 cullin-RING ubiquitin ligase complexes (PubMed:26906416, PubMed:23201271, PubMed:19617556, PubMed:23401859). Acts by binding to cullin-RBX1 complexes in the cytoplasm and promoting their nuclear translocation, enhancing recruitment of E2-NEDD8 (UBE2M-NEDD8) thioester to the complex, and optimizing the orientation of proteins in the complex to allow efficient transfer of NEDD8 from the E2 to the cullin substrates. Involved in the release of inhibitory effets of CAND1 on cullin-RING ligase E3 complex assembly and activity (PubMed:25349211, PubMed:28581483). Acts also as an oncogene facilitating malignant transformation and carcinogenic progression (By similarity). {ECO:0000250|UniProtKB:Q9QZ73, ECO:0000269|PubMed:18826954, ECO:0000269|PubMed:19617556, ECO:0000269|PubMed:23201271, ECO:0000269|PubMed:23401859, ECO:0000269|PubMed:25349211, ECO:0000269|PubMed:26906416, ECO:0000269|PubMed:28581483}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000282486+21013_41581169.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000282488+2813_41581083.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000324196+1813_41581151.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000324210+21013_41581466.0Zinc fingerC3H1-type 1
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000355460+2913_41581294.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000357472+1813_41581153.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000463374+1913_41581292.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000485509+1713_4158341.0Zinc fingerC3H1-type 1
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000485910+1713_41581014.3333333333334Zinc fingerC3H1-type 1
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000492948+1713_4158343.0Zinc fingerC3H1-type 1
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000545754+1813_41581125.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneDCUN1D1chr3:152018156chr3:182683541ENST000002927820760_2481260.0DomainDCUN1
TgeneDCUN1D1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000292782078_451260.0DomainNote=UBA-like

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000282486+210179_207581169.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000282486+210215_241581169.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000282486+21047_73581169.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000282488+28179_207581083.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000282488+28215_241581083.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000282488+2847_73581083.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000324196+18179_207581151.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000324196+18215_241581151.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000324196+1847_73581151.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000324210+210179_207581466.0Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000324210+210215_241581466.0Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000324210+21047_73581466.0Zinc fingerC3H1-type 2
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000355460+29179_207581294.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000355460+29215_241581294.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000355460+2947_73581294.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000357472+18179_207581153.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000357472+18215_241581153.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000357472+1847_73581153.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000463374+19179_207581292.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000463374+19215_241581292.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000463374+1947_73581292.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000485509+17179_20758341.0Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000485509+17215_24158341.0Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000485509+1747_7358341.0Zinc fingerC3H1-type 2
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000485910+17179_207581014.3333333333334Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000485910+17215_241581014.3333333333334Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000485910+1747_73581014.3333333333334Zinc fingerC3H1-type 2
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000492948+17179_20758343.0Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000492948+17215_24158343.0Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000492948+1747_7358343.0Zinc fingerC3H1-type 2
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000545754+18179_207581125.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000545754+18215_241581125.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
HgeneMBNL1chr3:152018156chr3:182683541ENST00000545754+1847_73581125.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2


Top

Fusion Gene Sequence for MBNL1-DCUN1D1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>52002_52002_1_MBNL1-DCUN1D1_MBNL1_chr3_152018156_ENST00000282486_DCUN1D1_chr3_182683541_ENST00000292782_length(transcript)=9813nt_BP=2016nt
TTACATCTTATAGCACCCAGTGAATTATGATATGGGGCTGCGGTTTATTTGCTCTGGCGACAATATGGCTTACTTGCCGTGGAATATCCC
GGTATTTCAGAAGTAACATATTATTTTTAAAGAGGGAGCTTTGCTTTCTCTAAATCACATGGTGCAAAGTTGGGAATACAGTGGCCTGTA
AATTACAAATATTATTTACAAACTAGAAGGAAAGCTGACATGTGTTTGTGCCTGTGTGACAGTTTCACTAAGGAATTCCAAAACTGTGGA
TAGCCTGTTACTTGAGAAAAATACACGGTGGCAGTCTTGCAGATGTTTTTCCCGCCTGTTAGCCCTCCAGGTTCAAAAACTGTTTGGTGC
ATTTTAAGGCGGCAGTCTCACCAGATCGCAGGATTCTAGTCTAATTGGCTTCTAACCTTCAATCTAACCTTGCCGGCTTCCTTGCAAAGC
CCGGTGCAAGGGCCTCTTTCAAAATGAACCCACTGGTGTGCCTAGCAGTCGGTAGAAGAAGCGGGAGGGCGTCCGGTCTGCACGCCCGCC
GCGAGGTTACAATGCTGAACGCATGAGATGGAAGATACCAACGGGAGGCCGAGGGGATCCACGGCGCCCGCGCGGGCTCCGGCTTCCTCC
TGCTCTCGGCGCCGCTGGGCGACCGCCCATGACCCGCTCTTGCGGGCTCTGTCCGGTTGACAGGCGACCCTGTGGCCCGGGGAAGCGCGG
GAGGGCGCCGGCGGAAAGTTGAAGAGCGTTTTTCTCGCCGCCGCGTGCATTAGGAGCTCGACGAGTCCGCCCTGGGCTTCCTGGTGGGGC
TGGGCGGGCGGGGGAGGGGCCGCGCAGCAGCAGCGGAAGCCAGACCTCGGCGATAAGAGGCTGCACAGCGACATGCAACAGTCTTTTCAC
TGCAGCTGAATGAGTTGTGGCGCCCACAATGCTCCCATGACAAGGAGCTGACAAGTTCCATTTTCCGTCGCGGGCATCTTGGAATCATGA
CTCCCACAATGCCTTGGGCACTTGGTCGACAGTGGGGCCGCCTCTGAAAAAAAAATGTGAGAGGTTGGTACTAAGAAGTGCCTTTCCTGA
CGTCTCTGCTGCTTGGAACCGCTTCTAGAGCAGTCTCTGCTTTTGCCTTGCTTGCTGCCAGCTAGACTGTGACGACAGCACATCCACCCT
CCACCTCTAGCCCAGACACCCCCATTTCTACTTATAATCAAGAGAAAAGCTCTAAGTATCTGGCATTGCCCTAGGCTGCTTTAGTGTTAA
AAGAAAAGTTTGCTGAAAAAGTAAGATATCTTCTGCCAGGAAATCAAGGAGGAAAAAAAAAATCATTTTCTCGATTTTGCTCTAAACTGC
TGCATCTGTCTATGCCAAACTAATCAATACCGATTGCACCACCAAACTCCATTGCAAATTCAGCTGTGAGGAGATTCCCTTTCAGACAAC
TTTGCTGAAAGCAGCTTGGAAATTCGGTGTCGAAGGGTCTGCCACGTTTTCATGCTTGCATTTTGGGCTCCAAATTGGCACTGGGAAGGG
GTTACTGAGAGCACAAGGCTGATACCAGGCCCTACTTTTAAACGTTCATCTACTTACAATCCTAGTATTTCTCTAAAAACCAAAACCTCT
TTGAATTAACAGTTTCATGCTGTGAATTTCTAGTGGGAGATCTTTTCCTTGATATTGACGACACAATTTTCCATGTACTTTTAAAGCAGG
GAGTGGGGAAAAGTATTTTGAGGGGACATTTTCATCATCAGTTCAGCTTTTTTTTTTTGGTTGTTGCTCTTTTTTGGGGGGGTTGGGTTT
GTTGGTTTCACTGAAACATTTAACTACCTGTAAAATCTAAACATGGCTGTTAGTGTCACACCAATTCGGGACACAAAATGGCTAACACTG
GAAGTATGTAGAGAGTTCCAGAGGGGGACTTGCTCACGGCCAGACACGGAATGTAAATTTGCACATCCTTCGAAAAGCTGCCAAGTTGAA
AATGGACGAGTAATCGCCTGCTTTGATTCATTGAAAAACAAGTTGAAATCATCGCAGAAGGATAAAGTTCGTCAGTTTATGATCTTCACA
CAATCTAGTGAAAAAACAGCAGTAAGTTGTCTTTCTCAAAATGACTGGAAGTTAGATGTTGCAACAGATAATTTTTTCCAAAATCCTGAA
CTTTATATACGAGAGAGTGTAAAAGGATCATTGGACAGGAAGAAGTTAGAACAGCTGTACAATAGATACAAAGACCCTCAAGATGAGAAT
AAAATTGGAATAGATGGCATACAGCAGTTCTGTGATGACCTGGCACTCGATCCAGCCAGCATTAGTGTGTTGATTATTGCGTGGAAGTTC
AGAGCAGCAACACAGTGCGAGTTCTCCAAACAGGAGTTCATGGATGGCATGACAGAATTAGGATGTGACAGCATAGAAAAACTAAAGGCC
CAGATACCCAAGATGGAACAAGAATTGAAAGAACCAGGACGATTTAAGGATTTTTACCAGTTTACTTTTAATTTTGCAAAGAATCCAGGA
CAAAAAGGATTAGATCTAGAAATGGCCATTGCCTACTGGAACTTAGTGCTTAATGGAAGATTTAAATTCTTAGACTTATGGAATAAATTT
TTGTTGGAACATCATAAACGATCAATACCAAAAGACACTTGGAATCTTCTTTTAGACTTCAGTACGATGATTGCAGATGACATGTCTAAT
TATGATGAAGAAGGAGCATGGCCTGTTCTTATTGATGACTTTGTGGAATTTGCACGCCCTCAAATTGCTGGGACAAAAAGTACAACAGTG
TAGCACTAAAGGAACCTTCTAGAATGTACATAGTCTGTACAATAAATACAACAGAAAATTGCACAGTCAATTTCTGCTGGCTGGACTGAA
CTGAAGATCAATCCTCACAATTCAGACTGAGGGTTGAGACAAAACTTTAAGGATACATCTTGGACCATATCGTATTTCATTCTTCTAATG
GTGGTTTGGGCTTGTCTTCTAGTCTGGGCCGCTCTAAACATTTATAATTCCAACATTGTGGATTTCATCTTATATCTGTGGACCATCCTA
GTTTATTCTCCCATAAGTCTTAGAAGCTTTATGGTGATTATTTTGAGGTTTTCATTCTCGCATAAAGCACAATGCTGTCTTCATCAGAAA
ACAGTTGGCATAAGAATTAAACATATGAACATCACAAAACAATTTATAAAAACTTCTTAAATATACGCTTTGGGCTAGTTGCAAAGACTA
TGCTAATAGCACTTCCAGTGAGAGTGATATATTTAAGTGTACTGGATCTGGAATGGTGTTTTGGTTTGGGGGGAATTTTTTTTTTTTCCT
GGCAAATCACATGTGTTGTTGATGTGAGTATCTGATGAAAAAACAATGTCAGAATAACCGACATGAAAATTTTTTAGGATAACTTGGTGC
CTACCTGAAAAATGTATTGTGTTTTAGACTCTTGATTTCAAAAGGTTCCACAGAACTAGTCTGCGCTTACCTTACCCATGTTTATATATA
GCTGTCCTACAGGGAGCTTTTATTTAGAAAATGTCTGCATAATGTTAGATTCTTCTCCTGTCTACATTATGCACTACATAATTGGACTTC
ATTATGCTTTTGAAATGCTTATCTGCCTGTCACATAAGTTAAACTATTTAATTTGTTTTGAATGTTTTGGATTGCTACACAATACAATAT
TCTAAATTTAGGCATGAGGGTTTTTTTGTTTTGTTTTTACTTTTTTTTTGTCATCGCACTATGGAACACAAATGGAATTCTCTTAATTTA
TAAGAAGATAGTTGCAGTTAAATTTTGAAAATGGTTGTAATGAGCCATGAAGTTCAATCTTTATAATATAGGTACTGCTCTTTCAGACAA
ATAGTCCATTTTCGATGACTTATTATTTTGTTGAAATTGCTTTAACTGCTAATCACTGTGGTTGCCAAATATTTACTTCAGGAGCAAAGA
TTTTCAAACAAGCATACACGATGCAAAATACCAATCTGGCTTCTAGTCTCTTTACTGTTTTCGTTTCACTCAGATTAGCTCAGTTTTCTC
ATCAAAGCAGAATGCTATCTTGTATGTATTTTTTTCATTACAAGCCCCATGAGCTGCTTTTATGCTGAAAATGGTCATTTCCCTGTTCAC
TTACTGACATGTGAAGAAGGGTTTCTTGCTTTCTTAAACATTTCCGTAAGGCAGGCTAGAAATGTAATACTTCAAATGTTTGATGATTAT
GGTCTTTTGATAGGAATAGATTCTGCTTGGGATATATATCCAGGCACTCTCTAAGGTCTAGGGTTGATATTAACAAAGGAATGTACTTAG
AATAGCAGTACATTTTATGCAAATATGGAAATTATTTTAAGAAACAATGACATATCAAAACTGCTTTTTACATGATTTTGAAATAGACTA
GAAAGCTTTCCCTATAGACATATTAATATTCCAATCATAACTTTAATTCAAGAATGCAGTTTTACCAAAAGAAAAATTTGAAAATTTCTA
TTCAGGCTACTGGAATTGGTTATTAAAAGAAAAAGGAAAAAGAAGAATCTTGCTGCTTTCAGTATTTCCTGATTTTTTTGTAAATATAAA
GAGGAACTTCAATTATGAAAAATTTTTAAAAGATATATATATCTATATATCTATATATATGTACTGTTTTGTTTCCTGTCTTGAAGATTT
TGAGTTATGGTTATTGGTTTCAGATTGATTAATTCACATATGCTGTGTTTTGAAATGAGATCCCATTAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTCAATATAAAGTGTTTTCTTTAAAAGTCATATTGGTTCGTGGCCTAGTGCCTTGGATTTTACATATTTTTCTTTTTAAATGCAAAACCT
TTTCAACAAAATAGTGTTTGTCATCAGGTTGGTACTAAACATTTATAATTACTGTGTAATTATAAACAAAAATACATAAAGCTTTGAATA
TAATTATGTAGCATAAAAGTTAAGGTTGTTCACTATGATGGCATCTTAGAATTAAACAAAACTTTTACTAGGGCTGAAAAGAGAAGACTG
ATTTAATGTGGTGTGATTATTCTGAAGATAAATGTCTGGCTACAGGGAATATTTTGTACTAAAAAATGATTACACATATGGCTGTGTGTG
TTTGAGTCTGTGTCTGTGAGAGAGCCAGAGAGAGTGAGAGAGATTGACAGAGAAAGGGAGAGACACACACACGCCCCTTGAATTGCTTTA
ACTCCTAAGTGTTTCAGTCCTCATTCCGGTAAACTCCCCATGCTGATTCTTTGTTTTAAACTGAACCATAGGTACAGTTTCCTTTTTGCC
AAATGTCAAAACAGGTACAAATTTTAAAATGTAATGCTTTTTAAATAGAAAAATGTATAAAATTAGAAGTGCCCACATATAAAAAATACT
TGAGATGAAGATTATCTTTAGTGAATATCATCTGCATATCTCTGTAAGTTCAATTGTGTTTCTTACAGTCCCTGTCATATTACCAACAGA
GGCAATAAAAGCTGCAGTGAAATTGCCATGACTAAATCTTTTCACATATTTCAGTGTATTTTTTTTATAGATTTAAAATATACCTGAAAA
CTTTTCTAGGAAGAATAATTATTCATGGAAAGAGCATTGTAATGGCATGTTTTGGGGAGAAAAGACATGCCAAGTCTTGTTTACTACATT
TAAGATGTTTACAACTATACTGGGCTGCTTTATTAACAATACTGTACTTGCATAATATGGCATTATAAGTACATGTCCTTCCTTAGACTT
TTAAAAAGTTTTAATGAGAGAAAGTAAATTTACTCAACAAAATAACATGAGAAATCCTTTACGTAATATCTTTACTGGGGAATTCTTATT
TAAGCAAGGTACACTATTTTTTCCTCAGACTTAAATGAATGAAGTGTTCATTTATTTTTTATTTGATGATAATCAAGAAGTGAGTAGTAG
TAGCTAACTTAATGTACACTTTGCTTAGGTTTTTAAACATGTTACTATTAAGACTACGTATTGTAAACCTTCTGTAATTTTCACATATGA
ATGACAGGAGAAAGTTAAACCTAATCGAAGGAGTTTTGGAATAAAAAAGTGGTGCTGGGGAAATTCACCATGGTTCACAAAGTATGCCTT
TGTAAAACTGAATCAACTTTTAGCAAGAATTAATTTATGTAGTTTTAAATGTTAAATTGTGTATATTTAACAGAAAATACTTATCTGGCA
CCTCAGCAGTTTTAATGTTACCTTATACTTTTAACAGTATGATTTATATTGAATACTTAGATGTTTTCATAAGATTTTATCAAATTTGAT
AATGTAATGATAAAATGTTTTTTTAAATGTGAACTATTTAACATATAAATGGGGACACAAAACCTGAATTGTGATTTCTACATAATGTGA
TAATTAGGGTTCAAATTATGACTCATCATTTAATTGATTATAAATGAGTATATTTCTGAACTCTTTATTGCCTCCATTTTTACAATCATA
ATATAGCAATAATTTCTATTTTTATTTCATAGGACTGTGGTGAAGTTATTTATCATGACACCTTTATCTTTGATTTCTGAGGGAAAGGGG
TGTATATTTTGTAGTTAAGATAAATGAGAAAGTTCCTAATAGTACAAATGCCCTTTTCCAGGTTTATCTTTGCTATTTGTTGCCATTTTT
CTTAAATATTTGCTTTATTTGTACCCGATTTCTGGAGGCAAATAGTGCTGTTTTTTCAAACTCATAATATAGTTACATAAATGATTTTAT
CAGAGCATTCTTGCTATCTTATTTTCTTTCCTACCTGTTGAGTAAGTAGCATTTCTTGCTCACCAACTCATTTATTTGACTAGGTTCAGT
GTTTCCTATTAATGTGTTTTTTTATTTTCCTTTGGTTGATTTTGAAAAATCTGTCACAAATAAGGAAGTTATGGTAAAAGATGCACAGCC
TTTGTAGTTAGTGGAATTCTCAATAAGTAATGTCTTTATGGAGTTTTAAAGGGAAATTATTTAAAGGGAATCATGTTATAGTTGTCCATT
TTTTAAATTGAGATTTTAAAAGTGTTTTTAAGTATAGCCCAATTTTCTATTTACTTACAAGTGCTTCATGATTGTTTTCTTTTTTATTTT
TTGCCATCATGCTGTGCAGAAATCATAATGTAGCTTGTAATACTTCAGAGCATTGGTCTTGAAGCTGTAACTTGGGGCTGCTGTCCTTCA
TGAGGTAGGGCCATAGCAGGCAGGCCCTTTCCCACTTCCTTTATGGCATTCTACTTTTATCTGTTGTAGGCTGTTAGTGTTTCATATTCG
ATTTGGTTTGGGGAAAAATACTCAGTTAAAAAAATTTTTTTTAATGATTGGCTTTAGAGGGACTGTTACCTCTTTGGCATATCTGTCAGC
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ATCGTAAAAACAAAGCCTGATTGGAAACAATGAAGTGTTTGAAACTTAGGGGCAGCATGTAAGTGGCTTAATGAGCAAACAAACGGAACA
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Fusion Gene PPI Analysis for MBNL1-DCUN1D1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for MBNL1-DCUN1D1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for MBNL1-DCUN1D1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource