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Fusion gene:NFIB-ZDHHC21 (FusionGDB2 ID:58899)

Fusion Gene Summary for NFIB-ZDHHC21

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: NFIB-ZDHHC21
Fusion gene ID: 58899
HgeneTgene
Gene symbol

NFIB

ZDHHC21

Gene ID

4781

340481

Gene namenuclear factor I Bzinc finger DHHC-type palmitoyltransferase 21
SynonymsCTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3DHHC-21|DHHC21|DNZ1|HSPC097
Cytomap

9p23-p22.3

9p22.3

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionnuclear factor 1 B-typeCCAAT-box-binding transcription factorTGGCA-binding proteinnuclear factor 1/Bpalmitoyltransferase ZDHHC21zinc finger DHHC-type containing 21zinc finger, DHHC domain containing 21
Modification date2020031320200313
UniProtAcc..
Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000380921, ENST00000380934, 
ENST00000380953, ENST00000380959, 
ENST00000397575, ENST00000397579, 
ENST00000397581, ENST00000380924, 
ENST00000543693, 		ENST00000497966, 
ENST00000380916, 
Fusion gene scores* DoF score16 X 16 X 8=20481 X 1 X 1=1
# samples 181
** MAII scorelog2(18/2048*10)=-3.50814690367033
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(1/1*10)=3.32192809488736
Context

PubMed: NFIB [Title/Abstract] AND ZDHHC21 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointNFIB(14306988)-ZDHHC21(14662324), # samples:3
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneNFIB

GO:0045893

positive regulation of transcription, DNA-templated

30388402

HgeneNFIB

GO:0045944

positive regulation of transcription by RNA polymerase II

9099724|19540848

TgeneZDHHC21

GO:0018345

protein palmitoylation

23034182


check buttonFusion gene breakpoints across NFIB (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across ZDHHC21 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4LUADTCGA-75-6211-01ANFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-


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Fusion Gene ORF analysis for NFIB-ZDHHC21

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
5CDS-intronENST00000380921ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000380934ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000380953ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000380959ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000397575ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000397579ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000397581ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000380921ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000380934ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000380953ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000380959ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000397575ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000397579ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000397581ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
intron-3CDSENST00000380924ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
intron-3CDSENST00000543693ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
intron-intronENST00000380924ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
intron-intronENST00000543693ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000380934NFIBchr914306988-ENST00000380916ZDHHC21chr914662324-94329923521536394
ENST00000380959NFIBchr914306988-ENST00000380916ZDHHC21chr914662324-947610364741580368
ENST00000380953NFIBchr914306988-ENST00000380916ZDHHC21chr914662324-91587181561262368
ENST00000397575NFIBchr914306988-ENST00000380916ZDHHC21chr914662324-956011205581664368
ENST00000397581NFIBchr914306988-ENST00000380916ZDHHC21chr914662324-10010157010082114368
ENST00000397579NFIBchr914306988-ENST00000380916ZDHHC21chr914662324-10073163310712177368
ENST00000380921NFIBchr914306988-ENST00000380916ZDHHC21chr914662324-944810084461552368

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000380934ENST00000380916NFIBchr914306988-ZDHHC21chr914662324-0.0002530930.99974686
ENST00000380959ENST00000380916NFIBchr914306988-ZDHHC21chr914662324-0.0001476770.9998523
ENST00000380953ENST00000380916NFIBchr914306988-ZDHHC21chr914662324-0.000137440.99986255
ENST00000397575ENST00000380916NFIBchr914306988-ZDHHC21chr914662324-0.0001499280.99985003
ENST00000397581ENST00000380916NFIBchr914306988-ZDHHC21chr914662324-0.0001683170.9998317
ENST00000397579ENST00000380916NFIBchr914306988-ZDHHC21chr914662324-0.0001735240.9998265
ENST00000380921ENST00000380916NFIBchr914306988-ZDHHC21chr914662324-0.0001478480.9998522

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Fusion Genomic Features for NFIB-ZDHHC21


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

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Fusion Protein Features for NFIB-ZDHHC21


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr9:14306988/chr9:14662324)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
..
FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST0000038091641090_14084266.0DomainDHHC
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST00000380916410155_18584266.0Topological domainExtracellular
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST00000380916410207_26584266.0Topological domainCytoplasmic
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST00000380916410134_15484266.0TransmembraneHelical
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST00000380916410186_20684266.0TransmembraneHelical

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneNFIBchr9:14306988chr9:14662324ENST00000380953-2111_195187495.0DNA bindingCTF/NF-I
HgeneNFIBchr9:14306988chr9:14662324ENST00000380959-291_195187421.0DNA bindingCTF/NF-I
HgeneNFIBchr9:14306988chr9:14662324ENST00000380953-211397_405187495.0Motif9aaTAD
HgeneNFIBchr9:14306988chr9:14662324ENST00000380959-29397_405187421.0Motif9aaTAD
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST000003809164101_1684266.0Topological domainCytoplasmic
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST0000038091641038_4484266.0Topological domainExtracellular
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST0000038091641066_13384266.0Topological domainCytoplasmic
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST0000038091641017_3784266.0TransmembraneHelical
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST0000038091641045_6584266.0TransmembraneHelical


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Fusion Gene Sequence for NFIB-ZDHHC21


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>58899_58899_1_NFIB-ZDHHC21_NFIB_chr9_14306988_ENST00000380921_ZDHHC21_chr9_14662324_ENST00000380916_length(transcript)=9448nt_BP=1008nt
GCCCCCCTCCCCGCCTTTTTTGAAAAAGCATTTTACCACCAACCACCACCCCAATCCAACCCACACCGAACCTTCGCGCACCCCCTACAC
CCCAACAACAACAACAACTGCAAAATAGAAAACAAATCCCCAAACCCAGGCGAAAAGCAGCCAACACCGGCGGCGGCGGCGGCCTCGGCA
AGCACGGCCAGCGCGCTCGGACTGCAAGAGGGTTAAAAGTGTAGATTGGATTTCACCCCTGGAAATCTAGCACGCCGAGTGAACTTGAAT
CTTTGGCTATTTAAGGAGGACTGGGTTTGTTGTGAAGTTGCGGTGATCCAGCGCAGAGCCCCGTCCTGATTGATCGCATCGCGGGGCTCA
GATGACTGTAAAATGAATAGATGAAATTCTTGCTTCTCGAAGATTTTCTTGGGCATCTCCCGGAAAGTGCGTTTTAAGGCGAAGTCATGA
TGTATTCTCCCATCTGTCTCACTCAGGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACTTGGT
TCAACCTGCAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAGCTTC
TCAGTGAAAAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAGGACT
TTGTGCTCACCGTGACTGGCAAGAAGCACCCGTGCTGTGTCTTATCCAATCCCGACCAGAAGGGTAAGATTAGGAGAATCGACTGCCTGC
GACAGGCAGACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCCTTGGAAAGTACCGATGGAGAGCGGCTCA
TGAAATCCCCACATTGCACAAACCCAGCACTTTGTGTCCAGCCACATCATATCACAGTATCAGTTAAGGAGCTTGATTTGTTTTTGGCAT
ACTACGTGCAGGAGCAAGAAAGGGAGTTCTGGGAATTATGTAACAAGTGTAATTTGATGAGACCAAAGCGTTCCCATCACTGTAGCCGCT
GCGGCCACTGTGTGAGGAGAATGGATCATCACTGTCCATGGATTAACAATTGTGTTGGTGAAGATAATCATTGGCTCTTTCTGCAGTTGT
GTTTCTACACTGAACTTCTTACTTGCTACGCACTGATGTTTTCTTTCTGCCACTATTACTATTTTCTTCCACTAAAAAAGCGTAATTTGG
ACCTCTTTGTTTTTAGACATGAATTGGCCATAATGAGACTAGCAGCCTTTATGGGCATTACTATGTTAGTTGGAATAACTGGACTCTTTT
ACACTCAACTAATTGGCATCATCACAGATACAACATCTATTGAAAAGATGTCAAACTGTTGTGAAGATATATCGAGGCCCCGAAAGCCAT
GGCAGCAGACCTTCTCAGAAGTTTTTGGCACTCGTTGGAAGATCCTGTGGTTCATTCCTTTCAGGCAGAGGCAACCACTGCGAGTTCCCT
ACCACTTTGCCAATCATGTCTAAACAGATGGATGGTGGGCACAGATGGGTCCTCCATGCTGGCAATGCGTTACAGGTTTTATGATAATAG
AACTATGACAGTCTTCAAGTCAATTAAAATCCACCCACCAGTCTTAGGCATCATAATGTGCCCCAGGCTTTATTTTAATAGTGATCTTGA
TCCTGTTGTGGGACTAATACAAGATCTATATTTAAGTTTTAAAGCATGTTTACTTTCAAATTAGCTTTCCACAGGGATTTCTTGAAATGC
TTTTGTTATTAAACTCAAAAGGCAGTGATTAGGATGAAATAATTGTACATAATTTATTTTAGTACTGACAGTGTTACAGATTCTAATTTA
TGGTAAATTTCAGATGTTTATTTAAAATTTTCACTTTTAAACAGTAACCAAATCTAAATTTAATTATTCAGGTTTTACAAAAGTTGATAC
ACCTTCTTATAGTATAGGTAAATTTTCTTTTTCAAATCCAATTTAAAATAACCTTTCCTTTTAAATGTGCTGCAACGTTTTTAAAAATGC
AGCAGCATAGGAGTGAACAACAGCAACACAAAACGGGCATTGGTTTCTTAGGAGTGGCTTGCTTACGTTTTCTTCTTTTTTCTTCACCAA
AACCAACATGAAAGTACCACTGAAGTAAAACACCAACTACCTACCTTACTATAAAGGAAATGTTAAAATTTTTTTCACAATAATTTTTTC
AATTTTCACTATTACTGTTGTAATTATTGATTGTGATTAAAATATTTGCTCCCAGGAGAACTCCTGACCAGTGGGCATGTATTCCTATTT
TATCCTAAGATTTTAATGAGCAAAAAGGGGAGAGAATTTGCAATAACTTCACAATTACCTTTTCTAGTGCAGTTATATTAGAATGCATAT
GTTTTTAAAATGCTAGTATAACTAGATAGTATATAATGTACAGTATAAAGAGGAATATTGTGCTTTTGAAAAGAGTATACTTTTTACTTT
TATTTATGTACTAGTAGATGTAAAATTTCACATTGAAGGTTTATATATATTGGCCAACTCATATAGAAATTTTATTTATAGGAAGCTACT
ACTAAAAAAAGTCACTAACTTTGTGTACCTATAATCCCTAAATTAAAATTAAATTTTAATTGGCTGGCTGTAATTTGCATTGAGAGACCT
TTTACTAGTAGCTAGTGTTAGGAAGTGAACCTAAAATAAGAAAATATAATGATCTGTGTTTATCATTAGCCTTGTACAAATGTAAATTAC
TAATAGTGATGTTCTTTTGCAAGGCATAGAACATTTGTATGAAAAGACATTTAGTATGCTTTGAAAAAAACTCAGCTTTTAGTTTTTTTC
CATTAGAATACTGCAAAACCCATATATCTTTTTAAAAAATTTATGTACTCACAGTCTTTCCCTTGAAGAGAAGATTGAAAAAGTCTACTG
TTCATAAACCATGCTAACATTTTCCTTTTAGCTAGTTTTGAAAGTAAGGAACAATACCTGGGAAATAATTAAACAGAAGGTTACCATTGT
CAGCCAGTTGGCTATACTGTGGTTAGTTCTTTCAGAAATTGTAAATATCTTGTAGCATATTCTGAAATAATAGAGTAAGTTCTTCTCAGA
GATGTTAATATCATGTTTTTCATGTTCTAATTAGAATACTTTATTACTTACAAACTCAGAAATACGAACAGAAATACAGCAGACGAACAT
ATTTATTGGTACTGAAAAGAGACGTAGTAAATTAAATAGAAGAAATATATTTATAAAGCTTAGTGAAACACAAAATTAGAATGTTCATGT
CAGGCACAAGGGTTTGGATTTTGTGCAAGCTAATTTGGCCACATTTGGCCTGGTGACAGAACTGTTCATAAGGAAGTAATATATAGATAA
GGTAGGTAGATATCAGTTGAATGCCTTATATTGTATACATTCCTTTCAAATAAAGACCTTGAGAAAACAGCAGAGCCAAGTGAAGATCAC
CTAAAGAACTTTGTGGCTAATTTATACTTCATGTAGTAGCAGTGGGTACTGGGCAGGGTCTCTTTCCCACTCTGATGATTTGTGCTCTTA
TTTTTCCTAGATTTACCTCATCTAGGGCATATTCTTTTCCCTCTTCCTCTTTACCTTTCCTGGTCCTGATCCCTCTGTACTCAGTTCCCC
TAAATTATTGGACTACAAACTAATATACTAGAAAAGCATACACTTATTTTATTTGAATGCAGAAATGCTATCTATCAGTATATATACATA
AGAATGTATATTACAGTATATCTATATATACTTAACACTGTAACTTTCAGTATTCCCCAGTTAGCGTACCTAACTCTCCTGTGGGTTTTG
TTAATTCTTATTAGACTACTAGAGAAAAACCAACTGGCAGTTTGCTAAGCATATCTACTGGTGTTGTTTCTGCGCCCTCTTTTGGCTAAT
TGATGTAATTATACTGGCTCTAAAGATTTACTGCCCCATAAGTAAATAGTATAGCCACATTCTGAACATATCAAAAGTACAAACTTAGGA
GGAGTGTATGTACAAAAATGTAAAATTTTATGAAAATGAACATGTTTTTATGATGTTATTTCTAGTTCATAAGAATGTGATGACTGCTTT
GCTTCATTTATGTACGTTCCCATTATATTCTTGCTGTCAATCAATCACAAATTTATATCAGATTAGGATAAACTAAGCCATTTTATGTAT
TTTATTTTAAACCTTATTTTGGCAGAGTAATTCCTTAGAATTGGAAAAGCTGTTACTTTGAAATTACCAATTTATTACAAAACATAGAAA
TGTATTGTAGCTACAAAGACAACCAAGCATTTTCTGTGTTTTAATGAATATCTAAAAAACTACATTTAGTTTATTTTACTCAGTTTTGAA
ATGATTTTTTTACTGGCTCTATTGCCTTAAAATAACTAAGAGATTAATGATTCTTTGTATAATTTTCCTTTTCTTTGTTCTTTTTTTTAC
ATTTCGCAGAGTTATATCTATAGTTTTAGTAACAATTTCTTATGTATTCTGGATAACTGAAAACAACTAAAGGTGTTGGGCATTAGAAAA
TAATTGTGAGCAGTAAGATTACTGATGTAATATGTATGTTGGACTGAAGTATTTCTTTATAAACATTCTATTTGATTTTAAGCAAAATGT
ATGTTAAAGCATGTTTTTACATCAGTAAAGTCATTTGTCGACCTTCTGGAAATGAAAGGTTTTTACCTAGATACTGTAAGTTACACCTCC
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GGCGGCGGCGGCGGCCTCGGCAAGCACGGCCAGCGCGCTCGGACTGCAAGAGGGTTAAAAGTGTAGATTGGATTTCACCCCTGGAAATCT
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GCAGTTATATTAGAATGCATATGTTTTTAAAATGCTAGTATAACTAGATAGTATATAATGTACAGTATAAAGAGGAATATTGTGCTTTTG
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TTAAAAATATAAGTATTGGTAAGTGTAGCAAATAAGCCATGTACATTTAATGTGTTCTACTTGCTAGTATTAACTGTATGATTAATGAAT
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TTAGTCATTCTCAGTTGAATTCTAGAATATTCCACAGTACAGTATAAGAAAGTATTAGAACCAACTTGCTTGAACTATTTTGAACCAGTG
TTGTAATTCTATATGTTAATCAGTATTTAGCATTTCTGCTCCTTTTGAGATGATGATGGTTTAACTTCAGGAAAGTGACTTTTCTGACTT
CTTTTATTATCATTGTGCAATTTTTAGCAACAAAACTCACTATATCTTTGTCAGTTCTTCAGATGTTACAATACTGCCTGCTAATTTGAA
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GCCTTGTCCACCCTAGAGAATAGGTACAAATGAGTAGTGAGTATCCACAAACTTACTAAGATGGAGAGAAGGCTAGATGGTGCATGAATA
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TCAGCTATTTAATGCAGAGGAGAAATGAATAGGTTGACCAAAGTTTGAAAAAACTGGCACCTTTTCTGGAAATCTCTTATTGCAAAGAAA
AGATACTGAGTGTATAGAAAATTTTGTCACCAGAGGAAAAATAAACAATATATAAGGGTGGCTTTCACTTTAACATTTGGGATATTTTGG
AGTTCTTGATACCTCGAAGGTCTCCATTTCTATTGGTATTTTGAATATCTGTAACATGTAATGTCGTTCTTATAACAGTTCAACACTGAT
TTTTTTGGTATCGATAGCTTTATATATAAACAAAGATGCGGACAAAATAGCTTAACAGAAGTTGTGGGCTTTTTTGTGGCTTTGCCTGCC
TGTTTGACCAAATACAGGGTTTAATTGTTTGCAGGCTGTTAACTAAAGGGAAAGCTTACCTGCGTATTGCAAGCTATATATTCTTGCCAG
TATACATTGGATGATATTTTAACCTACTGGTGCCTGAAGTTCGTGTTTTATAACCTCAACAACTATAAAACATCCTGGTGCTATTCACTT
TAGCATTGAGTGACATTTTTAATTCCTGTACCAAAGAGTTAATTTTCTTTTTGGTTGACTGAGTTTTCTTCTCACATCGTTGTGTATTTA
TAAAGTAGAATTTAATGTTACTAAGAACAGTTTGATTAACAGATCTTATTTTTTGCATGCTGCTCTGGCAATTTAATGGATTTTAAATGT
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GTAGATACAATATATGGTTTTGCAGTCAATTCTGAATGGAAAAAAAGAATCAAGTCTGAAATTTATGTGAAATGTGGCTTCAGATCATTT
GAACGATATGTAGAAATCTAGATGAACATATCATTAGAGGTGAAAGCAAAATTTGAAAGCCTAATGAGATGAAGCAACATTATCTCTCTC
TAATCTGCCAACAATATTCCCTAGATTGTGTTGCCACTGTATTGATTCTGAGTAATTTGGCTTGTTTATGCGTGATTTAAATGCATGTGG
CTGAATGCAGTAATTTTTCAAGTTATTGAGTAGTAGAGAATTCACCACTATTCACTGTCTCCCAGAGATGAACATATAAAAGAAAAAAAA
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Fusion Gene PPI Analysis for NFIB-ZDHHC21


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for NFIB-ZDHHC21


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for NFIB-ZDHHC21


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource