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Fusion gene:NRP1-ABI1 (FusionGDB2 ID:60338)

Fusion Gene Summary for NRP1-ABI1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: NRP1-ABI1
Fusion gene ID: 60338
HgeneTgene
Gene symbol

NRP1

ABI1

Gene ID

8829

10006

Gene nameneuropilin 1abl interactor 1
SynonymsBDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165RABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1
Cytomap

10p11.22

10p12.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionneuropilin-1transmembrane receptorvascular endothelial cell growth factor 165 receptorabl interactor 1Abelson interactor 1Abl-interactor protein 1 longabl-binding protein 4eps8 SH3 domain-binding proteininteractor protein AblBP4nap1 binding proteinspectrin SH3 domain-binding protein 1
Modification date2020032220200327
UniProtAcc

O14786

Q8IZP0

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000265371, ENST00000374816, 
ENST00000374821, ENST00000374822, 
ENST00000374823, ENST00000374867, 
ENST00000374875, ENST00000395995, 
ENST00000432372, 		ENST00000473481, 
ENST00000346832, ENST00000376134, 
ENST00000376137, ENST00000376140, 
ENST00000490841, ENST00000536334, 
ENST00000355394, ENST00000359188, 
ENST00000376138, ENST00000376139, 
ENST00000376142, ENST00000376160, 
ENST00000376166, ENST00000376170, 
Fusion gene scores* DoF score13 X 9 X 6=70214 X 8 X 5=560
# samples 1413
** MAII scorelog2(14/702*10)=-2.32604420335959
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(13/560*10)=-2.10691520391651
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: NRP1 [Title/Abstract] AND ABI1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointNRP1(33542956)-ABI1(27066170), # samples:1
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.NRP1-ABI1 seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a IUPHAR drug target due to the frame-shifted ORF.
NRP1-ABI1 seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a CGC due to the frame-shifted ORF.
NRP1-ABI1 seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a essential gene due to the frame-shifted ORF.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneNRP1

GO:0051894

positive regulation of focal adhesion assembly

24863063

TgeneABI1

GO:0018108

peptidyl-tyrosine phosphorylation

17101133


check buttonFusion gene breakpoints across NRP1 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across ABI1 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4STADTCGA-D7-A4Z0-01ANRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

27066170

-


Top

Fusion Gene ORF analysis for NRP1-ABI1

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
5CDS-5UTRENST00000265371ENST00000473481NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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-
5CDS-5UTRENST00000374816ENST00000473481NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-5UTRENST00000374821ENST00000473481NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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-
5CDS-5UTRENST00000374822ENST00000473481NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-5UTRENST00000374823ENST00000473481NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-5UTRENST00000374867ENST00000473481NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-5UTRENST00000374875ENST00000473481NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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5CDS-5UTRENST00000395995ENST00000473481NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-5UTRENST00000432372ENST00000473481NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000265371ENST00000346832NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000265371ENST00000376134NRP1chr10

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5CDS-intronENST00000265371ENST00000376137NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000265371ENST00000376140NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000265371ENST00000536334NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374816ENST00000346832NRP1chr10

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5CDS-intronENST00000374816ENST00000376134NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374816ENST00000376137NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374816ENST00000376140NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374816ENST00000490841NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374816ENST00000536334NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374821ENST00000346832NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374821ENST00000376134NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374821ENST00000376137NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374821ENST00000376140NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374821ENST00000490841NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374821ENST00000536334NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374822ENST00000346832NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374822ENST00000376134NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374822ENST00000376137NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374822ENST00000376140NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374822ENST00000490841NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374822ENST00000536334NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374823ENST00000376137NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374823ENST00000376140NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-
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-ABI1chr10

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33542956

-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374867ENST00000376134NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374867ENST00000376137NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374867ENST00000376140NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374867ENST00000490841NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000374875ENST00000376137NRP1chr10

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-ABI1chr10

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33542956

-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000374875ENST00000536334NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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-
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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000395995ENST00000376134NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-
5CDS-intronENST00000395995ENST00000376137NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000395995ENST00000376140NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000395995ENST00000490841NRP1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000395995ENST00000536334NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000432372ENST00000346832NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000432372ENST00000376137NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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5CDS-intronENST00000432372ENST00000490841NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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33542956

-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000374875ENST00000376166NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000374875ENST00000376170NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000432372ENST00000376138NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000432372ENST00000376142NRP1chr10

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-ABI1chr10

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-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000432372ENST00000376166NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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Frame-shiftENST00000432372ENST00000376170NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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-
In-frameENST00000374816ENST00000355394NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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In-frameENST00000374816ENST00000359188NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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-
In-frameENST00000374816ENST00000376138NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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-
In-frameENST00000374816ENST00000376139NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

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-
In-frameENST00000374816ENST00000376142NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

27066170

-
In-frameENST00000374816ENST00000376160NRP1chr10

33542956

-ABI1chr10

27066170

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check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
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check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
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ENST00000374867ENST00000376142NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.0001820580.999818
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ENST00000374821ENST00000376166NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.000175620.99982446
ENST00000374821ENST00000376138NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.0001457330.9998542
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ENST00000374823ENST00000376160NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.0001317230.9998683
ENST00000374823ENST00000376166NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.0001649860.999835
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ENST00000374823ENST00000355394NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.0001595890.9998404
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ENST00000374816ENST00000359188NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.0001707030.9998293
ENST00000374816ENST00000376142NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.0001568990.9998431
ENST00000374816ENST00000376139NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.0001264690.9998735
ENST00000374816ENST00000376160NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.0001414430.9998585
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ENST00000374816ENST00000355394NRP1chr1033542956-ABI1chr1027066170-0.0001713880.9998286

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Fusion Genomic Features for NRP1-ABI1


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

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Fusion Protein Features for NRP1-ABI1


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr10:33542956/chr10:27066170)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
NRP1

O14786

ABI1

Q8IZP0

FUNCTION: Cell-surface receptor involved in the development of the cardiovascular system, in angiogenesis, in the formation of certain neuronal circuits and in organogenesis outside the nervous system. Mediates the chemorepulsant activity of semaphorins (PubMed:9288753, PubMed:9529250, PubMed:10688880). Recognizes a C-end rule (CendR) motif R/KXXR/K on its ligands which causes cellular internalization and vascular leakage (PubMed:19805273). It binds to semaphorin 3A, the PLGF-2 isoform of PGF, the VEGF165 isoform of VEGFA and VEGFB (PubMed:9288753, PubMed:9529250, PubMed:10688880, PubMed:19805273). Coexpression with KDR results in increased VEGF165 binding to KDR as well as increased chemotaxis. Regulates VEGF-induced angiogenesis. Binding to VEGFA initiates a signaling pathway needed for motor neuron axon guidance and cell body migration, including for the caudal migration of facial motor neurons from rhombomere 4 to rhombomere 6 during embryonic development (By similarity). Regulates mitochondrial iron transport via interaction with ABCB8/MITOSUR (PubMed:30623799). {ECO:0000250|UniProtKB:P97333, ECO:0000269|PubMed:10688880, ECO:0000269|PubMed:19805273, ECO:0000269|PubMed:30623799, ECO:0000269|PubMed:9288753, ECO:0000269|PubMed:9529250}.; FUNCTION: [Isoform 2]: Binds VEGF-165 and may inhibit its binding to cells (PubMed:10748121, PubMed:26503042). May induce apoptosis by sequestering VEGF-165 (PubMed:10748121). May bind as well various members of the semaphorin family. Its expression has an averse effect on blood vessel number and integrity. {ECO:0000269|PubMed:10748121, ECO:0000269|PubMed:26503042}.; FUNCTION: (Microbial infection) Acts as a host factor for human coronavirus SARS-CoV-2 infection. Recognizes and binds to CendR motif RRAR on SARS-CoV-2 spike protein S1 which enhances SARS-CoV-2 infection. {ECO:0000269|PubMed:33082293, ECO:0000269|PubMed:33082294}.FUNCTION: May act in negative regulation of cell growth and transformation by interacting with nonreceptor tyrosine kinases ABL1 and/or ABL2. May play a role in regulation of EGF-induced Erk pathway activation. Involved in cytoskeletal reorganization and EGFR signaling. Together with EPS8 participates in transduction of signals from Ras to Rac. In vitro, a trimeric complex of ABI1, EPS8 and SOS1 exhibits Rac specific guanine nucleotide exchange factor (GEF) activity and ABI1 seems to act as an adapter in the complex. Regulates ABL1/c-Abl-mediated phosphorylation of ENAH. Recruits WASF1 to lamellipodia and there seems to regulate WASF1 protein level. In brain, seems to regulate the dendritic outgrowth and branching as well as to determine the shape and number of synaptic contacts of developing neurons. {ECO:0000269|PubMed:11003655, ECO:0000269|PubMed:18328268}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000265371-718147_265327924.0DomainCUB 2
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HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374822-612147_265327645.0DomainCUB 2
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374822-61227_141327645.0DomainCUB 1
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374867-617147_265327924.0DomainCUB 2
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374867-61727_141327924.0DomainCUB 1
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TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000376138110260_41895453.0Compositional biasNote=Pro-rich
TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000376139110260_41895477.0Compositional biasNote=Pro-rich
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TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000037616619260_41895447.0Compositional biasNote=Pro-rich
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TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000049084107260_4180330.0Compositional biasNote=Pro-rich
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TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000376142112446_50595509.0DomainSH3
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TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000049084107446_5050330.0DomainSH3
TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST000004908410745_1070330.0Domaint-SNARE coiled-coil homology
TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST000004908410718_790330.0RegionRequired for binding to WASF1

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000265371-718645_811327924.0DomainMAM
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374821-611645_811327610.0DomainMAM
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374822-612645_811327645.0DomainMAM
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374867-617645_811327924.0DomainMAM
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000265371-71822_856327924.0Topological domainExtracellular
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000265371-718880_923327924.0Topological domainCytoplasmic
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374821-61122_856327610.0Topological domainExtracellular
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HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374822-61222_856327645.0Topological domainExtracellular
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374822-612880_923327645.0Topological domainCytoplasmic
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374867-61722_856327924.0Topological domainExtracellular
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374867-617880_923327924.0Topological domainCytoplasmic
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000265371-718857_879327924.0TransmembraneHelical
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374821-611857_879327610.0TransmembraneHelical
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374822-612857_879327645.0TransmembraneHelical
HgeneNRP1chr10:33542956chr10:27066170ENST00000374867-617857_879327924.0TransmembraneHelical
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TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000037613811045_10795453.0Domaint-SNARE coiled-coil homology
TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000037613911045_10795477.0Domaint-SNARE coiled-coil homology
TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000037614011145_10795482.0Domaint-SNARE coiled-coil homology
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TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000034683221218_79112497.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000035918811118_7995481.0RegionRequired for binding to WASF1
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TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000037613911018_7995477.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000037614011118_7995482.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000037614211218_7995509.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST000003761661918_7995447.0RegionRequired for binding to WASF1
TgeneABI1chr10:33542956chr10:27066170ENST0000037617011018_7995452.0RegionRequired for binding to WASF1


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Fusion Gene Sequence for NRP1-ABI1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>60338_60338_1_NRP1-ABI1_NRP1_chr10_33542956_ENST00000374816_ABI1_chr10_27066170_ENST00000355394_length(transcript)=4340nt_BP=1121nt
CTTTTCTCCAAGACGGGCTGAGGATTGTACAGCTCTAGGCGGAGTTGGGGCTCTTCGGATCGCTTAGATTCTCCTCTTTGCTGCATTTCC
CCCCACGTCCTCGTTCTCCCGCGTCTGCCTGCGGACCCGGAGAAGGGAGAATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCC
TCGTCCTCGCCCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACGATAAATGTGGCGATACTATAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTT
ATCCTCATTCTTATCACCCAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATACCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTC
ACTTCGATTTGGAGGACAGAGACTGCAAGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAATGAAAATGGACATTTTAGGGGAAAGTTCT
GTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTGTCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGAT
TTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCCCAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCC
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AAAAATACTGTTTGTTTAAAGCATGCATAAAAATTTATGTATTGAAATATACTTAAAAATTCAAGATGCTTCCCATTTGTGTAATATTTA
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AGTAGAGCACTCAAGTGTGGGTTTCTGTGTTATTGAGGATTTGTTTGGAATTCAAATTACAGTTATGTACTGGATGCTACAGACTTATAA
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CTTGGAAAAAAATTTTAGCCTTATCTTAATCTGTCCCAACAGCAATGTGACGGATTTTTGCAGATTCAAAATCTGCAATGGTTATTTACA
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ACTTCGATTTGGAGGACAGAGACTGCAAGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAATGAAAATGGACATTTTAGGGGAAAGTTCT
GTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTGTCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGAT
TTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCCCAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCC
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CTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTGGACCAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTC
GACACAACTCTACTACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTA
ATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATG
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ATTACACAGTTCTGGATGATGTGGGCCATGGTGTCAAGAAATGGCATAAAATAATACATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACAC
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GCAGCATGGTTACTAACGCTATGTCAGACTAATATTAAAATCAGAAAATTTAAATGCTGGTGCTGGTCAGACTTTTTTTGTTAGATTCTC
TCATTTAAAAAAAATACTGTTTGTTTAAAGCATGCATAAAAATTTATGTATTGAAATATACTTAAAAATTCAAGATGCTTCCCATTTGTG
TAATATTTACCTGGAGGACTCGTACTTAGGTGTCTTAACGTGAATTGAGTCTCCAAGGTCTCCATGTGAAACAAGCAAAAAGAGAATTAT
CTGTAATGTTGTAATTTGTACCTAAGTTTTTTAATGAGTGAAATTTGCATTATAAACTTTTTCCATTCATAAATACATAAGTGAACCAAA
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AATATGTTTTAAAATGTGCCCATATTTTCAGAACATGCTGTTTTATTGGTAAATTGAATGTCTACCTGTAAGCATAAATCTTTGAGGCAG
TTTATGTATTGCTGAATAGCAATTTATACAAGAAGCTGTCCATAACTGATTATGCTTATGTACTTACTTACACATTTTTAACTTTATGAC
CAGCCTAAATATTCTGGGGGAAGTGGGGTATAATATTTAACGAATCATGATTCAGATTGTACCATTACATGTTTCAGTGCAGCATGGTTA
CTAACGCTATGTCAGACTAATATTAAAATCAGAAAATTTAAATGCTGGTGCTGGTCAGACTTTTTTTGTTAGATTCTCTCATTTAAAAAA
AATACTGTTTGTTTAAAGCATGCATAAAAATTTATGTATTGAAATATACTTAAAAATTCAAGATGCTTCCCATTTGTGTAATATTTACCT
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TTCCTTCACTGATTTGCTTTAAAAAAAATAAAAGATAATGATTTATTGCAGAATTATGATTCTATTTTCTCAATATGTTAACTTGGAAAA
AAATTTTAGCCTTATCTTAATCTGTCCCAACAGCAATGTGACGGATTTTTGCAGATTCAAAATCTGCAATGGTTATTTACAAGTCAATCT
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CCATGTCAGTCCTTCAGTTGTACAGTGAACTGTTGTACACTGGTTCAATGAAAGGAAGTTAAAAGTACCTTTTACATATTGTAAAAGTGG
ATACAGTTGATTTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCACTAGCAACATTAGAATTTTAAAATAAAATAATTGGGAAAGAAGG
TGGGTCATGTATTAATCAGTGAACAGAGATTTACCTAACCAACAGACTTGGATTGTCTTTTGACATAATCAAAATGCAACACATGCACTT
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AGAGCACTCAAGTGTGGGTTTCTGTGTTATTGAGGATTTGTTTGGAATTCAAATTACAGTTATGTACTGGATGCTACAGACTTATAACAG
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AAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCTTATCACCCAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCAT
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ATGAAAATGGACATTTTAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTG
TCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCCCAGAACTACACAACAC
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GGGATGGATTCCCTGATGTTGGCCCTCACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCCTCATCGGGCATTCTCT
CCATGGTTTTTTACACCGACAGCGCGATAGCAAAAGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAGATTTCA
AATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAAATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAGTATAGCACCAACTGGTCTGCAG
AGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAGAGGATTCCTACCGAGAGTGGATACAGACTGTGGATATTCATAAGG
AGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAATAATAGCACCTGCGAATATGGAGC
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ATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACAC
TGGGACGGAATACTCCTTATAAAACCCTGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAA
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GTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTGGACCAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCC
AGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCTACTACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGA
CTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGC
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AGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATTATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAG
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CTGATTATGCTTATGTACTTACTTACACATTTTTAACTTTATGACCAGCCTAAATATTCTGGGGGAAGTGGGGTATAATATTTAACGAAT
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TGGTGCTGGTCAGACTTTTTTTGTTAGATTCTCTCATTTAAAAAAAATACTGTTTGTTTAAAGCATGCATAAAAATTTATGTATTGAAAT
ATACTTAAAAATTCAAGATGCTTCCCATTTGTGTAATATTTACCTGGAGGACTCGTACTTAGGTGTCTTAACGTGAATTGAGTCTCCAAG
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TTTTTCCATTCATAAATACATAAGTGAACCAAAGGTTTTTGTCCTTTCCTTCACTGATTTGCTTTAAAAAAAATAAAAGATAATGATTTA
TTGCAGAATTATGATTCTATTTTCTCAATATGTTAACTTGGAAAAAAATTTTAGCCTTATCTTAATCTGTCCCAACAGCAATGTGACGGA
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CCATAACTGATTATGCTTATGTACTTACTTACACATTTTTAACTTTATGACCAGCCTAAATATTCTGGGGGAAGTGGGGTATAATATTTA
ACGAATCATGATTCAGATTGTACCATTACATGTTTCAGTGCAGCATGGTTACTAACGCTATGTCAGACTAATATTAAAATCAGAAAATTT
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GTGTCAAATTGTGTGCATTCATTCTGTAGGTAAAATTCTTAAGGATTGCCATGTCAGTCCTTCAGTTGTACAGTGAACTGTTGTACACTG
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TCTCTTCTTGTCTTGTGTATAATTCTCTATTGCTTAGGATATTAAAGTAGAGCACTCAAGTGTGGGTTTCTGTGTTATTGAGGATTTGTT
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TAAATGCTGGTGCTGGTCAGACTTTTTTTGTTAGATTCTCTCATTTAAAAAAAATACTGTTTGTTTAAAGCATGCATAAAAATTTATGTA
TTGAAATATACTTAAAAATTCAAGATGCTTCCCATTTGTGTAATATTTACCTGGAGGACTCGTACTTAGGTGTCTTAACGTGAATTGAGT
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TCACATTTTTCTGACCTTTACTCCTACGGTAAATCAAGACAAACCATTTGAATTTTAACATTGGTTATTTATTTGTGTAATGGCCTTACA
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ATCAAATTTGTCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCCCAGAAC
TACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATGCACTTATATTGTCTTTGTGCCA
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AATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGATGTGGGCCATGGTGTCAAGCATGGAAATAAC
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ATGCTGGTGCTGGTCAGACTTTTTTTGTTAGATTCTCTCATTTAAAAAAAATACTGTTTGTTTAAAGCATGCATAAAAATTTATGTATTG
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GTGCTGGTCAGACTTTTTTTGTTAGATTCTCTCATTTAAAAAAAATACTGTTTGTTTAAAGCATGCATAAAAATTTATGTATTGAAATAT
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GCAGAATTATGATTCTATTTTCTCAATATGTTAACTTGGAAAAAAATTTTAGCCTTATCTTAATCTGTCCCAACAGCAATGTGACGGATT
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ATGAAAGGAAGTTAAAAGTACCTTTTACATATTGTAAAAGTGGATACAGTTGATTTGTGAGTAGGCACTCTTTAATCCATTACCTGGCAC
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ATAAACCATTCTCCTATATGAAATTTTGGATACTGTTAAAATATAACTCATGTGGACTTCAATGCAGACTTCACATTTTTCTGACCTTTA
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ATCAAATTTGTCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCCCAGAAC
TACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATGCACTTATATTGTCTTTGTGCCA
AAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGCTTTGACCTGGAGCCTGACTCAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTACGACCGG
CTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATGTTGGCCCTCACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCCTCATCG
GGCATTCTCTCCATGGTTTTTTACACCGACAGCGCGATAGCAAAAGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCA
GAAGATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAAATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAGTATAGCACCAAC
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ATTCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAATAATAGCACCTGCG
AATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGATGTGGGCCATGGTGTCAAGAAATGGCATAAA
ATAATACATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCA
GGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTTATAAAACCCTGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCT
GCTAGGCTTGGAAGTCAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGA
AGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTGGACCAGAAAACATTTCT
GTCCCTCCTCCTTCTGGAGCTCCACCAGCACCACCTCTGGCACCACTTCTCCCAGTGAGCACTGTGATAGCAGCCCCGGGCTCAGCTCCT
GGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCTACTACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCC
TCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCC
CCTATGCCTCAGTTGACTCCACAGATACCTCTCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCA
CCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGCA
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TGTTTTATTGGTAAATTGAATGTCTACCTGTAAGCATAAATCTTTGAGGCAGTTTATGTATTGCTGAATAGCAATTTATACAAGAAGCTG
TCCATAACTGATTATGCTTATGTACTTACTTACACATTTTTAACTTTATGACCAGCCTAAATATTCTGGGGGAAGTGGGGTATAATATTT
AACGAATCATGATTCAGATTGTACCATTACATGTTTCAGTGCAGCATGGTTACTAACGCTATGTCAGACTAATATTAAAATCAGAAAATT
TAAATGCTGGTGCTGGTCAGACTTTTTTTGTTAGATTCTCTCATTTAAAAAAAATACTGTTTGTTTAAAGCATGCATAAAAATTTATGTA
TTGAAATATACTTAAAAATTCAAGATGCTTCCCATTTGTGTAATATTTACCTGGAGGACTCGTACTTAGGTGTCTTAACGTGAATTGAGT
CTCCAAGGTCTCCATGTGAAACAAGCAAAAAGAGAATTATCTGTAATGTTGTAATTTGTACCTAAGTTTTTTAATGAGTGAAATTTGCAT
TATAAACTTTTTCCATTCATAAATACATAAGTGAACCAAAGGTTTTTGTCCTTTCCTTCACTGATTTGCTTTAAAAAAAATAAAAGATAA
TGATTTATTGCAGAATTATGATTCTATTTTCTCAATATGTTAACTTGGAAAAAAATTTTAGCCTTATCTTAATCTGTCCCAACAGCAATG
TGACGGATTTTTGCAGATTCAAAATCTGCAATGGTTATTTACAAGTCAATCTACTGAATTCCTTTTTTAAATAATCTTTTGAAACTAAGA
AAATGTGTCAAATTGTGTGCATTCATTCTGTAGGTAAAATTCTTAAGGATTGCCATGTCAGTCCTTCAGTTGTACAGTGAACTGTTGTAC
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ACCTGGCACTAGCAACATTAGAATTTTAAAATAAAATAATTGGGAAAGAAGGTGGGTCATGTATTAATCAGTGAACAGAGATTTACCTAA
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AATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGATGTGGGCCATGGTGTCAAGTGGCTAAAAGCC
AAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGC
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CCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCT
CCCCCTATGCCTCAGTTGACTCCACAGATACCTCTCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCG
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TGCTGTTTTATTGGTAAATTGAATGTCTACCTGTAAGCATAAATCTTTGAGGCAGTTTATGTATTGCTGAATAGCAATTTATACAAGAAG
CTGTCCATAACTGATTATGCTTATGTACTTACTTACACATTTTTAACTTTATGACCAGCCTAAATATTCTGGGGGAAGTGGGGTATAATA
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GTATTGAAATATACTTAAAAATTCAAGATGCTTCCCATTTGTGTAATATTTACCTGGAGGACTCGTACTTAGGTGTCTTAACGTGAATTG
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TCTTGTCTTGTGTATAATTCTCTATTGCTTAGGATATTAAAGTAGAGCACTCAAGTGTGGGTTTCTGTGTTATTGAGGATTTGTTTGGAA
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TACTCCTACGGTAAATCAAGACAAACCATTTGAATTTTAACATTGGTTATTTATTTGTGTAATGGCCTTACATGTGGATATTAACAGTGT
AAACAATACCACATATAACCATCAAGATACCTTGATTATAATTTATAGGACTAGAATGACAGATTCAGGTGGTTTATTAATTACATTTAA

>60338_60338_47_NRP1-ABI1_NRP1_chr10_33542956_ENST00000395995_ABI1_chr10_27066170_ENST00000376166_length(amino acids)=678AA_BP=325
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AGATAATGATTTATTGCAGAATTATGATTCTATTTTCTCAATATGTTAACTTGGAAAAAAATTTTAGCCTTATCTTAATCTGTCCCAACA
GCAATGTGACGGATTTTTGCAGATTCAAAATCTGCAATGGTTATTTACAAGTCAATCTACTGAATTCCTTTTTTAAATAATCTTTTGAAA
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PSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIY

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Fusion Gene PPI Analysis for NRP1-ABI1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for NRP1-ABI1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for NRP1-ABI1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource