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Fusion gene:USP3-RAB8B (FusionGDB2 ID:97467)

Fusion Gene Summary for USP3-RAB8B

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: USP3-RAB8B
Fusion gene ID: 97467
HgeneTgene
Gene symbol

USP3

RAB8B

Gene ID

9960

51762

Gene nameubiquitin specific peptidase 3RAB8B, member RAS oncogene family
SynonymsSIH003|UBP-
Cytomap

15q22.31

15q22.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3deubiquitinating enzyme 3ubiquitin thioesterase 3ubiquitin thiolesterase 3ubiquitin-specific-processing protease 3ras-related protein Rab-8BRAB-8b protein
Modification date2020031320200313
UniProtAcc..
Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000268049, ENST00000380324, 
ENST00000539772, ENST00000540797, 
ENST00000558285, ENST00000559711, 
ENST00000536001, ENST00000558218, 
ENST00000321437, ENST00000448330, 
Fusion gene scores* DoF score11 X 8 X 6=5285 X 3 X 5=75
# samples 136
** MAII scorelog2(13/528*10)=-2.02202630633
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(6/75*10)=-0.321928094887362
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: USP3 [Title/Abstract] AND RAB8B [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointUSP3(63866602)-RAB8B(63536954), # samples:1
USP3(63866602)-RAB8B(63536955), # samples:1
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneUSP3

GO:0016578

histone deubiquitination

17980597

HgeneUSP3

GO:0031647

regulation of protein stability

17980597

TgeneRAB8B

GO:0045046

protein import into peroxisome membrane

18346465


check buttonFusion gene breakpoints across USP3 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check buttonFusion gene breakpoints across RAB8B (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0)
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4STADTCGA-HU-A4GH-01AUSP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
ChimerDB4STADTCGA-HU-A4GHUSP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+


Top

Fusion Gene ORF analysis for USP3-RAB8B

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000268049ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000268049ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000268049ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000268049ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000380324ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000380324ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000380324ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000380324ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000539772ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000539772ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000539772ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000539772ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000540797ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000540797ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000540797ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000540797ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000558285ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000558285ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000558285ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000558285ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000559711ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000559711ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
In-frameENST00000559711ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
In-frameENST00000559711ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
intron-3CDSENST00000536001ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
intron-3CDSENST00000536001ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
intron-3CDSENST00000536001ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
intron-3CDSENST00000536001ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
intron-3CDSENST00000558218ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
intron-3CDSENST00000558218ENST00000321437USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+
intron-3CDSENST00000558218ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536955

+
intron-3CDSENST00000558218ENST00000448330USP3chr15

63866602

+RAB8Bchr15

63536954

+

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
ENST00000540797USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536954+5772110941608534
ENST00000540797USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536954+2327110941557517
ENST00000380324USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536954+588812251291724531
ENST00000380324USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536954+244312251291673514
ENST00000268049USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536954+601713543121853513
ENST00000268049USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536954+257213543121802496
ENST00000539772USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536954+52876241131123336
ENST00000539772USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536954+18426241131072319
ENST00000558285USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536954+58091146891645518
ENST00000558285USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536954+23641146891594501
ENST00000559711USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536954+5579916871415442
ENST00000559711USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536954+2134916871364425
ENST00000540797USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536955+5772110941608534
ENST00000540797USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536955+2327110941557517
ENST00000380324USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536955+588812251291724531
ENST00000380324USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536955+244312251291673514
ENST00000268049USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536955+601713543121853513
ENST00000268049USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536955+257213543121802496
ENST00000539772USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536955+52876241131123336
ENST00000539772USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536955+18426241131072319
ENST00000558285USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536955+58091146891645518
ENST00000558285USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536955+23641146891594501
ENST00000559711USP3chr1563866602+ENST00000321437RAB8Bchr1563536955+5579916871415442
ENST00000559711USP3chr1563866602+ENST00000448330RAB8Bchr1563536955+2134916871364425

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
ENST00000540797ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.000314310.99968576
ENST00000540797ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0014859340.9985141
ENST00000380324ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0001350620.99986494
ENST00000380324ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.000724620.9992754
ENST00000268049ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0001271450.9998728
ENST00000268049ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0006840690.999316
ENST00000539772ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0005204550.9994796
ENST00000539772ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0022557620.9977443
ENST00000558285ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+9.95E-050.99990046
ENST00000558285ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0003197420.9996803
ENST00000559711ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0001420450.9998579
ENST00000559711ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.000548680.99945134
ENST00000540797ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.000314310.99968576
ENST00000540797ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.0014859340.9985141
ENST00000380324ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.0001350620.99986494
ENST00000380324ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.000724620.9992754
ENST00000268049ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.0001271450.9998728
ENST00000268049ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.0006840690.999316
ENST00000539772ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.0005204550.9994796
ENST00000539772ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.0022557620.9977443
ENST00000558285ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+9.95E-050.99990046
ENST00000558285ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.0003197420.9996803
ENST00000559711ENST00000321437USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.0001420450.9998579
ENST00000559711ENST00000448330USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536955+0.000548680.99945134

Top

Fusion Genomic Features for USP3-RAB8B


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)
USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0008918040.99910814
USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0008918040.99910814
USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0008918040.99910814
USP3chr1563866602+RAB8Bchr1563536954+0.0008918040.99910814

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions that are ovelapped with the top 1% feature importance score regions. More details are in help page.
genomic feature of top 1%

Top

Fusion Protein Features for USP3-RAB8B


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr15:63866602/chr15:63536954)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
..
FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.FUNCTION: Transcriptional activator which is required for calcium-dependent dendritic growth and branching in cortical neurons. Recruits CREB-binding protein (CREBBP) to nuclear bodies. Component of the CREST-BRG1 complex, a multiprotein complex that regulates promoter activation by orchestrating a calcium-dependent release of a repressor complex and a recruitment of an activator complex. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex. At the same time, there is increased recruitment of CREBBP to the promoter by a CREST-dependent mechanism, which leads to transcriptional activation. The CREST-BRG1 complex also binds to the NR2B promoter, and activity-dependent induction of NR2B expression involves a release of HDAC1 and recruitment of CREBBP (By similarity). {ECO:0000250}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

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* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
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- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
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Top

Fusion Gene Sequence for USP3-RAB8B


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
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GACTTAGATTCCTTTACAAATTTAGTTCTCAATCTTTAAAAACCACATTTCATTATGTTGGTTAATTATTATAAATTTTAAGCACTCATT
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GATCCATTCCTAGACCTTTCATTAGATATTCCAAGTCAGTTCAGAAGTAAGCGCTCTAAGAATCAAGAAAATGGACCAGTTTGTTCGTTA
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CAGAAAAGCAAGATAAAGTTCAGCACACAGTATGTATGGATTGCAGTAGCTACAGTACATACTGTTATCGCTGTGATGATTTTGTGGTTA
ATGACACCAAGCTGGGACTGGTACAGAAAGTCAGAGAACACTTACAGAACTTGGAAAACTCAGCTTTCACAGCTGACAGGCATAAGAAAA
GAAAACTTTTGGAAAACTCAACACTAAACAGCAAGTTATTAAAAGTAAATGGAAGCACCACTGCCATTTGTGCCACAGGCCTTCGGAATT
TGGGGAACACATGTTTCATGAATGCCATCCTTCAGTCACTCAGTAACATTGAGCAGTTTTGCTGTTATTTCAAAGAACTGCCCGCCGTGG
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AGACACTCTGTGCTTTATGGCAAGGCAGCCAGACTGCATTTAGCCCAGAGTCCTTATTTTATGTTGTTTGGAAGATTATGCCAAACTTTA
GGGGCTATCAACAGCAGGACGCCCATGAATTCATGCGCTACCTTTTGGACCACCTACACTTGGAACTTCAGGGCGGTTTCAACGGTGTTT
CCCGCTCAGCAATTCTGCAGGAGAATTCTACTCTGTCTGCAAGTAACAAGTGTTGCATAAATGGAGCATCTACTGTTGTCACGGCTATAT
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GTTTCTTTCGTTGCTCGCTACTTTGATGAACTCTTTCTGAGAGACTGCAGCACACCTAGAGGGCCCTTTCCTGCTTCTCTGAAAGCACAG
GTCACCCAGCCTCAGAATCACACCTCCCGGCTGCTGCTGAGAGCACCACTGAACTTAGACCTCTCAACACAGTATGCCAAGTGGATTCCA
GCCTCATGGCCTAGCAAAAGAACAGACTCCCTTTTTCAAACATGGAAGCAATGAAGTGGAGACACATGCAGGACCTAACTCGTTTTTTCC
TTGTTTTATTACCTGTTGCAGAAGCGGTTATCTTTCTTTTTTACTTTGCACATCAGTGTTAGCCTTTCCCTATTTCAGCACAATCTTAGA
CTCATATTTGCACACTTTTGTGTCGTGAAGTTCTAGACAAATTTGTACATGTGGCAATGTTAAAAGAGCATTTACAGCAGAGGTTAATAT
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TCATTAAAGTCATTAAAAAAATTTACTGAAATGCCCATCTTGTCATCAAAGGCCACAATTTCTTTATTTCTTCAGATTAAGAGCTTTGCC
TCATCCCCGACCTGTTTTCCAGAGTCTGGGTAGCTGAATGAATCACTTTAAAATGATTACCTCTGCCTAATCTATAGAAACTGCATTTGG
AAATCACCATAATCTCATTTTTCCCTGGGGTTTGTATTTGCTATTCTTTCCCATGTTTGACTTAAGTGTAATCACTCTTAAGTAATATTT
GAACATTATTATCTGTTTCTATTTGTGAACTTCTTGAGCTGAAATTTTACGTGGGCTGAGAGATATACCATTTAGGGTTTTAGTGCAGCA
TCTAACTGTGATTCTGTCAATAAGGATATGTAATATATTTTTTCTTAGGTTCACTCCTTAGCTGGCTGGTTTAGTTGTAATACCAAATTC
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ATTTAATAGAGCTAGCTCTTGGTAATGGTGAAAATAATGAGTTTTGGTTGGTTTTATTTGGCAGATGTTTTTAGAAATAAAAGTACTTAG
ACCTAGTGCAGCCTCTAGGAAAAGTCTTGCCTTTTCATTAGAGAAAACAGGACCAAGGTTTCAGTTTTCAAACAGCTGTTGTTGATTGTG
TAGAACCCAGTTCCATCTGTTTTGGTTCATTGTTACAGAACTTAGTCCAGTCATTTGGGCTAAAGCCAACCAAAAGCTTAGTTGCCTTTC
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TCGTTGTTGCTCTAGCCTTCAGTGTCATAACACAGGGGGGATAAAACAGAGGGGATGAGGGAAATGAATTCTGTTAATAATTATTCTTCC
TGGTATGCCTGTTTTGCTTCACAAAGGCTACTATCATGCTGGATAGATAAGAACAGGAGATGGCAGTGGAAAGGGATTGCTTGTTACCAC
AGAGAATTCTCTTCAAATTAAGATATGTCATTAGAATGCTTGGACCAGTCAATCTTTTGTACTTATTTGAAAATATAGGAACAATTTAGC
AGCTGCAAATATGCCCAAGCTATTTTTAATAGATATACTAAACTTATTGTTGACAAATTTCAGCCTCCTTAATTTTTTTTTTTTTGGTAA
TTACCTATAGGCTTAAAAGTCATTCGTTGCTGTTCTAGTATAATTAGTAGTTCCGTGATTGAAAGTTTATTGTAATTCTACTATCTTCAA
ATTAGATACATTTTCAAAAGGAAAAGATAATTTTTTAGAAACATCTTAATATTCACTATTTCCTGAAAAAATCCAAGCAGTTAACGCTTT
CTGGATGGTAACAAAGTACCTTCTAAAAGATAAGTGCTATGACACCATGTATGAATGTAATTCTCTTAGTAATTTACCTCTGACTATTTG
GTGTCTTAACGCTTTGGTTTATATAATCTCAGGGGTTGTCTGCAAACCAAAACTGACATATTCTGTGGTTAGCTTTTATTACTTTTTTTT
TTAACAGAATGCTTTGCTTTGGTTATATTTCTTCTTTCTTCTTTTGTCTTATATGGATTAATAACTAGTCTCCATGAACTTCACTTGAAA
GAGCCTGTAAAAGTTAGATGAGTCTAAAAGTGCTCTTTGAAGTAGCAGCAAATTGGGAGTATATGCTCTGTTATATAGAAATAAATTGTC
CTTGCTATTTTCTTACATTTAGCTTTGCTAGATTGTATATACATTGAGCTAAGACCTTAGGAAATTCACTTTCTGCATGATAAAATGACC
CAATAAATATTCCACTTTGCTTAATAATGTACATACAGTGCATTATTTTTTCTATTTGTAGATGAATTTAATGACAGATAATTGTCTGTT
CCCCGCTGAAACTGAAGAAATCTAGTTTTTTTGTGAACATTTTTGTGGTCTTATGGATAAGGTACATGAAGATTTTTGCAGCAGTATTAG
TGGTTCAGTGGCTGCACTTTATTAATCAGTGTGTTAATTTTTGACAGTGATTGGACTAGACCTTTTCAAATAGAGTCTGAGGGTATCAGA
CAGTGAAAATGTGCTGTAACTAAGTAGCATGTAAATCAGTTGATTGTAAAACGTTTCGCTGGGAACTTATTTTAGCTATATTTTACTTCA
GACAGATTATGATACAATAATCTACCTGTGCATCAGTTAGTAGGTGCTGCAGGGTTTCTTACTATTTACAGAAACATTTTGTGCAGTCTT
TGTTATAAATTTTCAGAAGACTATACTCTTTACTTTGAAGGTCTATTTTTTAATTATACCTCATTTAGCTAACTAGTATTCTAATACCTG
GTAGAAAAACAGTGAGCCAGCCTTTAAGCATCTAACAAAATTTAGACTCTTTGTTTTGTTTTGAACTGAAGACATCATTGGGAAAGGTAG
GAAATATTAGTTTAGGATAGAGCATACATGTCATATCCAGTAGCATAAAAAAAGTATTATCTCCCTGTCTCCATTAATAAATTTAGCTGT
GCAATATAGGTGCGTTTTTGCAGAAGTTTCTAGTAAGAGATTATAACTCCATTTTACAGGTTCTGAATGCTCAGAGTCTATATTAAGGCT
TATAAAGTTTTTCCTGTGATCAGTAAGTGACACATTTAAGCAGACATTCTTTTCAAGTTCATGACTTAGATTCCTTTACAAATTTAGTTC
TCAATCTTTAAAAACCACATTTCATTATGTTGGTTAATTATTATAAATTTTAAGCACTCATTTCTGCAATCAGGTTTCTCAGAATTTTTT
TTTTTTAAACAGAAGAGACATTCCTTTTTCCTTGTTACATCCAAGGGGGGCACAGGGGTGGGTGGAAAGGAATGTCTAAAAATGAAATCC
CTTGATATAGAGGGACCTAGACGGACAGGATATGCTAAAATAATTTCAAATTCTAGCACAATTTTAGAGTAGAATAAGTCATTTTTTTAG
ACTAATAAAATTAATGGCTGTCATGTTCACTCTGAAAAAAATCTAAATGACTGAAATGTACAGAAATAAAAATTAGCAAACAATTATTCT
AGGGATATTTTCAGATTTTACTTCATTTCTTGAAATGCGTGTGCCATATGCAATTGCATTTCTTGTGCCAAGAAACTAATAGAACTTATT
TCACTTTACCTTTTTTTAAAATGTGAATTTAGTTATTATAGTTCAATTTTATGGCCTTACAGATGGCTTTTATTTTGTTTGCAGCTGACA
CTGCAGTTCCTTTCATGCAAAATACCATAAACTGTTTGATGAAAATCATGCCCCTAATGGAAACTCTCTAGTTTTTCCATATAACTATCC
TACTGTACATGTTTAAACATATTTTATTTTTGCTCCAATGGCTTAATGTGAAAAGCTCCTGCAGATAAGTGGACCTGTCATGTGGTTAAT
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CAGAAAAGCAAGATAAAGTTCAGCACACAGTATGTATGGATTGCAGTAGCTACAGTACATACTGTTATCGCTGTGATGATTTTGTGGTTA
ATGACACCAAGCTGGGACTGGTACAGAAAGTCAGAGAACACTTACAGAACTTGGAAAACTCAGCTTTCACAGCTGACAGGCATAAGAAAA
GAAAACTTTTGGAAAACTCAACACTAAACAGCAAGTTATTAAAAGTAAATGGAAGCACCACTGCCATTTGTGCCACAGGCCTTCGGAATT
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AGTTAAGGAATGGGAAAACAGCAGGAAGGCGGACATACCACACCAGGAGCCAAGGGGATAACAATGTGTCTTTGGTAGAAGAGTTTAGAA
AGACACTCTGTGCTTTATGGCAAGGCAGCCAGACTGCATTTAGCCCAGAGTCCTTATTTTATGTTGTTTGGAAGATTATGCCAAACTTTA
GGGGCTATCAACAGCAGGACGCCCATGAATTCATGCGCTACCTTTTGGACCACCTACACTTGGAACTTCAGGGCGGTTTCAACGGTGTTT
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CCTGTTGCAGAAGCGGTTATCTTTCTTTTTTACTTTGCACATCAGTGTTAGCCTTTCCCTATTTCAGCACAATCTTAGACTCATATTTGC
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GGAAGCACCACTGCCATTTGTGCCACAGGCCTTCGGAATTTGGGGAACACATGTTTCATGAATGCCATCCTTCAGTCACTCAGTAACATT
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GACAAAAGACAAGTGTCAAAAGAAAGAGGGGAGAAGCTAGCAATTGACTATGGGATTAAATTCTTGGAGACAAGCGCAAAATCCAGTGCA
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CATCAGTGTTAGCCTTTCCCTATTTCAGCACAATCTTAGACTCATATTTGCACACTTTTGTGTCGTGAAGTTCTAGACAAATTTGTACAT
GTGGCAATGTTAAAAGAGCATTTACAGCAGAGGTTAATATACTAAAATTAAAGGGTATTTGGTCTGGTTCATATGGTCAAATATTACTGC
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CCATGTTTGACTTAAGTGTAATCACTCTTAAGTAATATTTGAACATTATTATCTGTTTCTATTTGTGAACTTCTTGAGCTGAAATTTTAC
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GAACAGGAGATGGCAGTGGAAAGGGATTGCTTGTTACCACAGAGAATTCTCTTCAAATTAAGATATGTCATTAGAATGCTTGGACCAGTC
AATCTTTTGTACTTATTTGAAAATATAGGAACAATTTAGCAGCTGCAAATATGCCCAAGCTATTTTTAATAGATATACTAAACTTATTGT
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TTCCGTGATTGAAAGTTTATTGTAATTCTACTATCTTCAAATTAGATACATTTTCAAAAGGAAAAGATAATTTTTTAGAAACATCTTAAT
ATTCACTATTTCCTGAAAAAATCCAAGCAGTTAACGCTTTCTGGATGGTAACAAAGTACCTTCTAAAAGATAAGTGCTATGACACCATGT
ATGAATGTAATTCTCTTAGTAATTTACCTCTGACTATTTGGTGTCTTAACGCTTTGGTTTATATAATCTCAGGGGTTGTCTGCAAACCAA
AACTGACATATTCTGTGGTTAGCTTTTATTACTTTTTTTTTTAACAGAATGCTTTGCTTTGGTTATATTTCTTCTTTCTTCTTTTGTCTT
ATATGGATTAATAACTAGTCTCCATGAACTTCACTTGAAAGAGCCTGTAAAAGTTAGATGAGTCTAAAAGTGCTCTTTGAAGTAGCAGCA
AATTGGGAGTATATGCTCTGTTATATAGAAATAAATTGTCCTTGCTATTTTCTTACATTTAGCTTTGCTAGATTGTATATACATTGAGCT
AAGACCTTAGGAAATTCACTTTCTGCATGATAAAATGACCCAATAAATATTCCACTTTGCTTAATAATGTACATACAGTGCATTATTTTT
TCTATTTGTAGATGAATTTAATGACAGATAATTGTCTGTTCCCCGCTGAAACTGAAGAAATCTAGTTTTTTTGTGAACATTTTTGTGGTC
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AGGGTTTCTTACTATTTACAGAAACATTTTGTGCAGTCTTTGTTATAAATTTTCAGAAGACTATACTCTTTACTTTGAAGGTCTATTTTT
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Fusion Gene PPI Analysis for USP3-RAB8B


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for USP3-RAB8B


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for USP3-RAB8B


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource