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Fusion gene:ARPP19-MYO5A (FusionGDB2 ID:6828)

Fusion Gene Summary for ARPP19-MYO5A

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: ARPP19-MYO5A
Fusion gene ID: 6828
HgeneTgene
Gene symbol

ARPP19

MYO5A

Gene ID

10776

4644

Gene namecAMP regulated phosphoprotein 19myosin VA
SynonymsARPP-16|ARPP-19|ARPP16|ENSALGS1|MYH12|MYO5|MYR12
Cytomap

15q21.2

15q21.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
DescriptioncAMP-regulated phosphoprotein 19cAMP-regulated phosphoprotein 19kDacyclic AMP phosphoprotein, 19 kDunconventional myosin-Vadilute myosin heavy chain, non-musclemyosin Vmyosin VA (heavy chain 12, myoxin)myosin, heavy polypeptide kinasemyosin-12myosin-Vamyoxin
Modification date2020031320200313
UniProtAcc.

Q9Y4I1

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000561971, ENST00000567669, 
ENST00000569281, ENST00000249822, 
ENST00000564163, ENST00000566423, 
ENST00000569723, ENST00000561650, 
ENST00000563277, ENST00000563566, 
ENST00000565288, ENST00000568196, 
ENST00000356338, ENST00000358212, 
ENST00000399231, ENST00000399233, 
ENST00000553916, 
Fusion gene scores* DoF score2 X 2 X 3=1213 X 14 X 7=1274
# samples 313
** MAII scorelog2(3/12*10)=1.32192809488736
effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (eGinPCFGs).
DoF>8 and MAII>0		log2(13/1274*10)=-3.29278174922785
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: ARPP19 [Title/Abstract] AND MYO5A [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointARPP19(52861045)-MYO5A(52606400), # samples:2
ARPP19(52861045)-MYO5A(52615641), # samples:2
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.ARPP19-MYO5A seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a CGC due to the frame-shifted ORF.
ARPP19-MYO5A seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a essential gene due to the frame-shifted ORF.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneARPP19

GO:0045722

positive regulation of gluconeogenesis

9653196


check buttonFusion gene breakpoints across ARPP19 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across MYO5A (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4BLCATCGA-DK-AA76-01AARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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ChimerDB4BLCATCGA-DK-AA76ARPP19chr15

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ChimerDB4BRCATCGA-C8-A1HI-01AARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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Top

Fusion Gene ORF analysis for ARPP19-MYO5A

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
Frame-shiftENST00000561971ENST00000356338ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000561971ENST00000356338ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000561971ENST00000358212ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000561971ENST00000399231ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000561971ENST00000399231ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000561971ENST00000399233ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000561971ENST00000399233ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000561971ENST00000553916ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000567669ENST00000358212ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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intron-3CDSENST00000563277ENST00000553916ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-
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-MYO5Achr15

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intron-3CDSENST00000563566ENST00000356338ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-
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52861045

-MYO5Achr15

52606400

-
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52861045

-MYO5Achr15

52615641

-
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52861045

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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-MYO5Achr15

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-
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-
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-
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52861045

-MYO5Achr15

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-
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-MYO5Achr15

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-
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52861045

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52606400

-
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52861045

-MYO5Achr15

52615641

-

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
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ENST00000566423ARPP19chr1552861045-ENST00000356338MYO5Achr1552606400-68231794771159
ENST00000566423ARPP19chr1552861045-ENST00000358212MYO5Achr1552606400-68211794771159
ENST00000566423ARPP19chr1552861045-ENST00000399233MYO5Achr1552606400-68211794771159
ENST00000566423ARPP19chr1552861045-ENST00000553916MYO5Achr1552606400-8051794771159
ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000399231MYO5Achr1552606400-69643176151205
ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000356338MYO5Achr1552606400-69613176151205
ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000358212MYO5Achr1552606400-69593176151205
ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000399233MYO5Achr1552606400-69593176151205
ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000553916MYO5Achr1552606400-9433176151205
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ENST00000569723ARPP19chr1552861045-ENST00000358212MYO5Achr1552606400-67369432113663150
ENST00000569723ARPP19chr1552861045-ENST00000399233MYO5Achr1552606400-67369432113663150
ENST00000569723ARPP19chr1552861045-ENST00000553916MYO5Achr1552606400-720943920131
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ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000358212MYO5Achr1552606400-68101684662155
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ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000553916MYO5Achr1552606400-7941684662155
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ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000358212MYO5Achr1552615641-76583171821249355
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ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000399231MYO5Achr1552615641-7514168331100355
ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000356338MYO5Achr1552615641-7511168331100355
ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000358212MYO5Achr1552615641-7509168331100355
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ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000553916MYO5Achr1552615641-1493168331100355

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
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ENST00000566423ENST00000399233ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.86732910.13267082
ENST00000566423ENST00000553916ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.0427104640.9572896
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ENST00000249822ENST00000356338ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.89759310.1024069
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ENST00000249822ENST00000399233ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.86142460.13857543
ENST00000249822ENST00000553916ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.061778180.93822175
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ENST00000569723ENST00000553916ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.0549329070.94506705
ENST00000564163ENST00000399231ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.80248510.19751492
ENST00000564163ENST00000356338ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.900793970.09920603
ENST00000564163ENST00000358212ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.86562890.13437109
ENST00000564163ENST00000399233ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.86562890.13437109
ENST00000564163ENST00000553916ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.0340377840.96596223
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ENST00000566423ENST00000356338ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0006389820.999361
ENST00000566423ENST00000358212ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0006299520.99937004
ENST00000566423ENST00000399233ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0006299520.99937004
ENST00000566423ENST00000553916ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0042760270.99572396
ENST00000249822ENST00000399231ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0006398440.99936014
ENST00000249822ENST00000356338ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.000665780.99933416
ENST00000249822ENST00000358212ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0006561790.9993438
ENST00000249822ENST00000399233ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0006561790.9993438
ENST00000249822ENST00000553916ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0040304830.99596953
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ENST00000569723ENST00000399233ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0006155010.9993845
ENST00000569723ENST00000553916ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0037095750.99629045
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ENST00000564163ENST00000356338ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0006541610.99934584
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ENST00000564163ENST00000553916ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0031065190.9968934

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Fusion Genomic Features for ARPP19-MYO5A


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.

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Fusion Protein Features for ARPP19-MYO5A


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr15:52861045/chr15:52606400)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
.MYO5A

Q9Y4I1

FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.FUNCTION: Processive actin-based motor that can move in large steps approximating the 36-nm pseudo-repeat of the actin filament. Involved in melanosome transport. Also mediates the transport of vesicles to the plasma membrane. May also be required for some polarization process involved in dendrite formation. {ECO:0000269|PubMed:10448864}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneMYO5Achr15:52861045chr15:52615641ENST0000035633833401534_181015181829.0DomainDilute

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
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Fusion Gene Sequence for ARPP19-MYO5A


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>6828_6828_1_ARPP19-MYO5A_ARPP19_chr15_52861045_ENST00000249822_MYO5A_chr15_52606400_ENST00000356338_length(transcript)=6961nt_BP=317nt
GGAAAAAAGGAAGTGTTTGGACGACAGCGAGCGGGAGAAGCGGGGTCAAGTAGGTAGGGGTGCGGTGCGGGAGGGGCAGGCGGGCTCCGG
CGTGCGAGGGCCTTGGCCAGCGGAGCGTTTCGCGGCTCCGTGTCGTCATAAGGCGGCGGCCATTTTCGCGGGCGGAGGCGGCCCGGCGGG
CCCTGGGAGAGCTGGGACGGGCGGCGGCCGGGTGGCCTCGGCCACCCGCTAATTGCATCTTTTCCCGGCGTCTCGTCTGCAGAGGGAGCA
CTATGTCTGCGGAAGTCCCCGAGGCAGCCTCCGCGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAAGTGTTGAATTTGTATACTCCAGTTAATGAGTTTG
AAGAAAGAGTCTCTGTGTCGTTCATTCGTACTATACAGATGCGTTTACGAGACAGGAAAGACTCTCCCCAGCTGCTCATGGATGCTAAAC
ACATCTTTCCTGTCACCTTTCCTTTCAACCCATCTTCCCTCGCACTAGAAACCATCCAGATTCCAGCCAGCCTCGGCCTGGGCTTCATTT
CACGGGTCTGAAAGTGATGTCCAGGCAAAAATTGACAATACATTTCTTGCCCGAAATAAGAACCCATTATTTCCAGTGAGTTACTGAAAA
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AAAAAGTATAACTTCCATAGATGAGCTGTTGTTAGGAAGGCACCAAAGAACCTCCTCTGCACTAAACAGGAGAATGGAAAGAAAAGTCTC
CATTGAGTACATATCATGTCAGTTTAGTAATCAATTATGTTGATATTGTTAAACTGGTTCAAAGAAATAAACTGGCAATATGTAAAGTAA
TTCCTCATTTGTGTCACTATGATATAGAGATATTAAAGGAATGTTGGTTTGCTAAATAGTATAGATGTCCATTTGTACTATAGTTTACTG
AGCATTTTAAATTGCTGCTACATACTGTCTTCTTAAAATGTAAGTGATATTAGGCACTACAATAAGTTTCTCTTGTCAATTCTGTTTACA
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ATATGACAAAATGCTTGACATTTAGGGGTAGGATTAGACAAAGTGGCTATTGTTGATGTCATTATTTATTCAGGATGTATTACATTGATG
TGCTCATTAATTTTCCCTGGGTGGATATTGCGTCAGGGTACAGTGTTCTGTGAAGTGACTTATTTTTAACTACCAGATCTGATTCCTTCA
GTGCATATTTTCAACCTTGACAGGTTTTCTCTCTTCTTAATTTATTAAGAATTAATCTCGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCC
CAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGGGCGGATCACTTCAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTA
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GGCGGAGATTGCAATGAGATCGAACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGAGAGACACTGCCTTGGAAAAAAAAAGAATCTCACTCAC
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GTGTAGCTGTAACCTTTCTTAAATGTACATGATTTATGTACATGCTTTTAGAAGGTCCTACTATATTTGTATTATAATTAGTTTAAGTAA
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CCTCCCCCAGCTTCATCCTGTGTAGCACGACTCAACGTGCACCCTGAATCTTCTCAGGTCTTCCAGGTCATGCTGTAGCTGTCACTGCCA
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TGAAGGCAGGTGGATGGAGTCAGTCCTCAGTTGCCCCTGCTGGCCTTCCTGGTGCTTACCATCAGCCCAATCTTTGCACAGTCCTTGTTG
TTCTTACTTCTCTGCATGCATTCCTTCAGAAGATCAGTCATCAACTTTTTCTTAATTCCTCTGTGACACACAATGGGAATTCAAAGGAAG
AGATCTTAAAAGTCACAACAGTTCTTTATCTTAATAATCCCCTCCCCATTCACCTTACTACATGCAGACTCACCTCACACCCTTACAACT
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TCGCACAGCCCTCTGGCTGTCCTGCTTTCCCATATGGAGCAGTGGTGGTGTGGGCACCTGTGATGCAGGAGACTTTAAAAATGTCGTGAG
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GTGAGCTGTGCAGCCTGGACAGGCCTGCAGCTATAGGCCACCTTCCCAGTTTAGGTCCTCAGCACAGGGGAGCCCAAGTCACTGGGTGCC
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TGCCTGGAAGGGATATCTTGCCCTGTTTCTCAAGGTTTTGTGAGAGTTTTGACTGGATGTGGCCCTGCATGACCCTCCTTCTCCTGTACT
TCCTCTTTCCTTTCCAAATGGGAATTAGAACTGTGGGGCAGCAACAGTCTCAGAGCCAGTGAGAGGCCAGCTTAGAGAATGCTTCTGAGT
TAGTGGGACTCTGTGTCACAAGTAAGCAAATGAATATATGAAAGAAATTATGGAGATAAGTTAGATTCTTGGTAATACTTAAATGTCTTG
CTTTCTACTAACCTTTTGTTACTAAAGGTAAAGGGTATAACTCAAACTTTTTGTGGACATTCTTTTCAAAATTTTTTAAGAACCCTGTAC
TATAAAAGGTTGAGTAAAAACAGGAAAGCGTGCTATAAGTTCAAATCTGTTGTATTACCCTAAATTAGATAAACCAACCTGAATTATAGT
AGATTTCTCAATAGATGAGGAACTGAAAAATACTATGTAAAATATCTTCCAAAATGCTTTTTATACTTTTTTTATTTGTAATTTGGTCTA
TCTAAAATGTTCGTTAGCTTAACTTAATGGGCGTTATTGGATTCATATGACTAACGTTTCCTCAGTATTGTAATGCTTGAAATATTTGAA
AGAAAAAATGTTGTTTTTTAGTTGAAACTGGTATATATAATTCAGTGCTTGGCAGGTTAGTATATTTTTATGCATTTTTCAGAGTCAGCA
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GATTTTGAAACCGTCTCCTTCTGGCTCTCTAACACATGCCGATTTTTGCACTGCTTGAAACAGTACAGTGGAGAAGAGGGCTTTATGAAG
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TCTGTTTACAATTCAATCAGATCACAGTTTTAACTGGATTATATGCAAATACCTACAGATTCACCTGCACAAGTAGCAGACACTGGAAAG
TCATGTAGTAATATGACAAAATGCTTGACATTTAGGGGTAGGATTAGACAAAGTGGCTATTGTTGATGTCATTATTTATTCAGGATGTAT
TACATTGATGTGCTCATTAATTTTCCCTGGGTGGATATTGCGTCAGGGTACAGTGTTCTGTGAAGTGACTTATTTTTAACTACCAGATCT
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GTCCTTGTTGTTCTTACTTCTCTGCATGCATTCCTTCAGAAGATCAGTCATCAACTTTTTCTTAATTCCTCTGTGACACACAATGGGAAT
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GAATTATAGTAGATTTCTCAATAGATGAGGAACTGAAAAATACTATGTAAAATATCTTCCAAAATGCTTTTTATACTTTTTTTATTTGTA
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TATTAGTTTTCATTAGAAACTCTGGTTCTGAATTACAATCATAGGTTATATAAATTTAACTGTTAGATGGTCTATAAATCTTATTAAAAT
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AGAGCTGCCTTAAGTTCTCCAGAACTTTTCTTCTGTAAAGGATATCTTGCCTGGAAGGGATATCTTGCCCTGTTTCTCAAGGTTTTGTGA
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AATACTGTCTGTTAATTTACATGGGCCTCAAGTTCCTCGTTTATAAAATAAGAGAGTTGGACACTGATTCTTAACATCTCCTCCACATTT
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GTGCCTGTCAATTCCTTAGGATTAATCAAATGTAAAATCACAAGTTTGTGTAGCTGTAACCTTTCTTAAATGTACATGATTTATGTACAT
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AAATGATTCTGTATACCATTTTCTTGAAGGTACAAGAAGATTCTGCCGACTATGGGGATCTTTGGGCCAGTTTGAGGATTGCTTTCCCTC
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AATCTGTTGTATTACCCTAAATTAGATAAACCAACCTGAATTATAGTAGATTTCTCAATAGATGAGGAACTGAAAAATACTATGTAAAAT
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CAGACTCACCTCACACCCTTACAACTTGAAGCTGAAAATTTAAAAGTAATTTCCCTTTTTGCAGCTTTTCCTCAGGTTAAGGCTTTGATC
TGCCTGAGAGTAACTCTAAAAGGAGGGAAGATAAATATGGGATAAAATCCACAAAGTGTAGCTTCTAATTCCTTTGGAAGTTTAAAAAAT
TTCCACATATCTGATGCTTCTTTTGTCAGGTGCAGAAGCACAAAAACATATTCCGAAGCCAACTGATAGGGAATTTGGGGATTATTGTCA
GTTTGGAGAATTTGCTGTGTTATTTCTTCATTTCCATGGATAGCTCATAGTTGGCTCTTTCTGGGTGAGTAATTATGTGTAATATAGATC
AAATCTTTTACTAAGGTTACAGCTACATGTTAGGGGAGGCTATGAAAATACTATATTATTATAATTTCAGTGCAGTGATTGTTGTGAGAA
ATAACTTTCATGGTAACCCTAGGAAAATGGGCACCTGCCACCATCCTGAGAAGTCCTCACACAATGCCCTTTCTCTCTTACACACACACA
CACACACATACACACACACACACCCCCGTCACTAATTCATAGAGTTCCTTAGCAGGCATAGTCAAGGATCCTCTGGGTAATGTCAGCTGC
TTAGTGATAAAACAGAGCCAAAACTAGTGCATCCTGTTGAAAGTAATGCAGAAACAGTACCTGGGTCCAGATATGCTTTCCTGCGGCGCT
TTCCTCTGTTACCTCGTTTCATCCTCACAGCAGCATGGACGGTAGGTGGGGTCGCTTCTACAATCATTTCTGATGATAGCTTGGGAATAG
AGATAGGGGCAGTGACTTGCCTGATGTCGCACAGCCCTCTGGCTGTCCTGCTTTCCCATATGGAGCAGTGGTGGTGTGGGCACCTGTGAT
GCAGGAGACTTTAAAAATGTCGTGAGGTCACGTGCTGCCCCTCCTGGTACGTGTGGAATGCCCCTGGCCAGCAAGGGGTGCTTTTTTATC
AGAGTTGGCAGCTGGCATGTGGGAACCGAGCAAGTGCTGCGTACCAAGTTACTTGTTTTAAGGAGACCAAGTGCTCAGCGCCAGGTGGTT
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GGCCAGCTTAGAGAATGCTTCTGAGTTAGTGGGACTCTGTGTCACAAGTAAGCAAATGAATATATGAAAGAAATTATGGAGATAAGTTAG
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Fusion Gene PPI Analysis for ARPP19-MYO5A


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for ARPP19-MYO5A


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for ARPP19-MYO5A


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource