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Fusion gene:OSCP1-NF1 (FusionGDB2 ID:61888)

Fusion Gene Summary for OSCP1-NF1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: OSCP1-NF1
Fusion gene ID: 61888
HgeneTgene
Gene symbol

OSCP1

NF1

Gene ID

127700

4763

Gene nameorganic solute carrier partner 1neurofibromin 1
SynonymsC1orf102|NOR1NFNS|VRNF|WSS
Cytomap

1p34.3

17q11.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionprotein OSCP1organic solute carrier protein 1organic solute transport protein 1oxidored nitro domain containing proteinoxidored-nitro domain-containing protein 1neurofibrominneurofibromatosis 1neurofibromatosis-related protein NF-1truncated neurofibromin 1
Modification date2020031320200322
UniProtAcc.

P21359

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000235532, ENST00000315643, 
ENST00000354267, ENST00000356637, 
ENST00000433045, ENST00000495222, 
ENST00000417592, ENST00000431387, 
ENST00000444181, ENST00000581113, 
ENST00000356175, ENST00000358273, 
Fusion gene scores* DoF score5 X 6 X 3=9028 X 30 X 15=12600
# samples 633
** MAII scorelog2(6/90*10)=-0.584962500721156
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(33/12600*10)=-5.25481389902883
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: OSCP1 [Title/Abstract] AND NF1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointOSCP1(36915859)-NF1(29701031), # samples:3
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgeneNF1

GO:0043547

positive regulation of GTPase activity

2121371


check buttonFusion gene breakpoints across OSCP1 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across NF1 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4MESOTCGA-UD-AAC4-01AOSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
ChimerDB4MESOTCGA-UD-AAC4OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
ChimerDB4MESOTCGA-UD-AAC4OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+


Top

Fusion Gene ORF analysis for OSCP1-NF1

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
5CDS-intronENST00000235532ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000417592OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000431387OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000444181OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000581113OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000417592OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000431387OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000444181OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000581113OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000417592OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000431387OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000444181OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000581113OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000417592OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000431387OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000444181OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000581113OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
In-frameENST00000235532ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000235532ENST00000356175OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
In-frameENST00000235532ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000235532ENST00000358273OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
In-frameENST00000315643ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000315643ENST00000356175OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
In-frameENST00000315643ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000315643ENST00000358273OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
In-frameENST00000354267ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000354267ENST00000356175OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
In-frameENST00000354267ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000354267ENST00000358273OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
In-frameENST00000356637ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000356637ENST00000356175OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
In-frameENST00000356637ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000356637ENST00000358273OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-3CDSENST00000433045ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-3CDSENST00000433045ENST00000356175OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-3CDSENST00000433045ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-3CDSENST00000433045ENST00000358273OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-3CDSENST00000495222ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-3CDSENST00000495222ENST00000356175OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-3CDSENST00000495222ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-3CDSENST00000495222ENST00000358273OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-intronENST00000433045ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000433045ENST00000417592OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-intronENST00000433045ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000433045ENST00000431387OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-intronENST00000433045ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000433045ENST00000444181OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-intronENST00000433045ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000433045ENST00000581113OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-intronENST00000495222ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000495222ENST00000417592OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-intronENST00000495222ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000495222ENST00000431387OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-intronENST00000495222ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000495222ENST00000444181OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+
intron-intronENST00000495222ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000495222ENST00000581113OSCP1chr1

36915858

-NF1chr17

29701030

+

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000235532OSCP1chr136915859-ENST00000356175NF1chr1729701031+38591941336111
ENST00000235532OSCP1chr136915859-ENST00000358273NF1chr1729701031+38591941336111
ENST00000356637OSCP1chr136915859-ENST00000356175NF1chr1729701031+384117613318101
ENST00000356637OSCP1chr136915859-ENST00000358273NF1chr1729701031+384117613318101
ENST00000315643OSCP1chr136915859-ENST00000356175NF1chr1729701031+389322835370111
ENST00000315643OSCP1chr136915859-ENST00000358273NF1chr1729701031+389322835370111
ENST00000354267OSCP1chr136915859-ENST00000356175NF1chr1729701031+38511868328106
ENST00000354267OSCP1chr136915859-ENST00000358273NF1chr1729701031+38511868328106
ENST00000235532OSCP1chr136915858-ENST00000356175NF1chr1729701030+38591941336111
ENST00000235532OSCP1chr136915858-ENST00000358273NF1chr1729701030+38591941336111
ENST00000356637OSCP1chr136915858-ENST00000356175NF1chr1729701030+384117613318101
ENST00000356637OSCP1chr136915858-ENST00000358273NF1chr1729701030+384117613318101
ENST00000315643OSCP1chr136915858-ENST00000356175NF1chr1729701030+389322835370111
ENST00000315643OSCP1chr136915858-ENST00000358273NF1chr1729701030+389322835370111
ENST00000354267OSCP1chr136915858-ENST00000356175NF1chr1729701030+38511868328106
ENST00000354267OSCP1chr136915858-ENST00000358273NF1chr1729701030+38511868328106

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000235532ENST00000356175OSCP1chr136915859-NF1chr1729701031+0.280653330.7193467
ENST00000235532ENST00000358273OSCP1chr136915859-NF1chr1729701031+0.280653330.7193467
ENST00000356637ENST00000356175OSCP1chr136915859-NF1chr1729701031+0.275531650.72446835
ENST00000356637ENST00000358273OSCP1chr136915859-NF1chr1729701031+0.275531650.72446835
ENST00000315643ENST00000356175OSCP1chr136915859-NF1chr1729701031+0.27429370.72570634
ENST00000315643ENST00000358273OSCP1chr136915859-NF1chr1729701031+0.27429370.72570634
ENST00000354267ENST00000356175OSCP1chr136915859-NF1chr1729701031+0.276462550.72353745
ENST00000354267ENST00000358273OSCP1chr136915859-NF1chr1729701031+0.276462550.72353745
ENST00000235532ENST00000356175OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+0.280653330.7193467
ENST00000235532ENST00000358273OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+0.280653330.7193467
ENST00000356637ENST00000356175OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+0.275531650.72446835
ENST00000356637ENST00000358273OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+0.275531650.72446835
ENST00000315643ENST00000356175OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+0.27429370.72570634
ENST00000315643ENST00000358273OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+0.27429370.72570634
ENST00000354267ENST00000356175OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+0.276462550.72353745
ENST00000354267ENST00000358273OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+0.276462550.72353745

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Fusion Genomic Features for OSCP1-NF1


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)
OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+8.29E-091
OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+8.29E-091
OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+8.29E-091
OSCP1chr136915858-NF1chr1729701030+8.29E-091

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.
genomic feature of top 1%

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Fusion Protein Features for OSCP1-NF1


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr1:36915859/chr17:29701031)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
.NF1

P21359

FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.FUNCTION: Stimulates the GTPase activity of Ras. NF1 shows greater affinity for Ras GAP, but lower specific activity. May be a regulator of Ras activity. {ECO:0000269|PubMed:2121371, ECO:0000269|PubMed:8417346}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST000004313870151352_13550594.0Compositional biasNote=Poly-Ser
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST000004313870151352_13550594.0Compositional biasNote=Poly-Ser
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST000004313870151235_14510594.0DomainRas-GAP
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST000004313870151580_17380594.0DomainCRAL-TRIO
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST000004313870151235_14510594.0DomainRas-GAP
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST000004313870151580_17380594.0DomainCRAL-TRIO
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST000004313870152555_25710594.0MotifNote=Bipartite nuclear localization signal
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST000004313870152555_25710594.0MotifNote=Bipartite nuclear localization signal
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST000004313870151580_18370594.0RegionNote=Lipid binding
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST000004313870151580_18370594.0RegionNote=Lipid binding

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST0000035617555571352_135527712819.0Compositional biasNote=Poly-Ser
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST0000035827356581352_135527922840.0Compositional biasNote=Poly-Ser
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST0000035617555571352_135527712819.0Compositional biasNote=Poly-Ser
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST0000035827356581352_135527922840.0Compositional biasNote=Poly-Ser
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST0000035617555571235_145127712819.0DomainRas-GAP
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST0000035617555571580_173827712819.0DomainCRAL-TRIO
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST0000035827356581235_145127922840.0DomainRas-GAP
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST0000035827356581580_173827922840.0DomainCRAL-TRIO
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST0000035617555571235_145127712819.0DomainRas-GAP
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST0000035617555571580_173827712819.0DomainCRAL-TRIO
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST0000035827356581235_145127922840.0DomainRas-GAP
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST0000035827356581580_173827922840.0DomainCRAL-TRIO
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST0000035617555572555_257127712819.0MotifNote=Bipartite nuclear localization signal
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST0000035827356582555_257127922840.0MotifNote=Bipartite nuclear localization signal
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST0000035617555572555_257127712819.0MotifNote=Bipartite nuclear localization signal
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST0000035827356582555_257127922840.0MotifNote=Bipartite nuclear localization signal
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST0000035617555571580_183727712819.0RegionNote=Lipid binding
TgeneNF1chr1:36915858chr17:29701030ENST0000035827356581580_183727922840.0RegionNote=Lipid binding
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST0000035617555571580_183727712819.0RegionNote=Lipid binding
TgeneNF1chr1:36915859chr17:29701031ENST0000035827356581580_183727922840.0RegionNote=Lipid binding


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Fusion Gene Sequence for OSCP1-NF1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>61888_61888_1_OSCP1-NF1_OSCP1_chr1_36915858_ENST00000235532_NF1_chr17_29701030_ENST00000356175_length(transcript)=3859nt_BP=194nt
ATTGGGACGCTGCGGCCTGGCCTTCAGGCCACTGGCTACCGAACCCCGGGGCTCTTCACCAGTCCAGCTCGTTTCCAGCACCATGTCGGT
GCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATCCCGGGAGA
CAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCACGGATCCGC
AAGCCAAGTGCAGAAGCAAAGAAGCGCTGGCAGTTTCAAACGTAATAGCATTAAGAAGATCGTGTGAAGCTTGCTTGCTTTCTTTTTTAA
AATCAACTTAACATGGGCTCTTCACTAGTGACCCCTTCCCTGTCCTTGCCCTTTCCCCCCATGTTGTAATGCTGCACTTCCTGTTTTATA
ATGAACCCATCCGGTTTGCCATGTTGCCAGATGATCAACTCTTCGAAGCCTTGCCTAAATTTAATGCTGCCTTTTCTTTAACTTTTTTTC
TTCTACTTTTGGCGTGTATCTGGTATATGTAAGTGTTCAGAACAACTGCAAAGAAAGTGGGAGGTCAGGAAACTTTTAACTGAGAAATCT
CAATTGTAAGAGAGGATGAATTCTTGAATACTGCTACTACTGGCCAGTGATGAAAGCCATTTGCACAGAGCTCTGCCTTCTGTGGTTTTC
CCTTCTTCATCCTACAGAGTAAAGTGTTAGTCCTATTTATACATTTTTCAAGATACAAGTTTATGAGAGAAATAGTATTATAACCCCAGT
ATGTTTAATCTTTTAGCTGTGGACTTTTTTTTTAACCGTACAAAACTGAAAGAACCATAGAGGTCAAGCCTCAGTGACTTGACACCATAA
AGCCACAGACAAGGTACTTGGGGGGGAGGGCAGGGAAATTTCATATTTTATAGTGGATTCTTAAGAAATACTAACACTTGAGTATTAGCA
ATAATTACAGGAAAATAAGTGCGACCACATATATCTTAACATTACTGAATTAAAACTATGGCTTCTAAGTCCTTATCCAAACTCAGTCAT
CCAAACTAGTTTATTTTTTTCTCCAGTTGATTATCTTTTAATTTTTAATTTTGCTAAAGGTGGTTTTTTTGTGTTTTGTTTTTTGTAAAC
CAAAACTATACTAAGTATAGTAATTATATATATATATATATTTTTTCCCCTCCCCCTCTTCTTTCCTAACTAATTCTGAGCAGGGTAATC
AGTGAACAAAGTGTTGAAAATTGTTCCCAGAAGGTAATTTTCATAGATGTTTGCATTAGCTCCATAGCAAAATGGAATGGTACGTGACAT
TTAGGGTAGCTGATATTTTTATTTTGTTAAATAATTTCCAAGAATAGAGTATGGTGTATATTATAAATTTCTTTGATAAGATGTATTTTG
AATGTCTTTTAATCTTCCTCCTCCTCTCCAAAAAAATCAGAAACCTCTTTAAGAAAACATGTAGGTTATATATGCTAGAATTGCATTTAA
TCACTGTGAAAAGACTGGTCAGCCTGCATTAGTATGACAGTAGGGGGGCTGTTAGAATTGCTGCTATACTGGTGGTATGGATTATCATGG
CATTGGAATTTTCATAGTAATGCAGATCCAATTTCTTTGTGGTACCTGCAGTTTACAAAATAATTTGACTTCAGTGAGCATATTGGTATC
TGGATGTTCCAATTTAGAACTAAACCATATTTATTACAAAAAGATATTAATCCCTCTACTCCCAGGTTCCCTTTATATGTTAAGATATAA
TGGCTTTGAGGGGGGAAAAAATAAACCTAGGGGAGAGGGGAGTTTCCTGTAGTGCTGTTTCATTAGAGGATTTCAGTAAATTAAATTCCA
CAGCTAATTCAATAAATAATGGTACATTTAAGTGTTCTGATTTTAATAATATATTTCACATTTATCCACACAGTAACAATGTAATATGTT
AATGTAAATAAAATTGGTTTTGATACTCAGAAATAACAAGAATTTAATTTTTTAAATTTGTTTACAGTCCTGGGAAAAGTAAGAATTATT
TGCCAAAATAAGAGGAAAGAAAACCTTAGTATTATTAATGAGTTTACCATAGAATTGTTGGAAATACTGAAGACAGGTGCAATTTACTAA
ACTTTTGTTTTTAAACTATTGTAGAGGCTGCATTAGAAGAAAATGTTTATAATGACAGAGCAACTATGACTATATAAAAAAGCTGAAATT
AGAACTGTGTTTAGAAATAGATCAGTAACCCAGTGCCAAGGATGCCAAGCTGCCACCATGGTCTTGGCTCTCCCACAACCCAGTGTTTCT
GGGGTAAGTTTCACAGTTTCTAGGCCCTGGAATAGCAGGCAGTGTAAGCCTTTGATAACTTTAGTTCGATGTTTTTCTTGTTTTTGTTTG
TTGGTTTGGTGCATATGATAGTGGGTGTTATGCTATTTTGCTCTTCCCATCAAAATAAAGAAACTTCCAGAGGTTTACTGTTAAAAATAC
TGATATTTCCATAAACGGGTTTACCAAGGGTGTAGTATTTCATACCGCCTGAAATGATCAGCATTGGCACAAATCAAAATTCAGCCGCCT
TTGAAATGCAAAAATACCTTTGACTAGTAAGTACATCCTAGGAGTTTGAAAACTTAACTAAGGTTTAAAATTTACCTTGTTTAAAGAACT
TCTGACTTTTGAGGAAAATCTAGCTTTCCAAGTAACTAAAATGTACATGAGATAAACCTCTCACCACTATGTGTCCCTTGAGAAATGCAA
CACTTTTTTAGTCTTCATACTTGTAATCTATAAAAGAAATTCTGAAGTTTAGACCAAGTTGCCCATTTCTGCGTAATTGACATAAGTTCT
GTTAAAAATATTATAAGTAATTCGTTTCGGTTTGTAGATGTTTCCCCTGACTTGTTAAAGAGGAAACCAGGAACTCAGTCATGTTTTTGT
CCTGGATAATCTACCTGTTATGCCAGTACTCCCATCCGAGGGGCATGCCCTTAGTTGCCCAGATGGAGATGCAGTTCAGTAGATTTGGGG
CAAAGTGGCTACAGCTCTGTCTTCCATTCACTCAACACCTGTTCATGACTGAGCCAGGTGCCCAGGACACATCCTAAACAGTCAGCTTCT
ATCCTGTGTCCTAGTTGGGGAGACAGAGTGCCAGCCAGCAACCCTCCCAGGTTTGTAGGTTTTAGGGGTTTTCAGTTTTGTTTGGGTTTT
TTGTTTTTTGTTTTTGTTTCTACATCCTTCCCCGACTCCCAGGCATAATGAGGCATGTCTTACTCAATGTTATGCAATGGATTTAGGCAA
AAATTCATTCTTAGTGTCAGCCACACAATTTTTTTTAATGCAGTATATTCACCTGTAAATAGTTTGTGTAAAATTTGACAAAAAAAGTAT
ATTTACTATACTGTAAATATATGTGATGATATATTGTATTATTTTGCTTTTTTGTAAAGCAGTTAGTTGCTGCACATGGATAACAACAAA
AATTTGATTATTCTCGTGTTAGTATTGTTAACTTCTTTTTGCGACTGCGTTACATCATTTAAAGAAAATGCTGTGTATTGTAAACTTAAA
TTGTATATGATAACTTACTGTCCTTTCCATCCGGGCCTAAACTTTGGCAGTTCCTTTGTCTACAACCTTGTTAATACTGTAAACAGTTGT
ACGCCAGCAGGAAAAATACTGCCCAACAGACAAAATCGATCATTGTAGGGGAAAATCATAGAAATCCATTTCAGATCTTTATTGTTCCTC

>61888_61888_1_OSCP1-NF1_OSCP1_chr1_36915858_ENST00000235532_NF1_chr17_29701030_ENST00000356175_length(amino acids)=111AA_BP=64
LGRCGLAFRPLATEPRGSSPVQLVSSTMSVRTLPLLFLNLGGEMLYILDQRLRAQNIPGDKARKGIDKENVELSPTTGHCNSGRTRHGSA

--------------------------------------------------------------
>61888_61888_2_OSCP1-NF1_OSCP1_chr1_36915858_ENST00000235532_NF1_chr17_29701030_ENST00000358273_length(transcript)=3859nt_BP=194nt
ATTGGGACGCTGCGGCCTGGCCTTCAGGCCACTGGCTACCGAACCCCGGGGCTCTTCACCAGTCCAGCTCGTTTCCAGCACCATGTCGGT
GCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATCCCGGGAGA
CAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCACGGATCCGC
AAGCCAAGTGCAGAAGCAAAGAAGCGCTGGCAGTTTCAAACGTAATAGCATTAAGAAGATCGTGTGAAGCTTGCTTGCTTTCTTTTTTAA
AATCAACTTAACATGGGCTCTTCACTAGTGACCCCTTCCCTGTCCTTGCCCTTTCCCCCCATGTTGTAATGCTGCACTTCCTGTTTTATA
ATGAACCCATCCGGTTTGCCATGTTGCCAGATGATCAACTCTTCGAAGCCTTGCCTAAATTTAATGCTGCCTTTTCTTTAACTTTTTTTC
TTCTACTTTTGGCGTGTATCTGGTATATGTAAGTGTTCAGAACAACTGCAAAGAAAGTGGGAGGTCAGGAAACTTTTAACTGAGAAATCT
CAATTGTAAGAGAGGATGAATTCTTGAATACTGCTACTACTGGCCAGTGATGAAAGCCATTTGCACAGAGCTCTGCCTTCTGTGGTTTTC
CCTTCTTCATCCTACAGAGTAAAGTGTTAGTCCTATTTATACATTTTTCAAGATACAAGTTTATGAGAGAAATAGTATTATAACCCCAGT
ATGTTTAATCTTTTAGCTGTGGACTTTTTTTTTAACCGTACAAAACTGAAAGAACCATAGAGGTCAAGCCTCAGTGACTTGACACCATAA
AGCCACAGACAAGGTACTTGGGGGGGAGGGCAGGGAAATTTCATATTTTATAGTGGATTCTTAAGAAATACTAACACTTGAGTATTAGCA
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CCAAACTAGTTTATTTTTTTCTCCAGTTGATTATCTTTTAATTTTTAATTTTGCTAAAGGTGGTTTTTTTGTGTTTTGTTTTTTGTAAAC
CAAAACTATACTAAGTATAGTAATTATATATATATATATATTTTTTCCCCTCCCCCTCTTCTTTCCTAACTAATTCTGAGCAGGGTAATC
AGTGAACAAAGTGTTGAAAATTGTTCCCAGAAGGTAATTTTCATAGATGTTTGCATTAGCTCCATAGCAAAATGGAATGGTACGTGACAT
TTAGGGTAGCTGATATTTTTATTTTGTTAAATAATTTCCAAGAATAGAGTATGGTGTATATTATAAATTTCTTTGATAAGATGTATTTTG
AATGTCTTTTAATCTTCCTCCTCCTCTCCAAAAAAATCAGAAACCTCTTTAAGAAAACATGTAGGTTATATATGCTAGAATTGCATTTAA
TCACTGTGAAAAGACTGGTCAGCCTGCATTAGTATGACAGTAGGGGGGCTGTTAGAATTGCTGCTATACTGGTGGTATGGATTATCATGG
CATTGGAATTTTCATAGTAATGCAGATCCAATTTCTTTGTGGTACCTGCAGTTTACAAAATAATTTGACTTCAGTGAGCATATTGGTATC
TGGATGTTCCAATTTAGAACTAAACCATATTTATTACAAAAAGATATTAATCCCTCTACTCCCAGGTTCCCTTTATATGTTAAGATATAA
TGGCTTTGAGGGGGGAAAAAATAAACCTAGGGGAGAGGGGAGTTTCCTGTAGTGCTGTTTCATTAGAGGATTTCAGTAAATTAAATTCCA
CAGCTAATTCAATAAATAATGGTACATTTAAGTGTTCTGATTTTAATAATATATTTCACATTTATCCACACAGTAACAATGTAATATGTT
AATGTAAATAAAATTGGTTTTGATACTCAGAAATAACAAGAATTTAATTTTTTAAATTTGTTTACAGTCCTGGGAAAAGTAAGAATTATT
TGCCAAAATAAGAGGAAAGAAAACCTTAGTATTATTAATGAGTTTACCATAGAATTGTTGGAAATACTGAAGACAGGTGCAATTTACTAA
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AGAACTGTGTTTAGAAATAGATCAGTAACCCAGTGCCAAGGATGCCAAGCTGCCACCATGGTCTTGGCTCTCCCACAACCCAGTGTTTCT
GGGGTAAGTTTCACAGTTTCTAGGCCCTGGAATAGCAGGCAGTGTAAGCCTTTGATAACTTTAGTTCGATGTTTTTCTTGTTTTTGTTTG
TTGGTTTGGTGCATATGATAGTGGGTGTTATGCTATTTTGCTCTTCCCATCAAAATAAAGAAACTTCCAGAGGTTTACTGTTAAAAATAC
TGATATTTCCATAAACGGGTTTACCAAGGGTGTAGTATTTCATACCGCCTGAAATGATCAGCATTGGCACAAATCAAAATTCAGCCGCCT
TTGAAATGCAAAAATACCTTTGACTAGTAAGTACATCCTAGGAGTTTGAAAACTTAACTAAGGTTTAAAATTTACCTTGTTTAAAGAACT
TCTGACTTTTGAGGAAAATCTAGCTTTCCAAGTAACTAAAATGTACATGAGATAAACCTCTCACCACTATGTGTCCCTTGAGAAATGCAA
CACTTTTTTAGTCTTCATACTTGTAATCTATAAAAGAAATTCTGAAGTTTAGACCAAGTTGCCCATTTCTGCGTAATTGACATAAGTTCT
GTTAAAAATATTATAAGTAATTCGTTTCGGTTTGTAGATGTTTCCCCTGACTTGTTAAAGAGGAAACCAGGAACTCAGTCATGTTTTTGT
CCTGGATAATCTACCTGTTATGCCAGTACTCCCATCCGAGGGGCATGCCCTTAGTTGCCCAGATGGAGATGCAGTTCAGTAGATTTGGGG
CAAAGTGGCTACAGCTCTGTCTTCCATTCACTCAACACCTGTTCATGACTGAGCCAGGTGCCCAGGACACATCCTAAACAGTCAGCTTCT
ATCCTGTGTCCTAGTTGGGGAGACAGAGTGCCAGCCAGCAACCCTCCCAGGTTTGTAGGTTTTAGGGGTTTTCAGTTTTGTTTGGGTTTT
TTGTTTTTTGTTTTTGTTTCTACATCCTTCCCCGACTCCCAGGCATAATGAGGCATGTCTTACTCAATGTTATGCAATGGATTTAGGCAA
AAATTCATTCTTAGTGTCAGCCACACAATTTTTTTTAATGCAGTATATTCACCTGTAAATAGTTTGTGTAAAATTTGACAAAAAAAGTAT
ATTTACTATACTGTAAATATATGTGATGATATATTGTATTATTTTGCTTTTTTGTAAAGCAGTTAGTTGCTGCACATGGATAACAACAAA
AATTTGATTATTCTCGTGTTAGTATTGTTAACTTCTTTTTGCGACTGCGTTACATCATTTAAAGAAAATGCTGTGTATTGTAAACTTAAA
TTGTATATGATAACTTACTGTCCTTTCCATCCGGGCCTAAACTTTGGCAGTTCCTTTGTCTACAACCTTGTTAATACTGTAAACAGTTGT
ACGCCAGCAGGAAAAATACTGCCCAACAGACAAAATCGATCATTGTAGGGGAAAATCATAGAAATCCATTTCAGATCTTTATTGTTCCTC

>61888_61888_2_OSCP1-NF1_OSCP1_chr1_36915858_ENST00000235532_NF1_chr17_29701030_ENST00000358273_length(amino acids)=111AA_BP=64
LGRCGLAFRPLATEPRGSSPVQLVSSTMSVRTLPLLFLNLGGEMLYILDQRLRAQNIPGDKARKGIDKENVELSPTTGHCNSGRTRHGSA

--------------------------------------------------------------
>61888_61888_3_OSCP1-NF1_OSCP1_chr1_36915858_ENST00000315643_NF1_chr17_29701030_ENST00000356175_length(transcript)=3893nt_BP=228nt
CTTCCCGTCACGGCGTTGCCCCAGCAACCGGACTATTGGGACGCTGCGGCCTGGCCTTCAGGCCACTGGCTACCGAACCCCGGGGCTCTT
CACCAGTCCAGCTCGTTTCCAGCACCATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCG
ACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATCCCGGGAGACAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCC
ACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCACGGATCCGCAAGCCAAGTGCAGAAGCAAAGAAGCGCTGGCAGTTTCAAACGTAATAGCATTAAGA
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GGCCTTCAGGCCACTGGCTACCGAACCCCGGGGCTCTTCACCAGTCCAGCTCGTTTCCAGCACCATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCT
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GAAAACCTTAGTATTATTAATGAGTTTACCATAGAATTGTTGGAAATACTGAAGACAGGTGCAATTTACTAAACTTTTGTTTTTAAACTA
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TCTAGGCCCTGGAATAGCAGGCAGTGTAAGCCTTTGATAACTTTAGTTCGATGTTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTGGTTTGGTGCATATGA
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GTTTACCAAGGGTGTAGTATTTCATACCGCCTGAAATGATCAGCATTGGCACAAATCAAAATTCAGCCGCCTTTGAAATGCAAAAATACC
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TCTAGCTTTCCAAGTAACTAAAATGTACATGAGATAAACCTCTCACCACTATGTGTCCCTTGAGAAATGCAACACTTTTTTAGTCTTCAT
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AATTCGTTTCGGTTTGTAGATGTTTCCCCTGACTTGTTAAAGAGGAAACCAGGAACTCAGTCATGTTTTTGTCCTGGATAATCTACCTGT
TATGCCAGTACTCCCATCCGAGGGGCATGCCCTTAGTTGCCCAGATGGAGATGCAGTTCAGTAGATTTGGGGCAAAGTGGCTACAGCTCT
GTCTTCCATTCACTCAACACCTGTTCATGACTGAGCCAGGTGCCCAGGACACATCCTAAACAGTCAGCTTCTATCCTGTGTCCTAGTTGG
GGAGACAGAGTGCCAGCCAGCAACCCTCCCAGGTTTGTAGGTTTTAGGGGTTTTCAGTTTTGTTTGGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTT
TCTACATCCTTCCCCGACTCCCAGGCATAATGAGGCATGTCTTACTCAATGTTATGCAATGGATTTAGGCAAAAATTCATTCTTAGTGTC
AGCCACACAATTTTTTTTAATGCAGTATATTCACCTGTAAATAGTTTGTGTAAAATTTGACAAAAAAAGTATATTTACTATACTGTAAAT
ATATGTGATGATATATTGTATTATTTTGCTTTTTTGTAAAGCAGTTAGTTGCTGCACATGGATAACAACAAAAATTTGATTATTCTCGTG
TTAGTATTGTTAACTTCTTTTTGCGACTGCGTTACATCATTTAAAGAAAATGCTGTGTATTGTAAACTTAAATTGTATATGATAACTTAC
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Fusion Gene PPI Analysis for OSCP1-NF1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for OSCP1-NF1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for OSCP1-NF1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource