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Fusion gene:SENP7-MBNL1 (FusionGDB2 ID:80438)

Fusion Gene Summary for SENP7-MBNL1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: SENP7-MBNL1
Fusion gene ID: 80438
HgeneTgene
Gene symbol

SENP7

MBNL1

Gene ID

57337

4154

Gene nameSUMO specific peptidase 7muscleblind like splicing regulator 1
Synonyms-EXP|MBNL
Cytomap

3q12.3

3q25.1-q25.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionsentrin-specific protease 7SUMO-1-specific protease 2SUMO1/sentrin specific peptidase 7sentrin/SUMO-specific protease SENP7muscleblind-like protein 1muscleblind-liketriplet-expansion RNA-binding protein
Modification date2020031320200327
UniProtAcc.

Q9NR56

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000314261, ENST00000348610, 
ENST00000358203, ENST00000394091, 
ENST00000394094, ENST00000394095, 
ENST00000394085, 		ENST00000461436, 
ENST00000282486, ENST00000282488, 
ENST00000324196, ENST00000324210, 
ENST00000355460, ENST00000357472, 
ENST00000463374, ENST00000485509, 
ENST00000485910, ENST00000492948, 
ENST00000493459, ENST00000498502, 
ENST00000545754, 
Fusion gene scores* DoF score12 X 11 X 5=66028 X 14 X 6=2352
# samples 1228
** MAII scorelog2(12/660*10)=-2.4594316186373
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(28/2352*10)=-3.0703893278914
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: SENP7 [Title/Abstract] AND MBNL1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointSENP7(101212717)-MBNL1(152163071), # samples:1
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.SENP7-MBNL1 seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a essential gene due to the frame-shifted ORF.
SENP7-MBNL1 seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a IUPHAR drug target due to the frame-shifted ORF.
SENP7-MBNL1 seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a essential gene due to the frame-shifted ORF.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgeneMBNL1

GO:0008380

RNA splicing

18335541

TgeneMBNL1

GO:0043484

regulation of RNA splicing

15257297|16946708


check buttonFusion gene breakpoints across SENP7 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across MBNL1 (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4STADTCGA-FP-8209-01ASENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+


Top

Fusion Gene ORF analysis for SENP7-MBNL1

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
5CDS-intronENST00000314261ENST00000461436SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
5CDS-intronENST00000348610ENST00000461436SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
5CDS-intronENST00000358203ENST00000461436SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
5CDS-intronENST00000394091ENST00000461436SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
5CDS-intronENST00000394094ENST00000461436SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
5CDS-intronENST00000394095ENST00000461436SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000282486SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000282488SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000324196SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000324210SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000355460SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000357472SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000463374SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000485509SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000485910SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000492948SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000493459SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000498502SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
Frame-shiftENST00000358203ENST00000545754SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000282486SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000282488SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000324196SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000324210SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000355460SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000357472SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000463374SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000485509SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000485910SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000492948SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000493459SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000498502SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000314261ENST00000545754SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000282486SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000282488SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000324196SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000324210SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000355460SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000357472SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000463374SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000485509SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000485910SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000492948SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000493459SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000498502SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000348610ENST00000545754SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000282486SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000282488SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000324196SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000324210SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000355460SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000357472SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000463374SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000485509SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000485910SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000492948SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000493459SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000498502SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394091ENST00000545754SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
In-frameENST00000394094ENST00000282486SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394094ENST00000282488SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394094ENST00000324196SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394094ENST00000324210SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
In-frameENST00000394094ENST00000355460SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
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101212717

-MBNL1chr3

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+
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101212717

-MBNL1chr3

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+
In-frameENST00000394094ENST00000485509SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
In-frameENST00000394094ENST00000485910SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
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101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394094ENST00000493459SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
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101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
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101212717

-MBNL1chr3

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+
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101212717

-MBNL1chr3

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+
In-frameENST00000394095ENST00000282488SENP7chr3

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-MBNL1chr3

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+
In-frameENST00000394095ENST00000324196SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
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101212717

-MBNL1chr3

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+
In-frameENST00000394095ENST00000355460SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
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101212717

-MBNL1chr3

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+
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101212717

-MBNL1chr3

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+
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101212717

-MBNL1chr3

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+
In-frameENST00000394095ENST00000485910SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
In-frameENST00000394095ENST00000492948SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394095ENST00000493459SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394095ENST00000498502SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
In-frameENST00000394095ENST00000545754SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
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101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
intron-3CDSENST00000394085ENST00000282488SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
intron-3CDSENST00000394085ENST00000324196SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
intron-3CDSENST00000394085ENST00000324210SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
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101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
intron-3CDSENST00000394085ENST00000357472SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
intron-3CDSENST00000394085ENST00000463374SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
intron-3CDSENST00000394085ENST00000485509SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
intron-3CDSENST00000394085ENST00000485910SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
intron-3CDSENST00000394085ENST00000492948SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

152163071

+
intron-3CDSENST00000394085ENST00000493459SENP7chr3

101212717

-MBNL1chr3

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+
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+
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-MBNL1chr3

152163071

+
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101212717

-MBNL1chr3

152163071

+

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
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(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
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ENST00000348610SENP7chr3101212717-ENST00000485910MBNL1chr3152163071+3630229142792216
ENST00000348610SENP7chr3101212717-ENST00000463374MBNL1chr3152163071+4261229142846234
ENST00000348610SENP7chr3101212717-ENST00000492948MBNL1chr3152163071+734229142708188
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check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
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ENST00000394094ENST00000485509SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0078071430.9921929
ENST00000314261ENST00000282488SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0016193760.99838066
ENST00000314261ENST00000282486SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0010834310.9989166
ENST00000314261ENST00000355460SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0015316650.99846834
ENST00000314261ENST00000493459SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0010326360.9989674
ENST00000314261ENST00000324210SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0020035050.9979965
ENST00000314261ENST00000498502SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0010088720.9989911
ENST00000314261ENST00000545754SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0021610010.99783903
ENST00000314261ENST00000357472SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0023991470.99760085
ENST00000314261ENST00000324196SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0047493050.9952507
ENST00000314261ENST00000485910SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0015197070.99848026
ENST00000314261ENST00000463374SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0010411490.9989588
ENST00000314261ENST00000492948SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.004982870.9950171
ENST00000314261ENST00000485509SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0074663090.9925337
ENST00000348610ENST00000282488SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0015072530.9984927
ENST00000348610ENST00000282486SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0011490570.99885094
ENST00000348610ENST00000355460SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0013732570.9986267
ENST00000348610ENST00000493459SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.001815710.99818426
ENST00000348610ENST00000324210SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.001288820.9987112
ENST00000348610ENST00000498502SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0015393660.99846065
ENST00000348610ENST00000545754SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0014773540.9985227
ENST00000348610ENST00000357472SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0022176920.9977823
ENST00000348610ENST00000324196SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0081091770.9918908
ENST00000348610ENST00000485910SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.001281390.9987186
ENST00000348610ENST00000463374SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0010715670.99892837
ENST00000348610ENST00000492948SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.003003720.9969963
ENST00000348610ENST00000485509SENP7chr3101212717-MBNL1chr3152163071+0.0076511370.9923489

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Fusion Genomic Features for SENP7-MBNL1


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)
SENP7chr3101212716-MBNL1chr3152163070+0.936888160.06311183
SENP7chr3101212716-MBNL1chr3152163070+0.936888160.06311183

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.
genomic feature of top 1%

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Fusion Protein Features for SENP7-MBNL1


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr3:101212717/chr3:152163071)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
.MBNL1

Q9NR56

FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.FUNCTION: Mediates pre-mRNA alternative splicing regulation. Acts either as activator or repressor of splicing on specific pre-mRNA targets. Inhibits cardiac troponin-T (TNNT2) pre-mRNA exon inclusion but induces insulin receptor (IR) pre-mRNA exon inclusion in muscle. Antagonizes the alternative splicing activity pattern of CELF proteins. Regulates the TNNT2 exon 5 skipping through competition with U2AF2. Inhibits the formation of the spliceosome A complex on intron 4 of TNNT2 pre-mRNA. Binds to the stem-loop structure within the polypyrimidine tract of TNNT2 intron 4 during spliceosome assembly. Binds to the 5'-YGCU(U/G)Y-3'consensus sequence. Binds to the IR RNA. Binds to expanded CUG repeat RNA, which folds into a hairpin structure containing GC base pairs and bulged, unpaired U residues. {ECO:0000269|PubMed:10970838, ECO:0000269|PubMed:15257297, ECO:0000269|PubMed:16946708, ECO:0000269|PubMed:18335541, ECO:0000269|PubMed:19470458}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST00000282486310215_2411831169.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000028248828179_2071151083.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000028248828215_2411151083.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000032419628215_2411831151.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST00000324210310215_2411831466.0Zinc fingerC3H1-type 4
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000035546039215_2411831294.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000035747228215_2411831153.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000046337429215_2411831292.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000048550927215_241183341.0Zinc fingerC3H1-type 4
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000048591017179_2071151014.3333333333334Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000048591017215_2411151014.3333333333334Zinc fingerC3H1-type 4
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000049294827215_241183343.0Zinc fingerC3H1-type 4
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000054575418179_2071151125.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000054575418215_2411151125.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 4

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneSENP7chr3:101212717chr3:152163071ENST00000314261-323760_105062985.0RegionNote=Protease
HgeneSENP7chr3:101212717chr3:152163071ENST00000348610-223760_1050291018.0RegionNote=Protease
HgeneSENP7chr3:101212717chr3:152163071ENST00000358203-322760_105029887.0RegionNote=Protease
HgeneSENP7chr3:101212717chr3:152163071ENST00000394085-17760_10500239.0RegionNote=Protease
HgeneSENP7chr3:101212717chr3:152163071ENST00000394091-221760_105029887.0RegionNote=Protease
HgeneSENP7chr3:101212717chr3:152163071ENST00000394095-324760_1050621051.0RegionNote=Protease
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000028248631013_411831169.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST00000282486310179_2071831169.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000028248631047_731831169.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000002824882813_411151083.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000002824882847_731151083.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000003241962813_411831151.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000032419628179_2071831151.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000003241962847_731831151.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000032421031013_411831466.0Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST00000324210310179_2071831466.0Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000032421031047_731831466.0Zinc fingerC3H1-type 2
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000003554603913_411831294.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000035546039179_2071831294.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000003554603947_731831294.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000003574722813_411831153.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000035747228179_2071831153.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000003574722847_731831153.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000004633742913_411831292.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000046337429179_2071831292.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000004633742947_731831292.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000004855092713_41183341.0Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000048550927179_207183341.0Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000004855092747_73183341.0Zinc fingerC3H1-type 2
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000004859101713_411151014.3333333333334Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000004859101747_731151014.3333333333334Zinc fingerC3H1-type 2
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000004929482713_41183343.0Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST0000049294827179_207183343.0Zinc fingerC3H1-type 3
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000004929482747_73183343.0Zinc fingerC3H1-type 2
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000005457541813_411151125.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 1
TgeneMBNL1chr3:101212717chr3:152163071ENST000005457541847_731151125.6666666666667Zinc fingerC3H1-type 2


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Fusion Gene Sequence for SENP7-MBNL1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>80438_80438_1_SENP7-MBNL1_SENP7_chr3_101212717_ENST00000314261_MBNL1_chr3_152163071_ENST00000282486_length(transcript)=4328nt_BP=297nt
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTCCCCTCCCCCTCCCTCTCCAAGCCGGAGGGGTCCTGAGGTGACAGCGCCTGCAACTG
AAATTTCAGCAGCGGGAGAAGATGGACAAGAGAAAGCTCGGGCGACGGCCATCTTCATCCGAAATCATCACAGAAGGAAAAAGGAAAAAG
TCATCTTCTGATTTATCGGAGATAAGAAAGATGTTAAATGCAAAACCAGAGGATGTCCATGTTCAATCACCACTGTCCAAATTCAGAAGC
TCAGAACGCTGGACTCTCCCTTTGCAGGTATGTCGAGAGTACCAACGTGGCAATTGCAACCGAGGAGAAAATGATTGTCGGTTTGCTCAT
CCTGCTGACAGCACAATGATTGACACCAATGACAACACAGTCACTGTGTGTATGGATTACATCAAAGGGAGATGCTCTCGGGAAAAGTGC
AAATACTTTCATCCCCCTGCACATTTGCAAGCCAAGATCAAGGCTGCCCAATACCAGGTCAACCAGGCTGCAGCTGCACAGGCTGCAGCC
ACCGCAGCTGCCATGACTCAGTCGGCTGTCAAATCACTGAAGCGACCCCTCGAGGCAACCTTTGACCTGGGAATTCCTCAAGCTGTACTT
CCCCCATTACCAAAGAGGCCTGCTCTTGAAAAAACCAACGGTGCCACCGCAGTCTTTAACACTGGTATTTTCCAATACCAACAGGCTCTA
GCCAACATGCAGTTACAACAGCATACAGCATTTCTCCCACCAGTTCCCATGGTGCACGGTGCTACGCCAGCCACTGTGTCCGCAGCAACA
ACATCTGCCACAAGTGTTCCCTTCGCTGCAACAGCCACAGCCAACCAGATACCCATAATATCTGCCGAACATCTGACTAGCCACAAGTAT
GTTACCCAGATGTAGAATTTTCATCACTAAACAATCATGCTAAAGAGGAAAGGACAGTGTGCTTGGTTAGAGTAAAGGACGAGGTCATTA
GCCATATTGTATATATCGTCAAGCAACACACACAAAAGTTCCTCAGCCACAAGACATCCACATATTGCATGTTAACCAGAAGAAAAGACA
ACATTTTCCGGAAATCCACTGCACACTGTTGCCTATACACTTTGTACATTTAATTGATATTTGTGCTGAGGTGATATTCCTGTCTAAAAG
AACAACATTGTCTTTCTTTTCTAGCACAGAGTTATGCATTCAAAGATGCATACCTAGTTAGTTTCCTATATATTCATGCCATCTTGAAAA
GACAGACTATGGTGTAACCATGATTCTATTATGTATTGGTACGTCTGTAGACCAAGATATAATTTTTTAAAAATAAGTTTATTTCTTTCA
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ATTTTTCAAAATACAAAAAAAAGTAGTTTTTCCTTCATAACATACTCAGTTTTGAATTACATGTAGTGTCACATGAATATTCGTATTGTT
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ATATTCGTATTGTTAACTAAATGATTTATATTTTACTGATTTAATATTACAGTGTAAGAATGTCAGTCATTGTTAGTTCTTGTCTAGTTT
TCATTAAAAGAACAAAGATCTTTTATATGGATATCTTATAAATATATAATCATTGCTAAGTAAGAAGTTAAGTTGTTGCTATCGCAACAA
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TGCATAATCAATAAATAGAACAAGGGACTTTTTGTTGATAATCCAAATACTCAAAGTTTACGTAATGAAAATTATAGCGTGTGTGCAAAC
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>80438_80438_65_SENP7-MBNL1_SENP7_chr3_101212717_ENST00000394095_MBNL1_chr3_152163071_ENST00000545754_length(amino acids)=271AA_BP=72
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Fusion Gene PPI Analysis for SENP7-MBNL1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for SENP7-MBNL1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for SENP7-MBNL1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource