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Fusion gene:PPIF-REEP3 (FusionGDB2 ID:67538)

Fusion Gene Summary for PPIF-REEP3

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: PPIF-REEP3
Fusion gene ID: 67538
HgeneTgene
Gene symbol

PPIF

REEP3

Gene ID

10105

221035

Gene namepeptidylprolyl isomerase Freceptor accessory protein 3
SynonymsCYP3|CyP-M|Cyp-D|CypDC10orf74|Yip2b
Cytomap

10q22.3

10q21.3

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionpeptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrialPPIase Fcyclophilin 3cyclophilin Dcyclophilin Fmitochondrial cyclophilinpeptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mitochondrialrotamase Freceptor expression-enhancing protein 3
Modification date2020032720200313
UniProtAcc..
Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000492149, ENST00000225174, 
ENST00000394579, 
ENST00000298249, 
ENST00000373758, 
Fusion gene scores* DoF score3 X 4 X 3=369 X 11 X 6=594
# samples 411
** MAII scorelog2(4/36*10)=0.15200309344505
effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (eGinPCFGs).
DoF>8 and MAII>0
log2(11/594*10)=-2.43295940727611
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: PPIF [Title/Abstract] AND REEP3 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointPPIF(81107499)-REEP3(65354538), # samples:3
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgenePPIF

GO:0000413

protein peptidyl-prolyl isomerization

20676357

HgenePPIF

GO:0043066

negative regulation of apoptotic process

19228691

HgenePPIF

GO:0090201

negative regulation of release of cytochrome c from mitochondria

19228691


check buttonFusion gene breakpoints across PPIF (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across REEP3 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4BRCATCGA-AN-A0AJ-01APPIFchr10

81107498

+REEP3chr10

65354537

+
ChimerDB4BRCATCGA-AN-A0AJ-01APPIFchr10

81107499

-REEP3chr10

65354538

+
ChimerDB4BRCATCGA-AN-A0AJ-01APPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354538

+
ChimerDB4BRCATCGA-AN-A0AJPPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354537

+


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Fusion Gene ORF analysis for PPIF-REEP3

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
3UTR-3CDSENST00000492149ENST00000298249PPIFchr10

81107498

+REEP3chr10

65354537

+
3UTR-3CDSENST00000492149ENST00000298249PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354538

+
3UTR-3CDSENST00000492149ENST00000298249PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354537

+
3UTR-3CDSENST00000492149ENST00000373758PPIFchr10

81107498

+REEP3chr10

65354537

+
3UTR-3CDSENST00000492149ENST00000373758PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354538

+
3UTR-3CDSENST00000492149ENST00000373758PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354537

+
In-frameENST00000225174ENST00000298249PPIFchr10

81107498

+REEP3chr10

65354537

+
In-frameENST00000225174ENST00000298249PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354538

+
In-frameENST00000225174ENST00000298249PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354537

+
In-frameENST00000225174ENST00000373758PPIFchr10

81107498

+REEP3chr10

65354537

+
In-frameENST00000225174ENST00000373758PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354538

+
In-frameENST00000225174ENST00000373758PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354537

+
In-frameENST00000394579ENST00000298249PPIFchr10

81107498

+REEP3chr10

65354537

+
In-frameENST00000394579ENST00000298249PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354538

+
In-frameENST00000394579ENST00000298249PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354537

+
In-frameENST00000394579ENST00000373758PPIFchr10

81107498

+REEP3chr10

65354537

+
In-frameENST00000394579ENST00000373758PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354538

+
In-frameENST00000394579ENST00000373758PPIFchr10

81107499

+REEP3chr10

65354537

+

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)
BP loci
(transcript)
Predicted start
(transcript)
Predicted stop
(transcript)
Seq length
(amino acids)
ENST00000394579PPIFchr1081107499+ENST00000298249REEP3chr1065354538+518827336935299
ENST00000394579PPIFchr1081107499+ENST00000373758REEP3chr1065354538+519027336935299
ENST00000225174PPIFchr1081107499+ENST00000298249REEP3chr1065354538+518126629928299
ENST00000225174PPIFchr1081107499+ENST00000373758REEP3chr1065354538+518326629928299
ENST00000394579PPIFchr1081107499+ENST00000298249REEP3chr1065354537+518827336935299
ENST00000394579PPIFchr1081107499+ENST00000373758REEP3chr1065354537+519027336935299
ENST00000225174PPIFchr1081107499+ENST00000298249REEP3chr1065354537+518126629928299
ENST00000225174PPIFchr1081107499+ENST00000373758REEP3chr1065354537+518326629928299
ENST00000394579PPIFchr1081107498+ENST00000298249REEP3chr1065354537+518827336935299
ENST00000394579PPIFchr1081107498+ENST00000373758REEP3chr1065354537+519027336935299
ENST00000225174PPIFchr1081107498+ENST00000298249REEP3chr1065354537+518126629928299
ENST00000225174PPIFchr1081107498+ENST00000373758REEP3chr1065354537+518326629928299

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000394579ENST00000298249PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354538+0.0001224550.9998776
ENST00000394579ENST00000373758PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354538+0.0001121210.9998878
ENST00000225174ENST00000298249PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354538+0.000122090.9998779
ENST00000225174ENST00000373758PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354538+0.0001119290.99988806
ENST00000394579ENST00000298249PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354537+0.0001224550.9998776
ENST00000394579ENST00000373758PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354537+0.0001121210.9998878
ENST00000225174ENST00000298249PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354537+0.000122090.9998779
ENST00000225174ENST00000373758PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354537+0.0001119290.99988806
ENST00000394579ENST00000298249PPIFchr1081107498+REEP3chr1065354537+0.0001224550.9998776
ENST00000394579ENST00000373758PPIFchr1081107498+REEP3chr1065354537+0.0001121210.9998878
ENST00000225174ENST00000298249PPIFchr1081107498+REEP3chr1065354537+0.000122090.9998779
ENST00000225174ENST00000373758PPIFchr1081107498+REEP3chr1065354537+0.0001119290.99988806

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Fusion Genomic Features for PPIF-REEP3


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)
PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354537+3.05E-050.9999695
PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354537+3.05E-050.9999695
PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354537+3.05E-050.9999695
PPIFchr1081107499+REEP3chr1065354537+3.05E-050.9999695

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.
genomic feature of top 1%

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Fusion Protein Features for PPIF-REEP3


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr10:81107499/chr10:65354538)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
..
FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneREEP3chr10:81107498chr10:65354537ENST000003737581835_5535256.0TransmembraneHelical
TgeneREEP3chr10:81107498chr10:65354537ENST000003737581859_7935256.0TransmembraneHelical
TgeneREEP3chr10:81107499chr10:65354537ENST000003737581835_5535256.0TransmembraneHelical
TgeneREEP3chr10:81107499chr10:65354537ENST000003737581859_7935256.0TransmembraneHelical
TgeneREEP3chr10:81107499chr10:65354538ENST000003737581835_5535256.0TransmembraneHelical
TgeneREEP3chr10:81107499chr10:65354538ENST000003737581859_7935256.0TransmembraneHelical

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgenePPIFchr10:81107498chr10:65354537ENST00000225174+1649_20565208.0DomainPPIase cyclophilin-type
HgenePPIFchr10:81107499chr10:65354537ENST00000225174+1649_20565208.0DomainPPIase cyclophilin-type
HgenePPIFchr10:81107499chr10:65354538ENST00000225174+1649_20565208.0DomainPPIase cyclophilin-type
TgeneREEP3chr10:81107498chr10:65354537ENST00000373758181_2135256.0TransmembraneHelical
TgeneREEP3chr10:81107499chr10:65354537ENST00000373758181_2135256.0TransmembraneHelical
TgeneREEP3chr10:81107499chr10:65354538ENST00000373758181_2135256.0TransmembraneHelical


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Fusion Gene Sequence for PPIF-REEP3


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>67538_67538_1_PPIF-REEP3_PPIF_chr10_81107498_ENST00000225174_REEP3_chr10_65354537_ENST00000298249_length(transcript)=5181nt_BP=266nt
TCTGGGCGCGCGCGACGTCAGTTTGAGTTCTGTGTTCTCCCCGCCCGTGTCCCGCCCGACCCGCGCCCGCGATGCTGGCGCTGCGCTGCG
GCTCCCGCTGGCTCGGCCTGCTCTCCGTCCCGCGCTCCGTGCCGCTGCGCCTCCCCGCGGCCCGCGCCTGCAGCAAGGGCTCCGGCGACC
CGTCCTCTTCCTCCTCCTCCGGGAACCCGCTCGTGTACCTGGACGTGGACGCCAACGGGAAGCCGCTCGGCCGCGTGGTGCTGGAGGTTC
GATGGATGATGTACTGGATTGTTTTTGCTCTCTATACTGTGATTGAAACAGTAGCCGATCAAACAGTTGCTTGGTTTCCCCTGTACTATG
AGCTGAAGATTGCTTTTGTCATATGGCTGCTTTCTCCCTATACCAAAGGAGCAAGTTTAATATATAGAAAATTCCTTCATCCACTTCTTT
CTTCAAAGGAAAGGGAGATTGATGATTATATTGTACAAGCAAAGGAACGAGGCTATGAAACCATGGTAAACTTTGGACGGCAAGGTTTAA
ACCTTGCAGCTACTGCTGCTGTTACTGCAGCAGTAAAGAGCCAAGGAGCAATAACTGAACGTTTAAGAAGCTTCAGTATGCATGATTTAA
CAACTATCCAAGGTGATGAGCCTGTGGGACAAAGACCATACCAACCTCTACCAGAAGCAAAAAAGAAAAGTAAACCAGCCCCCAGTGAAT
CAGCAGGTTATGGAATTCCACTGAAAGACGGAGATGAGAAAACAGATGAAGAAGCAGAGGGGCCATATTCAGATAATGAGATGTTAACAC
ACAAAGGGCTTCGAAGATCGCAAAGCATGAAATCTGTGAAAACCACCAAAGGCCGCAAAGAGGTGCGGTACGGGTCACTAAAATACAAAG
TGAAGAAACGACCACAAGTGTATTTTTAGTCATCTACACGTCAAATATCCCAAGACAGATTATGCTAAATACATCGACTTCATCTTCTAA
CATGATATATTCAGGATTTACACATTAAAATGATTATTTAAATTGTGGCAGTGATGGGGTTTACTTTCATGAATTTAAATTGTTTTTATT
TCTGTAACAATTGCTTCCAAATATTGACTACTAAAGGCAGTTCTGCAAGATGTACTAAATATGTATATTAGAAATTATAGAAAATCATGT
TGTCCGTTTTCAAATTCATCAACAGCCTAGAGTGCCTGAGATATAAGATGAAACACAAATCCACAGTATACTTGAAAGGAGCCTTTTTAC
GGTTCAGGATAAATCAGCCTTTGTGATGTACTGTGTTTACCTCCTTTTGTGTTGTATCTGGTAATTAAATAGGCCTCAGATTCAGCAGTG
ACATAACAAGGACATAATGTAAGATAATAAAGTAGGTTTTATATATTCTTTAAATTTTTACTTATATAATACTTTCTAGTTTTTCCACCA
TCAGCTGAAAGTTTTTGAAACAAATATTTGAAAACCAGGTATCCACACATAGCACTTTTATTCCTGACTAGTTTTGCACACTTGAAAATT
GTTTACTTATTTTACAACTGTTTTACTGATGCTATCTTTATTGTTTTTGCCGTATTCTGACATGTCAAATCTATGCCTTGAATTATATCA
TCTCTTTTCCTGTGGGTTTCATTTGTTAAATTCATTGGATTTTAATAATATAAAAGTATAGCTAATTGTTCAGTTTTAACTATTTTTAAT
TATCTTCTTAACAAATAAGAAGTTGCTTTAAACATTAACCAATTTTCTATATTTAGCTATACAGAGTAATTGAACTTAACATGTTTTTGT
CAACACCAATTACATTTTCAGCTTTTAAAAATGGTAGCTTTTGTGAAATAGAATCAGTGACCAGTATAGCACTTAGATCCCTTCTAACTC
ATATAATTTTTCTCAGCCAATCCATTCACAAGCTTGGCATTGACATGTGCTGCTAGTTTATAAACTGGCATTGACGAAAATCATTTGAAT
CTCTTCTGGCTGAGATAATTTGCCAATGCAAAATACAGTTGTCATTAATCCTGCACATTAGAAATTATTAGAAACATATTACTTTTTAAC
TTTAAATCTCAAAGAGATTTTGAGTTATTGAATTCTTAAGGCTTTCTTAGCTTGAACTGATAACTATGCATTATGAACCCTAAGTCAATA
TATTTTTGGTGGTTTTAGTGATCAGTAATCAAATTTGTACTTATTATGCTTGTTCAGGTAATTTACTTGACTGTTCTATTTGTTTGTCCA
AAAGATAAAATGATGAGAGAGATTCGAGAGGTCTTTGATCTGTCTCCCTTTTAAGAAATGAAGCCAGCTGGTAATGTATATTCAGGACTT
CCTCAGAGTATTGGCCAAGAACATAATGTTTACACAGGAGTACCTTGGTATAATGCATACATTGTCTCATGATACTAGTCATAAAATATT
TTATGGATTATTTCACATTCTTCATATATAACAAGTAAAATTAATTCAGTTTTCTTCTCCCAACGTTTAATTCTGAATAACTCTATCTAC
TTTACCCTAATTTTTAGCCTCTTAATTTCTGGAAGGACTCTAATTTCTATTCCAAATTTCTATGAATTCTAATTGTAAATTATCGGAACA
GAGTTTTATTTATATGACCTGGTACTAGACTTCTTAATATAACTGTTACACTGTCCTTGTCTTTCCTACTCAAAGACAGTATCATCTGAA
GTTGCCTAATAAGGTCATGTGAGTCAAGAACTTTATCTGTGGGAGCTGATTTGCACCATTTTACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAC
GGAGTCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCGAGCGATTCTCCTGC
CTCGGCCTCCCGAGTAACTGGGTCTACAGGCCCGTGCTACCACGCCCAGCTAATTTTTGTCTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTAACCATGT
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TTAACACACAAAGGGCTTCGAAGATCGCAAAGCATGAAATCTGTGAAAACCACCAAAGGCCGCAAAGAGGTGCGGTACGGGTCACTAAAA
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CTTCTAACATGATATATTCAGGATTTACACATTAAAATGATTATTTAAATTGTGGCAGTGATGGGGTTTACTTTCATGAATTTAAATTGT
TTTTATTTCTGTAACAATTGCTTCCAAATATTGACTACTAAAGGCAGTTCTGCAAGATGTACTAAATATGTATATTAGAAATTATAGAAA
ATCATGTTGTCCGTTTTCAAATTCATCAACAGCCTAGAGTGCCTGAGATATAAGATGAAACACAAATCCACAGTATACTTGAAAGGAGCC
TTTTTACGGTTCAGGATAAATCAGCCTTTGTGATGTACTGTGTTTACCTCCTTTTGTGTTGTATCTGGTAATTAAATAGGCCTCAGATTC
AGCAGTGACATAACAAGGACATAATGTAAGATAATAAAGTAGGTTTTATATATTCTTTAAATTTTTACTTATATAATACTTTCTAGTTTT
TCCACCATCAGCTGAAAGTTTTTGAAACAAATATTTGAAAACCAGGTATCCACACATAGCACTTTTATTCCTGACTAGTTTTGCACACTT
GAAAATTGTTTACTTATTTTACAACTGTTTTACTGATGCTATCTTTATTGTTTTTGCCGTATTCTGACATGTCAAATCTATGCCTTGAAT
TATATCATCTCTTTTCCTGTGGGTTTCATTTGTTAAATTCATTGGATTTTAATAATATAAAAGTATAGCTAATTGTTCAGTTTTAACTAT
TTTTAATTATCTTCTTAACAAATAAGAAGTTGCTTTAAACATTAACCAATTTTCTATATTTAGCTATACAGAGTAATTGAACTTAACATG
TTTTTGTCAACACCAATTACATTTTCAGCTTTTAAAAATGGTAGCTTTTGTGAAATAGAATCAGTGACCAGTATAGCACTTAGATCCCTT
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TTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCGAGCGATT
CTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAACTGGGTCTACAGGCCCGTGCTACCACGCCCAGCTAATTTTTGTCTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTA
ACCATGTTGCCCAGGATGGTCTCCATCTCTTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAACTTCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC
CGCACCCAGCCACCATTTTATCTCTCTAAAGTCTGGTCCCAGTATTAAACCTATTCTTTAGTAAACTCATATTACTGTTCTAAATTGAAG
AAATTATTTATTACTCTGTACTTCTAGACTCAAAATTCTTTATCAAAGATAGTCTCAAAGAGGTAGTACAAGTCCTGTTTAACTGCACTT
TTTCACATTCACAGTGCTTCCTCTGATATCTTTCCTTACATCATTATACACTGTTGATATCATTTTACTCTTCTTTCTCTTCTACATTTC
TTAAATTTTGGTTCTTTTCCTGTACATGTGTTTTAGCGGGGCCCTTTTCTTTGAACTTTGTCTAATTAGCCTGTACATTTTTGTTTCTTT
TAAGGTAGAACAGATCTTTTTTTGTTTCTCCTTTTAAGTCTACTGGTTTTAAAAGAGGTAAATGTATCCATAGACCACAGTGCCTTGCTT
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AGGTCCTGCATAAGATCCCCCTCACATACTTCACAATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTG
GCTAAAAAATTATACTGCCAAAATTACTGATTATAAATACTTGACTACACTGATTGATGGGACAAAATGATTAAAGTATTTTCAGGGATC
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TTTCCTTTTTTAGAATAACACAGTCTGTGCTTTCCAAAAATGCTTGAACTTTTATGTTGTTAAGAAATATATAATGATATCTTACATTAA
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GAGGTTCGATGGATGATGTACTGGATTGTTTTTGCTCTCTATACTGTGATTGAAACAGTAGCCGATCAAACAGTTGCTTGGTTTCCCCTG
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AGCAGTGACATAACAAGGACATAATGTAAGATAATAAAGTAGGTTTTATATATTCTTTAAATTTTTACTTATATAATACTTTCTAGTTTT
TCCACCATCAGCTGAAAGTTTTTGAAACAAATATTTGAAAACCAGGTATCCACACATAGCACTTTTATTCCTGACTAGTTTTGCACACTT
GAAAATTGTTTACTTATTTTACAACTGTTTTACTGATGCTATCTTTATTGTTTTTGCCGTATTCTGACATGTCAAATCTATGCCTTGAAT
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TTTTTGTCAACACCAATTACATTTTCAGCTTTTAAAAATGGTAGCTTTTGTGAAATAGAATCAGTGACCAGTATAGCACTTAGATCCCTT
CTAACTCATATAATTTTTCTCAGCCAATCCATTCACAAGCTTGGCATTGACATGTGCTGCTAGTTTATAAACTGGCATTGACGAAAATCA
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AGGACTTCCTCAGAGTATTGGCCAAGAACATAATGTTTACACAGGAGTACCTTGGTATAATGCATACATTGTCTCATGATACTAGTCATA
AAATATTTTATGGATTATTTCACATTCTTCATATATAACAAGTAAAATTAATTCAGTTTTCTTCTCCCAACGTTTAATTCTGAATAACTC
TATCTACTTTACCCTAATTTTTAGCCTCTTAATTTCTGGAAGGACTCTAATTTCTATTCCAAATTTCTATGAATTCTAATTGTAAATTAT
CGGAACAGAGTTTTATTTATATGACCTGGTACTAGACTTCTTAATATAACTGTTACACTGTCCTTGTCTTTCCTACTCAAAGACAGTATC
ATCTGAAGTTGCCTAATAAGGTCATGTGAGTCAAGAACTTTATCTGTGGGAGCTGATTTGCACCATTTTACCTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCGAGCGATT
CTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAACTGGGTCTACAGGCCCGTGCTACCACGCCCAGCTAATTTTTGTCTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTA
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AAATTATTTATTACTCTGTACTTCTAGACTCAAAATTCTTTATCAAAGATAGTCTCAAAGAGGTAGTACAAGTCCTGTTTAACTGCACTT
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TTAAATTTTGGTTCTTTTCCTGTACATGTGTTTTAGCGGGGCCCTTTTCTTTGAACTTTGTCTAATTAGCCTGTACATTTTTGTTTCTTT
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Fusion Gene PPI Analysis for PPIF-REEP3


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for PPIF-REEP3


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for PPIF-REEP3


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource