FusionNeoAntigen Logo

Home

Download

Statistics

Examples

Help

Contact

Terms of Use

Center for Computational Systems Medicine
check button Predicted full-length fusion amino acid sequences. For individual full-length fusion transcript sequence from FusionPDB, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among all the predicted ones.
>FusionGDB ID_FusionGDB isoform ID_FGname_Hgene_Hchr_Hbp_Henst_Tgene_Tchr_Tbp_Tenst_length(fusion AA) seq_BP

>52753_52753_1_MED26-ZNF99_MED26_chr19_16738682_ENST00000263390_ZNF99_chr19_22952126_ENST00000397104_length(amino acids)=1040AA_BP=184
MTAAPASPQQIRDRLLQAIDPQSNGSLTFWDVTIEFALEEWQCLDMAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKLDLITCLKQGKEPWNMKR
HEMVTKPPVISSHFTQDFWPDQSIKDSFQEIILRTYARCGHKNLRLRKDCESVNEGKMHEEAYNKLNQCWTTTQGKIFQCNKYVKVFHKY
SNSNRYKIIHTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAIHTGEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHQIIHTGKKPYKCEECGKAFSQSSTLRKH
EIIHTEEKPYKYEECGKAFSNLSALRKHEIIHTGQKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKCEECGKAFKRFSALRKHKIIHTG
KQPYKCEECSKAFSNFSALRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHMEEKPCKCEECGKAFKHFSALRKHKIIHTGKKPYKC
EECGKAFNNSSTLMKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAIHTGEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHQIIHTGKKPYKCEECGKA
FSQSSTLRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSHLTRHKVIHTEEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFSQSST
LRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKCEECGKAFKHFSALRKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNNSSTLRKHEI
IHTGEKSYKCEECALRKHEIIHTGKKPYKCEECGKAFNNSSTLRKHKIIYTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAVHTGEKPYKCGECG
KAFNNSSTLKKHKLIHTREKSYKCEECGKAFSNFSALRKHKIIHTGEKPYKCEECECGKAFNNSSTLMKHKIIHTGEKPYKCEECGKGFN
NFSTLMKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSHLTKHKSIHTGEKPYKCEERGKAFSHFSRLTKHRIIHTGKKPYKCEECGEKPYKCEECG

--------------------------------------------------------------

>52753_52753_2_MED26-ZNF99_MED26_chr19_16738682_ENST00000263390_ZNF99_chr19_22952126_ENST00000596209_length(amino acids)=888AA_BP=186
MTAAPASPQQIRDRLLQAIDPQSNGSLTFWDVTIEFALEEWQCLDMAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKLDLITCLKQGKEPWNMKR
HEMVTKPPVISSHFTQDFWPDQSIKDSFQEIILRTYARCGHKNLRLRKDCESVNEGKMHEEAYNKLNQCWTTTQGKIFQCNKYVKVFHKY
SNSNRYKIRHTKKKTFKCMKCSKSFFMLSHLIQHKRIHTRENIYKCEERGKAFKWFSTLIKHKIIHTEDKPYKYKKCGKAFNISSMFTKC
KIIHTGKKPCKCEECGKVFNNSSTLMKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAIHTGEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHQIIHTG
KKPYKCEECGKAFSQSSTLRKHEIIHTEEKPYKYEECGKAFSNLSALRKHEIIHTGQKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKC
EECGKAFKRFSALRKHKIIHTGKQPYKCEECSKAFSNFSALRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHMEEKPCKCEECGKA
FKHFSALRKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNNSSTLMKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAIHTGEKPYKCEECGKAFNHFSA
LRKHQIIHTGKKPYKCEECGKAFSQSSTLRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSHLTRHKVIHTEEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHKI
IHTGKKPYKCEECGKAFSQSSTLRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKCEECGKAFKHFSALRKHKIIHTGKK

--------------------------------------------------------------

>52753_52753_3_MED26-ZNF99_MED26_chr19_16738683_ENST00000263390_ZNF99_chr19_22952126_ENST00000397104_length(amino acids)=1040AA_BP=184
MTAAPASPQQIRDRLLQAIDPQSNGSLTFWDVTIEFALEEWQCLDMAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKLDLITCLKQGKEPWNMKR
HEMVTKPPVISSHFTQDFWPDQSIKDSFQEIILRTYARCGHKNLRLRKDCESVNEGKMHEEAYNKLNQCWTTTQGKIFQCNKYVKVFHKY
SNSNRYKIIHTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAIHTGEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHQIIHTGKKPYKCEECGKAFSQSSTLRKH
EIIHTEEKPYKYEECGKAFSNLSALRKHEIIHTGQKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKCEECGKAFKRFSALRKHKIIHTG
KQPYKCEECSKAFSNFSALRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHMEEKPCKCEECGKAFKHFSALRKHKIIHTGKKPYKC
EECGKAFNNSSTLMKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAIHTGEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHQIIHTGKKPYKCEECGKA
FSQSSTLRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSHLTRHKVIHTEEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFSQSST
LRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKCEECGKAFKHFSALRKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNNSSTLRKHEI
IHTGEKSYKCEECALRKHEIIHTGKKPYKCEECGKAFNNSSTLRKHKIIYTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAVHTGEKPYKCGECG
KAFNNSSTLKKHKLIHTREKSYKCEECGKAFSNFSALRKHKIIHTGEKPYKCEECECGKAFNNSSTLMKHKIIHTGEKPYKCEECGKGFN
NFSTLMKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSHLTKHKSIHTGEKPYKCEERGKAFSHFSRLTKHRIIHTGKKPYKCEECGEKPYKCEECG

--------------------------------------------------------------

>52753_52753_4_MED26-ZNF99_MED26_chr19_16738683_ENST00000263390_ZNF99_chr19_22952126_ENST00000596209_length(amino acids)=888AA_BP=186
MTAAPASPQQIRDRLLQAIDPQSNGSLTFWDVTIEFALEEWQCLDMAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKLDLITCLKQGKEPWNMKR
HEMVTKPPVISSHFTQDFWPDQSIKDSFQEIILRTYARCGHKNLRLRKDCESVNEGKMHEEAYNKLNQCWTTTQGKIFQCNKYVKVFHKY
SNSNRYKIRHTKKKTFKCMKCSKSFFMLSHLIQHKRIHTRENIYKCEERGKAFKWFSTLIKHKIIHTEDKPYKYKKCGKAFNISSMFTKC
KIIHTGKKPCKCEECGKVFNNSSTLMKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAIHTGEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHQIIHTG
KKPYKCEECGKAFSQSSTLRKHEIIHTEEKPYKYEECGKAFSNLSALRKHEIIHTGQKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKC
EECGKAFKRFSALRKHKIIHTGKQPYKCEECSKAFSNFSALRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHMEEKPCKCEECGKA
FKHFSALRKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNNSSTLMKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAIHTGEKPYKCEECGKAFNHFSA
LRKHQIIHTGKKPYKCEECGKAFSQSSTLRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSHLTRHKVIHTEEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHKI
IHTGKKPYKCEECGKAFSQSSTLRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKCEECGKAFKHFSALRKHKIIHTGKK

--------------------------------------------------------------