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Fusion gene:POU2F1-CD46 (FusionGDB2 ID:67231)

Fusion Gene Summary for POU2F1-CD46

Fusion gene summary

Fusion gene information	Fusion gene name: POU2F1-CD46
	Fusion gene ID: 67231
		Hgene	Tgene
	Gene symbol	POU2F1	CD46
	Gene ID	5451	4179
	Gene name	POU class 2 homeobox 1	CD46 molecule
	Synonyms	OCT1\|OTF1\|oct-1B	AHUS2\|MCP\|MIC10\|TLX\|TRA2.10
	Cytomap	1q24.2	1q32.2
	Type of gene	protein-coding	protein-coding
	Description	POU domain, class 2, transcription factor 1NF-A1OTF-1Octamer-binding transcription factor-1POU class 2 homeobox 1 isoform Oct-1Roct-1octamer-binding protein 1octamer-binding transcription factor 1	membrane cofactor proteinCD46 antigen, complement regulatory proteinCD46 molecule, complement regulatory proteinantigen identified by monoclonal antibody TRA-2-10complement membrane cofactor proteinmeasles virus receptormembrane cofactor protein (CD
	Modification date	20200320	20200313
	UniProtAcc	.	P15529
	Ensembl transtripts involved in fusion gene	ENST00000367865, ENST00000367862, ENST00000367866, ENST00000420254, ENST00000429375, ENST00000452019, ENST00000541643,	ENST00000322875, ENST00000322918, ENST00000354848, ENST00000358170, ENST00000361067, ENST00000367041, ENST00000367042, ENST00000441839, ENST00000360212, ENST00000469535, ENST00000480003, ENST00000357714, ENST00000367047,
Fusion gene scores	* DoF score	15 X 7 X 11=1155	16 X 13 X 7=1456
	# samples	17	17
	** MAII score	log2(17/1155*10)=-2.76428620016572 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0	log2(17/1456*10)=-3.098403704061 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0
Context	PubMed: POU2F1 [Title/Abstract] AND CD46 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]
Most frequent breakpoint	POU2F1(167301772)-CD46(207930358), # samples:1
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.

* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez

Partner	Gene	GO ID	GO term	PubMed ID
Hgene	POU2F1	GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-templated	11891224\|11997177
Hgene	POU2F1	GO:0045944	positive regulation of transcription by RNA polymerase II	15252056
Tgene	CD46	GO:0008593	regulation of Notch signaling pathway	23086448
Tgene	CD46	GO:0010629	negative regulation of gene expression	23086448
Tgene	CD46	GO:0032613	interleukin-10 production	23086448
Tgene	CD46	GO:0032733	positive regulation of interleukin-10 production	12540904
Tgene	CD46	GO:0035581	sequestering of extracellular ligand from receptor	23086448
Tgene	CD46	GO:0042102	positive regulation of T cell proliferation	12540904
Tgene	CD46	GO:0043382	positive regulation of memory T cell differentiation	12540904
Tgene	CD46	GO:0045591	positive regulation of regulatory T cell differentiation	12540904
Tgene	CD46	GO:0071636	positive regulation of transforming growth factor beta production	12540904

Fusion gene breakpoints across POU2F1 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.

Fusion gene breakpoints across CD46 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.

Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.

Source	Disease	Sample	Hgene	Hchr	Hbp	Hstrand	Tgene	Tchr	Tbp	Tstrand
ChimerDB4	STAD	TCGA-CD-A489	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+

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Fusion Gene ORF analysis for POU2F1-CD46

Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.

ORF	Henst	Tenst	Hgene	Hchr	Hbp	Hstrand	Tgene	Tchr	Tbp	Tstrand
3UTR-3CDS	ENST00000367865	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-3CDS	ENST00000367865	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-3CDS	ENST00000367865	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-3CDS	ENST00000367865	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-3CDS	ENST00000367865	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-3CDS	ENST00000367865	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-3CDS	ENST00000367865	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-3CDS	ENST00000367865	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-3UTR	ENST00000367865	ENST00000360212	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-3UTR	ENST00000367865	ENST00000469535	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-3UTR	ENST00000367865	ENST00000480003	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-intron	ENST00000367865	ENST00000357714	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
3UTR-intron	ENST00000367865	ENST00000367047	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000367862	ENST00000360212	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000367862	ENST00000469535	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000367862	ENST00000480003	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000367866	ENST00000360212	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000367866	ENST00000469535	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000367866	ENST00000480003	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000420254	ENST00000360212	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000420254	ENST00000469535	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000420254	ENST00000480003	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000429375	ENST00000360212	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000429375	ENST00000469535	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000429375	ENST00000480003	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000452019	ENST00000360212	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000452019	ENST00000469535	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000452019	ENST00000480003	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000541643	ENST00000360212	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000541643	ENST00000469535	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-3UTR	ENST00000541643	ENST00000480003	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000367862	ENST00000357714	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000367862	ENST00000367047	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000367866	ENST00000357714	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000367866	ENST00000367047	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000420254	ENST00000357714	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000420254	ENST00000367047	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000429375	ENST00000357714	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000429375	ENST00000367047	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000452019	ENST00000357714	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000452019	ENST00000367047	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000541643	ENST00000357714	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
5CDS-intron	ENST00000541643	ENST00000367047	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367862	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367862	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367862	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367862	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367862	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367862	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367862	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367862	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367866	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367866	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367866	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367866	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367866	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367866	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367866	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000367866	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000420254	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000420254	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000420254	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000420254	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000420254	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000420254	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000420254	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000420254	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000429375	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000429375	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000429375	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000429375	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000429375	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000429375	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000429375	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000429375	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000452019	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000452019	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000452019	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000452019	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000452019	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000452019	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000452019	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000452019	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000541643	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000541643	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000541643	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000541643	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000541643	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000541643	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000541643	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+
In-frame	ENST00000541643	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+

ORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.

Henst	Tenst	Hgene	Hchr	Hbp	Hstrand	Tgene	Tchr	Tbp	Tstrand	Seq length (transcript)	BP loci (transcript)	Predicted start (transcript)	Predicted stop (transcript)	Seq length (amino acids)
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ENST00000367866	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000441839	CD46	chr1	207930358	+	3112	196	51	1193	380
ENST00000367866	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322875	CD46	chr1	207930358	+	3221	196	51	1298	415
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ENST00000367866	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000358170	CD46	chr1	207930358	+	3314	196	51	1277	408
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ENST00000452019	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000354848	CD46	chr1	207930358	+	3215	235	177	1292	371
ENST00000452019	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000441839	CD46	chr1	207930358	+	3151	235	177	1232	351
ENST00000452019	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322875	CD46	chr1	207930358	+	3260	235	177	1337	386
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ENST00000452019	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000358170	CD46	chr1	207930358	+	3353	235	177	1316	379
ENST00000452019	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322918	CD46	chr1	207930358	+	3106	235	177	1187	336
ENST00000452019	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000361067	CD46	chr1	207930358	+	3218	235	177	1295	372
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ENST00000429375	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322875	CD46	chr1	207930358	+	3159	134	7	1236	409
ENST00000429375	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000367041	CD46	chr1	207930358	+	3162	134	7	1125	372
ENST00000429375	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000358170	CD46	chr1	207930358	+	3252	134	7	1215	402
ENST00000429375	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322918	CD46	chr1	207930358	+	3005	134	7	1086	359
ENST00000429375	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000361067	CD46	chr1	207930358	+	3117	134	7	1194	395
ENST00000541643	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000367042	CD46	chr1	207930358	+	3293	220	162	1256	364
ENST00000541643	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000354848	CD46	chr1	207930358	+	3200	220	162	1277	371
ENST00000541643	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000441839	CD46	chr1	207930358	+	3136	220	162	1217	351
ENST00000541643	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322875	CD46	chr1	207930358	+	3245	220	162	1322	386
ENST00000541643	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000367041	CD46	chr1	207930358	+	3248	220	162	1211	349
ENST00000541643	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000358170	CD46	chr1	207930358	+	3338	220	162	1301	379
ENST00000541643	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322918	CD46	chr1	207930358	+	3091	220	162	1172	336
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ENST00000420254	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000367042	CD46	chr1	207930358	+	3293	220	162	1256	364
ENST00000420254	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000354848	CD46	chr1	207930358	+	3200	220	162	1277	371
ENST00000420254	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000441839	CD46	chr1	207930358	+	3136	220	162	1217	351
ENST00000420254	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322875	CD46	chr1	207930358	+	3245	220	162	1322	386
ENST00000420254	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000367041	CD46	chr1	207930358	+	3248	220	162	1211	349
ENST00000420254	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000358170	CD46	chr1	207930358	+	3338	220	162	1301	379
ENST00000420254	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322918	CD46	chr1	207930358	+	3091	220	162	1172	336
ENST00000420254	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000361067	CD46	chr1	207930358	+	3203	220	162	1280	372
ENST00000367862	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000367042	CD46	chr1	207930358	+	3402	329	178	1365	395
ENST00000367862	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000354848	CD46	chr1	207930358	+	3309	329	178	1386	402
ENST00000367862	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000441839	CD46	chr1	207930358	+	3245	329	178	1326	382
ENST00000367862	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322875	CD46	chr1	207930358	+	3354	329	178	1431	417
ENST00000367862	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000367041	CD46	chr1	207930358	+	3357	329	178	1320	380
ENST00000367862	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000358170	CD46	chr1	207930358	+	3447	329	178	1410	410
ENST00000367862	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000322918	CD46	chr1	207930358	+	3200	329	178	1281	367
ENST00000367862	POU2F1	chr1	167301772	+	ENST00000361067	CD46	chr1	207930358	+	3312	329	178	1389	403

DeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.

Henst	Tenst	Hgene	Hchr	Hbp	Hstrand	Tgene	Tchr	Tbp	Tstrand	No-coding score	Coding score
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ENST00000367866	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000132306	0.9998677
ENST00000367866	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000154545	0.9998454
ENST00000367866	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000122099	0.9998779
ENST00000367866	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000139359	0.99986064
ENST00000367866	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000132662	0.9998673
ENST00000367866	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000129563	0.9998704
ENST00000367866	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000144672	0.9998553
ENST00000452019	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000229981	0.99977
ENST00000452019	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000225224	0.99977475
ENST00000452019	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000240328	0.9997596
ENST00000452019	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000326864	0.9996731
ENST00000452019	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000176301	0.99982375
ENST00000452019	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000303976	0.999696
ENST00000452019	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000218367	0.99978167
ENST00000452019	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000245169	0.99975485
ENST00000429375	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000148617	0.99985135
ENST00000429375	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000132354	0.9998677
ENST00000429375	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000156233	0.9998437
ENST00000429375	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000121325	0.99987864
ENST00000429375	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000140845	0.9998591
ENST00000429375	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.00013479	0.9998652
ENST00000429375	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000130425	0.9998696
ENST00000429375	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000145381	0.99985456
ENST00000541643	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000223409	0.99977654
ENST00000541643	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.00022009	0.9997799
ENST00000541643	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000233476	0.9997665
ENST00000541643	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000320314	0.9996797
ENST00000541643	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000171301	0.9998287
ENST00000541643	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000296406	0.9997036
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ENST00000541643	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000238896	0.99976116
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ENST00000420254	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000320314	0.9996797
ENST00000420254	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000171301	0.9998287
ENST00000420254	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000296406	0.9997036
ENST00000420254	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000212297	0.99978775
ENST00000420254	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000238896	0.99976116
ENST00000367862	ENST00000367042	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000178129	0.99982184
ENST00000367862	ENST00000354848	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000181959	0.999818
ENST00000367862	ENST00000441839	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000160617	0.9998393
ENST00000367862	ENST00000322875	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000174606	0.9998254
ENST00000367862	ENST00000367041	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000135185	0.9998648
ENST00000367862	ENST00000358170	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000192481	0.99980754
ENST00000367862	ENST00000322918	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000152338	0.99984765
ENST00000367862	ENST00000361067	POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.000204463	0.9997955

Top

Fusion Genomic Features for POU2F1-CD46

FusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.

Hgene	Hchr	Hbp	Hstrand	Tgene	Tchr	Tbp	Tstrand	1-p	p (fusion gene breakpoint)
POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.004841482	0.9951585
POU2F1	chr1	167301772	+	CD46	chr1	207930358	+	0.004841482	0.9951585

Distribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.

Distribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

Top

Fusion Protein Features for POU2F1-CD46

Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr1:167301772/chr1:207930358)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.

Main function of each fusion partner protein. (from UniProt)

Hgene	Tgene
.	CD46 P15529
FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.	FUNCTION: Acts as a cofactor for complement factor I, a serine protease which protects autologous cells against complement-mediated injury by cleaving C3b and C4b deposited on host tissue. May be involved in the fusion of the spermatozoa with the oocyte during fertilization. Also acts as a costimulatory factor for T-cells which induces the differentiation of CD4+ into T-regulatory 1 cells. T-regulatory 1 cells suppress immune responses by secreting interleukin-10, and therefore are thought to prevent autoimmunity. {ECO:0000269\|PubMed:10843656, ECO:0000269\|PubMed:12540904}.; FUNCTION: (Microbial infection) A number of viral and bacterial pathogens seem to bind MCP in order to exploit its immune regulation property and directly induce an immunosuppressive phenotype in T-cells.; FUNCTION: (Microbial infection) Acts as a receptor for Adenovirus subgroup B2 and Ad3. {ECO:0000269\|PubMed:12915534, ECO:0000269\|PubMed:14566335, ECO:0000269\|PubMed:15047806, ECO:0000269\|PubMed:15078926, ECO:0000269\|PubMed:15919905, ECO:0000269\|PubMed:16254377}.; FUNCTION: (Microbial infection) Acts as a receptor for cultured Measles virus. {ECO:0000269\|PubMed:10972291}.; FUNCTION: (Microbial infection) Acts as a receptor for Herpesvirus 6/HHV-6. {ECO:0000269\|PubMed:12663806, ECO:0000269\|PubMed:12724329}.; FUNCTION: (Microbial infection) May act as a receptor for pathogenic bacteria Neisseria and Streptococcus pyogenes (PubMed:7708671, PubMed:9379894, PubMed:11260136, PubMed:11971006).

Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at
download page

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.

- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.

Partner

Gene

Hbp

Tbp

ENST

Strand

BPexon

TotalExon

Protein feature loci

*BPloci

TotalLen

Protein feature

Protein feature note

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322875

302_326

400.0

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322918

302_326

350.0

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000354848

302_326

385.0

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000357714

302_326

370.0

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000358170

302_326

973.6666666666666

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000360212

302_326

356.0

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000361067

302_326

386.0

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367041

302_326

943.6666666666666

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367042

302_326

958.6666666666666

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367047

302_326

337.0

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000441839

302_326

365.0

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000480003

302_326

371.0

Compositional bias

Note=Ser/Thr-rich

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322875

160_225

400.0

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322875

226_285

400.0

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322875

35_96

400.0

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322875

97_159

400.0

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322918

160_225

350.0

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322918

226_285

350.0

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322918

35_96

350.0

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322918

97_159

350.0

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000354848

160_225

385.0

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000354848

226_285

385.0

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000354848

35_96

385.0

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000354848

97_159

385.0

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000357714

160_225

370.0

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000357714

226_285

370.0

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000357714

35_96

370.0

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000357714

97_159

370.0

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000358170

160_225

973.6666666666666

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000358170

226_285

973.6666666666666

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000358170

35_96

973.6666666666666

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000358170

97_159

973.6666666666666

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000360212

160_225

356.0

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000360212

226_285

356.0

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000360212

35_96

356.0

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000360212

97_159

356.0

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000361067

160_225

386.0

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000361067

226_285

386.0

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000361067

35_96

386.0

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000361067

97_159

386.0

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367041

160_225

943.6666666666666

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367041

226_285

943.6666666666666

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367041

35_96

943.6666666666666

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367041

97_159

943.6666666666666

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367042

160_225

958.6666666666666

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367042

226_285

958.6666666666666

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367042

35_96

958.6666666666666

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367042

97_159

958.6666666666666

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367047

160_225

337.0

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367047

226_285

337.0

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367047

35_96

337.0

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000367047

97_159

337.0

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000441839

160_225

365.0

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000441839

226_285

365.0

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000441839

35_96

365.0

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000441839

97_159

365.0

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000480003

160_225

371.0

Domain

Sushi 3

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000480003

226_285

371.0

Domain

Sushi 4

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000480003

35_96

371.0

Domain

Sushi 1

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000480003

97_159

371.0

Domain

Sushi 2

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322875

35_343

400.0

Topological domain

Extracellular

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322875

367_392

400.0

Topological domain

Cytoplasmic

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322918

35_343

350.0

Topological domain

Extracellular

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000322918

367_392

350.0

Topological domain

Cytoplasmic

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000354848

35_343

385.0

Topological domain

Extracellular

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000354848

367_392

385.0

Topological domain

Cytoplasmic

Tgene

CD46

chr1:167301772

chr1:207930358

ENST00000357714

35_343

370.0

Topological domain

Extracellular

Tgene

CD46

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Transmembrane

Helical

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.

Partner

Gene

Hbp

Tbp

ENST

Strand

BPexon

TotalExon

Protein feature loci

*BPloci

TotalLen

Protein feature

Protein feature note

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Homeobox

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DNA binding

Homeobox

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DNA binding

Homeobox

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DNA binding

Homeobox

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756.0

Domain

POU-specific

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654.0

Domain

POU-specific

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Domain

POU-specific

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280_354

744.0

Domain

POU-specific

Top

Fusion Gene Sequence for POU2F1-CD46

For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.

>67231_67231_1_POU2F1-CD46_POU2F1_chr1_167301772_ENST00000367862_CD46_chr1_207930358_ENST00000322875_length(transcript)=3354nt_BP=329nt
AAACTCCTCTGAGCAACTGAAGTTTCCTTATTCAGTTGAAGATTGCTATGGTGTAACAGAAGTTGTATTTTGCTTTTCCCCTTAATCCAC
TTTCCACCCTACGCAACCCCCCTCTTTTCGCTTAAGAACATACTGTAGATTTGTTAGAAATAGTAGTACCTTCTTTCCCCACCCCAAACT
GCTACCTGTTTCTTCCTTGTTTGGACTCTCTGCTCCTCTAGAAGATTTCACAGCAATGCTGGACTGCAGTGACTATGTTCTAGACTCAAG
AATGAACAATCCGTCAGAAACCAGTAAACCATCTATGGAGAGTGGAGATGGCAACACAGATGCCTGTGAGGAGCCACCAACATTTGAAGC
TATGGAGCTCATTGGTAAACCAAAACCCTACTATGAGATTGGTGAACGAGTAGATTATAAGTGTAAAAAAGGATACTTCTATATACCTCC
TCTTGCCACCCATACTATTTGTGATCGGAATCATACATGGCTACCTGTCTCAGATGACGCCTGTTATAGAGAAACATGTCCATATATACG
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AATTGGTGAAGAAATTCTATATTGTGAACTTAAAGGATCAGTAGCAATTTGGAGCGGTAAGCCCCCAATATGTGAAAAGGTTTTGTGTAC
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TAAAGTGGTCAAATGTCGATTTCCAGTAGTCGAAAATGGAAAACAGATATCAGGATTTGGAAAAAAATTTTACTACAAAGCAACAGTTAT
GTTTGAATGCGATAAGGGTTTTTACCTCGATGGCAGCGACACAATTGTCTGTGACAGTAACAGTACTTGGGATCCCCCAGTTCCAAAGTG
TCTTAAAGTGCTGCCTCCATCTAGTACAAAACCTCCAGCTTTGAGTCATTCAGTGTCGACTTCTTCCACTACAAAATCTCCAGCGTCCAG
TGCCTCAGGTCCTAGGCCTACTTACAAGCCTCCAGTCTCAAATTATCCAGGATATCCTAAACCTGAGGAAGGAATACTTGACAGTTTGGA
TGTTTGGGTCATTGCTGTGATTGTTATTGCCATAGTTGTTGGAGTTGCAGTAATTTGTGTTGTCCCGTACAGATATCTTCAAAGGAGGAA
GAAGAAAGGGAAAGCAGATGGTGGAGCTGAATATGCCACTTACCAGACTAAATCAACCACTCCAGCAGAGCAGAGAGGCTGAATAGATTC
CACAACCTGGTTTGCCAGTTCATCTTTTGACTCTATTAAAATCTTCAATAGTTGTTATTCTGTAGTTTCACTCTCATGAGTGCAACTGTG
GCTTAGCTAATATTGCAATGTGGCTTGAATGTAGGTAGCATCCTTTGATGCTTCTTTGAAACTTGTATGAATTTGGGTATGAACAGATTG
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AAAATTGGCAAAATTAGAGAAATATAGTTCACAATGAAATTATATTTTCTTTGTAAAGAAAGTGGCTTGAAATCTTTTTTGTTCAAAGAT
TAATGCCAACTCTTAAGATTATTCTTTCACCAACTATAGAATGTATTTTATATATCGTTCATTGTAAAAAGCCCTTAAAAATATGTGTAT
ACTACTTTGGCTCTTGTGCATAAAAACAAGAACACTGAAAATTGGGAATATGCACAAACTTGGCTTCTTTAACCAAGAATATTATTGGAA
AATTCTCTAAAAGTTAATAGGGTAAATTCTCTATTTTTTGTAATGTGTTCGGTGATTTCAGAAAGCTAGAAAGTGTATGTGTGGCATTTG
TTTTCACTTTTTAAAACATCCCTAACTGATCGAATATATCAGTAATTTCAGAATCAGATGCATCCTTTCATAAGAAGTGAGAGGACTCTG
ACAGCCATAACAGGAGTGCCACTTCATGGTGCGAAGTGAACACTGTAGTCTTGTTGTTTTCCCAAAGAGAACTCCGTATGTTCTCTTAGG
TTGAGTAACCCACTCTGAATTCTGGTTACATGTGTTTTTCTCTCCCTCCTTAAATAAAGAGAGGGGTTAAACATGCCCTCTAAAAGTAGG
TGGTTTTGAAGAGAATAAATTCATCAGATAACCTCAAGTCACATGAGAATCTTAGTCCATTTACATTGCCTTGGCTAGTAAAAGCCATCT
ATGTATATGTCTTACCTCATCTCCTAAAAGGCAGAGTACAAAGTAAGCCATGTATCTCAGGAAGGTAACTTCATTTTGTCTATTTGCTGT
TGATTGTACCAAGGGATGGAAGAAGTAAATATAGCTCAGGTAGCACTTTATACTCAGGCAGATCTCAGCCCTCTACTGAGTCCCTTAGCC
AAGCAGTTTCTTTCAAAGAAGCCAGCAGGCGAAAAGCAGGGACTGCCACTGCATTTCATATCACACTGTTAAAAGTTGTGTTTTGAAATT
TTATGTTTAGTTGCACAAATTGGGCCAAAGAAACATTGCCTTGAGGAAGATATGATTGGAAAATCAAGAGTGTAGAAGAATAAATACTGT
TTTACTGTCCAAAGACATGTTTATAGTGCTCTGTAAATGTTCCTTTCCTTTGTAGTCTCTGGCAAGATGCTTTAGGAAGATAAAAGTTTG
AGGAGAACAAACAGGAATTCTGAATTAAGCACAGAGTTGAAGTTTATACCCGTTTCACATGCTTTTCAAGAATGTCGCAATTACTAAGAA
GCAGATAATGGTGTTTTTTAGAAACCTAATTGAAGTATATTCAACCAAATACTTTAATGTATAAAATAAATATTATACAATATACTTGTA
TAGCAGTTTCTGCTTCACATTTGATTTTTTCAAATTTAATATTTATATTAGAGATCTATATATGTATAAATATGTATTTTGTCAAATTTG
TTACTTAAATATATAGAGACCAGTTTTCTCTGGAAGTTTGTTTAAATGACAGAAGCGTATATGAATTCAAGAAAATTTAAGCTGCAAAAA
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AATGAACAATCCGTCAGAAACCAGTAAACCATCTATGGAGAGTGGAGATGGCAACACAGATGCCTGTGAGGAGCCACCAACATTTGAAGC
TATGGAGCTCATTGGTAAACCAAAACCCTACTATGAGATTGGTGAACGAGTAGATTATAAGTGTAAAAAAGGATACTTCTATATACCTCC
TCTTGCCACCCATACTATTTGTGATCGGAATCATACATGGCTACCTGTCTCAGATGACGCCTGTTATAGAGAAACATGTCCATATATACG
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AATTGGTGAAGAAATTCTATATTGTGAACTTAAAGGATCAGTAGCAATTTGGAGCGGTAAGCCCCCAATATGTGAAAAGGTTTTGTGTAC
ACCACCTCCAAAAATAAAAAATGGAAAACACACCTTTAGTGAAGTAGAAGTATTTGAGTATCTTGATGCAGTAACTTATAGTTGTGATCC
TGCACCTGGACCAGATCCATTTTCACTTATTGGAGAGAGCACGATTTATTGTGGTGACAATTCAGTGTGGAGTCGTGCTGCTCCAGAGTG
TAAAGTGGTCAAATGTCGATTTCCAGTAGTCGAAAATGGAAAACAGATATCAGGATTTGGAAAAAAATTTTACTACAAAGCAACAGTTAT
GTTTGAATGCGATAAGGGTTTTTACCTCGATGGCAGCGACACAATTGTCTGTGACAGTAACAGTACTTGGGATCCCCCAGTTCCAAAGTG
TCTTAAAGGTCCTAGGCCTACTTACAAGCCTCCAGTCTCAAATTATCCAGGATATCCTAAACCTGAGGAAGGAATACTTGACAGTTTGGA
TGTTTGGGTCATTGCTGTGATTGTTATTGCCATAGGAAAGCAGATGGTGGAGCTGAATATGCCACTTACCAGACTAAATCAACCACTCCA
GCAGAGCAGAGAGGCTGAATAGATTCCACAACCTGGTTTGCCAGTTCATCTTTTGACTCTATTAAAATCTTCAATAGTTGTTATTCTGTA
GTTTCACTCTCATGAGTGCAACTGTGGCTTAGCTAATATTGCAATGTGGCTTGAATGTAGGTAGCATCCTTTGATGCTTCTTTGAAACTT
GTATGAATTTGGGTATGAACAGATTGCCTGCTTTCCCTTAAATAACACTTAGATTTATTGGACCAGTCAGCACAGCATGCCTGGTTGTAT
TAAAGCAGGGATATGCTGTATTTTATAAAATTGGCAAAATTAGAGAAATATAGTTCACAATGAAATTATATTTTCTTTGTAAAGAAAGTG
GCTTGAAATCTTTTTTGTTCAAAGATTAATGCCAACTCTTAAGATTATTCTTTCACCAACTATAGAATGTATTTTATATATCGTTCATTG
TAAAAAGCCCTTAAAAATATGTGTATACTACTTTGGCTCTTGTGCATAAAAACAAGAACACTGAAAATTGGGAATATGCACAAACTTGGC
TTCTTTAACCAAGAATATTATTGGAAAATTCTCTAAAAGTTAATAGGGTAAATTCTCTATTTTTTGTAATGTGTTCGGTGATTTCAGAAA
GCTAGAAAGTGTATGTGTGGCATTTGTTTTCACTTTTTAAAACATCCCTAACTGATCGAATATATCAGTAATTTCAGAATCAGATGCATC
CTTTCATAAGAAGTGAGAGGACTCTGACAGCCATAACAGGAGTGCCACTTCATGGTGCGAAGTGAACACTGTAGTCTTGTTGTTTTCCCA
AAGAGAACTCCGTATGTTCTCTTAGGTTGAGTAACCCACTCTGAATTCTGGTTACATGTGTTTTTCTCTCCCTCCTTAAATAAAGAGAGG
GGTTAAACATGCCCTCTAAAAGTAGGTGGTTTTGAAGAGAATAAATTCATCAGATAACCTCAAGTCACATGAGAATCTTAGTCCATTTAC
ATTGCCTTGGCTAGTAAAAGCCATCTATGTATATGTCTTACCTCATCTCCTAAAAGGCAGAGTACAAAGTAAGCCATGTATCTCAGGAAG
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AGATGCTTTAGGAAGATAAAAGTTTGAGGAGAACAAACAGGAATTCTGAATTAAGCACAGAGTTGAAGTTTATACCCGTTTCACATGCTT
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AATAAATATTATACAATATACTTGTATAGCAGTTTCTGCTTCACATTTGATTTTTTCAAATTTAATATTTATATTAGAGATCTATATATG
TATAAATATGTATTTTGTCAAATTTGTTACTTAAATATATAGAGACCAGTTTTCTCTGGAAGTTTGTTTAAATGACAGAAGCGTATATGA
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AATTGGTGAAGAAATTCTATATTGTGAACTTAAAGGATCAGTAGCAATTTGGAGCGGTAAGCCCCCAATATGTGAAAAGGTTTTGTGTAC
ACCACCTCCAAAAATAAAAAATGGAAAACACACCTTTAGTGAAGTAGAAGTATTTGAGTATCTTGATGCAGTAACTTATAGTTGTGATCC
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TAAAGTGGTCAAATGTCGATTTCCAGTAGTCGAAAATGGAAAACAGATATCAGGATTTGGAAAAAAATTTTACTACAAAGCAACAGTTAT
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TGCAGTAATTTGTGTTGTCCCGTACAGATATCTTCAAAGGAGGAAGAAGAAAGGGAAAGCAGATGGTGGAGCTGAATATGCCACTTACCA
GACTAAATCAACCACTCCAGCAGAGCAGAGAGGCTGAATAGATTCCACAACCTGGTTTGCCAGTTCATCTTTTGACTCTATTAAAATCTT
CAATAGTTGTTATTCTGTAGTTTCACTCTCATGAGTGCAACTGTGGCTTAGCTAATATTGCAATGTGGCTTGAATGTAGGTAGCATCCTT
TGATGCTTCTTTGAAACTTGTATGAATTTGGGTATGAACAGATTGCCTGCTTTCCCTTAAATAACACTTAGATTTATTGGACCAGTCAGC
ACAGCATGCCTGGTTGTATTAAAGCAGGGATATGCTGTATTTTATAAAATTGGCAAAATTAGAGAAATATAGTTCACAATGAAATTATAT
TTTCTTTGTAAAGAAAGTGGCTTGAAATCTTTTTTGTTCAAAGATTAATGCCAACTCTTAAGATTATTCTTTCACCAACTATAGAATGTA
TTTTATATATCGTTCATTGTAAAAAGCCCTTAAAAATATGTGTATACTACTTTGGCTCTTGTGCATAAAAACAAGAACACTGAAAATTGG
GAATATGCACAAACTTGGCTTCTTTAACCAAGAATATTATTGGAAAATTCTCTAAAAGTTAATAGGGTAAATTCTCTATTTTTTGTAATG
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GTGGCTTGAATGTAGGTAGCATCCTTTGATGCTTCTTTGAAACTTGTATGAATTTGGGTATGAACAGATTGCCTGCTTTCCCTTAAATAA
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GGGTAAATTCTCTATTTTTTGTAATGTGTTCGGTGATTTCAGAAAGCTAGAAAGTGTATGTGTGGCATTTGTTTTCACTTTTTAAAACAT
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AGCCAGCAGGCGAAAAGCAGGGACTGCCACTGCATTTCATATCACACTGTTAAAAGTTGTGTTTTGAAATTTTATGTTTAGTTGCACAAA
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TTTATAGTGCTCTGTAAATGTTCCTTTCCTTTGTAGTCTCTGGCAAGATGCTTTAGGAAGATAAAAGTTTGAGGAGAACAAACAGGAATT
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TAAATAACACTTAGATTTATTGGACCAGTCAGCACAGCATGCCTGGTTGTATTAAAGCAGGGATATGCTGTATTTTATAAAATTGGCAAA
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TTAAGATTATTCTTTCACCAACTATAGAATGTATTTTATATATCGTTCATTGTAAAAAGCCCTTAAAAATATGTGTATACTACTTTGGCT
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AAAACATCCCTAACTGATCGAATATATCAGTAATTTCAGAATCAGATGCATCCTTTCATAAGAAGTGAGAGGACTCTGACAGCCATAACA
GGAGTGCCACTTCATGGTGCGAAGTGAACACTGTAGTCTTGTTGTTTTCCCAAAGAGAACTCCGTATGTTCTCTTAGGTTGAGTAACCCA
CTCTGAATTCTGGTTACATGTGTTTTTCTCTCCCTCCTTAAATAAAGAGAGGGGTTAAACATGCCCTCTAAAAGTAGGTGGTTTTGAAGA
GAATAAATTCATCAGATAACCTCAAGTCACATGAGAATCTTAGTCCATTTACATTGCCTTGGCTAGTAAAAGCCATCTATGTATATGTCT
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GGGATGGAAGAAGTAAATATAGCTCAGGTAGCACTTTATACTCAGGCAGATCTCAGCCCTCTACTGAGTCCCTTAGCCAAGCAGTTTCTT
TCAAAGAAGCCAGCAGGCGAAAAGCAGGGACTGCCACTGCATTTCATATCACACTGTTAAAAGTTGTGTTTTGAAATTTTATGTTTAGTT
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GTTTTTTAGAAACCTAATTGAAGTATATTCAACCAAATACTTTAATGTATAAAATAAATATTATACAATATACTTGTATAGCAGTTTCTG
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GAAAGTGGCTTGAAATCTTTTTTGTTCAAAGATTAATGCCAACTCTTAAGATTATTCTTTCACCAACTATAGAATGTATTTTATATATCG
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CATTTACATTGCCTTGGCTAGTAAAAGCCATCTATGTATATGTCTTACCTCATCTCCTAAAAGGCAGAGTACAAAGTAAGCCATGTATCT
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CATGCTTTTCAAGAATGTCGCAATTACTAAGAAGCAGATAATGGTGTTTTTTAGAAACCTAATTGAAGTATATTCAACCAAATACTTTAA
TGTATAAAATAAATATTATACAATATACTTGTATAGCAGTTTCTGCTTCACATTTGATTTTTTCAAATTTAATATTTATATTAGAGATCT
ATATATGTATAAATATGTATTTTGTCAAATTTGTTACTTAAATATATAGAGACCAGTTTTCTCTGGAAGTTTGTTTAAATGACAGAAGCG
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GCAGTCCCTGCAAATGGGACTTACGAGTTTGGTTATCAGATGCACTTTATTTGTAATGAGGGTTATTACTTAATTGGTGAAGAAATTCTA
TATTGTGAACTTAAAGGATCAGTAGCAATTTGGAGCGGTAAGCCCCCAATATGTGAAAAGGTTTTGTGTACACCACCTCCAAAAATAAAA
AATGGAAAACACACCTTTAGTGAAGTAGAAGTATTTGAGTATCTTGATGCAGTAACTTATAGTTGTGATCCTGCACCTGGACCAGATCCA
TTTTCACTTATTGGAGAGAGCACGATTTATTGTGGTGACAATTCAGTGTGGAGTCGTGCTGCTCCAGAGTGTAAAGTGGTCAAATGTCGA
TTTCCAGTAGTCGAAAATGGAAAACAGATATCAGGATTTGGAAAAAAATTTTACTACAAAGCAACAGTTATGTTTGAATGCGATAAGGGT
TTTTACCTCGATGGCAGCGACACAATTGTCTGTGACAGTAACAGTACTTGGGATCCCCCAGTTCCAAAGTGTCTTAAAGTGTCGACTTCT
TCCACTACAAAATCTCCAGCGTCCAGTGCCTCAGGTCCTAGGCCTACTTACAAGCCTCCAGTCTCAAATTATCCAGGATATCCTAAACCT
GAGGAAGGAATACTTGACAGTTTGGATGTTTGGGTCATTGCTGTGATTGTTATTGCCATAGGAAAGCAGATGGTGGAGCTGAATATGCCA
CTTACCAGACTAAATCAACCACTCCAGCAGAGCAGAGAGGCTGAATAGATTCCACAACCTGGTTTGCCAGTTCATCTTTTGACTCTATTA
AAATCTTCAATAGTTGTTATTCTGTAGTTTCACTCTCATGAGTGCAACTGTGGCTTAGCTAATATTGCAATGTGGCTTGAATGTAGGTAG
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AGTCAGCACAGCATGCCTGGTTGTATTAAAGCAGGGATATGCTGTATTTTATAAAATTGGCAAAATTAGAGAAATATAGTTCACAATGAA
ATTATATTTTCTTTGTAAAGAAAGTGGCTTGAAATCTTTTTTGTTCAAAGATTAATGCCAACTCTTAAGATTATTCTTTCACCAACTATA
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TGTAATGTGTTCGGTGATTTCAGAAAGCTAGAAAGTGTATGTGTGGCATTTGTTTTCACTTTTTAAAACATCCCTAACTGATCGAATATA
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TCTCTCCCTCCTTAAATAAAGAGAGGGGTTAAACATGCCCTCTAAAAGTAGGTGGTTTTGAAGAGAATAAATTCATCAGATAACCTCAAG
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GTTCCTTTCCTTTGTAGTCTCTGGCAAGATGCTTTAGGAAGATAAAAGTTTGAGGAGAACAAACAGGAATTCTGAATTAAGCACAGAGTT
GAAGTTTATACCCGTTTCACATGCTTTTCAAGAATGTCGCAATTACTAAGAAGCAGATAATGGTGTTTTTTAGAAACCTAATTGAAGTAT
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ATATTTATATTAGAGATCTATATATGTATAAATATGTATTTTGTCAAATTTGTTACTTAAATATATAGAGACCAGTTTTCTCTGGAAGTT
TGTTTAAATGACAGAAGCGTATATGAATTCAAGAAAATTTAAGCTGCAAAAATGTATTTGCTATAAAATGAGAAGTCTCACTGATAGAGG

>67231_67231_48_POU2F1-CD46_POU2F1_chr1_167301772_ENST00000541643_CD46_chr1_207930358_ENST00000441839_length(amino acids)=351AA_BP=19
MNNPSETSKPSMESGDGNTDACEEPPTFEAMELIGKPKPYYEIGERVDYKCKKGYFYIPPLATHTICDRNHTWLPVSDDACYRETCPYIR
DPLNGQAVPANGTYEFGYQMHFICNEGYYLIGEEILYCELKGSVAIWSGKPPICEKVLCTPPPKIKNGKHTFSEVEVFEYLDAVTYSCDP
APGPDPFSLIGESTIYCGDNSVWSRAAPECKVVKCRFPVVENGKQISGFGKKFYYKATVMFECDKGFYLDGSDTIVCDSNSTWDPPVPKC

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Top

Fusion Gene PPI Analysis for POU2F1-CD46

Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in
ChiPPI page.

Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)

Hgene

Hgene's interactors

Tgene

Tgene's interactors

- Retained PPIs in in-frame fusion.

Partner

Gene

Hbp

Tbp

ENST

Strand

BPexon

TotalExon

Protein feature loci

*BPloci

TotalLen

Still interaction with

- Lost PPIs in in-frame fusion.

Partner

Gene

Hbp

Tbp

ENST

Strand

BPexon

TotalExon

Protein feature loci

*BPloci

TotalLen

Interaction lost with

- Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.

Partner

Gene

Hbp

Tbp

ENST

Strand

BPexon

TotalExon

Protein feature loci

*BPloci

TotalLen

Interaction lost with

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Related Drugs for POU2F1-CD46

Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)

Partner

Gene

UniProtAcc

DrugBank ID

Drug name

Drug activity

Drug type

Drug status

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Related Diseases for POU2F1-CD46

Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)

Partner

Gene

Disease ID

Disease name

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