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Fusion gene:MLLT10-ABI1 (FusionGDB2 ID:54251)

Fusion Gene Summary for MLLT10-ABI1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: MLLT10-ABI1
Fusion gene ID: 54251
HgeneTgene
Gene symbol

MLLT10

ABI1

Gene ID

8028

10006

Gene nameMLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactorabl interactor 1
SynonymsAF10ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1
Cytomap

10p12.31

10p12.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionprotein AF-10ALL1-fused gene from chromosome 10 proteinmyeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 10myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia; translocated to, 10type I AF10 proteintype III AF10 protabl interactor 1Abelson interactor 1Abl-interactor protein 1 longabl-binding protein 4eps8 SH3 domain-binding proteininteractor protein AblBP4nap1 binding proteinspectrin SH3 domain-binding protein 1
Modification date2020031320200327
UniProtAcc

P55197

Q8IZP0

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000495130, ENST00000307729, 
ENST00000377059, ENST00000377072, 
ENST00000377091, ENST00000377100, 
ENST00000446906, 		ENST00000346832, 
ENST00000355394, ENST00000359188, 
ENST00000376134, ENST00000376137, 
ENST00000376138, ENST00000376139, 
ENST00000376140, ENST00000376142, 
ENST00000376160, ENST00000376166, 
ENST00000376170, ENST00000490841, 
ENST00000536334, ENST00000473481, 
Fusion gene scores* DoF score18 X 15 X 10=270014 X 8 X 5=560
# samples 2413
** MAII scorelog2(24/2700*10)=-3.49185309632968
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(13/560*10)=-2.10691520391651
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: MLLT10 [Title/Abstract] AND ABI1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointMLLT10(21827841)-ABI1(27112234), # samples:1
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneMLLT10

GO:0045944

positive regulation of transcription by RNA polymerase II

17868029

TgeneABI1

GO:0018108

peptidyl-tyrosine phosphorylation

17101133


check buttonFusion gene breakpoints across MLLT10 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across ABI1 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4STADTCGA-BR-8366-01AMLLT10chr10

21827841

+ABI1chr10

27112234

-


Top

Fusion Gene ORF analysis for MLLT10-ABI1

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
3UTR-3CDSENST00000495130ENST00000346832MLLT10chr10

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+ABI1chr10

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+ABI1chr10

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+ABI1chr10

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+ABI1chr10

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21827841

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+ABI1chr10

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27112234

-

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
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ENST00000377100MLLT10chr1021827841+ENST00000346832ABI1chr1027112234-38935963381918526
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ENST00000377091MLLT10chr1021827841+ENST00000376160ABI1chr1027112234-37044161581726522
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ENST00000377091MLLT10chr1021827841+ENST00000376140ABI1chr1027112234-17454161581744529

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
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ENST00000446906ENST00000359188MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-9.42E-050.9999057
ENST00000446906ENST00000376142MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-0.0001123650.9998876
ENST00000446906ENST00000376139MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-8.38E-050.9999162
ENST00000446906ENST00000376160MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-8.46E-050.99991536
ENST00000446906ENST00000376166MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-7.74E-050.99992263
ENST00000446906ENST00000376138MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-8.13E-050.9999187
ENST00000446906ENST00000355394MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-9.84E-050.99990153
ENST00000446906ENST00000490841MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-5.75E-050.99994254
ENST00000446906ENST00000376137MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-7.11E-050.99992895
ENST00000446906ENST00000346832MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-0.0001156660.99988437
ENST00000446906ENST00000536334MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-6.69E-050.9999331
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ENST00000377091ENST00000376134MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-8.17E-050.99991834
ENST00000377091ENST00000376140MLLT10chr1021827841+ABI1chr1027112234-0.0022734360.9977266

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Fusion Genomic Features for MLLT10-ABI1


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

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Fusion Protein Features for MLLT10-ABI1


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr10:21827841/chr10:27112234)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
MLLT10

P55197

ABI1

Q8IZP0

FUNCTION: Probably involved in transcriptional regulation. In vitro or as fusion protein with KMT2A/MLL1 has transactivation activity. Binds to cruciform DNA. In cells, binding to unmodified histone H3 regulates DOT1L functions including histone H3 'Lys-79' dimethylation (H3K79me2) and gene activation (PubMed:26439302). {ECO:0000269|PubMed:17868029, ECO:0000269|PubMed:26439302}.FUNCTION: May act in negative regulation of cell growth and transformation by interacting with nonreceptor tyrosine kinases ABL1 and/or ABL2. May play a role in regulation of EGF-induced Erk pathway activation. Involved in cytoskeletal reorganization and EGFR signaling. Together with EPS8 participates in transduction of signals from Ras to Rac. In vitro, a trimeric complex of ABI1, EPS8 and SOS1 exhibits Rac specific guanine nucleotide exchange factor (GEF) activity and ABI1 seems to act as an adapter in the complex. Regulates ABL1/c-Abl-mediated phosphorylation of ENAH. Recruits WASF1 to lamellipodia and there seems to regulate WASF1 protein level. In brain, seems to regulate the dendritic outgrowth and branching as well as to determine the shape and number of synaptic contacts of developing neurons. {ECO:0000269|PubMed:11003655, ECO:0000269|PubMed:18328268}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneMLLT10chr10:21827841chr10:27112234ENST00000307729+32322_74801069.0Zinc fingerPHD-type 1
HgeneMLLT10chr10:21827841chr10:27112234ENST00000377072+32422_74801476.0Zinc fingerPHD-type 1
HgeneMLLT10chr10:21827841chr10:27112234ENST00000377091+3522_7480127.0Zinc fingerPHD-type 1
HgeneMLLT10chr10:21827841chr10:27112234ENST00000377100+3422_7480180.0Zinc fingerPHD-type 1
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- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
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Top

Fusion Gene Sequence for MLLT10-ABI1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>54251_54251_1_MLLT10-ABI1_MLLT10_chr10_21827841_ENST00000307729_ABI1_chr10_27112234_ENST00000346832_length(transcript)=3715nt_BP=418nt
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GGTCTCTAGCGACCGGCCCGTGTCACTGGAGGACGAGGTCTCCCATAGTATGAAGGAGATGATTGGAGGCTGTTGCGTTTGCTCAGACGA
GAGAGGCTGGGCCGAGAACCCGCTGGTTTATTGCGACGGGCACGGCTGCAGCGTCGCGGTGCATCAAGCTTGCTATGGCATTGTTCAAGT
ACCCACTGGACCGTGGTTTTGCAGGAAATGTGAATCTCAGGAGAGAGCAGCCAGAGTGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGAC
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TATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAATAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACC
TATCGATTACACAGTTCTGGATGATGTGGGCCATGGTGTCAAGTGGCTAAAAGCCAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCAC
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ATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGAAGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCC
CATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTGGACCAGAAAACATTTCTGTCCCTCCTCCTTCTGGAGCTCCACCAGCACCACCTCT
GGCACCACTTCTCCCAGTGAGCACTGTGATAGCAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCG
ACACAACTCTACTACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTAA
TGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGA
CTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGA
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GGGTGCAATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCCTGGGAACTA
TGTTGAATCAATCATGCACTATACTGATTAATTTTTTTTTTTCTTTTGAAGTAGATTCTTATTACTCAGTCATACTGTGGGACTATTATG
GTTAACAGAACTGTCTTAATATGTTTTAAAATGTGCCCATATTTTCAGAACATGCTGTTTTATTGGTAAATTGAATGTCTACCTGTAAGC
ATAAATCTTTGAGGCAGTTTATGTATTGCTGAATAGCAATTTATACAAGAAGCTGTCCATAACTGATTATGCTTATGTACTTACTTACAC
ATTTTTAACTTTATGACCAGCCTAAATATTCTGGGGGAAGTGGGGTATAATATTTAACGAATCATGATTCAGATTGTACCATTACATGTT
TCAGTGCAGCATGGTTACTAACGCTATGTCAGACTAATATTAAAATCAGAAAATTTAAATGCTGGTGCTGGTCAGACTTTTTTTGTTAGA
TTCTCTCATTTAAAAAAAATACTGTTTGTTTAAAGCATGCATAAAAATTTATGTATTGAAATATACTTAAAAATTCAAGATGCTTCCCAT
TTGTGTAATATTTACCTGGAGGACTCGTACTTAGGTGTCTTAACGTGAATTGAGTCTCCAAGGTCTCCATGTGAAACAAGCAAAAAGAGA
ATTATCTGTAATGTTGTAATTTGTACCTAAGTTTTTTAATGAGTGAAATTTGCATTATAAACTTTTTCCATTCATAAATACATAAGTGAA
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TATTTACAAGTCAATCTACTGAATTCCTTTTTTAAATAATCTTTTGAAACTAAGAAAATGTGTCAAATTGTGTGCATTCATTCTGTAGGT
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ACATATTGTAAAAGTGGATACAGTTGATTTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCACTAGCAACATTAGAATTTTAAAATAAA
ATAATTGGGAAAGAAGGTGGGTCATGTATTAATCAGTGAACAGAGATTTACCTAACCAACAGACTTGGATTGTCTTTTGACATAATCAAA
ATGCAACACATGCACTTTGTGTGTCTCCTCTTAATTGAAGGGAGGGCTGAGGGATGTTTTCTCTTCTTGTCTTGTGTATAATTCTCTATT
GCTTAGGATATTAAAGTAGAGCACTCAAGTGTGGGTTTCTGTGTTATTGAGGATTTGTTTGGAATTCAAATTACAGTTATGTACTGGATG
CTACAGACTTATAACAGCATAGTGAATGGTAAGACTAGTGCAAAACAGTTATTTCTGAAAATTAAAGACCATTATTGCTACCAAATCAAT
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TCAAGTGGATTGTTCTCTTAATTTGTATATAACCTGTTGTCTAAATTTTATGTACAGTCTTTTATAATAAACCATTCTCCTATATGAAAT
TTTGGATACTGTTAAAATATAACTCATGTGGACTTCAATGCAGACTTCACATTTTTCTGACCTTTACTCCTACGGTAAATCAAGACAAAC
CATTTGAATTTTAACATTGGTTATTTATTTGTGTAATGGCCTTACATGTGGATATTAACAGTGTAAACAATACCACATATAACCATCAAG
ATACCTTGATTATAATTTATAGGACTAGAATGACAGATTCAGGTGGTTTATTAATTACATTTAAAAAGTTTTCTGAAAAAACTTTTGCAA

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GAGAGGCTGGGCCGAGAACCCGCTGGTTTATTGCGACGGGCACGGCTGCAGCGTCGCGGTGCATCAAGCTTGCTATGGCATTGTTCAAGT
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TATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAATAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACC
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TCTGGCACCACTTCTCCCAGTGAGCACTGTGATAGCAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATC
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AGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGA
CTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGA
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GGGTGCAATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCCTGGGAACTA
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GTTAACAGAACTGTCTTAATATGTTTTAAAATGTGCCCATATTTTCAGAACATGCTGTTTTATTGGTAAATTGAATGTCTACCTGTAAGC
ATAAATCTTTGAGGCAGTTTATGTATTGCTGAATAGCAATTTATACAAGAAGCTGTCCATAACTGATTATGCTTATGTACTTACTTACAC
ATTTTTAACTTTATGACCAGCCTAAATATTCTGGGGGAAGTGGGGTATAATATTTAACGAATCATGATTCAGATTGTACCATTACATGTT
TCAGTGCAGCATGGTTACTAACGCTATGTCAGACTAATATTAAAATCAGAAAATTTAAATGCTGGTGCTGGTCAGACTTTTTTTGTTAGA
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ACATATTGTAAAAGTGGATACAGTTGATTTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCACTAGCAACATTAGAATTTTAAAATAAA
ATAATTGGGAAAGAAGGTGGGTCATGTATTAATCAGTGAACAGAGATTTACCTAACCAACAGACTTGGATTGTCTTTTGACATAATCAAA
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ATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTGGACCAGAAAACATTTCTGTCCCTCCTCCTTCTGGAGCTCCACCAGCACCA
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TTACATATTGTAAAAGTGGATACAGTTGATTTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCACTAGCAACATTAGAATTTTAAAATA
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ATGTGACTATTTCATATGCATTTTGCCTTTGTTAATTTTAAACAAACAAAGTATCATTAGTGATCAGCTAGCTACCTTCTACTTTCCATT
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CTCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTT
GATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGAT
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ATGTTTCAGTGCAGCATGGTTACTAACGCTATGTCAGACTAATATTAAAATCAGAAAATTTAAATGCTGGTGCTGGTCAGACTTTTTTTG
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AGAGAATTATCTGTAATGTTGTAATTTGTACCTAAGTTTTTTAATGAGTGAAATTTGCATTATAAACTTTTTCCATTCATAAATACATAA
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ATGGTTATTTACAAGTCAATCTACTGAATTCCTTTTTTAAATAATCTTTTGAAACTAAGAAAATGTGTCAAATTGTGTGCATTCATTCTG
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CTTTTACATATTGTAAAAGTGGATACAGTTGATTTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCACTAGCAACATTAGAATTTTAAA
ATAAAATAATTGGGAAAGAAGGTGGGTCATGTATTAATCAGTGAACAGAGATTTACCTAACCAACAGACTTGGATTGTCTTTTGACATAA
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GGATGCTACAGACTTATAACAGCATAGTGAATGGTAAGACTAGTGCAAAACAGTTATTTCTGAAAATTAAAGACCATTATTGCTACCAAA
TCAATGTGACTATTTCATATGCATTTTGCCTTTGTTAATTTTAAACAAACAAAGTATCATTAGTGATCAGCTAGCTACCTTCTACTTTCC
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CTTTCCATTTTTCAAGTGGATTGTTCTCTTAATTTGTATATAACCTGTTGTCTAAATTTTATGTACAGTCTTTTATAATAAACCATTCTC
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ACCAAATCAATGTGACTATTTCATATGCATTTTGCCTTTGTTAATTTTAAACAAACAAAGTATCATTAGTGATCAGCTAGCTACCTTCTA
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TATGTACTGGATGCTACAGACTTATAACAGCATAGTGAATGGTAAGACTAGTGCAAAACAGTTATTTCTGAAAATTAAAGACCATTATTG
CTACCAAATCAATGTGACTATTTCATATGCATTTTGCCTTTGTTAATTTTAAACAAACAAAGTATCATTAGTGATCAGCTAGCTACCTTC
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TCCTATATGAAATTTTGGATACTGTTAAAATATAACTCATGTGGACTTCAATGCAGACTTCACATTTTTCTGACCTTTACTCCTACGGTA
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CCACTGGACCGTGGTTTTGCAGGAAATGTGAATCTCAGGAGAGAGCAGCCAGAGTGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGACCA
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CTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATATTCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTA
TTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAATAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTA
TCGATTACACAGTTCTGGATGATGTGGGCCATGGTGTCAAGTGGCTAAAAGCCAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACAC
TGTCGAGAACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTTATAAAACCC
TGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGTCAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCAT
CTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGAAGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCA
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CACCACTTCTCCCAGTGAGCACTGTGATAGCAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGAC
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GAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACT
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TATCTGTAATGTTGTAATTTGTACCTAAGTTTTTTAATGAGTGAAATTTGCATTATAAACTTTTTCCATTCATAAATACATAAGTGAACC
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AATTCTTAAGGATTGCCATGTCAGTCCTTCAGTTGTACAGTGAACTGTTGTACACTGGTTCAATGAAAGGAAGTTAAAAGTACCTTTTAC
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CTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATC
CTGCTTGGGCCCCCAAGAATTATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGG
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AAATCTTTGAGGCAGTTTATGTATTGCTGAATAGCAATTTATACAAGAAGCTGTCCATAACTGATTATGCTTATGTACTTACTTACACAT
TTTTAACTTTATGACCAGCCTAAATATTCTGGGGGAAGTGGGGTATAATATTTAACGAATCATGATTCAGATTGTACCATTACATGTTTC
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Fusion Gene PPI Analysis for MLLT10-ABI1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with
HgeneMLLT10chr10:21827841chr10:27112234ENST00000307729+323141_23380.01069.0FSTL3
HgeneMLLT10chr10:21827841chr10:27112234ENST00000377072+324141_23380.01476.0FSTL3
HgeneMLLT10chr10:21827841chr10:27112234ENST00000377091+35141_23380.0127.0FSTL3
HgeneMLLT10chr10:21827841chr10:27112234ENST00000377100+34141_23380.0180.0FSTL3


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for MLLT10-ABI1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for MLLT10-ABI1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource