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Fusion Gene Summary

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Fusion Gene ORF analysis

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Fusion Gene Sequence

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Fusion Gene PPI analysis

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Related Diseases

Fusion gene:ARPP19-MYO5A (FusionGDB2 ID:HG10776TG4644)

Fusion Gene Summary for ARPP19-MYO5A

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: ARPP19-MYO5A
Fusion gene ID: hg10776tg4644
HgeneTgene
Gene symbol

ARPP19

MYO5A

Gene ID

10776

4644

Gene namecAMP regulated phosphoprotein 19myosin VA
SynonymsARPP-16|ARPP-19|ARPP16|ENSALGS1|MYH12|MYO5|MYR12
Cytomap('ARPP19')('MYO5A')

15q21.2

15q21.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
DescriptioncAMP-regulated phosphoprotein 19cAMP-regulated phosphoprotein 19kDacyclic AMP phosphoprotein, 19 kDunconventional myosin-Vadilute myosin heavy chain, non-musclemyosin Vmyosin VA (heavy chain 12, myoxin)myosin, heavy polypeptide kinasemyosin-12myosin-Vamyoxin
Modification date2020031320200313
UniProtAcc

P56211

Q9Y4I1

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000561971, ENST00000567669, 
ENST00000569281, ENST00000249822, 
ENST00000564163, ENST00000566423, 
ENST00000569723, ENST00000561650, 
ENST00000563277, ENST00000563566, 
ENST00000565288, ENST00000568196, 
Fusion gene scores* DoF score2 X 2 X 3=1213 X 14 X 7=1274
# samples 313
** MAII scorelog2(3/12*10)=1.32192809488736
effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (eGinPCFGs).
DoF>8 and MAII>0		log2(13/1274*10)=-3.29278174922785
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: ARPP19 [Title/Abstract] AND MYO5A [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Most frequent breakpointARPP19(52861045)-MYO5A(52606400), # samples:2
ARPP19(52861045)-MYO5A(52615641), # samples:2
Anticipated loss of major functional domain due to fusion event.ARPP19-MYO5A seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a CGC by not retaining the major functional domain in the partially deleted in-frame ORF.
ARPP19-MYO5A seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a CGC by not retaining the major functional domain in the partially deleted in-frame ORF.
ARPP19-MYO5A seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a essential gene by not retaining the major functional domain in the partially deleted in-frame ORF.
ARPP19-MYO5A seems lost the major protein functional domain in Hgene partner, which is a essential gene by not retaining the major functional domain in the partially deleted in-frame ORF.
ARPP19-MYO5A seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a CGC due to the frame-shifted ORF.
ARPP19-MYO5A seems lost the major protein functional domain in Tgene partner, which is a essential gene due to the frame-shifted ORF.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneARPP19

GO:0045722

positive regulation of gluconeogenesis

9653196


check buttonFusion gene breakpoints across ARPP19 (5'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure
check buttonFusion gene breakpoints across MYO5A (3'-gene)
* Click on the image to open the UCSC genome browser with custom track showing this image in a new window.
all structure

check button Fusion gene information
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
SourceDiseaseSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChimerDB4BLCATCGA-DK-AA76-01AARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-
ChimerDB4BLCATCGA-DK-AA76ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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ChimerDB4BRCATCGA-C8-A1HI-01AARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-


Top

Fusion Gene ORF analysis for ARPP19-MYO5A

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
Frame-shiftENST00000561971ENST00000356338ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-
Frame-shiftENST00000561971ENST00000356338ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000561971ENST00000358212ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-
Frame-shiftENST00000561971ENST00000399231ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000561971ENST00000399231ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000561971ENST00000399233ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000567669ENST00000358212ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000567669ENST00000399231ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000567669ENST00000399233ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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Frame-shiftENST00000567669ENST00000399233ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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intron-3CDSENST00000563277ENST00000358212ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-MYO5Achr15

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intron-3CDSENST00000563277ENST00000399231ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

52615641

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intron-3CDSENST00000563277ENST00000399233ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

