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Fusion Gene Summary | |
Fusion Gene ORF analysis | |
Fusion Genomic Features | |
Fusion Protein Features | |
Fusion Gene Sequence | |
Fusion Gene PPI analysis | |
Related Drugs | |
Related Diseases |
Fusion gene:EWSR1-SP3 (FusionGDB2 ID:HG2130TG6670) |
Fusion Gene Summary for EWSR1-SP3 |
Fusion gene summary |
Fusion gene information | Fusion gene name: EWSR1-SP3 | Fusion gene ID: hg2130tg6670 | Hgene | Tgene | Gene symbol | EWSR1 | SP3 | Gene ID | 2130 | 6670 |
Gene name | EWS RNA binding protein 1 | Sp3 transcription factor | |
Synonyms | EWS|EWS-FLI1|bK984G1.4 | SPR2 | |
Cytomap | ('EWSR1')('SP3') 22q12.2 | 2q31.1 | |
Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
Description | RNA-binding protein EWSEWS RNA-binding protein variant 6Ewing sarcoma breakpoint region 1Ewings sarcoma EWS-Fli1 (type 1) oncogene | transcription factor Sp3GC-binding transcription factor Sp3specificity protein 3 | |
Modification date | 20200329 | 20200313 | |
UniProtAcc | Q01844 | Q02447 | |
Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000331029, ENST00000332035, ENST00000332050, ENST00000333395, ENST00000397938, ENST00000406548, ENST00000414183, | ||
Fusion gene scores | * DoF score | 44 X 91 X 16=64064 | 6 X 5 X 4=120 |
# samples | 98 | 6 | |
** MAII score | log2(98/64064*10)=-6.03058831983342 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | log2(6/120*10)=-1 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | |
Context | PubMed: EWSR1 [Title/Abstract] AND SP3 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
Most frequent breakpoint | |||
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event. |
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
Tgene | SP3 | GO:0006355 | regulation of transcription, DNA-templated | 12560508 |
Tgene | SP3 | GO:0045893 | positive regulation of transcription, DNA-templated | 12771217 |
Fusion gene information from two resources (ChiTars 5.0 and ChimerDB 4.0) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
Source | Disease | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
ChimerKB3 | . | . | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
ChimerKB3 | . | . | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
Top |
Fusion Gene ORF analysis for EWSR1-SP3 |
Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
5CDS-intron | ENST00000331029 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
5CDS-intron | ENST00000332035 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
5CDS-intron | ENST00000332035 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
5CDS-intron | ENST00000332050 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
5CDS-intron | ENST00000333395 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
5CDS-intron | ENST00000397938 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
5CDS-intron | ENST00000397938 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
5CDS-intron | ENST00000406548 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
5CDS-intron | ENST00000406548 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
5CDS-intron | ENST00000414183 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
5CDS-intron | ENST00000414183 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000331029 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000331029 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000331029 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000332035 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000332035 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000332035 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000332035 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000332035 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000332035 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000332050 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000332050 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000332050 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000333395 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000333395 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000333395 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000397938 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000397938 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000397938 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000397938 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000397938 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000397938 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000406548 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000406548 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000406548 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000406548 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000406548 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000406548 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000414183 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000414183 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000414183 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000414183 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000414183 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
In-frame | ENST00000414183 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-3CDS | ENST00000331029 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-3CDS | ENST00000331029 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-3CDS | ENST00000331029 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-3CDS | ENST00000332050 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-3CDS | ENST00000332050 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-3CDS | ENST00000332050 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-3CDS | ENST00000333395 | ENST00000310015 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-3CDS | ENST00000333395 | ENST00000418194 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-3CDS | ENST00000333395 | ENST00000455789 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-intron | ENST00000331029 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-intron | ENST00000332050 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
intron-intron | ENST00000333395 | ENST00000483084 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | SP3 | chr2 | 174783513 | - |
ORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. |
Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand | Seq length (transcript) | BP loci (transcript) | Predicted start (transcript) | Predicted stop (transcript) | Seq length (amino acids) |
ENST00000332050 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5310 | 1121 | 328 | 1827 | 499 |
ENST00000332050 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5310 | 1121 | 328 | 1827 | 499 |
ENST00000332050 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 3239 | 1121 | 328 | 1827 | 499 |
ENST00000397938 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5301 | 1112 | 319 | 1818 | 499 |
ENST00000397938 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5301 | 1112 | 319 | 1818 | 499 |
ENST00000397938 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 3230 | 1112 | 319 | 1818 | 499 |
ENST00000406548 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5046 | 857 | 64 | 1563 | 499 |
ENST00000406548 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5046 | 857 | 64 | 1563 | 499 |
ENST00000406548 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 2975 | 857 | 64 | 1563 | 499 |
ENST00000331029 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5028 | 839 | 46 | 1545 | 499 |
ENST00000331029 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5028 | 839 | 46 | 1545 | 499 |
ENST00000331029 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 2957 | 839 | 46 | 1545 | 499 |
ENST00000414183 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5021 | 832 | 21 | 1538 | 505 |
ENST00000414183 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5021 | 832 | 21 | 1538 | 505 |
ENST00000414183 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 2950 | 832 | 21 | 1538 | 505 |
ENST00000333395 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5001 | 812 | 19 | 1518 | 499 |
ENST00000333395 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5001 | 812 | 19 | 1518 | 499 |
ENST00000333395 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 2930 | 812 | 19 | 1518 | 499 |
ENST00000332035 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 4825 | 636 | 11 | 1342 | 443 |
ENST00000332035 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 4825 | 636 | 11 | 1342 | 443 |
ENST00000332035 | EWSR1 | chr22 | 29683123 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 2754 | 636 | 11 | 1342 | 443 |
ENST00000397938 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5520 | 1331 | 319 | 2037 | 572 |
ENST00000397938 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5520 | 1331 | 319 | 2037 | 572 |
ENST00000397938 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 3449 | 1331 | 319 | 2037 | 572 |
ENST00000406548 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5262 | 1073 | 64 | 1779 | 571 |
ENST00000406548 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5262 | 1073 | 64 | 1779 | 571 |
ENST00000406548 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 3191 | 1073 | 64 | 1779 | 571 |
ENST00000414183 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5237 | 1048 | 21 | 1754 | 577 |
ENST00000414183 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5237 | 1048 | 21 | 1754 | 577 |
ENST00000414183 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 3166 | 1048 | 21 | 1754 | 577 |
ENST00000332035 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000455789 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5044 | 855 | 11 | 1561 | 516 |
ENST00000332035 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000310015 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 5044 | 855 | 11 | 1561 | 516 |
ENST00000332035 | EWSR1 | chr22 | 29687588 | + | ENST00000418194 | SP3 | chr2 | 174783513 | - | 2973 | 855 | 11 | 1561 | 516 |
DeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated. |
Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand | No-coding score | Coding score |
Top |
Fusion Genomic Features for EWSR1-SP3 |
FusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints. |
Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand | 1-p | p (fusion gene breakpoint) |
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Fusion Protein Features for EWSR1-SP3 |
Four levels of functional features of fusion genes Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr22:/chr2:) - FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels. - How to search 1. Put your fusion gene symbol. 2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled. 4. Go down and press 'Search' tab twice. 4. Go down to have the hyperlink of the search result. 5. Click the hyperlink. 6. See the FGviewer result for your fusion gene. |
Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
Hgene | Tgene |
EWSR1 | SP3 |
FUNCTION: Might normally function as a transcriptional repressor. EWS-fusion-proteins (EFPS) may play a role in the tumorigenic process. They may disturb gene expression by mimicking, or interfering with the normal function of CTD-POLII within the transcription initiation complex. They may also contribute to an aberrant activation of the fusion protein target genes. | FUNCTION: Transcriptional factor that can act as an activator or repressor depending on isoform and/or post-translational modifications. Binds to GT and GC boxes promoter elements. Competes with SP1 for the GC-box promoters. Weak activator of transcription but can activate a number of genes involved in different processes such as cell-cycle regulation, hormone-induction and house-keeping. {ECO:0000269|PubMed:10391891, ECO:0000269|PubMed:11812829, ECO:0000269|PubMed:12419227, ECO:0000269|PubMed:12837748, ECO:0000269|PubMed:15247228, ECO:0000269|PubMed:15494207, ECO:0000269|PubMed:15554904, ECO:0000269|PubMed:16781829, ECO:0000269|PubMed:17548428, ECO:0000269|PubMed:18187045, ECO:0000269|PubMed:18617891, ECO:0000269|PubMed:9278495}. |
Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
Top |
Fusion Gene Sequence for EWSR1-SP3 |
For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones. |
>27857_27857_1_EWSR1-SP3_EWSR1_chr22_29683123_ENST00000331029_SP3_chr2_174783513_ENST00000310015_length(transcript)=5028nt_BP=839nt GCGAGAGGGAGACGGACGTTGAGAGAACGAGGAGGAAGGAGAGAAAATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCA GCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCCCACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGG ACAGCCCACTGATGTCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCCAC TGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGT CACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGC ACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATA TGGACAGAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTA TTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAG CTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAG CCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAATATTAGGATCAAGGAAGAAGAACCTGATCCTGAAGAGTGGCAGCTCAGTGGTGATTCTAC CTTGAATACCAATGACCTAACACACTTAAGAGTACAGGTGGTAGATGAAGAAGGGGACCAACAACATCAAGAAGGAAAAAGACTTCGGAG GGTAGCTTGCACCTGTCCCAACTGTAAAGAAGGTGGTGGAAGAGGTACCAATCTTGGGAAAAAGAAGCAACACATTTGTCATATACCAGG ATGTGGTAAAGTCTATGGGAAGACCTCACATCTGAGAGCTCATCTGCGTTGGCATTCTGGAGAACGCCCTTTTGTTTGTAACTGGATGTA CTGTGGTAAAAGATTTACTCGAAGTGATGAATTACAGAGGCACAGAAGAACACATACAGGTGAGAAGAAATTTGTTTGTCCAGAATGTTC AAAACGCTTTATGAGAAGTGACCACCTTGCCAAACATATTAAAACACACCAGAATAAAAAAGGTATTCACTCTAGCAGTACAGTGCTGGC ATCTGTGGAAGCTGCGCGAGATGATACTTTGATTACTGCAGGAGGAACAACGCTTATCCTTGCAAATATTCAACAAGGTTCTGTTTCAGG GATAGGAACTGTTAATACTTCCGCCACCAGCAATCAAGATATCCTTACCAACACTGAAATACCTTTACAGCTTGTCACAGTTTCTGGAAA TGAGACAATGGAGTAAATATTACACAAATACTTATTCATTGTGGTTATTTTTATACAGTAGTGAGAAGAATATTGTTCCTAAGTTCTTAG ATATCTTTTTATTGATGTGCAAAAATTTTTGGATTGACAGTAACTTGGTTATACATGACACTGAAATGCCTTACTTTGTATGATATTCCA TAGTATATTAAAAATGGTAAAATTGCATGGGTTTTGTAGGTACTTTTGGAATCTAGAAGAAATGAAATTTTACCAAGTTATATAAAGAGA AAATTGAATTTAACAATGCGAATGGTAGTCTAACCAAATGCATCAATCCTGTGTGGTTTAGTGTAAAAATGAGAACATGTTGGTATTTAT CTATTGTAAGATAAAAAAGCTGGTGGGTGAAAGAAATCATGTTATGATAAAAAATTTTGTAATTTTCTTGATGACTGGAATTTTTATTAT GCATAACTGACAAATCAAGTTTCCAAGCAAATGTTACATAGTGTAGGCTTTACTTAGCTTATCAATTTGTCATTTTGAAGCTAATTATTT TAATTAGGTTAACTATGTACAATATTTTAAGCATTACTCTTGTAAGATTTTGAAAACTACATTTTAACATGGAACTCTAGGGATAGTCAC CTTTTAAATCCTGTTGAAAAGCCATGTTTAAGATTTAATTTGCCAAAATAATGTCTTGTTAATATTCTTTCAATAACGAAGTTGGGCAAT ATAACCAATGTTTAAAAAAGTTTAAAATGTATAAGTTGAGGCATTTGGGTGGTAAGAGAATGTTATAGTGAATTATCCCTTTTCTTGACT ATTGGAGGACCAAAAAAATAAGGTGTATTGCGTCTTAGCAGTGATTTTTATCCAATCTTGTTTCCAAAAACCATGTCTCCCAGGGCCTTA AAAGCCATCATGTAAATTACCAGTAAAGTGTAACATATGCAAACATAACAAAATCACTTCCATAGTGACGATACTCCAACCATATGGATA TTAGTCATAGAAGAACTAGAGGTTTTATGATATTTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTGTCTAGGTAGTCAGTCTGCACTTAAATATCAATC ATTTTCCTTTTTTGCTTCTTCCCTTAAAATTTATATGTATCCAGTACATTTAATTGAGAAGCGTATGTTTTTTATTATGCTGTATTTTCT TTTTATTTTTTAATTATTGTTTATATTTTCAATTCAAAAATGTACAAAATAAAGTTACATTGCTGGTCTTGTAAGAGCTATACAGTTTTC CTAAATGTATACCTGTAACTGCAGCAGTTCACCTATTTCAAAAATTTGGAATTCTGTTCATTTGTTATTCTTAAGACCACCTCAAATTTA AAGGCTACCTTATTGTACGTTTAAAGTGTATTATAACAGTGTGGTAGTTAATAAAACACTATTTTTTTTTCTTTTGAGTTTGTTGTATTC CTATGCATAAAAAATATTGCAGTGGTATGGGGTAAGAATTGGTGGTTTATTTTTCTTCAACTTGGCTTTTTATTTTTAGATTCTTGATTT TAGACACTGAATTGTAAACAGGCATTTATTTGAAGAAGAGATATATAGAGACACTGGTCATTTACTAATTTTTTACCTAGAGTAAATAAG AATGAGCTTATTAAATAAAATTTTTGAAAAAAAGTCTTAGCCCTTAGCCCACATTGATTCATATCAGTTTTATCAGTACCATTTTGCAAT TTTTTTGTTTTCCGTTTTAAAGCAATGCAGAATATTTTGATTTATCGAAAACCTGAATTTACATTAAGACTCCTGAAAATGATAAGACAA GCGTTGGTAACCATGGCAGGAGTTACTTGAAAAAGTTGCCTTTGAATTTGCATGTGTTTCATCATTATAAAGGCAGAGTAGGAGGAAAGA GTATTAATGTGATTGTGTATTGTAGATGTTTTAAAGTAAAAATCAAGTTTCTTAACACATGTATACAGTGGGGGTAAAGATGTCCATTTT CTGTTTTCCAGGCCCAGTCTGACTCTGTCTGTAATACCTGATTGCATTGGAGAACTCTAGACACGCATAAACATGGACAGTTTTTCTAAA TGTGAGACTTAAGCCTGTGATGTAAAATAGGAAGTTCTACTTGGAATAATATAAAGGAACCACTAGAATTTACAATTATTTTGAAGTTAC AGGGATTAGATTTTGAATCTTAAAATCCTTTAGGTAATTTTTAGAATTTTTAAATTAAGATTAATGTGAAGAGAATTAAGTGAGCAGCAG GTGGTTCACTTGAGCAAACTGCCCATTAAGTCAGATTAAACCATTTGAATGATAGTAGAGATGTTTTAAGTAATACTGGATTTTTACAGT AAGTTTATGGTGTACTTTGAATCGATAGGTGTCCATGCATATTTTATGAATTCGTGGAGAATGAATGCAATGAAGAAAGTAAGTAGTCTT GAAAATTATTTAAATAAAGTTGTAGATTTTTTTAGTGCCCCCTAGGAATATATTAGTGAACTTTGGAACTTTTACCAAAGTTATGTAACC TCAGTGTAGATAATTTTAAATATTTCTATTTTTATATTTTAAAATGTTGAATATACTCTGGAAACAACATTTGAAGATTTGCTCTGATGT CAACTTTTTCTGGTTATAAAACCTATTAGTATTGTGTATAATTCTCAGGGTAGGTATACTCTAATAGGTGTTTTGTCAATTGCTTTATTT TTGTAAAGGCTAGAGTTAGTGCATATTGAATATATTTATGTACAAATAATTCCTGTTGTAACATTTAGTGGACGCGATTATCTGTATACC TCAAATTTTAATTTAAGAAAGTATCACTTAAAGAGCATCTCATTTTCTATAGATTGAGGCTTAATTACTGAAAAGTGACTCAACCAAAAA GCACATAACCTTTTAAAGGAGCTACACCTACCGCAGAAAGTCAGATGCCCTGTAAATAACTTTGGTCTTTCAAAATAGTGGCAATGCTTA AGATACTTAAAAATACACATACATATAAGCTGAAAGCATGTCAAGCCTATTTCATAGAAAATAGTTCTTAAACAGTATTGTTCATTAGAA ATTGCTGGGGAGCATTTTAGAGATTCCATAGGCCTGGTAGCCACCTCAGCTTACTAAATCAACATCTCTGGAGATGGAGTGTATATGTGT TTTGAAACAGCTGCTCAAGTGGTTCTGTTAAACACTCCTGCGTTACAATCACTTAAAATAGAGCAAGCATCCCCTTAGGCTCTTAATTGT AGTTTAAATTCCAGTACTGCCTACTCAGACCCAAAAGTTTTGTTTTATGAAAAATTTGTATTGTGTTCAATATTGTTTGAAATTTGGGGT TGTTGCATAAATGATTATGGAATAACATTTGGTTTTAAAATAATATAAACTGACATGTTATGCTACCTGTTACACAATTTGGTTTTCAGT >27857_27857_1_EWSR1-SP3_EWSR1_chr22_29683123_ENST00000331029_SP3_chr2_174783513_ENST00000310015_length(amino acids)=499AA_BP=265 MASTDYSTYSQAAAQQGYSAYTAQPTQGYAQTTQAYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTGYTTPTAPQAYSQPV QGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPTRPQDGNKPTETSQPQSSTGGYNQPSLGYGQSNYSYPQVPGSYP MQPVTAPPSYPPTSYSSTQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQNIRIKE EEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHL RWHSGERPFVCNWMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGG -------------------------------------------------------------- >27857_27857_2_EWSR1-SP3_EWSR1_chr22_29683123_ENST00000331029_SP3_chr2_174783513_ENST00000418194_length(transcript)=2957nt_BP=839nt GCGAGAGGGAGACGGACGTTGAGAGAACGAGGAGGAAGGAGAGAAAATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCA GCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCCCACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGG ACAGCCCACTGATGTCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCCAC TGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGT CACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGC ACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATA TGGACAGAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTA TTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAG CTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAG CCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAATATTAGGATCAAGGAAGAAGAACCTGATCCTGAAGAGTGGCAGCTCAGTGGTGATTCTAC CTTGAATACCAATGACCTAACACACTTAAGAGTACAGGTGGTAGATGAAGAAGGGGACCAACAACATCAAGAAGGAAAAAGACTTCGGAG GGTAGCTTGCACCTGTCCCAACTGTAAAGAAGGTGGTGGAAGAGGTACCAATCTTGGGAAAAAGAAGCAACACATTTGTCATATACCAGG ATGTGGTAAAGTCTATGGGAAGACCTCACATCTGAGAGCTCATCTGCGTTGGCATTCTGGAGAACGCCCTTTTGTTTGTAACTGGATGTA CTGTGGTAAAAGATTTACTCGAAGTGATGAATTACAGAGGCACAGAAGAACACATACAGGTGAGAAGAAATTTGTTTGTCCAGAATGTTC AAAACGCTTTATGAGAAGTGACCACCTTGCCAAACATATTAAAACACACCAGAATAAAAAAGGTATTCACTCTAGCAGTACAGTGCTGGC ATCTGTGGAAGCTGCGCGAGATGATACTTTGATTACTGCAGGAGGAACAACGCTTATCCTTGCAAATATTCAACAAGGTTCTGTTTCAGG GATAGGAACTGTTAATACTTCCGCCACCAGCAATCAAGATATCCTTACCAACACTGAAATACCTTTACAGCTTGTCACAGTTTCTGGAAA TGAGACAATGGAGTAAATATTACACAAATACTTATTCATTGTGGTTATTTTTATACAGTAGTGAGAAGAATATTGTTCCTAAGTTCTTAG ATATCTTTTTATTGATGTGCAAAAATTTTTGGATTGACAGTAACTTGGTTATACATGACACTGAAATGCCTTACTTTGTATGATATTCCA TAGTATATTAAAAATGGTAAAATTGCATGGGTTTTGTAGGTACTTTTGGAATCTAGAAGAAATGAAATTTTACCAAGTTATATAAAGAGA AAATTGAATTTAACAATGCGAATGGTAGTCTAACCAAATGCATCAATCCTGTGTGGTTTAGTGTAAAAATGAGAACATGTTGGTATTTAT CTATTGTAAGATAAAAAAGCTGGTGGGTGAAAGAAATCATGTTATGATAAAAAATTTTGTAATTTTCTTGATGACTGGAATTTTTATTAT GCATAACTGACAAATCAAGTTTCCAAGCAAATGTTACATAGTGTAGGCTTTACTTAGCTTATCAATTTGTCATTTTGAAGCTAATTATTT TAATTAGGTTAACTATGTACAATATTTTAAGCATTACTCTTGTAAGATTTTGAAAACTACATTTTAACATGGAACTCTAGGGATAGTCAC CTTTTAAATCCTGTTGAAAAGCCATGTTTAAGATTTAATTTGCCAAAATAATGTCTTGTTAATATTCTTTCAATAACGAAGTTGGGCAAT ATAACCAATGTTTAAAAAAGTTTAAAATGTATAAGTTGAGGCATTTGGGTGGTAAGAGAATGTTATAGTGAATTATCCCTTTTCTTGACT ATTGGAGGACCAAAAAAATAAGGTGTATTGCGTCTTAGCAGTGATTTTTATCCAATCTTGTTTCCAAAAACCATGTCTCCCAGGGCCTTA AAAGCCATCATGTAAATTACCAGTAAAGTGTAACATATGCAAACATAACAAAATCACTTCCATAGTGACGATACTCCAACCATATGGATA TTAGTCATAGAAGAACTAGAGGTTTTATGATATTTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTGTCTAGGTAGTCAGTCTGCACTTAAATATCAATC ATTTTCCTTTTTTGCTTCTTCCCTTAAAATTTATATGTATCCAGTACATTTAATTGAGAAGCGTATGTTTTTTATTATGCTGTATTTTCT TTTTATTTTTTAATTATTGTTTATATTTTCAATTCAAAAATGTACAAAATAAAGTTACATTGCTGGTCTTGTAAGAGCTATACAGTTTTC CTAAATGTATACCTGTAACTGCAGCAGTTCACCTATTTCAAAAATTTGGAATTCTGTTCATTTGTTATTCTTAAGACCACCTCAAATTTA >27857_27857_2_EWSR1-SP3_EWSR1_chr22_29683123_ENST00000331029_SP3_chr2_174783513_ENST00000418194_length(amino acids)=499AA_BP=265 MASTDYSTYSQAAAQQGYSAYTAQPTQGYAQTTQAYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTGYTTPTAPQAYSQPV QGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPTRPQDGNKPTETSQPQSSTGGYNQPSLGYGQSNYSYPQVPGSYP MQPVTAPPSYPPTSYSSTQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQNIRIKE EEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHL RWHSGERPFVCNWMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGG -------------------------------------------------------------- >27857_27857_3_EWSR1-SP3_EWSR1_chr22_29683123_ENST00000331029_SP3_chr2_174783513_ENST00000455789_length(transcript)=5028nt_BP=839nt GCGAGAGGGAGACGGACGTTGAGAGAACGAGGAGGAAGGAGAGAAAATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCA GCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCCCACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGG ACAGCCCACTGATGTCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCCAC TGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGT CACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGC ACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATA TGGACAGAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTA TTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAG CTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAG CCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAATATTAGGATCAAGGAAGAAGAACCTGATCCTGAAGAGTGGCAGCTCAGTGGTGATTCTAC CTTGAATACCAATGACCTAACACACTTAAGAGTACAGGTGGTAGATGAAGAAGGGGACCAACAACATCAAGAAGGAAAAAGACTTCGGAG GGTAGCTTGCACCTGTCCCAACTGTAAAGAAGGTGGTGGAAGAGGTACCAATCTTGGGAAAAAGAAGCAACACATTTGTCATATACCAGG ATGTGGTAAAGTCTATGGGAAGACCTCACATCTGAGAGCTCATCTGCGTTGGCATTCTGGAGAACGCCCTTTTGTTTGTAACTGGATGTA CTGTGGTAAAAGATTTACTCGAAGTGATGAATTACAGAGGCACAGAAGAACACATACAGGTGAGAAGAAATTTGTTTGTCCAGAATGTTC AAAACGCTTTATGAGAAGTGACCACCTTGCCAAACATATTAAAACACACCAGAATAAAAAAGGTATTCACTCTAGCAGTACAGTGCTGGC ATCTGTGGAAGCTGCGCGAGATGATACTTTGATTACTGCAGGAGGAACAACGCTTATCCTTGCAAATATTCAACAAGGTTCTGTTTCAGG GATAGGAACTGTTAATACTTCCGCCACCAGCAATCAAGATATCCTTACCAACACTGAAATACCTTTACAGCTTGTCACAGTTTCTGGAAA TGAGACAATGGAGTAAATATTACACAAATACTTATTCATTGTGGTTATTTTTATACAGTAGTGAGAAGAATATTGTTCCTAAGTTCTTAG ATATCTTTTTATTGATGTGCAAAAATTTTTGGATTGACAGTAACTTGGTTATACATGACACTGAAATGCCTTACTTTGTATGATATTCCA TAGTATATTAAAAATGGTAAAATTGCATGGGTTTTGTAGGTACTTTTGGAATCTAGAAGAAATGAAATTTTACCAAGTTATATAAAGAGA AAATTGAATTTAACAATGCGAATGGTAGTCTAACCAAATGCATCAATCCTGTGTGGTTTAGTGTAAAAATGAGAACATGTTGGTATTTAT CTATTGTAAGATAAAAAAGCTGGTGGGTGAAAGAAATCATGTTATGATAAAAAATTTTGTAATTTTCTTGATGACTGGAATTTTTATTAT GCATAACTGACAAATCAAGTTTCCAAGCAAATGTTACATAGTGTAGGCTTTACTTAGCTTATCAATTTGTCATTTTGAAGCTAATTATTT TAATTAGGTTAACTATGTACAATATTTTAAGCATTACTCTTGTAAGATTTTGAAAACTACATTTTAACATGGAACTCTAGGGATAGTCAC 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ACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACC ACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACA AGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAG AGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCT ACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGT CAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAG AGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGA CCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGG GGAGGAGGACGCGGTGGAATGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGATATTAGGATCAAGGAAGAAGAACCTGATCCT GAAGAGTGGCAGCTCAGTGGTGATTCTACCTTGAATACCAATGACCTAACACACTTAAGAGTACAGGTGGTAGATGAAGAAGGGGACCAA CAACATCAAGAAGGAAAAAGACTTCGGAGGGTAGCTTGCACCTGTCCCAACTGTAAAGAAGGTGGTGGAAGAGGTACCAATCTTGGGAAA AAGAAGCAACACATTTGTCATATACCAGGATGTGGTAAAGTCTATGGGAAGACCTCACATCTGAGAGCTCATCTGCGTTGGCATTCTGGA GAACGCCCTTTTGTTTGTAACTGGATGTACTGTGGTAAAAGATTTACTCGAAGTGATGAATTACAGAGGCACAGAAGAACACATACAGGT GAGAAGAAATTTGTTTGTCCAGAATGTTCAAAACGCTTTATGAGAAGTGACCACCTTGCCAAACATATTAAAACACACCAGAATAAAAAA GGTATTCACTCTAGCAGTACAGTGCTGGCATCTGTGGAAGCTGCGCGAGATGATACTTTGATTACTGCAGGAGGAACAACGCTTATCCTT GCAAATATTCAACAAGGTTCTGTTTCAGGGATAGGAACTGTTAATACTTCCGCCACCAGCAATCAAGATATCCTTACCAACACTGAAATA CCTTTACAGCTTGTCACAGTTTCTGGAAATGAGACAATGGAGTAAATATTACACAAATACTTATTCATTGTGGTTATTTTTATACAGTAG TGAGAAGAATATTGTTCCTAAGTTCTTAGATATCTTTTTATTGATGTGCAAAAATTTTTGGATTGACAGTAACTTGGTTATACATGACAC TGAAATGCCTTACTTTGTATGATATTCCATAGTATATTAAAAATGGTAAAATTGCATGGGTTTTGTAGGTACTTTTGGAATCTAGAAGAA ATGAAATTTTACCAAGTTATATAAAGAGAAAATTGAATTTAACAATGCGAATGGTAGTCTAACCAAATGCATCAATCCTGTGTGGTTTAG TGTAAAAATGAGAACATGTTGGTATTTATCTATTGTAAGATAAAAAAGCTGGTGGGTGAAAGAAATCATGTTATGATAAAAAATTTTGTA ATTTTCTTGATGACTGGAATTTTTATTATGCATAACTGACAAATCAAGTTTCCAAGCAAATGTTACATAGTGTAGGCTTTACTTAGCTTA TCAATTTGTCATTTTGAAGCTAATTATTTTAATTAGGTTAACTATGTACAATATTTTAAGCATTACTCTTGTAAGATTTTGAAAACTACA TTTTAACATGGAACTCTAGGGATAGTCACCTTTTAAATCCTGTTGAAAAGCCATGTTTAAGATTTAATTTGCCAAAATAATGTCTTGTTA ATATTCTTTCAATAACGAAGTTGGGCAATATAACCAATGTTTAAAAAAGTTTAAAATGTATAAGTTGAGGCATTTGGGTGGTAAGAGAAT GTTATAGTGAATTATCCCTTTTCTTGACTATTGGAGGACCAAAAAAATAAGGTGTATTGCGTCTTAGCAGTGATTTTTATCCAATCTTGT TTCCAAAAACCATGTCTCCCAGGGCCTTAAAAGCCATCATGTAAATTACCAGTAAAGTGTAACATATGCAAACATAACAAAATCACTTCC ATAGTGACGATACTCCAACCATATGGATATTAGTCATAGAAGAACTAGAGGTTTTATGATATTTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTGTCTA GGTAGTCAGTCTGCACTTAAATATCAATCATTTTCCTTTTTTGCTTCTTCCCTTAAAATTTATATGTATCCAGTACATTTAATTGAGAAG CGTATGTTTTTTATTATGCTGTATTTTCTTTTTATTTTTTAATTATTGTTTATATTTTCAATTCAAAAATGTACAAAATAAAGTTACATT GCTGGTCTTGTAAGAGCTATACAGTTTTCCTAAATGTATACCTGTAACTGCAGCAGTTCACCTATTTCAAAAATTTGGAATTCTGTTCAT TTGTTATTCTTAAGACCACCTCAAATTTAAAGGCTACCTTATTGTACGTTTAAAGTGTATTATAACAGTGTGGTAGTTAATAAAACACTA >27857_27857_32_EWSR1-SP3_EWSR1_chr22_29687588_ENST00000414183_SP3_chr2_174783513_ENST00000418194_length(amino acids)=577AA_BP=336 MASTDYSTYSQAAAQQGYSAYTAQPTQGYAQTTQAYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTVEGTSTGYTTPTAPQ AYSQPVQGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPTRPQDGNKPTETSQPQSSTGGYNQPSLGYGQSNYSYPQ VPGSYPMQPVTAPPSYPPTSYSSTQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQ SSFRQDHPSSMGVYGQESGGFSGPGENRSMSGPDNRGRGRGGFDRGGMSRGGRGGGRGGMGAGERGGFNKPGDIRIKEEEPDPEEWQLSG DSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCN WMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGS -------------------------------------------------------------- >27857_27857_33_EWSR1-SP3_EWSR1_chr22_29687588_ENST00000414183_SP3_chr2_174783513_ENST00000455789_length(transcript)=5237nt_BP=1048nt AACGAGGAGGAAGGAGAGAAAATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCC CAGCCCACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATGTCAGCTATACC CAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCCACTGTAGAAGGGACCAGTACAGGTTAT ACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACC ACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACA AGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAG AGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCT ACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGT CAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAG AGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGA CCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGG GGAGGAGGACGCGGTGGAATGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGATATTAGGATCAAGGAAGAAGAACCTGATCCT GAAGAGTGGCAGCTCAGTGGTGATTCTACCTTGAATACCAATGACCTAACACACTTAAGAGTACAGGTGGTAGATGAAGAAGGGGACCAA CAACATCAAGAAGGAAAAAGACTTCGGAGGGTAGCTTGCACCTGTCCCAACTGTAAAGAAGGTGGTGGAAGAGGTACCAATCTTGGGAAA AAGAAGCAACACATTTGTCATATACCAGGATGTGGTAAAGTCTATGGGAAGACCTCACATCTGAGAGCTCATCTGCGTTGGCATTCTGGA GAACGCCCTTTTGTTTGTAACTGGATGTACTGTGGTAAAAGATTTACTCGAAGTGATGAATTACAGAGGCACAGAAGAACACATACAGGT GAGAAGAAATTTGTTTGTCCAGAATGTTCAAAACGCTTTATGAGAAGTGACCACCTTGCCAAACATATTAAAACACACCAGAATAAAAAA GGTATTCACTCTAGCAGTACAGTGCTGGCATCTGTGGAAGCTGCGCGAGATGATACTTTGATTACTGCAGGAGGAACAACGCTTATCCTT GCAAATATTCAACAAGGTTCTGTTTCAGGGATAGGAACTGTTAATACTTCCGCCACCAGCAATCAAGATATCCTTACCAACACTGAAATA CCTTTACAGCTTGTCACAGTTTCTGGAAATGAGACAATGGAGTAAATATTACACAAATACTTATTCATTGTGGTTATTTTTATACAGTAG TGAGAAGAATATTGTTCCTAAGTTCTTAGATATCTTTTTATTGATGTGCAAAAATTTTTGGATTGACAGTAACTTGGTTATACATGACAC TGAAATGCCTTACTTTGTATGATATTCCATAGTATATTAAAAATGGTAAAATTGCATGGGTTTTGTAGGTACTTTTGGAATCTAGAAGAA ATGAAATTTTACCAAGTTATATAAAGAGAAAATTGAATTTAACAATGCGAATGGTAGTCTAACCAAATGCATCAATCCTGTGTGGTTTAG TGTAAAAATGAGAACATGTTGGTATTTATCTATTGTAAGATAAAAAAGCTGGTGGGTGAAAGAAATCATGTTATGATAAAAAATTTTGTA ATTTTCTTGATGACTGGAATTTTTATTATGCATAACTGACAAATCAAGTTTCCAAGCAAATGTTACATAGTGTAGGCTTTACTTAGCTTA TCAATTTGTCATTTTGAAGCTAATTATTTTAATTAGGTTAACTATGTACAATATTTTAAGCATTACTCTTGTAAGATTTTGAAAACTACA TTTTAACATGGAACTCTAGGGATAGTCACCTTTTAAATCCTGTTGAAAAGCCATGTTTAAGATTTAATTTGCCAAAATAATGTCTTGTTA ATATTCTTTCAATAACGAAGTTGGGCAATATAACCAATGTTTAAAAAAGTTTAAAATGTATAAGTTGAGGCATTTGGGTGGTAAGAGAAT GTTATAGTGAATTATCCCTTTTCTTGACTATTGGAGGACCAAAAAAATAAGGTGTATTGCGTCTTAGCAGTGATTTTTATCCAATCTTGT TTCCAAAAACCATGTCTCCCAGGGCCTTAAAAGCCATCATGTAAATTACCAGTAAAGTGTAACATATGCAAACATAACAAAATCACTTCC ATAGTGACGATACTCCAACCATATGGATATTAGTCATAGAAGAACTAGAGGTTTTATGATATTTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTGTCTA GGTAGTCAGTCTGCACTTAAATATCAATCATTTTCCTTTTTTGCTTCTTCCCTTAAAATTTATATGTATCCAGTACATTTAATTGAGAAG CGTATGTTTTTTATTATGCTGTATTTTCTTTTTATTTTTTAATTATTGTTTATATTTTCAATTCAAAAATGTACAAAATAAAGTTACATT GCTGGTCTTGTAAGAGCTATACAGTTTTCCTAAATGTATACCTGTAACTGCAGCAGTTCACCTATTTCAAAAATTTGGAATTCTGTTCAT TTGTTATTCTTAAGACCACCTCAAATTTAAAGGCTACCTTATTGTACGTTTAAAGTGTATTATAACAGTGTGGTAGTTAATAAAACACTA TTTTTTTTTCTTTTGAGTTTGTTGTATTCCTATGCATAAAAAATATTGCAGTGGTATGGGGTAAGAATTGGTGGTTTATTTTTCTTCAAC TTGGCTTTTTATTTTTAGATTCTTGATTTTAGACACTGAATTGTAAACAGGCATTTATTTGAAGAAGAGATATATAGAGACACTGGTCAT TTACTAATTTTTTACCTAGAGTAAATAAGAATGAGCTTATTAAATAAAATTTTTGAAAAAAAGTCTTAGCCCTTAGCCCACATTGATTCA TATCAGTTTTATCAGTACCATTTTGCAATTTTTTTGTTTTCCGTTTTAAAGCAATGCAGAATATTTTGATTTATCGAAAACCTGAATTTA CATTAAGACTCCTGAAAATGATAAGACAAGCGTTGGTAACCATGGCAGGAGTTACTTGAAAAAGTTGCCTTTGAATTTGCATGTGTTTCA TCATTATAAAGGCAGAGTAGGAGGAAAGAGTATTAATGTGATTGTGTATTGTAGATGTTTTAAAGTAAAAATCAAGTTTCTTAACACATG TATACAGTGGGGGTAAAGATGTCCATTTTCTGTTTTCCAGGCCCAGTCTGACTCTGTCTGTAATACCTGATTGCATTGGAGAACTCTAGA CACGCATAAACATGGACAGTTTTTCTAAATGTGAGACTTAAGCCTGTGATGTAAAATAGGAAGTTCTACTTGGAATAATATAAAGGAACC ACTAGAATTTACAATTATTTTGAAGTTACAGGGATTAGATTTTGAATCTTAAAATCCTTTAGGTAATTTTTAGAATTTTTAAATTAAGAT TAATGTGAAGAGAATTAAGTGAGCAGCAGGTGGTTCACTTGAGCAAACTGCCCATTAAGTCAGATTAAACCATTTGAATGATAGTAGAGA TGTTTTAAGTAATACTGGATTTTTACAGTAAGTTTATGGTGTACTTTGAATCGATAGGTGTCCATGCATATTTTATGAATTCGTGGAGAA TGAATGCAATGAAGAAAGTAAGTAGTCTTGAAAATTATTTAAATAAAGTTGTAGATTTTTTTAGTGCCCCCTAGGAATATATTAGTGAAC TTTGGAACTTTTACCAAAGTTATGTAACCTCAGTGTAGATAATTTTAAATATTTCTATTTTTATATTTTAAAATGTTGAATATACTCTGG AAACAACATTTGAAGATTTGCTCTGATGTCAACTTTTTCTGGTTATAAAACCTATTAGTATTGTGTATAATTCTCAGGGTAGGTATACTC TAATAGGTGTTTTGTCAATTGCTTTATTTTTGTAAAGGCTAGAGTTAGTGCATATTGAATATATTTATGTACAAATAATTCCTGTTGTAA CATTTAGTGGACGCGATTATCTGTATACCTCAAATTTTAATTTAAGAAAGTATCACTTAAAGAGCATCTCATTTTCTATAGATTGAGGCT TAATTACTGAAAAGTGACTCAACCAAAAAGCACATAACCTTTTAAAGGAGCTACACCTACCGCAGAAAGTCAGATGCCCTGTAAATAACT TTGGTCTTTCAAAATAGTGGCAATGCTTAAGATACTTAAAAATACACATACATATAAGCTGAAAGCATGTCAAGCCTATTTCATAGAAAA TAGTTCTTAAACAGTATTGTTCATTAGAAATTGCTGGGGAGCATTTTAGAGATTCCATAGGCCTGGTAGCCACCTCAGCTTACTAAATCA ACATCTCTGGAGATGGAGTGTATATGTGTTTTGAAACAGCTGCTCAAGTGGTTCTGTTAAACACTCCTGCGTTACAATCACTTAAAATAG AGCAAGCATCCCCTTAGGCTCTTAATTGTAGTTTAAATTCCAGTACTGCCTACTCAGACCCAAAAGTTTTGTTTTATGAAAAATTTGTAT TGTGTTCAATATTGTTTGAAATTTGGGGTTGTTGCATAAATGATTATGGAATAACATTTGGTTTTAAAATAATATAAACTGACATGTTAT GCTACCTGTTACACAATTTGGTTTTCAGTTTTAATTATATGAAGCTGGTAACAATCGTTTTTGTTGTAAAAGAATTATTTTTCACTAAAC >27857_27857_33_EWSR1-SP3_EWSR1_chr22_29687588_ENST00000414183_SP3_chr2_174783513_ENST00000455789_length(amino acids)=577AA_BP=336 MASTDYSTYSQAAAQQGYSAYTAQPTQGYAQTTQAYGQQSYGTYGQPTDVSYTQAQTTATYGQTAYATSYGQPPTVEGTSTGYTTPTAPQ AYSQPVQGYGTGAYDTTTATVTTTQASYAAQSAYGTQPAYPAYGQQPAATAPTRPQDGNKPTETSQPQSSTGGYNQPSLGYGQSNYSYPQ VPGSYPMQPVTAPPSYPPTSYSSTQPTSYDQSSYSQQNTYGQPSSYGQQSSYGQQSSYGQQPPTSYPPQTGSYSQAPSQYSQQSSSYGQQ SSFRQDHPSSMGVYGQESGGFSGPGENRSMSGPDNRGRGRGGFDRGGMSRGGRGGGRGGMGAGERGGFNKPGDIRIKEEEPDPEEWQLSG DSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCN WMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGS -------------------------------------------------------------- |
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Fusion Gene PPI Analysis for EWSR1-SP3 |
Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in |
Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
- Retained PPIs in in-frame fusion. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
- Lost PPIs in in-frame fusion. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
- Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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Related Drugs for EWSR1-SP3 |
Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08) |
Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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Related Diseases for EWSR1-SP3 |
Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |
Hgene | EWSR1 | C0553580 | Ewings sarcoma | 3 | CTD_human;ORPHANET |
Hgene | EWSR1 | C0002736 | Amyotrophic Lateral Sclerosis | 1 | GENOMICS_ENGLAND |
Hgene | EWSR1 | C0033578 | Prostatic Neoplasms | 1 | CTD_human |
Hgene | EWSR1 | C0206651 | Clear Cell Sarcoma of Soft Tissue | 1 | ORPHANET |
Hgene | EWSR1 | C0206663 | Neuroectodermal Tumor, Primitive | 1 | CTD_human |
Hgene | EWSR1 | C0279980 | Extra-osseous Ewing's sarcoma | 1 | ORPHANET |
Hgene | EWSR1 | C0334584 | Spongioblastoma | 1 | CTD_human |
Hgene | EWSR1 | C0334596 | Medulloepithelioma | 1 | CTD_human |
Hgene | EWSR1 | C0376358 | Malignant neoplasm of prostate | 1 | CTD_human |
Hgene | EWSR1 | C0700367 | Ependymoblastoma | 1 | CTD_human |
Hgene | EWSR1 | C0751675 | Cerebral Primitive Neuroectodermal Tumor | 1 | CTD_human |
Hgene | EWSR1 | C1275278 | Extraskeletal Myxoid Chondrosarcoma | 1 | ORPHANET |