52606400

-
intron-3CDSENST00000563277ENST00000399233ARPP19chr15

52861045

-MYO5Achr15

52615641

-
intron-3CDSENST00000563277ENST00000553916ARPP19chr15

52861045

-MYO5Achr15

52606400

-
intron-3CDSENST00000563277ENST00000553916ARPP19chr15

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-MYO5Achr15

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-
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52861045

-MYO5Achr15

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-
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52861045

-MYO5Achr15

52615641

-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-MYO5Achr15

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-
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-
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-
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52861045

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-
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-MYO5Achr15

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-
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52606400

-
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52861045

-MYO5Achr15

52615641

-

check buttonORFfinder result based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandSeq length
(transcript)		BP loci
(transcript)		Predicted start
(transcript)		Predicted stop
(transcript)		Seq length
(amino acids)
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ENST00000566423ARPP19chr1552861045-ENST00000356338MYO5Achr1552606400-68231794771159
ENST00000566423ARPP19chr1552861045-ENST00000358212MYO5Achr1552606400-68211794771159
ENST00000566423ARPP19chr1552861045-ENST00000399233MYO5Achr1552606400-68211794771159
ENST00000566423ARPP19chr1552861045-ENST00000553916MYO5Achr1552606400-8051794771159
ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000399231MYO5Achr1552606400-69643176151205
ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000356338MYO5Achr1552606400-69613176151205
ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000358212MYO5Achr1552606400-69593176151205
ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000399233MYO5Achr1552606400-69593176151205
ENST00000249822ARPP19chr1552861045-ENST00000553916MYO5Achr1552606400-9433176151205
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ENST00000569723ARPP19chr1552861045-ENST00000358212MYO5Achr1552606400-67369432113663150
ENST00000569723ARPP19chr1552861045-ENST00000399233MYO5Achr1552606400-67369432113663150
ENST00000569723ARPP19chr1552861045-ENST00000553916MYO5Achr1552606400-720943920131
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ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000553916MYO5Achr1552606400-7941684662155
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ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000399231MYO5Achr1552615641-7514168331100355
ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000356338MYO5Achr1552615641-7511168331100355
ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000358212MYO5Achr1552615641-7509168331100355
ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000399233MYO5Achr1552615641-7509168331100355
ENST00000564163ARPP19chr1552861045-ENST00000553916MYO5Achr1552615641-1493168331100355

check buttonDeepORF prediction of the coding potential based on the fusion transcript sequence of in-frame fusion genes. DeepORF is a coding potential classifier based on convolutional neural network by comparing the real Ribo-seq data. If the no-coding score < 0.5 and coding score > 0.5, then the in-frame fusion transcript is predicted as being likely translated.
HenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrandNo-coding scoreCoding score
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ENST00000566423ENST00000399233ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.86732910.13267082
ENST00000566423ENST00000553916ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.0427104640.9572896
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ENST00000249822ENST00000356338ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.89759310.1024069
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ENST00000249822ENST00000399233ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.86142460.13857543
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ENST00000569723ENST00000356338ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.907998440.092001565
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ENST00000564163ENST00000399231ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.80248510.19751492
ENST00000564163ENST00000356338ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.900793970.09920603
ENST00000564163ENST00000358212ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.86562890.13437109
ENST00000564163ENST00000399233ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552606400-0.86562890.13437109
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ENST00000566423ENST00000356338ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0006389820.999361
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ENST00000566423ENST00000553916ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.0042760270.99572396
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ENST00000249822ENST00000356338ARPP19chr1552861045-MYO5Achr1552615641-0.000665780.99933416
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Fusion Genomic Features for ARPP19-MYO5A


check buttonFusionAI prediction of the potential fusion gene breakpoint based on the pre-mature RNA sequence context (+/- 5kb of individual partner genes, total 20kb length sequence). FusionAI is a fusion gene breakpoint classifier based on convolutional neural network by comparing the fusion positive and negative sequence context of ~ 20K fusion gene data. From here, we can have the relative potentency of the 20K genomic sequence how individual sequnce will be likely used as the gene fusion breakpoints.
HgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand1-pp (fusion gene breakpoint)

check buttonDistribution of 44 human genomic features loci across 20kb length fusion breakpoint regions. We integrated a total of 44 different types of human genomic feature loci information across five big categories including virus integration sites, repeats, structural variants, chromatin states, and gene expression regulation. More details are in help page.
genomic feature

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Fusion Protein Features for ARPP19-MYO5A


check button Four levels of functional features of fusion genes
Go to FGviewer search page for the most frequent breakpoint (https://ccsmweb.uth.edu/FGviewer/chr15:52861045/chr15:52606400)
- FGviewer provides the online visualization of the retention search of the protein functional features across DNA, RNA, protein, and pathological levels.
- How to search
1. Put your fusion gene symbol.
2. Press the tab key until there will be shown the breakpoint information filled.
4. Go down and press 'Search' tab twice.
4. Go down to have the hyperlink of the search result.
5. Click the hyperlink.
6. See the FGviewer result for your fusion gene.
FGviewer

check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
ARPP19

P56211

MYO5A

Q9Y4I1

FUNCTION: Protein phosphatase inhibitor that specifically inhibits protein phosphatase 2A (PP2A) during mitosis. When phosphorylated at Ser-62 during mitosis, specifically interacts with PPP2R2D (PR55-delta) and inhibits its activity, leading to inactivation of PP2A, an essential condition to keep cyclin-B1-CDK1 activity high during M phase. May indirectly enhance GAP-43 expression. {ECO:0000269|PubMed:21164014}.FUNCTION: Processive actin-based motor that can move in large steps approximating the 36-nm pseudo-repeat of the actin filament. Involved in melanosome transport. Also mediates the transport of vesicles to the plasma membrane. May also be required for some polarization process involved in dendrite formation. {ECO:0000269|PubMed:10448864}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page


* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneMYO5Achr15:52861045chr15:52615641ENST0000035633833401534_181015181829.0DomainDilute

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneMYO5Achr15:52861045chr15:52606400ENST0000035633837401338_144517511829.0Coiled coilOntology_term=ECO:0000255
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Fusion Gene Sequence for ARPP19-MYO5A


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. To have fusion amino acid sequence, we ran ORFfinder and chose the longest ORF among the all predicted ones.
>6828_6828_1_ARPP19-MYO5A_ARPP19_chr15_52861045_ENST00000249822_MYO5A_chr15_52606400_ENST00000356338_length(transcript)=6961nt_BP=317nt
GGAAAAAAGGAAGTGTTTGGACGACAGCGAGCGGGAGAAGCGGGGTCAAGTAGGTAGGGGTGCGGTGCGGGAGGGGCAGGCGGGCTCCGG
CGTGCGAGGGCCTTGGCCAGCGGAGCGTTTCGCGGCTCCGTGTCGTCATAAGGCGGCGGCCATTTTCGCGGGCGGAGGCGGCCCGGCGGG
CCCTGGGAGAGCTGGGACGGGCGGCGGCCGGGTGGCCTCGGCCACCCGCTAATTGCATCTTTTCCCGGCGTCTCGTCTGCAGAGGGAGCA
CTATGTCTGCGGAAGTCCCCGAGGCAGCCTCCGCGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAAGTGTTGAATTTGTATACTCCAGTTAATGAGTTTG
AAGAAAGAGTCTCTGTGTCGTTCATTCGTACTATACAGATGCGTTTACGAGACAGGAAAGACTCTCCCCAGCTGCTCATGGATGCTAAAC
ACATCTTTCCTGTCACCTTTCCTTTCAACCCATCTTCCCTCGCACTAGAAACCATCCAGATTCCAGCCAGCCTCGGCCTGGGCTTCATTT
CACGGGTCTGAAAGTGATGTCCAGGCAAAAATTGACAATACATTTCTTGCCCGAAATAAGAACCCATTATTTCCAGTGAGTTACTGAAAA
TACATTTTTAAAGAGAAAGTACTGATTATCTCCCAAATGAGAAGTCATTAACTGGAAATCTCCCTAGAATACTTTCATCACTTTGGAAAC
AAAGATAGGCTCTTTCGTGCTGTGTTATCTTTATAGCAACACTCATCCTTAACCAACTAGGTACCGTGAGTTTACATACAGGAGAATGAT
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AAAAAGTATAACTTCCATAGATGAGCTGTTGTTAGGAAGGCACCAAAGAACCTCCTCTGCACTAAACAGGAGAATGGAAAGAAAAGTCTC
CATTGAGTACATATCATGTCAGTTTAGTAATCAATTATGTTGATATTGTTAAACTGGTTCAAAGAAATAAACTGGCAATATGTAAAGTAA
TTCCTCATTTGTGTCACTATGATATAGAGATATTAAAGGAATGTTGGTTTGCTAAATAGTATAGATGTCCATTTGTACTATAGTTTACTG
AGCATTTTAAATTGCTGCTACATACTGTCTTCTTAAAATGTAAGTGATATTAGGCACTACAATAAGTTTCTCTTGTCAATTCTGTTTACA
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TGCTCATTAATTTTCCCTGGGTGGATATTGCGTCAGGGTACAGTGTTCTGTGAAGTGACTTATTTTTAACTACCAGATCTGATTCCTTCA
GTGCATATTTTCAACCTTGACAGGTTTTCTCTCTTCTTAATTTATTAAGAATTAATCTCGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCC
CAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGGGCGGATCACTTCAGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTA
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GGCGGAGATTGCAATGAGATCGAACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGAGAGACACTGCCTTGGAAAAAAAAAGAATCTCACTCAC
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GTTACTCAGTAAGTCCATTCTCTGATGGAAAGACCAGTGTGTAGTGCCTGTCAATTCCTTAGGATTAATCAAATGTAAAATCACAAGTTT
GTGTAGCTGTAACCTTTCTTAAATGTACATGATTTATGTACATGCTTTTAGAAGGTCCTACTATATTTGTATTATAATTAGTTTAAGTAA
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TTCCAGGGCTCCAGCTTCCTCCCAGGTCTACCCAGAGCTCCAGATGGGGGTCTGAATTAACCTCTCTTGGTGGCCTGGAGATTTTTAGTC
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TTCTTACTTCTCTGCATGCATTCCTTCAGAAGATCAGTCATCAACTTTTTCTTAATTCCTCTGTGACACACAATGGGAATTCAAAGGAAG
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CAGGTGCAGAAGCACAAAAACATATTCCGAAGCCAACTGATAGGGAATTTGGGGATTATTGTCAGTTTGGAGAATTTGCTGTGTTATTTC
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CGAGCAAGTGCTGCGTACCAAGTTACTTGTTTTAAGGAGACCAAGTGCTCAGCGCCAGGTGGTTTTCTTTTTTGTCATAGTTACTTGCTA
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AGGAGGGGTGTCGTGTGCATGCGCGTTGAAGAGGATCTGTATTGCCGTGACCTCTGTTCATGGATGAGTGCATTGTAATTTGTTCTCAGG
CTGTGCTGTGAGGGCCGCCTTAACCCTTGCTCCCTTCCCTTCTAGAGCTGCCTTAAGTTCTCCAGAACTTTTCTTCTGTAAAGGATATCT
TGCCTGGAAGGGATATCTTGCCCTGTTTCTCAAGGTTTTGTGAGAGTTTTGACTGGATGTGGCCCTGCATGACCCTCCTTCTCCTGTACT
TCCTCTTTCCTTTCCAAATGGGAATTAGAACTGTGGGGCAGCAACAGTCTCAGAGCCAGTGAGAGGCCAGCTTAGAGAATGCTTCTGAGT
TAGTGGGACTCTGTGTCACAAGTAAGCAAATGAATATATGAAAGAAATTATGGAGATAAGTTAGATTCTTGGTAATACTTAAATGTCTTG
CTTTCTACTAACCTTTTGTTACTAAAGGTAAAGGGTATAACTCAAACTTTTTGTGGACATTCTTTTCAAAATTTTTTAAGAACCCTGTAC
TATAAAAGGTTGAGTAAAAACAGGAAAGCGTGCTATAAGTTCAAATCTGTTGTATTACCCTAAATTAGATAAACCAACCTGAATTATAGT
AGATTTCTCAATAGATGAGGAACTGAAAAATACTATGTAAAATATCTTCCAAAATGCTTTTTATACTTTTTTTATTTGTAATTTGGTCTA
TCTAAAATGTTCGTTAGCTTAACTTAATGGGCGTTATTGGATTCATATGACTAACGTTTCCTCAGTATTGTAATGCTTGAAATATTTGAA
AGAAAAAATGTTGTTTTTTAGTTGAAACTGGTATATATAATTCAGTGCTTGGCAGGTTAGTATATTTTTATGCATTTTTCAGAGTCAGCA
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GATTTTGAAACCGTCTCCTTCTGGCTCTCTAACACATGCCGATTTTTGCACTGCTTGAAACAGTACAGTGGAGAAGAGGGCTTTATGAAG
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TCTGTTTACAATTCAATCAGATCACAGTTTTAACTGGATTATATGCAAATACCTACAGATTCACCTGCACAAGTAGCAGACACTGGAAAG
TCATGTAGTAATATGACAAAATGCTTGACATTTAGGGGTAGGATTAGACAAAGTGGCTATTGTTGATGTCATTATTTATTCAGGATGTAT
TACATTGATGTGCTCATTAATTTTCCCTGGGTGGATATTGCGTCAGGGTACAGTGTTCTGTGAAGTGACTTATTTTTAACTACCAGATCT
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GTCCTTGTTGTTCTTACTTCTCTGCATGCATTCCTTCAGAAGATCAGTCATCAACTTTTTCTTAATTCCTCTGTGACACACAATGGGAAT
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GAATTATAGTAGATTTCTCAATAGATGAGGAACTGAAAAATACTATGTAAAATATCTTCCAAAATGCTTTTTATACTTTTTTTATTTGTA
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TATTAGTTTTCATTAGAAACTCTGGTTCTGAATTACAATCATAGGTTATATAAATTTAACTGTTAGATGGTCTATAAATCTTATTAAAAT
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AGAGCTGCCTTAAGTTCTCCAGAACTTTTCTTCTGTAAAGGATATCTTGCCTGGAAGGGATATCTTGCCCTGTTTCTCAAGGTTTTGTGA
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AATACTGTCTGTTAATTTACATGGGCCTCAAGTTCCTCGTTTATAAAATAAGAGAGTTGGACACTGATTCTTAACATCTCCTCCACATTT
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GTGCCTGTCAATTCCTTAGGATTAATCAAATGTAAAATCACAAGTTTGTGTAGCTGTAACCTTTCTTAAATGTACATGATTTATGTACAT
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AAATGATTCTGTATACCATTTTCTTGAAGGTACAAGAAGATTCTGCCGACTATGGGGATCTTTGGGCCAGTTTGAGGATTGCTTTCCCTC
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AATCTGTTGTATTACCCTAAATTAGATAAACCAACCTGAATTATAGTAGATTTCTCAATAGATGAGGAACTGAAAAATACTATGTAAAAT
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GACACACAATGGGAATTCAAAGGAAGAGATCTTAAAAGTCACAACAGTTCTTTATCTTAATAATCCCCTCCCCATTCACCTTACTACATG
CAGACTCACCTCACACCCTTACAACTTGAAGCTGAAAATTTAAAAGTAATTTCCCTTTTTGCAGCTTTTCCTCAGGTTAAGGCTTTGATC
TGCCTGAGAGTAACTCTAAAAGGAGGGAAGATAAATATGGGATAAAATCCACAAAGTGTAGCTTCTAATTCCTTTGGAAGTTTAAAAAAT
TTCCACATATCTGATGCTTCTTTTGTCAGGTGCAGAAGCACAAAAACATATTCCGAAGCCAACTGATAGGGAATTTGGGGATTATTGTCA
GTTTGGAGAATTTGCTGTGTTATTTCTTCATTTCCATGGATAGCTCATAGTTGGCTCTTTCTGGGTGAGTAATTATGTGTAATATAGATC
AAATCTTTTACTAAGGTTACAGCTACATGTTAGGGGAGGCTATGAAAATACTATATTATTATAATTTCAGTGCAGTGATTGTTGTGAGAA
ATAACTTTCATGGTAACCCTAGGAAAATGGGCACCTGCCACCATCCTGAGAAGTCCTCACACAATGCCCTTTCTCTCTTACACACACACA
CACACACATACACACACACACACCCCCGTCACTAATTCATAGAGTTCCTTAGCAGGCATAGTCAAGGATCCTCTGGGTAATGTCAGCTGC
TTAGTGATAAAACAGAGCCAAAACTAGTGCATCCTGTTGAAAGTAATGCAGAAACAGTACCTGGGTCCAGATATGCTTTCCTGCGGCGCT
TTCCTCTGTTACCTCGTTTCATCCTCACAGCAGCATGGACGGTAGGTGGGGTCGCTTCTACAATCATTTCTGATGATAGCTTGGGAATAG
AGATAGGGGCAGTGACTTGCCTGATGTCGCACAGCCCTCTGGCTGTCCTGCTTTCCCATATGGAGCAGTGGTGGTGTGGGCACCTGTGAT
GCAGGAGACTTTAAAAATGTCGTGAGGTCACGTGCTGCCCCTCCTGGTACGTGTGGAATGCCCCTGGCCAGCAAGGGGTGCTTTTTTATC
AGAGTTGGCAGCTGGCATGTGGGAACCGAGCAAGTGCTGCGTACCAAGTTACTTGTTTTAAGGAGACCAAGTGCTCAGCGCCAGGTGGTT
TTCTTTTTTGTCATAGTTACTTGCTATAACTCAGCTTGACTTCTGTCATGAATCAGTGCTCTCTGGGAGGATGCAATACTCTGTTTGGGC
ATTAATTGGTAGCAGGTTGTCTCAACCAAAAAGACAGGAAACAGCAAAAGCCTCTCTGAAATTAAGAGGAAAGTTACTCTCCCCACACCC
ATCAGAGTCTTTATTGGAGCCACCAGGTGAGCTGTGCAGCCTGGACAGGCCTGCAGCTATAGGCCACCTTCCCAGTTTAGGTCCTCAGCA
CAGGGGAGCCCAAGTCACTGGGTGCCTTCCGAGGGCTGTCACTGGGCAGGCCATATACAAGTCAGTGTGTGCGTGGGCACTGCAGTGTGT
GCATGCCGTAGGTGTTGATGGGTGCTAGGAGGGGTGTCGTGTGCATGCGCGTTGAAGAGGATCTGTATTGCCGTGACCTCTGTTCATGGA
TGAGTGCATTGTAATTTGTTCTCAGGCTGTGCTGTGAGGGCCGCCTTAACCCTTGCTCCCTTCCCTTCTAGAGCTGCCTTAAGTTCTCCA
GAACTTTTCTTCTGTAAAGGATATCTTGCCTGGAAGGGATATCTTGCCCTGTTTCTCAAGGTTTTGTGAGAGTTTTGACTGGATGTGGCC
CTGCATGACCCTCCTTCTCCTGTACTTCCTCTTTCCTTTCCAAATGGGAATTAGAACTGTGGGGCAGCAACAGTCTCAGAGCCAGTGAGA
GGCCAGCTTAGAGAATGCTTCTGAGTTAGTGGGACTCTGTGTCACAAGTAAGCAAATGAATATATGAAAGAAATTATGGAGATAAGTTAG
ATTCTTGGTAATACTTAAATGTCTTGCTTTCTACTAACCTTTTGTTACTAAAGGTAAAGGGTATAACTCAAACTTTTTGTGGACATTCTT
TTCAAAATTTTTTAAGAACCCTGTACTATAAAAGGTTGAGTAAAAACAGGAAAGCGTGCTATAAGTTCAAATCTGTTGTATTACCCTAAA
TTAGATAAACCAACCTGAATTATAGTAGATTTCTCAATAGATGAGGAACTGAAAAATACTATGTAAAATATCTTCCAAAATGCTTTTTAT
ACTTTTTTTATTTGTAATTTGGTCTATCTAAAATGTTCGTTAGCTTAACTTAATGGGCGTTATTGGATTCATATGACTAACGTTTCCTCA
GTATTGTAATGCTTGAAATATTTGAAAGAAAAAATGTTGTTTTTTAGTTGAAACTGGTATATATAATTCAGTGCTTGGCAGGTTAGTATA
TTTTTATGCATTTTTCAGAGTCAGCAGTTTCAAATCTTATTGTTATCATGTTATAAAATTTTAGCCCACATTTCAGGCTCCGTAAATCAT
TTGAGCCATTATTTTTTCCCAACAAATGGTGAATTTTTTCTTTAAATGTGGATATATATGTTGTAATTTATGATTCCTGGTTATGTATTT
TTGTGGGATCCTGCAGTAAAATTGACTTTTTTGTGTCTTTGGGAGATTTAAATTGCGCTAACAGTGTTGCGCAAAAATGAGTTCATGCCA
TTTAACATATTGTATTTTAATTATTAACTGTATTAATTTACTATGAAATGGACATCCTTTTAACTAAAATGGAATTGAACATTGCAGTTT
TCAAATATTTTTCCTTGTTGGGTCTGGAAAAGGAATTCTACTTTGATCTGCATAGAAAATTTTGATACAATTTTTTGAAAGTTCTTAGGT
GAAACATTTACCCATTAAAAAGGAAGCAGAAATACTGAGACATGAAAGGCATTATCAACTAACTCTAGACTCTAGAACCCATTCTAGCAT
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AGAGGGCTTTATGAAGCACAACACATCTCGCCAGAATGAACACTGCCTCACCAATTTTGACCTGGCTGAGTATCGGCAGGTGCTGAGTGA
CTTGGCCATTCAGATCTACCAGCAGCTCGTGCGGGTGTTAGAGAACATCCTTCAGCCAATGATTGTCTCAGGCATGCTGGAACATGAAAC
GATTCAGGGCGTGTCTGGGGTGAAGCCCACAGGGTTGAGAAAGCGAACCTCCAGTATCGCCGATGAGGGCACCTACACACTGGACTCCAT
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CATCATAGGGGCCATCACCCTGAACAACCTTCTCCTGCGGAAGGACATGTGCTCCTGGAGTAAAGGCATGCAGATCAGGTACAATGTCAG
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Fusion Gene PPI Analysis for ARPP19-MYO5A


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page.


check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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Related Drugs for ARPP19-MYO5A


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.8 2021-05-08)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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Related Diseases for ARPP19-MYO5A


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
TgeneC1836573GRISCELLI SYNDROME, TYPE 32GENOMICS_ENGLAND;ORPHANET
TgeneC0023893Liver Cirrhosis, Experimental1CTD_human
TgeneC0398794Hypopigmentation-immunodeficiency disease1GENOMICS_ENGLAND
TgeneC1859194GRISCELLI SYNDROME, TYPE 11CTD_human;GENOMICS_ENGLAND;ORPHANET
TgeneC1860157Elejalde Disease1GENOMICS_ENGLAND;ORPHANET
TgeneC4721453Peripheral Nervous System Diseases1CTD_human